P29994 (ITPR1_RAT) Reviewed, UniProtKB/Swiss-Prot
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April 3, 2013.
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| Protein names | Recommended name: Inositol 1,4,5-trisphosphate receptor type 1 Alternative name(s): IP3 receptor isoform 1 Short name=IP-3-R Short name=IP3R 1 Short name=InsP3R1 Type 1 inositol 1,4,5-trisphosphate receptor Short name=Type 1 InsP3 receptor | ||||
| Gene names |
| ||||
| Organism | Rattus norvegicus (Rat) [Reference proteome] | ||||
| Taxonomic identifier | 10116 [NCBI] | ||||
| Taxonomic lineage | Eukaryota › Metazoa › Chordata › Craniata › Vertebrata › Euteleostomi › Mammalia › Eutheria › Euarchontoglires › Glires › Rodentia › Sciurognathi › Muroidea › Muridae › Murinae › Rattus![]() |
Protein attributes
| Sequence length | 2750 AA. |
| Sequence status | Complete. |
| Protein existence | Evidence at protein level |
General annotation (Comments)
| Function | Intracellular channel that mediates calcium release from the endoplasmic reticulum following stimulation by inositol 1,4,5-trisphosphate. Plays a role in ER stress-induced apoptosis. Cytoplasmic calcium released from the ER triggers apoptosis by the activation of CaM kinase II, eventually leading to the activation of downstream apoptosis pathways By similarity. |
| Subunit structure | Homotetramer. Part of cGMP kinase signaling complex at least composed of ACTA2/alpha-actin, CNN1/calponin H1, PLN/phospholamban, PRKG1 and ITPR1. Interacts with TRPC4. The PPXXF motif binds HOM1, HOM2 and HOM3. Interacts with RYR1, RYR2, ITPR1, SHANK1 and SHANK3. Interacts with ERP44 in a pH-, redox state- and calcium-dependent manner which results in the inhibition the calcium channel activity. The strength of this interaction inversely correlates with calcium concentration. Interacts with CABP1. Interacts with AHCYL1 and MRVI1 By similarity. Ref.5 |
| Subcellular location | Endoplasmic reticulum membrane; Multi-pass membrane protein. |
| Tissue specificity | Isoform 3 is found in the brain while isoform 7 is found in the fetal brain and peripheral tissues. |
| Domain | The receptor contains a calcium channel in its C-terminal extremity. Its large N-terminal cytoplasmic region has the ligand-binding site in the N-terminus and modulatory sites in the middle portion immediately upstream of the channel region. |
| Post-translational modification | Phosphorylated by cAMP kinase. Phosphorylation prevents the ligand-induced opening of the calcium channels. Phosphorylated on tyrosine residues By similarity. Ubiquitination at multiple lysines targets ITPR1 for proteasomal degradation. Approximately 40% of the ITPR1-associated ubiquitin is monoubiquitin, and polyubiquitins are both 'Lys-48'- and 'Lys-63'-linked. |
| Miscellaneous | Calcium appears to inhibit ligand binding to the receptor, most probably by interacting with a distinct calcium-binding protein which then inhibits the receptor. |
| Sequence similarities | Belongs to the InsP3 receptor family. Contains 5 MIR domains. |
Ontologies
Alternative products
| This entry describes 8 isoforms produced by alternative splicing. [Align] [Select] Note: There is a combination of two alternatively spliced domains at site SI and site SII (A, B and C). Experimental confirmation may be lacking for some isoforms. | ||||||
| Isoform 1 (identifier: P29994-1) Also known as: SISIIABC; This isoform has been chosen as the 'canonical' sequence. All positional information in this entry refers to it. This is also the sequence that appears in the downloadable versions of the entry. | ||||||
| Isoform 2 (identifier: P29994-2) Also known as: SI-SIIABC; The sequence of this isoform differs from the canonical sequence as follows: 322-336: Missing. | ||||||
| Isoform 3 (identifier: P29994-3) Also known as: SISIIAC; The sequence of this isoform differs from the canonical sequence as follows: 1716-1716: Missing. | ||||||
| Isoform 4 (identifier: P29994-4) Also known as: SI-SIIAC; The sequence of this isoform differs from the canonical sequence as follows: 322-336: Missing. 1716-1716: Missing. | ||||||
