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UniProtKB/Swiss-Prot P27051 (GUB_BACLI)
Last modified
November 24, 2009.
Version 67.
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90%,
50% identity |
Documents (3) |
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Names and origin
| Protein names | Recommended name: Beta-glucanase EC=3.2.1.73 Alternative name(s): Endo-beta-1,3-1,4 glucanase 1,3-1,4-beta-D-glucan 4-glucanohydrolase Lichenase | ||
| Gene names |
| ||
| Organism | Bacillus licheniformis | ||
| Taxonomic identifier | 1402 [NCBI] | ||
| Taxonomic lineage | Bacteria › Firmicutes › Bacillales › Bacillaceae › Bacillus |
Protein attributes
| Sequence length | 243 AA. |
| Sequence status | Complete. |
| Sequence processing | The displayed sequence is further processed into a mature form. |
| Protein existence | Evidence at protein level. |
General annotation (Comments)
| Catalytic activity | Hydrolysis of (1->4)-beta-D-glucosidic linkages in beta-D-glucans containing (1->3)- and (1->4)-bonds. |
| Miscellaneous | Beta-glucanases of Bacillus have a substrate range similar to lichenase of germinating barley. |
| Sequence similarities | Belongs to the glycosyl hydrolase 16 family. |
Ontologies
| Keywords | |
|---|---|
| Domain | Signal |
| Molecular function | Glycosidase Hydrolase |
| PTM | Disulfide bond |
| Technical term | 3D-structure |
| Gene Ontology (GO) | |
| Biological process | carbohydrate metabolic process Inferred from electronic annotation. Source: InterPro |
| Molecular function | licheninase activity Inferred from electronic annotation. Source: EC |
| Complete GO annotation... | |
Sequence annotation (Features)
| Feature key | Position(s) | Length | Description | Graphical view | Feature identifier | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule processing | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Signal peptide | 1 – 27 | 27 | Potential | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Chain | 28 – 243 | 216 | Beta-glucanase | PRO_0000011788 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sites | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Active site | 134 | 1 | Nucleophile | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Active site | 138 | 1 | Proton donor | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Amino acid modifications | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Disulfide bond | 61 ↔ 90 | Ref.5 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Experimental info | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Mutagenesis | 51 | 1 | D → N: 30% of wild-type activity. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Mutagenesis | 89 | 1 | D → N: 85% of wild-type activity. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Mutagenesis | 92 | 1 | E → Q: 3% of wild-type activity. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Mutagenesis | 105 | 1 | E → Q: 50% of wild-type activity. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Mutagenesis | 133 | 1 | D → N: 15% of wild-type activity. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Mutagenesis | 134 | 1 | E → Q: 0.2% of wild-type activity. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Mutagenesis | 136 | 1 | D → N: 0.5% of wild-type activity. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Mutagenesis | 138 | 1 | E → Q: Complete loss of activity. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Mutagenesis | 143 | 1 | D → N: 65% of wild-type activity. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Mutagenesis | 160 | 1 | E → Q: 15% of wild-type activity. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Mutagenesis | 168 | 1 | D → N: 60% of wild-type activity. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Mutagenesis | 179 | 1 | D → N: 80% of wild-type activity. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Mutagenesis | 190 | 1 | D → N: 70% of wild-type activity. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Mutagenesis | 219 | 1 | D → N: No change in activity. