P28329 (CLAT_HUMAN) Reviewed, UniProtKB/Swiss-Prot
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January 25, 2012.
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| Protein names | Recommended name: Choline O-acetyltransferase Short name=CHOACTase Short name=ChAT Short name=Choline acetylase EC=2.3.1.6 | ||
| Gene names |
| ||
| Organism | Homo sapiens (Human) | ||
| Taxonomic identifier | 9606 [NCBI] | ||
| Taxonomic lineage | Eukaryota › Metazoa › Chordata › Craniata › Vertebrata › Euteleostomi › Mammalia › Eutheria › Euarchontoglires › Primates › Haplorrhini › Catarrhini › Hominidae › Homo |
Protein attributes
| Sequence length | 748 AA. |
| Sequence status | Complete. |
| Protein existence | Evidence at protein level |
General annotation (Comments)
| Function | Catalyzes the reversible synthesis of acetylcholine (ACh) from acetyl CoA and choline at cholinergic synapses. |
| Catalytic activity | Acetyl-CoA + choline = CoA + O-acetylcholine. |
| Involvement in disease | Defects in CHAT are the cause of congenital myasthenic syndrome with episodic apnea (CMSEA) [MIM:254210]; formerly known as familial infantile myasthenia gravis 2 (FIMG2). CMSEA is an autosomal recessive congenital myasthenic syndrome. Patients have myasthenic symptoms since birth or early infancy, negative tests for anti-AChR antibodies, and abrupt episodic crises with increased weakness, bulbar paralysis, and apnea precipitated by undue exertion, fever, or excitement. Ref.2 Ref.11 |
| Sequence similarities | Belongs to the carnitine/choline acetyltransferase family. |
Ontologies
| Keywords | |
|---|---|
| Biological process | Neurotransmitter biosynthesis |
| Coding sequence diversity | Alternative splicing Polymorphism |
| Disease | Congenital myasthenic syndrome Disease mutation |
| Molecular function | Acyltransferase Transferase |
| Technical term | 3D-structure Complete proteome Direct protein sequencing Reference proteome |
| Gene Ontology (GO) | |
| Biological process | neurotransmitter secretion Traceable author statement. Source: Reactome |
| Cellular component | cytosol Traceable author statement. Source: Reactome nucleusTraceable author statement. Source: ProtInc |
| Molecular function | choline O-acetyltransferase activity Inferred from electronic annotation. Source: EC |
| Complete GO annotation... | |
Alternative products
| This entry describes 3 isoforms produced by alternative splicing. [Align] [Select] | ||||||
| Isoform M (identifier: P28329-1) Also known as: 83 kDa; This isoform has been chosen as the 'canonical' sequence. All positional information in this entry refers to it. This is also the sequence that appears in the downloadable versions of the entry. | ||||||
| Isoform S (identifier: P28329-2) Also known as: 74 kDa; The sequence of this isoform differs from the canonical sequence as follows: 1-95: MGLRTAKKRG...SAEAAEPRRA → MWPECRDEALSTV | ||||||
| Isoform R (identifier: P28329-3) Also known as: 70 kDa; The sequence of this isoform differs from the canonical sequence as follows: 1-118: Missing. |
Sequence annotation (Features)
| Feature key | Position(s) | Length | Description | Graphical view | Feature identifier | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule processing | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Chain | 1 – 748 | 748 | Choline O-acetyltransferase | PRO_0000210154 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Regions | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Region | 520 – 532 | 13 | Coenzyme A binding | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sites | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Active site | 442 | 1 | Proton acceptor | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Binding site | 558 | 1 | Coenzyme A | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Binding site | 659 | 1 | Coenzyme A | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Natural variations | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Alternative