P26239 (BCHI_RHOCB) Reviewed, UniProtKB/Swiss-Prot
Last modified
May 1, 2013.
Version 81.
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| Protein names | Recommended name: Magnesium-chelatase 38 kDa subunit EC=6.6.1.1 Alternative name(s): Mg-protoporphyrin IX chelatase | ||||
| Gene names |
| ||||
| Organism | Rhodobacter capsulatus (strain ATCC BAA-309 / NBRC 16581 / SB1003) [Complete proteome] [HAMAP] | ||||
| Taxonomic identifier | 272942 [NCBI] | ||||
| Taxonomic lineage | Bacteria › Proteobacteria › Alphaproteobacteria › Rhodobacterales › Rhodobacteraceae › Rhodobacter › ![]() |
Protein attributes
| Sequence length | 350 AA. |
| Sequence status | Complete. |
| Protein existence | Evidence at protein level |
General annotation (Comments)
| Function | Involved in bacteriochlorophyll biosynthesis; introduces a magnesium ion into protoporphyrin IX to yield Mg-protoporphyrin IX. |
| Catalytic activity | ATP + protoporphyrin IX + Mg2+ + H2O = ADP + phosphate + Mg-protoporphyrin IX + 2 H+. |
| Pathway | |
| Sequence similarities | Belongs to the Mg-chelatase subunits D/I family. |
Ontologies
| Keywords | |
|---|---|
| Biological process | Bacteriochlorophyll biosynthesis Chlorophyll biosynthesis Photosynthesis |
| Ligand | ATP-binding Nucleotide-binding |
| Molecular function | Ligase |
| Technical term | 3D-structure Complete proteome |
| Gene Ontology (GO) | |
| Biological_process | bacteriochlorophyll biosynthetic process Inferred from electronic annotation. Source: UniProtKB-UniPathway photosynthesisInferred from electronic annotation. Source: UniProtKB-KW |
| Molecular_function | ATP binding Inferred from electronic annotation. Source: UniProtKB-KW magnesium chelatase activityInferred from electronic annotation. Source: EC nucleoside-triphosphatase activityInferred from electronic annotation. Source: InterPro |
| Complete GO annotation... | |
Sequence annotation (Features)
| Feature key | Position(s) | Length | Description | Graphical view | Feature identifier | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule processing | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Chain | 1 – 350 | 350 | Magnesium-chelatase 38 kDa subunit | PRO_0000206859 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Regions | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Nucleotide binding | 52 – 59 | 8 | ATP Potential | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Secondary structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Helix Strand Turn | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 23 – 25 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 30 – 41 | 12 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 43 – 45 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 48 – 51 | 4 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 54 – 56 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 60 – 68 | 9 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 72 – 75 | 4 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 85 – 87 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 99 – 102 | 4 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 106 – 109 | 4 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 115 – 119 | 5 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 124 – 130 | 7 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 132 – 134 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 139 – 143 | 5 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 146 – 150 | 5 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 153 – 155 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 158 – 170 | 13 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 171 – 175 | 5 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 182 – 185 | 4 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 188 – 194 | 7 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 203 – 206 | 4 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 210 – 214 | 5 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 221 – 236 | 16 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 238 – 262 | 25 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 263 – 265 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 270 – 282 | 13 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 283 – 285 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 288 – 304 | 17 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 312 – 323 | 12 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 324 – 326 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 342 – 348 | 7 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequences
| ||||||||||||||||||
References
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| [1] | Burke D.H., Alberti M., Armstrong G.A., Hearst J.E. Submitted (NOV-1991) to the EMBL/GenBank/DDBJ databases Cited for: NUCLEOTIDE SEQUENCE [GENOMIC DNA]. Strain: ATCC BAA-309 / NBRC 16581 / SB1003. |
| [2] | "Nucleotide sequence, organization, and nature of the protein products of the carotenoid biosynthesis gene cluster of Rhodobacter capsulatus." Armstrong G.A., Alberti M., Leach F., Hearst J.E. Mol. Gen. Genet. 216:254-268(1989) [PubMed] [Europe PMC] [Abstract] Cited for: NUCLEOTIDE SEQUENCE [GENOMIC DNA]. Strain: ATCC BAA-309 / NBRC 16581 / SB1003. |
| [3] | "Complete genome sequence of the photosynthetic purple nonsulfur bacterium Rhodobacter capsulatus SB 1003." Strnad H., Lapidus A., Paces J., Ulbrich P., Vlcek C., Paces V., Haselkorn R. J. Bacteriol. 192:3545-3546(2010) [PubMed] [Europe PMC] [Abstract] Cited for: NUCLEOTIDE SEQUENCE [LARGE SCALE GENOMIC DNA]. Strain: ATCC BAA-309 / NBRC 16581 / SB1003. |
| + | Additional computationally mapped references. |
Cross-references
Sequence databases | |||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| EMBL GenBank DDBJ | Z11165 Genomic DNA. Translation: CAA77538.1. CP001312 Genomic DNA. Translation: ADE84442.1. | ||||||||||||||||||
| RefSeq | YP_003576849.1. NC_014034.1. | ||||||||||||||||||
3D structure databases | |||||||||||||||||||
| PDBe RCSB PDB PDBj |
| ||||||||||||||||||
| ProteinModelPortal | P26239. | ||||||||||||||||||
| SMR | P26239. Positions 18-350. | ||||||||||||||||||
| ModBase | Search... | ||||||||||||||||||
Protein-protein interaction databases | |||||||||||||||||||
| DIP | DIP-58976N. | ||||||||||||||||||
Protocols and materials databases | |||||||||||||||||||
| StructuralBiologyKnowledgebase | Search... | ||||||||||||||||||
Genome annotation databases | |||||||||||||||||||
| EnsemblBacteria | ADE84442; ADE84442; RCAP_rcc00677. | ||||||||||||||||||
| GeneID | 9003506. | ||||||||||||||||||
| KEGG | rcp:RCAP_rcc00677. | ||||||||||||||||||
| PATRIC | 35501422. VBIRhoCap134200_0688. | ||||||||||||||||||
Organism-specific databases | |||||||||||||||||||
| CMR | Search... | ||||||||||||||||||
Phylogenomic databases | |||||||||||||||||||
| HOGENOM | HOG000225091. | ||||||||||||||||||
| KO | K03405. | ||||||||||||||||||
| OMA | PRGMAKS. | ||||||||||||||||||
Enzyme and pathway databases | |||||||||||||||||||
| BioCyc | RCAP272942:GJIY-690-MONOMER. | ||||||||||||||||||
| UniPathway | UPA00669. | ||||||||||||||||||
Family and domain databases | |||||||||||||||||||
| InterPro | IPR003593. AAA+_ATPase. IPR011775. Mg_chelatase_ATPase-isu. IPR000523. Mg_chelatse_chII. [Graphical view] | ||||||||||||||||||
| Pfam | PF01078. Mg_chelatase. 1 hit. [Graphical view] | ||||||||||||||||||
| SMART | SM00382. AAA. 1 hit. [Graphical view] | ||||||||||||||||||
| TIGRFAMs | TIGR02030. BchI-ChlI. 1 hit. | ||||||||||||||||||
| ProtoNet | Search... | ||||||||||||||||||
Other | |||||||||||||||||||
| EvolutionaryTrace | P26239. | ||||||||||||||||||
Entry information
| Entry name | BCHI_RHOCB | ||||||||
| Accession | Primary (citable) accession number: P26239 Secondary accession number(s): D5ANT8 | ||||||||
| Entry history |
| ||||||||
| Entry status | Reviewed (UniProtKB/Swiss-Prot) | ||||||||
| Annotation program | Prokaryotic Protein Annotation Program | ||||||||
Relevant documents
| PATHWAY comments Index of metabolic and biosynthesis pathways |
| PDB cross-references Index of Protein Data Bank (PDB) cross-references |
| SIMILARITY comments Index of protein domains and families |

Clusters with
