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UniProtKB/Swiss-Prot P30566 (PUR8_HUMAN)
Last modified
November 24, 2009.
Version 112.
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Clusters with 100%,
90%,
50% identity |
Documents (7) |
Third-party data |
Customize display | text xml rdf/xml gff fasta |
Names and origin
| Protein names | Recommended name: Adenylosuccinate lyase Short name=ASL EC=4.3.2.2 Alternative name(s): Adenylosuccinase Short name=ASase | ||||
| Gene names |
| ||||
| Organism | Homo sapiens (Human) [Complete proteome] | ||||
| Taxonomic identifier | 9606 [NCBI] | ||||
| Taxonomic lineage | Eukaryota › Metazoa › Chordata › Craniata › Vertebrata › Euteleostomi › Mammalia › Eutheria › Euarchontoglires › Primates › Haplorrhini › Catarrhini › Hominidae › Homo |
Protein attributes
| Sequence length | 484 AA. |
| Sequence status | Complete. |
| Sequence processing | The displayed sequence is further processed into a mature form. |
| Protein existence | Evidence at protein level. |
General annotation (Comments)
| Catalytic activity | N(6)-(1,2-dicarboxyethyl)AMP = fumarate + AMP. (S)-2-(5-amino-1-(5-phospho-D-ribosyl)imidazole-4-carboxamido)succinate = fumarate + 5-amino-1-(5-phospho-D-ribosyl)imidazole-4-carboxamide. |
| Pathway | Purine metabolism; AMP biosynthesis via de novo pathway; AMP from IMP: step 2/2. |
| Tissue specificity | Ubiquitously expressed. Both isoforms are produced by all tissues. |
| Involvement in disease | Defects in ADSL are the cause of adenylosuccinase deficiency (ADSL deficiency) [MIM:103050]. ADSL deficiency is an autosomal recessive disorder characterized by the accumulation in the body fluids of succinylaminoimidazole-carboxamide riboside (SAICA-riboside) and succinyladenosine (S-Ado). Most children display marked psychomotor delay, often accompanied by epilepsy or autistic features, or both, although some patients may be less profoundly retarded. Occasionally, growth retardation and muscular wasting are also present. |
| Sequence similarities | Belongs to the lyase 1 family. Adenylosuccinate lyase subfamily. |
Ontologies
| Keywords | |
|---|---|
| Biological process | Purine biosynthesis |
| Coding sequence diversity | Alternative splicing |
| Disease | Disease mutation Epilepsy |
| Molecular function | Lyase |
| PTM | Acetylation Phosphoprotein |
| Technical term | 3D-structure Complete proteome Direct protein sequencing |
| Gene Ontology (GO) | |
| Biological process | 'de novo' IMP biosynthetic process Inferred from Experiment. Source: Reactome AMP biosynthetic processInferred from direct assay. Source: UniProtKB protein tetramerizationInferred from direct assay. Source: UniProtKB |
| Cellular component | cytosol Inferred from Experiment. Source: Reactome |
| Molecular function | (S)-2-(5-amino-1-(5-phospho-D-ribosyl)imidazole-4-carboxamido)succinate AMP-lyase (fumarate-forming) activity Inferred from electronic annotation. Source: EC N6-(1,2-dicarboxyethyl)AMP AMP-lyase (fumarate-forming) activityInferred from direct assay. Source: UniProtKB |
| Complete GO annotation... | |
Alternative products
| This entry describes 2 isoforms produced by alternative splicing. [Align] [Select] | ||||||
| Isoform 1 (identifier: P30566-1) This isoform has been chosen as the 'canonical' sequence. All positional information in this entry refers to it. This is also the sequence that appears in the downloadable versions of the entry. | ||||||
| Isoform 2 (identifier: P30566-2) Also known as: Delta-ADSL; The sequence of this isoform differs from the canonical sequence as follows: 398-456: Missing. | ||||||
| Note: No enzymatic activity. 10-fold less abundant than isoform 1. |
Sequence annotation (Features)
| Feature key | Position(s) | Length | Description | Graphical view | Feature identifier | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule processing | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Initiator methionine | 1 | 1 | Removed Ref.7 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Chain | 2 – 484 | 483 | Adenylosuccinate lyase | PRO_0000137892 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sites | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Active site | 86 | 1 | Proton donor By similarity | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Active site | 159 | 1 | Proton acceptor By similarity | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Amino acid modifications | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Modified residue | 2 | 1 | N-acetylalanine Ref.7 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Modified residue | 9 | 1 | Phosphoserine Ref.9 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Modified residue | 147 | 1 | N6-acetyllysine Ref.12 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Modified residue | 295 | 1 | N6-acetyllysine Ref.12 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Natural variations | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Alternative sequence | 398 – 456 | 59 | Missing in isoform 2. | VSP_000318 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 2 | 1 | A → V in ADSL deficiency; severe. Ref.16 | VAR_016930 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 