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence conflict | 232 | 1 | S → Y Ref.5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Secondary structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Helix Strand Turn | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 35 – 37 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 44 – 46 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 47 – 49 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 61 – 63 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 65 – 67 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 68 – 70 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 76 – 84 | 9 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 87 – 97 | 11 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 101 – 109 | 9 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 116 – 124 | 9 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 126 – 128 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 133 – 140 | 8 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 146 – 153 | 8 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 161 – 164 | 4 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 169 – 171 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 174 – 181 | 8 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 184 – 189 | 6 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 192 – 197 | 6 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 206 – 217 | 12 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 219 – 222 | 4 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 231 – 242 | 12 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequences
| ||||||||||||||||||
References
| [1] | "Molecular cloning, expression and nucleotide sequence of the endo-beta-1,3-1,4-D-glucanase gene from Bacillus licheniformis. Predictive structural analyses of the encoded polypeptide." Lloberas J., Perez-Pons J.A., Querol E. Eur. J. Biochem. 197:337-343(1991) [PubMed: 2026156] [Abstract] Cited for: NUCLEOTIDE SEQUENCE [GENOMIC DNA]. |
| [2] | Querol E. Submitted (JUL-1991) to the EMBL/GenBank/DDBJ databases Cited for: SEQUENCE REVISION. |
| [3] | "Essential catalytic role of Glu134 in endo-beta-1,3-1,4-D-glucan 4-glucanohydrolase from B. licheniformis as determined by site-directed mutagenesis." Planas A., Juncosa M., Lloberas J., Querol E. FEBS Lett. 308:141-145(1992) [PubMed: 1354172] [Abstract] Cited for: MUTAGENESIS. |
| [4] | "Identification of active site carboxylic residues in Bacillus licheniformis 1,3-1,4-beta-D-glucan 4-glucanohydrolase by site-directed mutagenesis." Juncosa M., Pons J., Dot T., Querol E., Planas A. J. Biol. Chem. 269:14530-14535(1994) [PubMed: 8182059] [Abstract] Cited for: MUTAGENESIS. |
| [5] | "Crystal structure of Bacillus licheniformis 1,3-1,4-beta-D-glucan 4-glucanohydrolase at 1.8-A resolution." Hahn M., Pons J., Planas A., Querol E., Heinemann U. FEBS Lett. 374:221-224(1995) [PubMed: 7589539] [Abstract] Cited for: X-RAY CRYSTALLOGRAPHY (1.8 ANGSTROMS), DISULFIDE BOND. |
Cross-references
Sequence databases | |||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| EMBL GenBank DDBJ | X57279 Genomic DNA. Translation: CAA40547.1. | ||||||||||||||||||
| PIR | S15388. | ||||||||||||||||||
3D structure databases | |||||||||||||||||||
| PDBe RCSB PDB PDBj |
| ||||||||||||||||||
| ModBase | Search... | ||||||||||||||||||
Protein family/group databases | |||||||||||||||||||
| CAZy | GH16. Glycoside Hydrolase Family 16. | ||||||||||||||||||
Enzyme and pathway databases | |||||||||||||||||||
| BRENDA | 3.2.1.73. 1017. | ||||||||||||||||||
Family and domain databases | |||||||||||||||||||
| InterPro | IPR008264. Beta_glucanase. IPR008985. ConA-like_lec_gl. IPR013320. ConA-like_subgrp. IPR000757. Glyco_hydro_16. IPR008263. Glycoside_hydrolase_16_AS. [Graphical view] | ||||||||||||||||||
| Gene3D | G3DSA:2.60.120.200. ConA_like_subgrp. 1 hit. | ||||||||||||||||||
| Pfam | PF00722. Glyco_hydro_16. 1 hit. [Graphical view] | ||||||||||||||||||
| PRINTS | PR00737. GLHYDRLASE16. | ||||||||||||||||||
| PROSITE | PS01034. GLYCOSYL_HYDROL_F16. 1 hit. [Graphical view] | ||||||||||||||||||
| ProtoNet | Search... | ||||||||||||||||||
Entry information
| Entry name | GUB_BACLI | ||||||||
| Accession | Primary (citable) accession number: P27051 | ||||||||
| Entry history |
| ||||||||
| Entry status | Reviewed (UniProtKB/Swiss-Prot) | ||||||||
| Annotation project | HAMAP (High-quality Automated and Manual Annotation of microbial Proteomes) | ||||||||
Relevant documents
| Glycosyl hydrolases Classification of glycosyl hydrolase families and list of entries |
| PDB cross-references Index of Protein Data Bank (PDB) cross-references |
| SIMILARITY comments Index of protein domains and families |

Clusters with