| Isoform 5 (identifier: P29994-5) Also known as: SISIIA; The sequence of this isoform differs from the canonical sequence as follows: 1716-1716: Missing. 1717-1732: Missing. | ||||||
| Isoform 6 (identifier: P29994-6) Also known as: SI-SIIA; The sequence of this isoform differs from the canonical sequence as follows: 322-336: Missing. 1716-1716: Missing. 1717-1732: Missing. | ||||||
| Isoform 7 (identifier: P29994-7) Also known as: SISII; The sequence of this isoform differs from the canonical sequence as follows: 1693-1715: Missing. 1716-1716: Missing. 1717-1732: Missing. | ||||||
| Isoform 8 (identifier: P29994-8) Also known as: SI-SII; The sequence of this isoform differs from the canonical sequence as follows: 322-336: Missing. 1693-1715: Missing. 1716-1716: Missing. 1717-1732: Missing. |
Sequence annotation (Features)
| Feature key | Position(s) | Length | Description | Graphical view | Feature identifier | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule processing | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Chain | 1 – 2750 | 2750 | Inositol 1,4,5-trisphosphate receptor type 1 | PRO_0000153922 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Regions | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Topological domain | 1 – 2274 | 2274 | Cytoplasmic Potential | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Transmembrane | 2275 – 2295 | 21 | Helical; Potential | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Topological domain | 2296 – 2306 | 11 | Lumenal Potential | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Transmembrane | 2307 – 2327 | 21 | Helical; Potential | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Topological domain | 2328 – 2353 | 26 | Cytoplasmic Potential | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Transmembrane | 2354 – 2374 | 21 | Helical; Potential | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Topological domain | 2375 – 2397 | 23 | Lumenal Potential | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Transmembrane | 2398 – 2418 | 21 | Helical; Potential | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Topological domain | 2419 – 2440 | 22 | Cytoplasmic Potential | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Transmembrane | 2441 – 2461 | 21 | Helical; Potential | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Topological domain | 2462 – 2569 | 108 | Lumenal Potential | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Transmembrane | 2570 – 2590 | 21 | Helical; Potential | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Topological domain | 2591 – 2750 | 160 | Cytoplasmic Potential | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Domain | 112 – 166 | 55 | MIR 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Domain | 173 – 223 | 51 | MIR 2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Domain | 231 – 287 | 57 | MIR 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Domain | 294 – 373 | 80 | MIR 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Domain | 379 – 435 | 57 | MIR 5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Region | 265 – 269 | 5 | Inositol 1,4,5-trisphosphate binding By similarity | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Region | 508 – 511 | 4 | Inositol 1,4,5-trisphosphate binding By similarity | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Region | 567 – 569 | 3 | Inositol 1,4,5-trisphosphate binding By similarity | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Region | 2464 – 2529 | 66 | Interaction with ERP44 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Amino acid modifications | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Modified residue | 482 | 1 | Phosphotyrosine Potential | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Modified residue | 1589 | 1 | Phosphoserine By similarity | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Modified residue | 1756 | 1 | Phosphoserine; by PKA Potential | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Modified residue | 2656 | 1 | Phosphotyrosine Potential | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Cross-link | 916 | Glycyl lysine isopeptide (Lys-Gly) (interchain with G-Cter in ubiquitin) Ref.6 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Cross-link | 962 | Glycyl lysine isopeptide (Lys-Gly) (interchain with G-Cter in ubiquitin) Ref.6 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Cross-link | 1572 | Glycyl lysine isopeptide (Lys-Gly) (interchain with G-Cter in ubiquitin) Ref.6 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Cross-link | 1772 | Glycyl lysine isopeptide (Lys-Gly) (interchain with G-Cter in ubiquitin) Ref.6 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Cross-link | 1885 | Glycyl lysine isopeptide (Lys-Gly) (interchain with G-Cter in ubiquitin) Ref.6 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Cross-link | 1886 | Glycyl lysine isopeptide (Lys-Gly) (interchain with G-Cter in ubiquitin) Ref.6 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Cross-link | 1887 | Glycyl lysine isopeptide (Lys-Gly) (interchain with G-Cter in ubiquitin) Ref.6 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Cross-link | 1902 | Glycyl lysine isopeptide (Lys-Gly) (interchain with G-Cter in ubiquitin) Ref.6 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Cross-link | 1925 | Glycyl lysine isopeptide (Lys-Gly) (interchain with G-Cter in ubiquitin) Ref.6 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Cross-link | 2119 | Glycyl lysine isopeptide (Lys-Gly) (interchain with G-Cter in ubiquitin) Ref.6 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Cross-link | 2258 | Glycyl lysine isopeptide (Lys-Gly) (interchain with G-Cter in ubiquitin) Ref.6 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Natural variations | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Alternative sequence | 322 – 336 | 15 | Missing in isoform 2, isoform 4, isoform 6 and isoform 8. | VSP_002695 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Alternative sequence | 1693 – 1715 | 23 | Missing in isoform 7 and isoform 8. | VSP_002696 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Alternative sequence | 1716 | 1 | Missing in isoform 3, isoform 4, isoform 5, isoform 6, isoform 7 and isoform 8. | VSP_002697 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Alternative sequence | 1717 – 1732 | 16 | Missing in isoform 5, isoform 6, isoform 7 and isoform 8. | VSP_002698 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 1372 | 1 | Missing in all but PI17 clones. Ref.1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Experimental info | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence conflict | 1764 | 1 | P → R in AAA41447. Ref.2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence conflict | 1764 | 1 | P → R in AAA41448. Ref.2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Secondary structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Helix Strand Turn | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 14 – 23 | 10 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 25 – 30 | 6 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 36 – 39 | 4 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 41 – 43 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 53 – 56 | 4 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 57 – 61 | 5 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 67 – 74 | 8 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 87 – 108 | 22 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 109 – 112 | 4 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 120 – 125 | 6 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 126 – 129 | 4 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 130 – 139 | 10 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 141 – 143 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 147 – 154 | 8 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 157 – 159 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 161 – 167 | 7 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 181 – 189 | 9 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 193 – 199 | 7 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 201 – 203 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 207 – 213 | 7 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 217 – 224 | 8 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 226 – 228 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 239 – 244 | 6 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 245 – 248 | 4 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 249 – 256 | 8 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 259 – 265 | 7 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 278 – 280 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 281 – 286 | 6 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 302 – 307 | 6 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 308 – 310 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 313 – 318 | 6 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 353 – 359 | 7 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 364 – 366 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 368 – 374 | 7 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 387 – 392 | 6 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 393 – 395 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 398 – 406 | 9 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 408 – 412 | 5 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 415 – 423 | 9 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 430 – 434 | 5 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 437 – 462 | 26 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 467 – 483 | 17 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 504 – 512 | 9 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 515 – 522 | 8 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 552 – 562 | 11 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 563 – 566 | 4 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 568 – 575 | 8 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequences
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
References
| [1] | "Structure and expression of the rat inositol 1,4,5-trisphosphate receptor." Mignery G.A., Newton C.L., Archer B.T. III, Suedhof T.C. J. Biol. Chem. 265:12679-12685(1990) [PubMed] [Europe PMC] [Abstract] Cited for: NUCLEOTIDE SEQUENCE [MRNA] (ISOFORMS 3 AND 4), VARIANT PHE-1372 DEL. |
| [2] | "Inositol 1,4,5-trisphosphate receptors: distinct neuronal and nonneuronal forms derived by alternative splicing differ in phosphorylation." Danoff S.K., Ferris C.D., Donath C., Fischer G.A., Munemitsu S., Ullrich A., Snyder S.H., Ross C.A. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 88:2951-2955(1991) [PubMed] [Europe PMC] [Abstract] Cited for: PARTIAL NUCLEOTIDE SEQUENCE [MRNA] (ISOFORMS 1 AND 7). Tissue: Brain. |
| [3] | "Inositol 1,4,5-trisphosphate receptor expression in mammalian olfactory tissue." Smutzer G., Zimmerman J.E., Hahn C.-G., Ruscheinsky D.D., Rodriguez A., Han L.-Y., Arnold S.E. Brain Res. Mol. Brain Res. 44:347-354(1997) [PubMed] [Europe PMC] [Abstract] Cited for: PARTIAL NUCLEOTIDE SEQUENCE [MRNA] (ISOFORMS 3; 4; 7 AND 8). Strain: Sprague-Dawley. |
| [4] | "Subunit oligomerization, and topology of the inositol 1,4, 5-trisphosphate receptor." Galvan D.L., Borrego-Diaz E., Perez P.J., Mignery G.A. J. Biol. Chem. 274:29483-29492(1999) [PubMed] [Europe PMC] [Abstract] Cited for: CHARACTERIZATION. |
| [5] | "Identification of a family of calcium sensors as protein ligands of inositol trisphosphate receptor Ca(2+) release channels." Yang J., McBride S., Mak D.-O.D., Vardi N., Palczewski K., Haeseleer F., Foskett J.K. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 99:7711-7716(2002) [PubMed] [Europe PMC] [Abstract] Cited for: INTERACTION WITH CABP1. |
| [6] | "Mass spectrometric analysis of type 1 inositol 1,4,5-trisphosphate receptor ubiquitination." Sliter D.A., Kubota K., Kirkpatrick D.S., Alzayady K.J., Gygi S.P., Wojcikiewicz R.J. J. Biol. Chem. 283:35319-35328(2008) [PubMed] [Europe PMC] [Abstract] Cited for: UBIQUITINATION AT LYS-916; LYS-962; LYS-1572; LYS-1772; LYS-1885; LYS-1886; LYS-1887; LYS-1902; LYS-1925; LYS-2119 AND LYS-2258. |