3 | 1 | A → V in ADSL deficiency; severe. Ref.2 | VAR_017078 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 26 | 1 | M → L in ADSL deficiency; severe. Ref.16 | VAR_016931 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 31 | 1 | S → N: dbSNP rs5757921. | VAR_037883 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 72 | 1 | I → V in ADSL deficiency; severe. Ref.15 | VAR_007972 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 100 | 1 | P → A in ADSL deficiency; moderate. Ref.14 | VAR_017079 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 114 | 1 | Y → H in ADSL deficiency; severe. Total loss of activity. Ref.2 | VAR_017080 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 141 | 1 | R → W in ADSL deficiency; severe. Ref.16 Ref.15 | VAR_007973 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 147 | 1 | K → M: dbSNP rs11089991. | VAR_037884 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 190 | 1 | R → Q in ADSL deficiency; moderate. dbSNP rs28941471. | VAR_007974 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 194 | 1 | R → C in ADSL deficiency; severe. Ref.2 | VAR_017081 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 246 | 1 | K → E in ADSL deficiency; moderate. Ref.15 | VAR_007975 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 268 | 1 | D → N in ADSL deficiency; severe. Total loss of activity. Ref.2 | VAR_017082 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 303 | 1 | R → C in ADSL deficiency; mild. Ref.16 Ref.15 | VAR_007976 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 311 | 1 | L → V in ADSL deficiency; severe. Ref.17 | VAR_017083 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 318 | 1 | P → L in ADSL deficiency; severe. | VAR_017084 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 364 | 1 | V → M in ADSL deficiency; severe. Ref.17 | VAR_017085 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 374 | 1 | R → W in ADSL deficiency; severe. | VAR_017086 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 395 | 1 | S → R in ADSL deficiency; severe. Ref.16 Ref.15 | VAR_007977 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 396 | 1 | R → C in ADSL deficiency; severe. | VAR_017087 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 396 | 1 | R → H in ADSL deficiency; severe. Ref.17 | VAR_017088 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 422 | 1 | D → Y in ADSL deficiency; moderate. Ref.14 | VAR_017089 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 423 | 1 | L → V in ADSL deficiency; moderate. | VAR_017090 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 426 | 1 | R → H in ADSL deficiency; severe. Most frequent mutation. Ref.16 Ref.2 Ref.15 Ref.13 Ref.18 | VAR_007978 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 430 | 1 | D → N in ADSL deficiency; mild. Ref.2 | VAR_017091 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 438 | 1 | S → P in ADSL deficiency; severe. Ref.7 | VAR_000680 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 447 | 1 | S → P in ADSL deficiency; severe. | VAR_017092 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 450 | 1 | T → S in ADSL deficiency; moderate. Ref.16 | VAR_016932 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 452 | 1 | R → P in ADSL deficiency; severe. Ref.17 | VAR_017093 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Secondary structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Helix Strand Turn | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 16 – 19 | 4 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 24 – 29 | 6 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 32 – 53 | 22 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 59 – 66 | 8 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 74 – 84 | 11 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 87 – 98 | 12 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 100 – 102 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 103 – 105 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 106 – 109 | 4 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 113 – 148 | 36 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 149 – 151 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 153 – 158 | 6 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 161 – 167 | 7 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 168 – 192 | 25 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 206 – 211 | 6 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 212 – 214 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 216 – 229 | 14 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 240 – 242 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 246 – 274 | 29 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 277 – 279 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 299 – 313 | 15 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 316 – 323 | 8 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 331 – 333 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 334 – 360 | 27 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 366 – 380 | 15 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 382 – 389 | 8 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 396 – 416 | 21 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 423 – 429 | 7 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 431 – 433 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 434 – 437 | 4 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 440 – 443 | 4 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 446 – 449 | 4 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 453 – 463 | 11 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 465 – 469 | 5 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 470 – 472 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequences
