Reviewed,
UniProtKB/Swiss-Prot P22748 (CAH4_HUMAN)
Last modified
November 3, 2009.
Version 109.
History...
Clusters with 100%,
90%,
50% identity |
Documents (6) |
Third-party data |
Customize display | text xml rdf/xml gff fasta |
Names and origin
| Protein names | Recommended name: Carbonic anhydrase 4 EC=4.2.1.1 Alternative name(s): Carbonic anhydrase IV Short name=CA-IV Carbonate dehydratase IV | ||
| Gene names |
| ||
| Organism | Homo sapiens (Human) [Complete proteome] | ||
| Taxonomic identifier | 9606 [NCBI] | ||
| Taxonomic lineage | Eukaryota › Metazoa › Chordata › Craniata › Vertebrata › Euteleostomi › Mammalia › Eutheria › Euarchontoglires › Primates › Haplorrhini › Catarrhini › Hominidae › Homo |
Protein attributes
| Sequence length | 312 AA. |
| Sequence status | Complete. |
| Sequence processing | The displayed sequence is further processed into a mature form. |
| Protein existence | Evidence at protein level. |
General annotation (Comments)
| Function | Reversible hydration of carbon dioxide. May stimulate the sodium/bicarbonate transporter activity of SLC4A4. Ref.8 |
| Catalytic activity | H2CO3 = CO2 + H2O. |
| Cofactor | Zinc. |
| Enzyme regulation | Inhibited by acetazolamide. |
| Subunit structure | Interacts with SLC4A4. Ref.8 |
| Subcellular location | |
| Tissue specificity | Expressed in the endothelium of the choriocapillaris in eyes (at protein level). Ref.8 |
| Involvement in disease | Defects in CA4 are the cause of retinitis pigmentosa type 17 (RP17) [MIM:600852]. RP leads to degeneration of retinal photoreceptor cells. Patients typically have night vision blindness and loss of midperipheral visual field. As their condition progresses, they lose their far peripheral visual field and eventually central vision as well. RP17 inheritance is autosomal dominant. Ref.8 |
| Sequence similarities | Belongs to the alpha-carbonic anhydrase family. |
Ontologies
Sequence annotation (Features)
| Feature key | Position(s) | Length | Description | Graphical view | Feature identifier | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule processing | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Signal peptide | 1 – 18 | 18 | Ref.4 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Chain | 19 – 284 | 266 | Carbonic anhydrase 4 | PRO_0000004226 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Propeptide | 285 – 312 | 28 | Removed in mature form | PRO_0000004227 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sites | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Metal binding | 115 | 1 | Zinc; catalytic | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Metal binding | 117 | 1 | Zinc; catalytic | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Metal binding | 140 | 1 | Zinc; catalytic | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Amino acid modifications | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Lipidation | 284 | 1 | GPI-anchor amidated serine | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Disulfide bond | 24 ↔ 36 | Ref.5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Disulfide bond | 46 ↔ 229 | Ref.5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Natural variations | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 14 | 1 | R → W in RP17; abolishes interaction with SLC4A4. Impaired SLC4A4 cotransporter activity stimulation. Ref.8 | VAR_024749 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 219 | 1 | R → S in RP17; no catalytic activity. Impaired SLC4A4 cotransporter activity stimulation. Ref.8 | VAR_024750 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 237 | 1 | V → L: dbSNP rs2229178. | VAR_048680 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Experimental info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Mutagenesis | 284 | 1 | S → F: Loss of C-terminal domain removal and inactivation. Ref.6 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence conflict | 24 | 1 | C → E AA sequence Ref.4 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Helix Strand Turn | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 26 – 31 | 6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 39 – 41 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 44 – 47 | 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 48 – 50 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 58 – 60 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 61 – 63 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 