P29029 (CHIT_YEAST) Reviewed, UniProtKB/Swiss-Prot
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December 14, 2011.
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Names·Attributes·General annotation·Ontologies·Sequence annotation·Sequences·References·Cross-refs·Entry info·DocumentsCustomize orderNames and origin
| Protein names | Recommended name: Endochitinase EC=3.2.1.14 Alternative name(s): Soluble cell wall protein 2 | ||||||||
| Gene names |
| ||||||||
| Organism | Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c) (Baker's yeast) | ||||||||
| Taxonomic identifier | 559292 [NCBI] | ||||||||
| Taxonomic lineage | Eukaryota › Fungi › Dikarya › Ascomycota › Saccharomycotina › Saccharomycetes › Saccharomycetales › Saccharomycetaceae › Saccharomyces |
Protein attributes
| Sequence length | 562 AA. |
| Sequence status | Complete. |
| Sequence processing | The displayed sequence is further processed into a mature form. |
| Protein existence | Evidence at protein level |
General annotation (Comments)
| Function | Chitinase is required for cell separation during growth of Saccharomyces cerevisiae. |
| Catalytic activity | Random hydrolysis of N-acetyl-beta-D-glucosaminide (1->4)-beta-linkages in chitin and chitodextrins. |
| Subcellular location | Secreted. Secreted › cell wall. Note: Most of the enzyme is secreted, but a significant amount of chitinase is also found associated with the cell wall through binding of C-terminal domain to chitin. Ref.5 |
| Post-translational modification | Extensively glycosylated with a series of short O-linked mannose oligosaccharides ranging in size from Man2 to Man5. |
| Miscellaneous | Present with 6350 molecules/cell in log phase SD medium. Ref.6 |
| Sequence similarities | Belongs to the glycosyl hydrolase 18 family. Chitinase class II subfamily. |
Ontologies
Sequence annotation (Features)
| Feature key | Position(s) | Length | Description | Graphical view | Feature identifier | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule processing | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Signal peptide | 1 – 20 | 20 | Ref.1 Ref.5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Chain | 21 – 562 | 542 | Endochitinase | PRO_0000011936 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Regions | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Region | 21 – 327 | 307 | Catalytic | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Region | 481 – 562 | 82 | Chitin-binding, high affinity | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Compositional bias | 328 – 480 | 153 | Ser/Thr-rich | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sites | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Active site | 157 | 1 | Proton donor By similarity | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Amino acid modifications | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Glycosylation | 553 | 1 | N-linked (GlcNAc...) Potential | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Natural variations | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 16 | 1 | L → P in strain: DBY939. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 23 | 1 | R → S in strain: DBY939 and SEY6210. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 321 | 1 | T → S in strain: DBY939. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 336 – 340 | 5 | Missing in strain: DBY939. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 399 | 1 | S → A in strain: DBY939. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 433 – 434 | 2 | PI → SL in strain: DBY939. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 461 | 1 | T → K in strain: DBY939. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 477 – 481 | 5 | Missing in strain: DBY939. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Experimental info | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence conflict | 168 | 1 | A → R in AAA34539. Ref.1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence conflict | 168 | 1 | A → R in AAA34538. Ref.1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Secondary structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Helix Strand Turn | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 28 – 35 | 8 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 44 – 48 | 5 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 50 – 52 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 54 – 64 | 11 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 65 – 67 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 72 – 74 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 87 – 98 | 12 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 102 – 108 | 7 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 119 – 133 | 15 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 143 – 146 | 4 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 150 – 155 | 6 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 164 – 175 | 12 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 178 – 180 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 183 – 186 | 4 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 189 – 193 | 5 