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UniProtKB/Swiss-Prot P30044 (PRDX5_HUMAN)
Last modified
June 16, 2009.
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90%,
50% identity |
Documents (6) |
Third-party data |
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Names and origin
| Protein names | Recommended name: Peroxiredoxin-5, mitochondrial EC=1.11.1.15 Alternative name(s): Prx-V Peroxisomal antioxidant enzyme PLP Thioredoxin reductase Thioredoxin peroxidase PMP20 Antioxidant enzyme B166 Short name=AOEB166 TPx type VI Liver tissue 2D-page spot 71B Alu corepressor 1 | ||||||
| Gene names |
| ||||||
| Organism | Homo sapiens (Human) | ||||||
| Taxonomic identifier | 9606 [NCBI] | ||||||
| Taxonomic lineage | Eukaryota › Metazoa › Chordata › Craniata › Vertebrata › Euteleostomi › Mammalia › Eutheria › Euarchontoglires › Primates › Haplorrhini › Catarrhini › Hominidae › Homo |
Protein attributes
| Sequence length | 214 AA. |
| Sequence status | Complete. |
| Sequence processing | The displayed sequence is further processed into a mature form. |
| Protein existence | Evidence at protein level. |
General annotation (Comments)
| Function | Reduces hydrogen peroxide and alkyl hydroperoxides with reducing equivalents provided through the thioredoxin system. Involved in intracellular redox signaling. |
| Catalytic activity | 2 R'-SH + ROOH = R'-S-S-R' + H2O + ROH. |
| Subunit structure | Monomer. |
| Subcellular location | |
| Tissue specificity | Widely expressed. Ref.3 |
| Sequence similarities | Belongs to the peroxiredoxin 2 family. Contains 1 thioredoxin domain. |
| Sequence caution | The sequence AAF17200.1 differs from that shown. Reason: Frameshift at positions 14 and 30. |
Ontologies
Alternative products
| This entry describes 2 isoforms produced by alternative initiation. [Align] [Select] | ||||||
| Isoform Mitochondrial (identifier: P30044-1) This isoform has been chosen as the 'canonical' sequence. All positional information in this entry refers to it. This is also the sequence that appears in the downloadable versions of the entry. | ||||||
| Isoform Cytoplasmic+peroxisomal (identifier: P30044-2) The sequence of this isoform differs from the canonical sequence as follows: 1-52: Missing. |
Sequence annotation (Features)
| Feature key | Position(s) | Length | Description | Graphical view | Feature identifier | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule processing | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Transit peptide | 1 – 52 | 52 | Mitochondrion Potential | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Chain | 53 – 214 | 162 | Peroxiredoxin-5, mitochondrial | PRO_0000023793 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Regions | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Domain | 56 – 214 | 159 | Thioredoxin | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motif | 212 – 214 | 3 | Microbody targeting signal By similarity | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sites | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Active site | 100 | 1 | Cysteine sulfenic acid (-SOH) intermediate Potential | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Amino acid modifications | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Disulfide bond | 100 ↔ 204 | Redox-active | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Natural variations | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Alternative sequence | 1 – 52 | 52 | Missing in isoform Cytoplasmic+peroxisomal. | VSP_018829 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 33 | 1 | C → Y: dbSNP rs7938623. Ref.10 | VAR_025049 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 157 | 1 | F → L in a breast cancer sample; somatic mutation. Ref.16 | VAR_036406 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Experimental info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Mutagenesis | 100 | 1 | C → S: Complete loss of activity. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Mutagenesis | 125 | 1 | C → S: No change in activity. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Mutagenesis | 204 | 1 | C → S: Complete loss of activity. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence conflict | 141 | 1 | H → T in AAF04856. Ref.4 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Helix Strand Turn | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 66 – 68 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 75 – 77 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 78 – 81 | 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 82 – 84 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 85 – 91 | 7 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 98 – 102 | 5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 104 – 110 | 7 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 112 – 116 | 5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 117 – 119 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 120 – 129 | 10 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 131 – 140 | 10 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 144 – 146 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 148 – 151 | 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 156 – 161 | 6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 170 – 173 | 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 181 – 186 | 6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 189 – 195 | 7 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 207 – 211 | 5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequences
| ||||||||||||||||||||||||
References
| « Hide 'large scale' references | |
| [1] | "A novel human DNA-binding protein with sequence similarity to a subfamily of redox proteins which is able to repress RNA-polymerase-III-driven transcription of the Alu-family retroposons in vitro." Kropotov A., Sedova V., Ivanov V., Sazeeva N., Tomilin A., Krutilina R., Oei S.L., Griesenbeck J., Buchlow G., Tomilin N. Eur. J. Biochem. 260:336-346(1999) [PubMed: 10095767] [Abstract] Cited for: NUCLEOTIDE SEQUENCE [MRNA]. |
| [2] | "Characterization of human and murine PMP20 peroxisomal proteins that exhibit antioxidant activity in vitro." Yamashita H., Avraham S., Jiang S., London R., Van Veldhoven P.P., Subramani S., Rogers R.A., Avraham H. J. Biol. Chem. 274:29897-29904(1999) [PubMed: 10514471] [Abstract] Cited for: NUCLEOTIDE SEQUENCE [MRNA], CHARACTERIZATION. |
| [3] | "Cloning and characterization of AOEB166, a novel mammalian antioxidant enzyme of the peroxiredoxin family." Knoops B., Clippe A., Bogard C., Arsalane K., Wattiez R., Hermans C., Duconseille E., Falmagne P., Bernard A. J. Biol. Chem. 274:30451-30458(1999) [PubMed: 10521424] [Abstract] Cited for: NUCLEOTIDE SEQUENCE [MRNA], PROTEIN SEQUENCE OF 54-90, TISSUE SPECIFICITY, SUBCELLULAR LOCATION, CHARACTERIZATION. Tissue: Lung. |
| [4] | "Mouse peroxiredoxin V is a thioredoxin peroxidase that inhibits p53-induced apoptosis." Zhou Y., Kok K.H., Chun A.C.S., Wong C.M., Wu H.W., Lin M.C.M., Fung P.C.W., Kung H.-F., Jin D.-Y. Biochem. Biophys. Res. Commun. 268:921-927(2000) [PubMed: 10679306] [Abstract] Cited for: NUCLEOTIDE SEQUENCE [MRNA]. |
| [5] | "Identification of a new type of mammalian peroxiredoxin that forms an intramolecular disulfide as a reaction intermediate." Seo M.S., Kang S.W., Kim K., Baines I.C., Lee T.H., Rhee S.G. J. Biol. Chem. 275:20346-20354(2000) [PubMed: 10751410] [Abstract] Cited for: NUCLEOTIDE SEQUENCE [MRNA], MUTAGENESIS, CHARACTERIZATION. |
| [6] | "A new type of human thiol peroxidase (Human TPx type VI)." Kim I.H., Jeong W. Submitted (SEP-1999) to the EMBL/GenBank/DDBJ databases Cited for: NUCLEOTIDE SEQUENCE [MRNA]. |
| [7] | Zhang W., Li N., Wan T., Cao X. Submitted (MAR-2000) to the EMBL/GenBank/DDBJ databases Cited for: NUCLEOTIDE SEQUENCE [MRNA]. |
| [8] | "Gene expression profiling in the human hypothalamus-pituitary-adrenal axis and full-length cDNA cloning." Hu R.-M., Han Z.-G., Song H.-D., Peng Y.-D., Huang Q.-H., Ren S.-X., Gu Y.-J., Huang C.-H., Li Y.-B., Jiang C.-L., Fu G., Zhang Q.-H., Gu B.-W., Dai M., Mao Y.-F., Gao G.-F., Rong R., Ye M. Chen J.-L.Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 97:9543-9548(2000) [PubMed: 10931946] [Abstract] Cited for: NUCLEOTIDE SEQUENCE [LARGE SCALE MRNA]. Tissue: Adrenal gland. |
| [9] | "Cloning of human full open reading frames in Gateway(TM) system entry vector (pDONR201)." Ebert L., Schick M., Neubert P., Schatten R., Henze S., Korn B. Submitted (JUN-2004) to the EMBL/GenBank/DDBJ databases Cited for: NUCLEOTIDE SEQUENCE [LARGE SCALE MRNA]. |
| [10] | NIEHS SNPs program Submitted (OCT-2005) to the EMBL/GenBank/DDBJ databases Cited for: NUCLEOTIDE SEQUENCE [GENOMIC DNA], VARIANT TYR-33. |
| [11] | "Human chromosome 11 DNA sequence and analysis including novel gene identification." Taylor T.D., Noguchi H., Totoki Y., Toyoda A., Kuroki Y., Dewar K., Lloyd C., Itoh T., Takeda T., Kim D.-W., She X., Barlow K.F., Bloom T., Bruford E., Chang J.L., Cuomo C.A., Eichler E., FitzGerald M.G. Sakaki Y.Nature 440:497-500(2006) [PubMed: 16554811] [Abstract] Cited for: NUCLEOTIDE SEQUENCE [LARGE SCALE GENOMIC DNA]. |
| [12] | "The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC)." The MGC Project Team Genome Res. 14:2121-2127(2004) [PubMed: 15489334] [Abstract] Cited for: NUCLEOTIDE SEQUENCE [LARGE SCALE MRNA]. Tissue: Brain and Medulla oblongata. |
| [13] | "Human liver protein map: a reference database established by microsequencing and gel comparison." Hochstrasser D.F., Frutiger S., Paquet N., Bairoch A., Ravier F., Pasquali C., Sanchez J.-C., Tissot J.-D., Bjellqvist B., Vargas R., Appel R.D., Hughes G.J. Electrophoresis 13:992-1001(1992) [PubMed: 1286669] [Abstract] Cited for: PROTEIN SEQUENCE OF 54-63. Tissue: Liver. |
| [14] | Colinge J., Superti-Furga G., Bennett K.L. Submitted (OCT-2008) to UniProtKB Cited for: IDENTIFICATION [LARGE SCALE ANALYSIS], MASS SPECTROMETRY. |
| [15] | "Crystal structure of human peroxiredoxin 5, a novel type of mammalian peroxiredoxin at 1.5-A resolution." Declercq J.-P., Evrard C., Clippe A., Stricht D.V., Bernard A., Knoops B. J. Mol. Biol. 311:751-759(2001) [PubMed: 11518528] [Abstract] Cited for: X-RAY CRYSTALLOGRAPHY (1.5 ANGSTROMS). |
| [16] | "The consensus coding sequences of human breast and colorectal cancers." Sjoeblom T., Jones S., Wood L.D., Parsons D.W., Lin J., Barber T.D., Mandelker D., Leary R.J., Ptak J., Silliman N., Szabo S., Buckhaults P., Farrell C., Meeh P., Markowitz S.D., Willis J., Dawson D., Willson J.K.V. Velculescu V.E.Science 314:268-274(2006) [PubMed: 16959974] [Abstract] Cited for: VARIANT [LARGE SCALE ANALYSIS] LEU-157. |
| + | Additional computationally mapped references. |
Cross-references