sequence | 1 – 118 | 118 | Missing in isoform R. | VSP_000791 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Alternative sequence | 1 – 95 | 95 | MGLRT…EPRRA → MWPECRDEALSTV in isoform S. | VSP_000790 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 47 | 1 | D → E. Corresponds to variant rs3810948 [ dbSNP | Ensembl ]. | VAR_046683 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 120 | 1 | A → T. Ref.2 Ref.6 Corresponds to variant rs3810950 [ dbSNP | Ensembl ]. | VAR_011675 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 210 | 1 | L → P in CMSEA; impaired activity. Ref.2 Corresponds to variant rs28930071 [ dbSNP | Ensembl ]. | VAR_011666 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 211 | 1 | P → A in CMSEA; impaired activity. Ref.2 | VAR_011667 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 222 | 1 | R → P. Corresponds to variant rs8178989 [ dbSNP | Ensembl ]. | VAR_046684 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 243 | 1 | L → F. Corresponds to variant rs8178990 [ dbSNP | Ensembl ]. | VAR_046685 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 299 | 1 | P → L. Corresponds to variant rs868749 [ dbSNP | Ensembl ]. | VAR_046686 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 305 | 1 | I → T in CMSEA; impaired activity. Ref.2 Corresponds to variant rs28929482 [ dbSNP | Ensembl ]. | VAR_011668 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 336 | 1 | I → T in CMSEA. Ref.11 | VAR_038605 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 392 | 1 | A → G. Ref.1 Ref.2 | VAR_011676 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 400 | 1 | D → N. Corresponds to variant rs8178991 [ dbSNP | Ensembl ]. | VAR_046687 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 420 | 1 | R → C in CMSEA; impaired activity. Ref.2 | VAR_011669 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 441 | 1 | E → K in CMSEA; completely lack activity. Ref.2 Corresponds to variant rs28930070 [ dbSNP | Ensembl ]. | VAR_011670 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 461 | 1 | V → M. Ref.1 Ref.2 Ref.6 Corresponds to variant rs4838544 [ dbSNP | Ensembl ]. | VAR_046688 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 482 | 1 | R → G in CMSEA; impaired activity. Ref.2 Corresponds to variant rs28929481 [ dbSNP | Ensembl ]. | VAR_011671 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 498 | 1 | S → L in CMSEA; impaired activity. Ref.2 | VAR_011672 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 506 | 1 | V → L in CMSEA; impaired activity. Ref.2 | VAR_011673 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 560 | 1 | R → H in CMSEA; impaired activity. Ref.2 | VAR_011674 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Experimental info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence conflict | 151 | 1 | R → Q in CAA39923. Ref.7 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence conflict | 261 – 262 | 2 | GQ → PE in AAA14245. Ref.1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence conflict | 396 | 1 | V → L in AAB23557. Ref.6 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence conflict | 434 | 1 | G → A in AAA14245. Ref.1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence conflict | 529 | 1 | C → S in AAB23557. Ref.6 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence conflict | 567 | 1 | V → L in AAB23557. Ref.6 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence conflict | 629 – 630 | 2 | EL → DV in AAB23557. Ref.6 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence conflict | 664 | 1 | T → M in AAB23557. Ref.6 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Helix Strand Turn | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 139 – 150 | 12 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 151 – 153 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 156 – 169 | 14 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 175 – 189 | 15 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 