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 195 – 197 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 198 – 203 | 6 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 207 – 212 | 6 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 214 – 216 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 226 – 235 | 10 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 243 – 251 | 9 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 254 – 257 | 4 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 263 – 273 | 11 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 279 – 285 | 7 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 287 – 292 | 6 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 300 – 311 | 12 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequences
| ||||||||||||||||||
References
| « Hide 'large scale' references | |
| [1] | "Chitinase is required for cell separation during growth of Saccharomyces cerevisiae." Kuranda M.J., Robbins P.W. J. Biol. Chem. 266:19758-19767(1991) [PubMed: 1918080] [Abstract] Cited for: NUCLEOTIDE SEQUENCE [GENOMIC DNA], PROTEIN SEQUENCE OF 21-38. Strain: DBY918 and DBY939. |
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| + | Additional computationally mapped references. |
Cross-references
Sequence databases | |||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| EMBL GenBank DDBJ | M74070 Genomic DNA. Translation: AAA34539.1. M74069 Genomic DNA. Translation: AAA34538.1. U17243 Genomic DNA. Translation: AAB67331.1. AY693040 Genomic DNA. Translation: AAT93059.1. BK006945 Genomic DNA. Translation: DAA09597.1. | ||||||||||||||||||||||||||||||
| PIR | A41035. B41035. S50371. | ||||||||||||||||||||||||||||||
| RefSeq | NP_013388.1. NM_001182173.1. | ||||||||||||||||||||||||||||||
3D structure databases | |||||||||||||||||||||||||||||||
| PDBe RCSB PDB PDBj |
| ||||||||||||||||||||||||||||||
| ProteinModelPortal | P29029. | ||||||||||||||||||||||||||||||
| SMR | P29029. Positions 25-312. | ||||||||||||||||||||||||||||||
| ModBase | Search... | ||||||||||||||||||||||||||||||
Protein-protein interaction databases | |||||||||||||||||||||||||||||||
| STRING | P29029. | ||||||||||||||||||||||||||||||
Protein family/group databases | |||||||||||||||||||||||||||||||
| CAZy | CBM19. Carbohydrate-Binding Module Family 19. GH18. Glycoside Hydrolase Family 18. | ||||||||||||||||||||||||||||||
Proteomic databases | |||||||||||||||||||||||||||||||
| PeptideAtlas | P29029. | ||||||||||||||||||||||||||||||
Protocols and materials databases | |||||||||||||||||||||||||||||||
| StructuralBiologyKnowledgebase | Search... | ||||||||||||||||||||||||||||||
Genome annotation databases | |||||||||||||||||||||||||||||||
| EnsemblFungi | YLR286C; YLR286C; YLR286C. | ||||||||||||||||||||||||||||||
| GeneID | 850992. | ||||||||||||||||||||||||||||||
| KEGG | sce:YLR286C. | ||||||||||||||||||||||||||||||
| NMPDR | fig|4932.3.peg.4404. | ||||||||||||||||||||||||||||||
Organism-specific databases | |||||||||||||||||||||||||||||||
| CYGD | YLR286c. | ||||||||||||||||||||||||||||||
| SGD | S000004276. CTS1. | ||||||||||||||||||||||||||||||
Phylogenomic databases | |||||||||||||||||||||||||||||||
| eggNOG | fuNOG05730. | ||||||||||||||||||||||||||||||
| GeneTree | EFGT00050000000133. | ||||||||||||||||||||||||||||||
| HOGENOM | HBG588556. | ||||||||||||||||||||||||||||||
| OMA | YWGQNSA. | ||||||||||||||||||||||||||||||
| OrthoDB | EOG40KC7X. | ||||||||||||||||||||||||||||||
Gene expression databases | |||||||||||||||||||||||||||||||
| ArrayExpress | P29029. | ||||||||||||||||||||||||||||||
| Genevestigator | P29029. | ||||||||||||||||||||||||||||||
| GermOnline | YLR286C. Saccharomyces cerevisiae. | ||||||||||||||||||||||||||||||
Family and domain databases | |||||||||||||||||||||||||||||||
| InterPro | IPR005089. CBM_fam19. IPR001579. Glyco_hydro_18_chit_AS. IPR013781. Glyco_hydro_subgr_catalytic. IPR017853. Glycoside_hydrolase_SF. [Graphical view] | ||||||||||||||||||||||||||||||
| Gene3D | G3DSA:3.20.20.80. Glyco_hydro_cat. 1 hit. | ||||||||||||||||||||||||||||||
| KO | K01183. | ||||||||||||||||||||||||||||||
| Pfam | PF03427. CBM_19. 1 hit. [Graphical view] | ||||||||||||||||||||||||||||||
| SUPFAM | SSF51445. Glyco_hydro_cat. 1 hit. | ||||||||||||||||||||||||||||||
| PROSITE | PS01095. CHITINASE_18. 1 hit. [Graphical view] | ||||||||||||||||||||||||||||||
| ProtoNet | Search... | ||||||||||||||||||||||||||||||
Other | |||||||||||||||||||||||||||||||
| NextBio | 967519. | ||||||||||||||||||||||||||||||
Entry information
| Entry name | CHIT_YEAST | ||||||||
| Accession | Primary (citable) accession number: P29029 Secondary accession number(s): D6VYT1, P29028 | ||||||||
| Entry history |
| ||||||||
| Entry status | Reviewed (UniProtKB/Swiss-Prot) | ||||||||
| Annotation program | Fungal Protein Annotation Program | ||||||||
Relevant documents
| Yeast Yeast (Saccharomyces cerevisiae): entries, gene names and cross-references to SGD |
| Glycosyl hydrolases Classification of glycosyl hydrolase families and list of entries |
| PDB cross-references Index of Protein Data Bank (PDB) cross-references |
| SIMILARITY comments Index of protein domains and families |

Clusters with