70 – 74 | 5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 79 – 85 | 7 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 87 – 93 | 7 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 99 – 102 | 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 109 – 118 | 10 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 127 – 130 | 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 136 – 147 | 12 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 162 – 175 | 14 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 178 – 180 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 181 – 186 | 6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 187 – 189 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 196 – 202 | 7 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 204 – 206 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 211 – 215 | 5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 217 – 222 | 6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 233 – 240 | 8 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 242 – 245 | 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 246 – 255 | 10 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 257 – 259 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequences
| ||||||||||||||||||
References
| « Hide 'large scale' references | |
| [1] | "Human carbonic anhydrase IV: cDNA cloning, sequence comparison, and expression in COS cell membranes." Okuyama T., Sato S., Zhu X.L., Waheed A., Sly W.S. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 89:1315-1319(1992) [PubMed: 1311094] [Abstract] Cited for: NUCLEOTIDE SEQUENCE [MRNA]. |
| [2] | "Genomic organization and localization of gene for human carbonic anhydrase IV to chromosome 17q." Okuyama T., Batanian J.R., Sly W.S. Genomics 16:678-684(1993) [PubMed: 8325641] [Abstract] Cited for: NUCLEOTIDE SEQUENCE [GENOMIC DNA]. |
| [3] | "The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC)." The MGC Project Team Genome Res. 14:2121-2127(2004) [PubMed: 15489334] [Abstract] Cited for: NUCLEOTIDE SEQUENCE [LARGE SCALE MRNA]. Tissue: Brain and Placenta. |
| [4] | "Carbonic anhydrase IV from human lung. Purification, characterization, and comparison with membrane carbonic anhydrase from human kidney." Zhu X.L., Sly W.S. J. Biol. Chem. 265:8795-8801(1990) [PubMed: 2111324] [Abstract] Cited for: PROTEIN SEQUENCE OF 19-35; 113-123 AND 233-239. Tissue: Lung. |
| [5] | "Carbonic anhydrase IV: purification of a secretory form of the recombinant human enzyme and identification of the positions and importance of its disulfide bonds." Waheed A., Okuyama T., Heyduk T., Sly W.S. Arch. Biochem. Biophys. 333:432-438(1996) [PubMed: 8809084] [Abstract] Cited for: DISULFIDE BONDS. |
| [6] | "Carbonic anhydrase IV: role of removal of C-terminal domain in glycosylphosphatidylinositol anchoring and realization of enzyme activity." Okuyama T., Waheed A., Kusumoto W., Zhu X.L., Sly W.S. Arch. Biochem. Biophys. 320:315-322(1995) [PubMed: 7625839] [Abstract] Cited for: GPI-ANCHOR AT SER-284, MUTAGENESIS OF SER-284. |
| [7] | "Crystal structure of the secretory form of membrane-associated human carbonic anhydrase IV at 2.8-A resolution." Stams T., Nair S.K., Okuyama T., Waheed A., Sly W.S., Christianson D.W. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 93:13589-13594(1996) [PubMed: 8942978] [Abstract] Cited for: X-RAY CRYSTALLOGRAPHY (2.8 ANGSTROMS) OF 19-284. |
| [8] | "Mutant carbonic anhydrase 4 impairs pH regulation and causes retinal photoreceptor degeneration." Yang Z., Alvarez B.V., Chakarova C., Jiang L., Karan G., Frederick J.M., Zhao Y., Sauve Y., Li X., Zrenner E., Wissinger B., Den Hollander A.I., Katz B., Baehr W., Cremers F.P., Casey J.R., Bhattacharya S.S., Zhang K. Hum. Mol. Genet. 14:255-265(2005) [PubMed: 15563508] [Abstract] Cited for: VARIANTS RP17 TRP-14 AND SER-219, FUNCTION, TISSUE SPECIFICITY, INTERACTION WITH SLC4A4. |
| + | Additional computationally mapped references. |
Cross-references
Sequence databases | |||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| M83670 mRNA. Translation: AAA35630.1. L10955 L10954 Genomic DNA. Translation: AAA35625.1. Sequence problems.L10955, L10954 Genomic DNA. Translation: AAA35626.1. Sequence problems. BC057792 mRNA. Translation: AAH57792.1. BC069649 mRNA. Translation: AAH69649.1. BC074768 mRNA. Translation: AAH74768.1. | |||||||||||||||||||||||||
| IPI | IPI00027466. | ||||||||||||||||||||||||
