Reviewed,
UniProtKB/Swiss-Prot P19424 (GUN_BACS6)
Last modified
June 16, 2009.
Version 75.
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Documents (3) |
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Names and origin · Protein attributes · General annotation (Comments) · Ontologies · Sequence annotation (Features) · Sequences · References · Cross-references · Entry information · Relevant documents
Names and origin
| Protein names | Recommended name: Endoglucanase EC=3.2.1.4 Alternative name(s): Endo-1,4-beta-glucanase Alkaline cellulase |
| Organism | Bacillus sp. (strain KSM-635) |
| Taxonomic identifier | 1415 [NCBI] |
| Taxonomic lineage | Bacteria › Firmicutes › Bacillales › Bacillaceae › Bacillus |
Protein attributes
| Sequence length | 941 AA. |
| Sequence status | Complete. |
| Sequence processing | The displayed sequence is further processed into a mature form. |
| Protein existence | Evidence at protein level. |
General annotation (Comments)
| Catalytic activity | Endohydrolysis of (1->4)-beta-D-glucosidic linkages in cellulose, lichenin and cereal beta-D-glucans. |
| Sequence similarities | Belongs to the glycosyl hydrolase 5 (cellulase A) family. Contains 3 SLH (S-layer homology) domains. |
Ontologies
| Keywords | |
|---|---|
| Biological process | Carbohydrate metabolism Cellulose degradation Polysaccharide degradation |
| Domain | Repeat Signal |
| Molecular function | Glycosidase Hydrolase |
| Technical term | 3D-structure Direct protein sequencing |
| Gene Ontology (GO) | |
| Biological process | cellulose catabolic process Inferred from electronic annotation. Source: UniProtKB-KW |
| Molecular function | cation binding Inferred from electronic annotation. Source: InterPro cellulase activityInferred from electronic annotation. Source: EC |
| Complete GO annotation... | |
Sequence annotation (Features)
| Feature key | Position(s) | Length | Description | Graphical view | Feature identifier | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule processing | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Signal peptide | 1 – 29 | 29 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Chain | 30 – 941 | 912 | Endoglucanase | PRO_0000007838 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Regions | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Domain | 37 – 94 | 58 | SLH 1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Domain | 95 – 158 | 64 | SLH 2 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Domain | 161 – 224 | 64 | SLH 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sites | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Active site | 373 | 1 | Proton donor | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Active site | 485 | 1 | Nucleophile | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Helix Strand Turn | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 232 – 235 | 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 239 – 243 | 5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 246 – 250 | 5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 260 – 265 | 6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 267 – 270 | 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 271 – 273 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 276 – 283 | 8 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 289 – 301 | 13 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 302 – 304 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 308 – 321 | 14 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 325 – 331 | 7 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 334 – 336 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 341 – 343 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 346 – 357 | 12 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 363 – 365 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 366 – 369 | 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 388 – 408 | 21 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 413 – 415 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 418 – 421 | 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 424 – 429 | 6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 433 – 444 | 12 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 445 – 447 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 461 – 463 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 467 – 476 | 10 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 481 – 490 | 10 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 491 – 493 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 499 – 511 | 13 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 516 – 521 | 6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 524 – 526 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 554 – 556 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 559 – 569 | 11 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequences
| ||||||||||||||||||
References
| [1] | "Molecular cloning and nucleotide sequence of a gene for alkaline cellulase from Bacillus sp. KSM-635." Ozaki K., Shikata S., Kawai S., Ito S., Okamoto K. J. Gen. Microbiol. 136:1327-1334(1990) [PubMed: 2230718] [Abstract] Cited for: NUCLEOTIDE SEQUENCE [GENOMIC DNA]. |
| [2] | "Crystallization and preliminary X-ray analysis of a truncated family A alkaline endoglucanase isolated from Bacillus sp. KSM-635." Shirai T., Yamane T., Hidaka T., Kuyama K., Suzuki A., Ashida T., Ozaki K., Ito S. J. Biochem. 122:683-685(1997) [PubMed: 9399567] [Abstract] Cited for: PROTEIN SEQUENCE OF 228-584, CRYSTALLIZATION. |
| [3] | "Crystal structure of alkaline cellulase K: insight into the alkaline adaptation of an industrial enzyme." Shirai T., Ishida H., Noda J., Yamane T., Ozaki K., Hakamada Y., Ito S. J. Mol. Biol. 310:1079-1087(2001) [PubMed: 11501997] [Abstract] Cited for: X-RAY CRYSTALLOGRAPHY (1.9 ANGSTROMS) OF 221-584. |
Cross-references
Sequence databases | |||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| M27420 Genomic DNA. Translation: AAA22304.1. | |||||||||||||||||||
| PIR | S29043. | ||||||||||||||||||
3D structure databases | |||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||
| SMR | P19424. Positions 759-941. | ||||||||||||||||||
| ModBase | Search... | ||||||||||||||||||
Protein family/group databases | |||||||||||||||||||
| CAZy | CBM17. Carbohydrate-Binding Module Family 17. CBM28. Carbohydrate-Binding Module Family 28. GH5. Glycoside Hydrolase Family 5. | ||||||||||||||||||
Family and domain databases | |||||||||||||||||||
| InterPro | IPR005086. CBM_17_28. IPR001547. Glyco_hydro_5. IPR018087. Glyco_hydro_5_CS. IPR013781. Glyco_hydro_sg_catalytic. IPR001119. SLH. [Graphical view] | ||||||||||||||||||
| Gene3D | G3DSA:3.20.20.80. Glyco_hydro_cat. 1 hit. | ||||||||||||||||||
| Pfam | PF03424. CBM_17_28. 2 hits. PF00150. Cellulase. 1 hit. PF00395. SLH. 3 hits. [Graphical view] | ||||||||||||||||||
| PROSITE | PS00659. GLYCOSYL_HYDROL_F5. 1 hit. PS51272. SLH. 3 hits. [Graphical view] | ||||||||||||||||||
| ProtoNet | Search... | ||||||||||||||||||
Entry information
| Entry name | GUN_BACS6 | ||||||||
| Accession | Primary (citable) accession number: P19424 | ||||||||
| Entry history |
| ||||||||
| Entry status | Reviewed (UniProtKB/Swiss-Prot) | ||||||||
| Annotation project | HAMAP (High-quality Automated and Manual Annotation of microbial Proteomes) | ||||||||
Relevant documents
| Glycosyl hydrolases Classification of glycosyl hydrolase families and list of entries |
| PDB cross-references Index of Protein Data Bank (PDB) cross-references |
| SIMILARITY comments Index of protein domains and families |

Clusters with