195 – 202 | 8 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 203 – 205 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 210 – 213 | 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 217 – 219 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 228 – 250 | 23 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 271 – 275 | 5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 276 – 282 | 7 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 285 – 287 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 289 – 292 | 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 300 – 308 | 9 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 311 – 319 | 9 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 326 – 340 | 15 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 343 – 345 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 350 – 355 | 6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 358 – 369 | 12 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 372 – 382 | 11 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 387 – 390 | 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 400 – 409 | 10 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 413 – 418 | 6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 424 – 430 | 7 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 436 – 440 | 5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 447 – 461 | 15 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 489 – 508 | 20 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 509 – 516 | 8 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 521 – 525 | 5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 526 – 528 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 531 – 547 | 17 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 553 – 558 | 6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 567 – 569 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 575 – 585 | 11 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 587 – 589 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 593 – 615 | 23 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 621 – 634 | 14 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 640 – 643 | 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 645 – 650 | 6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 654 – 659 | 6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 663 – 665 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 667 – 669 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 678 – 684 | 7 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 689 – 696 | 8 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 704 – 722 | 19 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequences
| ||||||||||||||||||||||||||||||
References
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| [1] | "A complementary DNA for human choline acetyltransferase induces two forms of enzyme with different molecular weights in cultured cells." Oda Y., Nakanishi I., Deguchi T. Brain Res. Mol. Brain Res. 16:287-294(1992) [PubMed: 1337937] [Abstract] Cited for: NUCLEOTIDE SEQUENCE [MRNA], VARIANTS GLY-392 AND MET-461. Tissue: Spinal cord. |
| [2] | "Choline acetyltransferase mutations cause myasthenic syndrome associated with episodic apnea in humans." Ohno K., Tsujino A., Brengman J.M., Harper C.M., Bajzer Z., Udd B., Beyring R., Robb S., Kirkham F.J., Engel A.G. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 98:2017-2022(2001) [PubMed: 11172068] [Abstract] Cited for: NUCLEOTIDE SEQUENCE [GENOMIC DNA / MRNA], ALTERNATIVE SPLICING, VARIANTS CMSEA PRO-210; ALA-211; THR-305; CYS-420; LYS-441; GLY-482; LEU-498; LEU-506 AND HIS-560, VARIANTS THR-120; GLY-392 AND MET-461. |
| [3] | "The DNA sequence and comparative analysis of human chromosome 10." Deloukas P., Earthrowl M.E., Grafham D.V., Rubenfield M., French L., Steward C.A., Sims S.K., Jones M.C., Searle S., Scott C., Howe K., Hunt S.E., Andrews T.D., Gilbert J.G.R., Swarbreck D., Ashurst J.L., Taylor A., Battles J. Rogers J.Nature 429:375-381(2004) [PubMed: 15164054] [Abstract] Cited for: NUCLEOTIDE SEQUENCE [LARGE SCALE GENOMIC DNA]. |