| PIR | CRHU4. A45745. | ||||||||||||||||||||||||
| RefSeq | NP_000708.1. | ||||||||||||||||||||||||
| UniGene | Hs.89485 | ||||||||||||||||||||||||
3D structure databases | |||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||
| ModBase | Search... | ||||||||||||||||||||||||
Protein-protein interaction databases | |||||||||||||||||||||||||
| STRING | P22748. | ||||||||||||||||||||||||
Proteomic databases | |||||||||||||||||||||||||
| PRIDE | P22748. | ||||||||||||||||||||||||
Genome annotation databases | |||||||||||||||||||||||||
| Ensembl | ENST00000300900; ENSP00000300900; ENSG00000167434; Homo sapiens. [Genome view] ENST00000418816; ENSP00000405207; ENSG00000167434; Homo sapiens. [Genome view] | ||||||||||||||||||||||||
| GeneID | 762. | ||||||||||||||||||||||||
| KEGG | hsa:762. | ||||||||||||||||||||||||
| UCSC | uc002iym.2. human. | ||||||||||||||||||||||||
Organism-specific databases | |||||||||||||||||||||||||
| CTD | 762. | ||||||||||||||||||||||||
| GeneCards | GC17P055582. | ||||||||||||||||||||||||
| H-InvDB | HIX0039194. | ||||||||||||||||||||||||
| HGNC | HGNC:1375. CA4. | ||||||||||||||||||||||||
| HPA | HPA011089. HPA017258. | ||||||||||||||||||||||||
| MIM | 114760. gene. 600852. phenotype. | ||||||||||||||||||||||||
| Orphanet | 791. Retinitis pigmentosa. | ||||||||||||||||||||||||
| PharmGKB | PA24379. | ||||||||||||||||||||||||
| GenAtlas | Search... | ||||||||||||||||||||||||
Phylogenomic databases | |||||||||||||||||||||||||
| HOGENOM | P22748. | ||||||||||||||||||||||||
| HOVERGEN | P22748. | ||||||||||||||||||||||||
| OMA | EPIQLHR. | ||||||||||||||||||||||||
Enzyme and pathway databases | |||||||||||||||||||||||||
| BRENDA | 4.2.1.1. 247. | ||||||||||||||||||||||||
Gene expression databases | |||||||||||||||||||||||||
| ArrayExpress | P22748. | ||||||||||||||||||||||||
| Bgee | P22748. | ||||||||||||||||||||||||
| CleanEx | HS_CA4. | ||||||||||||||||||||||||
| Genevestigator | P22748. | ||||||||||||||||||||||||
| GermOnline | ENSG00000167434. Homo sapiens. | ||||||||||||||||||||||||
Family and domain databases | |||||||||||||||||||||||||
| InterPro | IPR001148. Carbonic_anhydrase_a-class_cat. IPR018338. Carbonic_anhydrase_a-class_CS. IPR018343. Carbonic_anhydrase_CA4. [Graphical view] | ||||||||||||||||||||||||
| Gene3D | G3DSA:3.10.200.10. Euk_COanhd. 1 hit. | ||||||||||||||||||||||||
| PANTHER | PTHR18952:SF5. Carbonic_anhydrase_CA4. 1 hit. PTHR18952. Euk_COanhd. 1 hit. | ||||||||||||||||||||||||
| Pfam | PF00194. Carb_anhydrase. 1 hit. [Graphical view] | ||||||||||||||||||||||||
| ProDom | PD000865. Euk_COanhd. 1 hit. [Graphical view] [Entries sharing at least one domain] | ||||||||||||||||||||||||
| PROSITE | PS00162. ALPHA_CA_1. 1 hit. PS51144. ALPHA_CA_2. 1 hit. [Graphical view] | ||||||||||||||||||||||||
| ProtoNet | Search... | ||||||||||||||||||||||||
Other Resources | |||||||||||||||||||||||||
| BindingDB | P22748. | ||||||||||||||||||||||||
| DrugBank | DB00436. Bendroflumethiazide. DB00562. Benzthiazide. DB00880. Chlorothiazide. DB00606. Cyclothiazide. DB01119. Diazoxide. DB00999. Hydrochlorothiazide. DB00774. Hydroflumethiazide. DB00232. Methyclothiazide. DB01325. Quinethazone. DB00273. Topiramate. DB01021. Trichlormethiazide. | ||||||||||||||||||||||||
| NextBio | 3082. | ||||||||||||||||||||||||
| SOURCE | Search... | ||||||||||||||||||||||||
Entry information
| Entry name | CAH4_HUMAN | ||||||||
| Accession | Primary (citable) accession number: P22748 | ||||||||
| Entry history |
| ||||||||
| Entry status | Reviewed (UniProtKB/Swiss-Prot) | ||||||||
| Annotation project | HPI (Human Proteome Initiative) | ||||||||
| Disclaimer | Any medical or genetic information present in this entry is provided for research, educational and informational purposes only. It is not in any way intended to be used as a substitute for professional medical advice, diagnosis, treatment or care. | ||||||||
Relevant documents
| Human chromosome 17 Human chromosome 17: entries, gene names and cross-references to MIM |
| Human entries with polymorphisms or disease mutations List of human entries with polymorphisms or disease mutations |
| Human polymorphisms and disease mutations Index of human polymorphisms and disease mutations |
| MIM cross-references Online Mendelian Inheritance in Man (MIM) cross-references in UniProtKB/Swiss-Prot |
| PDB cross-references Index of Protein Data Bank (PDB) cross-references |
| SIMILARITY comments Index of protein domains and families |

Clusters with