Sequence databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| AJ249483 mRNA. Translation: CAB62210.1. AF231705 mRNA. Translation: AAF78899.1. AF124993 mRNA. Translation: AAF27531.1. AF110731 mRNA. Translation: AAF03750.1. AF197952 mRNA. Translation: AAF04856.1. AF242525 mRNA. Translation: AAF99605.1. AF112212 mRNA. Translation: AAF17200.1. Frameshift. CR457203 mRNA. Translation: CAG33484.1. DQ247769 Genomic DNA. Translation: ABB05181.1. AP001453 Genomic DNA. No translation available. AP003774 Genomic DNA. No translation available. BC110983 mRNA. Translation: AAI10984.1. BC113723 mRNA. Translation: AAI13724.1. BC113725 mRNA. Translation: AAI13726.1. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IPI | IPI00024915. IPI00759663. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| RefSeq | NP_036226.1. NP_857634.1. NP_857635.1. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| UniGene | Hs.502823 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3D structure databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| ModBase | Search... | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Protein-protein interaction databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IntAct | P30044. 4 interactions. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Protein family/group databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| PeroxiBase | 4448. HsPrxV. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PTM databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| PhosphoSite | P30044. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
2-D gel databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| SWISS-2DPAGE | P30044. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| OGP | P30044. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| REPRODUCTION-2DPAGE | IPI00759663. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Proteomic databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| PRIDE | P30044. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome annotation databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Ensembl | ENSG00000126432. Homo sapiens. [Contig view] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GeneID | 25824. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| KEGG | hsa:25824. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Organism-specific databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GeneCards | GC11P063842. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| H-InvDB | HIX0021287. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| HGNC | HGNC:9355. PRDX5. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| HPA | CAB008661. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MIM | 606583. gene. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| PharmGKB | PA33726. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GenAtlas | Search... | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Phylogenomic databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| HOGENOM | P30044. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| HOVERGEN | P30044. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Enzyme and pathway databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| BRENDA | 1.11.1.15. 247. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene expression databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| ArrayExpress | P30044. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Bgee | P30044. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| CleanEx | HS_PRDX5. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GermOnline | ENSG00000126432. Homo sapiens. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Family and domain databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| InterPro | IPR013740. Redoxin. IPR017936. Thioredoxin-like. IPR012335. Thioredoxin_fold. [Graphical view] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Gene3D | G3DSA:3.40.30.10. Thioredoxin_fold. 1 hit. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Pfam | PF08534. Redoxin. 1 hit. [Graphical view] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| PROSITE | PS51352. THIOREDOXIN_2. 1 hit. [Graphical view] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| ProtoNet | Search... | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Other Resources | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| DrugBank | DB00995. Auranofin. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| NextBio | 47091. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| SOURCE | Search... | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry information
| Entry name | PRDX5_HUMAN | ||||||||
| Accession | Primary (citable) accession number: P30044 Secondary accession number(s): Q14CK0 Q9UKX4 | ||||||||
| Entry history |
| ||||||||
| Entry status | Reviewed (UniProtKB/Swiss-Prot) | ||||||||
| Annotation project | HPI (Human Proteome Initiative) | ||||||||
Relevant documents
| Human chromosome 11 Human chromosome 11: entries, gene names and cross-references to MIM |
| Human entries with polymorphisms or disease mutations List of human entries with polymorphisms or disease mutations |
| Human polymorphisms and disease mutations Index of human polymorphisms and disease mutations |
| MIM cross-references Online Mendelian Inheritance in Man (MIM) cross-references in UniProtKB/Swiss-Prot |
| PDB cross-references Index of Protein Data Bank (PDB) cross-references |
| SIMILARITY comments Index of protein domains and families |

Clusters with