| + | Additional computationally mapped references. |
Cross-references
Sequence databases | |||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| EMBL GenBank DDBJ | J05510 mRNA. Translation: AAA41358.1. J05510 mRNA. Translation: AAA41357.1. M64699 mRNA. Translation: AAA41447.1. M64698 mRNA. Translation: AAA41448.1. U38653 mRNA. Translation: AAC53099.1. U38812 mRNA. Translation: AAC53100.1. U38665 mRNA. Translation: AAB51330.1. | ||||||||||||||||||||||||
| IPI | IPI00230873. IPI00230877. IPI00230879. IPI00230881. IPI00944825. IPI00947857. IPI00949472. IPI00950591. | ||||||||||||||||||||||||
| PIR | A36579. B36579. | ||||||||||||||||||||||||
| RefSeq | NP_001257526.1. NM_001270597.1. | ||||||||||||||||||||||||
| UniGene | Rn.170703. Rn.2135. | ||||||||||||||||||||||||
3D structure databases | |||||||||||||||||||||||||
| PDBe RCSB PDB PDBj |
| ||||||||||||||||||||||||
| ProteinModelPortal | P29994. | ||||||||||||||||||||||||
| SMR | P29994. Positions 7-225, 236-602. | ||||||||||||||||||||||||
| ModBase | Search... | ||||||||||||||||||||||||
Protein-protein interaction databases | |||||||||||||||||||||||||
| DIP | DIP-29715N. | ||||||||||||||||||||||||
PTM databases | |||||||||||||||||||||||||
| PhosphoSite | P29994. | ||||||||||||||||||||||||
Proteomic databases | |||||||||||||||||||||||||
| PaxDb | P29994. | ||||||||||||||||||||||||
| PRIDE | P29994. | ||||||||||||||||||||||||
Protocols and materials databases | |||||||||||||||||||||||||
| StructuralBiologyKnowledgebase | Search... | ||||||||||||||||||||||||
Genome annotation databases | |||||||||||||||||||||||||
| GeneID | 25262. | ||||||||||||||||||||||||
| KEGG | rno:25262. | ||||||||||||||||||||||||
Organism-specific databases | |||||||||||||||||||||||||
| CTD | 3708. | ||||||||||||||||||||||||
| RGD | 2933. Itpr1. | ||||||||||||||||||||||||
Phylogenomic databases | |||||||||||||||||||||||||
| eggNOG | NOG280601. | ||||||||||||||||||||||||
| HOGENOM | HOG000007660. | ||||||||||||||||||||||||
| HOVERGEN | HBG052158. | ||||||||||||||||||||||||
| InParanoid | P29994. | ||||||||||||||||||||||||
| KO | K04958. | ||||||||||||||||||||||||
Enzyme and pathway databases | |||||||||||||||||||||||||
| Reactome | REACT_109781. Immune System. REACT_110573. Disease. REACT_111984. Signal Transduction. REACT_113568. Metabolism. | ||||||||||||||||||||||||
Gene expression databases | |||||||||||||||||||||||||
| ArrayExpress | P29994. | ||||||||||||||||||||||||
| Genevestigator | P29994. | ||||||||||||||||||||||||
| GermOnline | ENSRNOG00000007104. Rattus norvegicus. | ||||||||||||||||||||||||
Family and domain databases | |||||||||||||||||||||||||
| InterPro | IPR000699. Ca-rel_channel. IPR014821. Ins145_P3_rcpt. IPR000493. InsP3_rcpt-bd. IPR005821. Ion_trans_dom. IPR016093. MIR_motif. IPR013662. RIH_assoc-dom. IPR015925. Ryanodine_recept-rel. [Graphical view] | ||||||||||||||||||||||||
| PANTHER | PTHR13715. PTHR13715. 1 hit. | ||||||||||||||||||||||||
| Pfam | PF08709. Ins145_P3_rec. 1 hit. PF00520. Ion_trans. 1 hit. PF02815. MIR. 1 hit. PF08454. RIH_assoc. 1 hit. PF01365. RYDR_ITPR. 2 hits. [Graphical view] | ||||||||||||||||||||||||
| PRINTS | PR00779. INSP3RECEPTR. | ||||||||||||||||||||||||
| SMART | SM00472. MIR. 4 hits. [Graphical view] | ||||||||||||||||||||||||
| SUPFAM | SSF82109. MIR. 2 hits. | ||||||||||||||||||||||||
| PROSITE | PS50919. MIR. 5 hits. [Graphical view] | ||||||||||||||||||||||||
| ProtoNet | Search... | ||||||||||||||||||||||||
Other | |||||||||||||||||||||||||
| BindingDB | P29994. | ||||||||||||||||||||||||
| ChEMBL | CHEMBL2804. | ||||||||||||||||||||||||
| NextBio | 605915. | ||||||||||||||||||||||||
Entry information
| Entry name | ITPR1_RAT | ||||||||
| Accession | Primary (citable) accession number: P29994 Secondary accession number(s): Q62869 | ||||||||
| Entry history |
| ||||||||
| Entry status | Reviewed (UniProtKB/Swiss-Prot) | ||||||||
| Annotation program | Chordata Protein Annotation Program | ||||||||
Relevant documents
| PDB cross-references Index of Protein Data Bank (PDB) cross-references |
| SIMILARITY comments Index of protein domains and families |

Clusters with