| ||||||||||||||||||||||||
References
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| + | Additional computationally mapped references. |
Cross-references
Sequence databases | |||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| X65867 mRNA. Translation: CAA46696.1. X65867 mRNA. Translation: CAA46697.1. Different initiation. AF067853 mRNA. Translation: AAC21560.1. AF067854 mRNA. Translation: AAC21561.1. CR456368 mRNA. Translation: CAG30254.1. AL022238 Genomic DNA. Translation: CAI18983.1. AL022238 Genomic DNA. Translation: CAQ08930.1. CH471095 Genomic DNA. Translation: EAW60375.1. BC000253 mRNA. Translation: AAH00253.1. S60710 mRNA. Translation: AAC60603.1. Different initiation. | |||||||||||||||||||
| IPI | IPI00220887. IPI00942092. | ||||||||||||||||||
| RefSeq | NP_000017.1. NP_001116850.1. | ||||||||||||||||||
| UniGene | Hs.75527 | ||||||||||||||||||
3D structure databases | |||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||
| ModBase | Search... | ||||||||||||||||||
Protein-protein interaction databases | |||||||||||||||||||
| STRING | P30566. | ||||||||||||||||||
PTM databases | |||||||||||||||||||
| PhosphoSite | P30566. | ||||||||||||||||||
Proteomic databases | |||||||||||||||||||
| PeptideAtlas | P30566. | ||||||||||||||||||
| PRIDE | P30566. | ||||||||||||||||||
Genome annotation databases | |||||||||||||||||||
| Ensembl | ENST00000216194; ENSP00000216194; ENSG00000239900; Homo sapiens. [Genome view] | ||||||||||||||||||
| GeneID | 158. | ||||||||||||||||||
| KEGG | hsa:158. | ||||||||||||||||||
| UCSC | uc003ayp.2. human. uc003ays.2. human. | ||||||||||||||||||
Organism-specific databases | |||||||||||||||||||
| CTD | 158. | ||||||||||||||||||
| GeneCards | GC22P039067. | ||||||||||||||||||
| H-InvDB | HIX0016502. | ||||||||||||||||||
| HGNC | HGNC:291. ADSL. | ||||||||||||||||||
| HPA | CAB019285. HPA000525. | ||||||||||||||||||
| MIM | 103050. phenotype. 608222. gene. | ||||||||||||||||||
| Orphanet | 46. Adenylosuccinate lyase deficiency. | ||||||||||||||||||
| PharmGKB | PA24600. | ||||||||||||||||||
| GenAtlas | Search... | ||||||||||||||||||
Phylogenomic databases | |||||||||||||||||||
| HOGENOM | P30566. | ||||||||||||||||||
| HOVERGEN | P30566. | ||||||||||||||||||
Enzyme and pathway databases | |||||||||||||||||||
| BRENDA | 4.3.2.2. 247. | ||||||||||||||||||
| Reactome | REACT_1698. Metablism of nucleotides. | ||||||||||||||||||
Gene expression databases | |||||||||||||||||||
| ArrayExpress | P30566. | ||||||||||||||||||
| Bgee | P30566. | ||||||||||||||||||
| CleanEx | HS_ADSL. | ||||||||||||||||||
| Genevestigator | P30566. | ||||||||||||||||||
| GermOnline | ENSG00000100357. Homo sapiens. | ||||||||||||||||||
Family and domain databases | |||||||||||||||||||
| InterPro | IPR019468. Adenylosuccinate_lyase_C. IPR003031. D_crystallin. IPR000362. Fumarate_lyase. IPR020557. Fumarate_lyase_CS. IPR008948. L-Aspartase-like. IPR004769. Pur_lyase. [Graphical view] | ||||||||||||||||||
| Pfam | PF10397. ADSL_C. 1 hit. PF00206. Lyase_1. 1 hit. [Graphical view] | ||||||||||||||||||
| PRINTS | PR00145. ARGSUCLYASE. PR00149. FUMRATELYASE. | ||||||||||||||||||
| TIGRFAMs | TIGR00928. purB. 1 hit. | ||||||||||||||||||
| PROSITE | PS00163. FUMARATE_LYASES. 1 hit. [Graphical view] | ||||||||||||||||||
| ProtoNet | Search... | ||||||||||||||||||
Other Resources | |||||||||||||||||||
| NextBio | 629. | ||||||||||||||||||
| SOURCE | Search... | ||||||||||||||||||
Entry information
| Entry name | PUR8_HUMAN | ||||||||
| Accession | Primary (citable) accession number: P30566 Secondary accession number(s): B0QY76, O75495, Q5TI34 | ||||||||
| Entry history |
| ||||||||
| Entry status | Reviewed (UniProtKB/Swiss-Prot) | ||||||||
| Annotation project | HPI (Human Proteome Initiative) | ||||||||
| Disclaimer | Any medical or genetic information present in this entry is provided for research, educational and informational purposes only. It is not in any way intended to be used as a substitute for professional medical advice, diagnosis, treatment or care. | ||||||||
Relevant documents
| Human chromosome 22 Human chromosome 22: entries, gene names and cross-references to MIM |
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| MIM cross-references Online Mendelian Inheritance in Man (MIM) cross-references in UniProtKB/Swiss-Prot |
| PATHWAY comments Index of metabolic and biosynthesis pathways |
| PDB cross-references Index of Protein Data Bank (PDB) cross-references |
| SIMILARITY comments Index of protein domains and families |

Clusters with