| [4] | Mural R.J., Istrail S., Sutton G.G., Florea L., Halpern A.L., Mobarry C.M., Lippert R., Walenz B., Shatkay H., Dew I., Miller J.R., Flanigan M.J., Edwards N.J., Bolanos R., Fasulo D., Halldorsson B.V., Hannenhalli S., Turner R. Venter J.C.Submitted (SEP-2005) to the EMBL/GenBank/DDBJ databases Cited for: NUCLEOTIDE SEQUENCE [LARGE SCALE GENOMIC DNA]. |
| [5] | "The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC)." The MGC Project Team Genome Res. 14:2121-2127(2004) [PubMed: 15489334] [Abstract] Cited for: NUCLEOTIDE SEQUENCE [LARGE SCALE MRNA] (ISOFORM R). |
| [6] | "Two mRNAs are transcribed from the human gene for choline acetyltransferase." Lorenzi M.V., Trinidad A.C., Zhang R., Strauss W.L. DNA Cell Biol. 11:593-603(1992) [PubMed: 1388731] [Abstract] Cited for: NUCLEOTIDE SEQUENCE [MRNA] OF 111-669, VARIANTS THR-120 AND MET-461. |
| [7] | "Human choline acetyltransferase (CHAT): partial gene sequence and potential control regions." Toussaint J.L., Geoffroy V., Schmitt M., Werner A., Garnier J.-M., Simoni P., Kempf J. Genomics 12:412-416(1992) [PubMed: 1339386] [Abstract] Cited for: NUCLEOTIDE SEQUENCE [GENOMIC DNA] OF 109-232. |
| [8] | "Conservation of amino acid sequences between human and porcine choline acetyltransferase." Hersh L.B., Takane K., Gylys K., Moomaw C., Slaughter C. J. Neurochem. 51:1843-1845(1988) [PubMed: 3183663] [Abstract] Cited for: PROTEIN SEQUENCE OF 161-182; 271-295; 340-352; 376-382; 404-415; 550-559; 572-583; 620-632; 644-648; 650-662 AND 739-748. Tissue: Placenta. |
| [9] | "Isolation and sub-chromosomal localization of a DNA fragment of the human choline acetyltransferase gene." Cervini R., Rocchi M., DiDonato S., Finocchiaro G. Neurosci. Lett. 132:191-194(1991) [PubMed: 1784419] [Abstract] Cited for: NUCLEOTIDE SEQUENCE [GENOMIC DNA] OF 688-738. Tissue: Lymphocyte. |
| [10] | "Substrate binding and catalytic mechanism of human choline acetyltransferase." Kim A.-R., Rylett R.J., Shilton B.H. Biochemistry 45:14621-14631(2006) [PubMed: 17144655] [Abstract] Cited for: X-RAY CRYSTALLOGRAPHY (2.3 ANGSTROMS) OF 120-733 IN COMPLEXES WITH CHOLINE AND ACETYL COENZYME A. |
| [11] | "Congenital myasthenic syndrome with episodic apnea in patients homozygous for a CHAT missense mutation." Kraner S., Laufenberg I., Strassburg H.M., Sieb J.P., Steinlein O.K. Arch. Neurol. 60:761-763(2003) [PubMed: 12756141] [Abstract] Cited for: VARIANT CMSEA THR-336. |
| + | Additional computationally mapped references. |
Web resources
| GeneReviews |
| Wikipedia Choline acetyltransferase entry |
Cross-references
Sequence databases | |||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| EMBL GenBank DDBJ | S56138 mRNA. Translation: AAA14245.1. AF305907 mRNA. Translation: AAK08953.1. AF305906 AF305905 Genomic DNA. Translation: AAK08950.1.AF305908 mRNA. Translation: AAK08954.1. AF305906 AF305905 Genomic DNA. Translation: AAK08951.1.AF305909 mRNA. Translation: AAK08955.1. AF305906 AF305905 Genomic DNA. Translation: AAK08952.1.AC073366 Genomic DNA. No translation available. CH471187 Genomic DNA. Translation: EAW93086.1. BC130615 mRNA. Translation: AAI30616.1. S45018 mRNA. Translation: AAB23557.2. X56585 Genomic DNA. Translation: CAA39923.1. X56879 Genomic DNA. Translation: CAA40201.1. | ||||||||||||||||||||||||||||||
| IPI | IPI00220707. IPI00220708. IPI00305227. | ||||||||||||||||||||||||||||||
| PIR | A60202. I52631. | ||||||||||||||||||||||||||||||
| RefSeq | NP_001136401.1. NM_001142929.1. NP_001136405.1. NM_001142933.1. NP_001136406.1. NM_001142934.1. NP_065574.3. NM_020549.4. NP_066264.3. NM_020984.3. NP_066265.3. NM_020985.3. NP_066266.3. NM_020986.3. | ||||||||||||||||||||||||||||||
| UniGene | Hs.302002. | ||||||||||||||||||||||||||||||
3D structure databases | |||||||||||||||||||||||||||||||
| PDBe RCSB PDB PDBj |
| ||||||||||||||||||||||||||||||
| ProteinModelPortal | P28329. | ||||||||||||||||||||||||||||||
| SMR | P28329. Positions 126-727. | ||||||||||||||||||||||||||||||
| ModBase | Search... | ||||||||||||||||||||||||||||||
Protein-protein interaction databases | |||||||||||||||||||||||||||||||
| STRING | P28329. | ||||||||||||||||||||||||||||||
PTM databases | |||||||||||||||||||||||||||||||
| PhosphoSite | P28329. | ||||||||||||||||||||||||||||||
Polymorphism databases | |||||||||||||||||||||||||||||||
| DMDM | 281185509. | ||||||||||||||||||||||||||||||
Proteomic databases | |||||||||||||||||||||||||||||||
| PRIDE | P28329. | ||||||||||||||||||||||||||||||
Protocols and materials databases | |||||||||||||||||||||||||||||||
| StructuralBiologyKnowledgebase | Search... | ||||||||||||||||||||||||||||||
Genome annotation databases | |||||||||||||||||||||||||||||||
| Ensembl | ENST00000337653; ENSP00000337103; ENSG00000070748. | ||||||||||||||||||||||||||||||
| GeneID | 1103. | ||||||||||||||||||||||||||||||
| KEGG | hsa:1103. | ||||||||||||||||||||||||||||||
| UCSC | uc001jhv.1. human. uc001jhz.2. human. | ||||||||||||||||||||||||||||||
Organism-specific databases | |||||||||||||||||||||||||||||||
| CTD | 1103. | ||||||||||||||||||||||||||||||
| GeneCards | GC10P050817. | ||||||||||||||||||||||||||||||
| HGNC | HGNC:1912. CHAT. | ||||||||||||||||||||||||||||||
| HPA | CAB002313. | ||||||||||||||||||||||||||||||
| MIM | 118490. gene. 254210. phenotype. | ||||||||||||||||||||||||||||||
| neXtProt | NX_P28329. | ||||||||||||||||||||||||||||||
| Orphanet | 98914. Presynaptic congenital myasthenic syndromes. | ||||||||||||||||||||||||||||||
| PharmGKB | PA26448. | ||||||||||||||||||||||||||||||
| GenAtlas | Search... | ||||||||||||||||||||||||||||||
Phylogenomic databases | |||||||||||||||||||||||||||||||
| HOGENOM | HBG618916. | ||||||||||||||||||||||||||||||
| HOVERGEN | HBG107717. | ||||||||||||||||||||||||||||||
| InParanoid | P28329. | ||||||||||||||||||||||||||||||
| OMA | QAIVQRF. | ||||||||||||||||||||||||||||||
| PhylomeDB | P28329. | ||||||||||||||||||||||||||||||
Enzyme and pathway databases | |||||||||||||||||||||||||||||||
| Reactome | REACT_13685. Neuronal System. | ||||||||||||||||||||||||||||||
Gene expression databases | |||||||||||||||||||||||||||||||
| ArrayExpress | P28329. | ||||||||||||||||||||||||||||||
| Bgee | P28329. | ||||||||||||||||||||||||||||||
| CleanEx | HS_CHAT. | ||||||||||||||||||||||||||||||
| Genevestigator | P28329. | ||||||||||||||||||||||||||||||
| GermOnline | ENSG00000070748. Homo sapiens. | ||||||||||||||||||||||||||||||
Family and domain databases | |||||||||||||||||||||||||||||||
| InterPro | IPR000542. Carn_acyl_trans. [Graphical view] | ||||||||||||||||||||||||||||||
| KO | K00623. | ||||||||||||||||||||||||||||||
| PANTHER | PTHR22589. Carn_acyl_trans. 1 hit. | ||||||||||||||||||||||||||||||
| Pfam | PF00755. Carn_acyltransf. 1 hit. [Graphical view] | ||||||||||||||||||||||||||||||
| PROSITE | PS00439. ACYLTRANSF_C_1. 1 hit. PS00440. ACYLTRANSF_C_2. 1 hit. [Graphical view] | ||||||||||||||||||||||||||||||
| ProtoNet | Search... | ||||||||||||||||||||||||||||||
Other | |||||||||||||||||||||||||||||||
| DrugBank | DB00122. Choline. | ||||||||||||||||||||||||||||||
| NextBio | 4562. | ||||||||||||||||||||||||||||||
| SOURCE | Search... | ||||||||||||||||||||||||||||||
Entry information
| Entry name | CLAT_HUMAN | ||||||||
| Accession | Primary (citable) accession number: P28329 Secondary accession number(s): A2BDF4 Q9BQE1 | ||||||||
| Entry history |
| ||||||||
| Entry status | Reviewed (UniProtKB/Swiss-Prot) | ||||||||
| Annotation program | Chordata Protein Annotation Program | ||||||||
| Disclaimer | Any medical or genetic information present in this entry is provided for research, educational and informational purposes only. It is not in any way intended to be used as a substitute for professional medical advice, diagnosis, treatment or care. | ||||||||
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