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UniProtKB/Swiss-Prot P18054 (LOX12_HUMAN)
Last modified
November 3, 2009.
Version 114.
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Clusters with 100%,
90%,
50% identity |
Documents (7) |
Third-party data |
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Names and origin
| Protein names | Recommended name: Arachidonate 12-lipoxygenase, 12S-type Short name=12-LOX EC=1.13.11.31 Alternative name(s): Platelet-type lipoxygenase 12 | ||||
| Gene names |
| ||||
| Organism | Homo sapiens (Human) [Complete proteome] | ||||
| Taxonomic identifier | 9606 [NCBI] | ||||
| Taxonomic lineage | Eukaryota › Metazoa › Chordata › Craniata › Vertebrata › Euteleostomi › Mammalia › Eutheria › Euarchontoglires › Primates › Haplorrhini › Catarrhini › Hominidae › Homo |
Protein attributes
| Sequence length | 663 AA. |
| Sequence status | Complete. |
| Sequence processing | The displayed sequence is further processed into a mature form. |
| Protein existence | Evidence at protein level. |
General annotation (Comments)
| Function | Oxygenase and 14,15-leukotriene A4 synthase activity. |
| Catalytic activity | Arachidonate + O2 = (5Z,8Z,10E,14Z)-(12S)-12-hydroperoxyicosa-5,8,10,14-tetraenoate. |
| Cofactor | Binds 1 iron ion per subunit. |
| Pathway | |
| Subcellular location | |
| Sequence similarities | Belongs to the lipoxygenase family. Contains 1 lipoxygenase domain. Contains 1 PLAT domain. |
Ontologies
Binary interactions
With | Entry | #Exp. | IntAct | Notes |
|---|---|---|---|---|
| ITGB4 | P16144 | 2 | EBI-1633210,EBI-948678 | |
| KRT5 | P13647 | 3 | EBI-1633210,EBI-702187 | |
| LMNA | P02545 | 3 | EBI-1633210,EBI-351935 | |
| TRIB1 | Q96RU8 | 2 | EBI-1633210,EBI-492555 |
Sequence annotation (Features)
| Feature key | Position(s) | Length | Description | Graphical view | Feature identifier | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule processing | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Initiator methionine | 1 | 1 | Removed By similarity | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Chain | 2 – 663 | 662 | Arachidonate 12-lipoxygenase, 12S-type | PRO_0000220682 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Regions | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Domain | 2 – 114 | 113 | PLAT | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Domain | 115 – 663 | 549 | Lipoxygenase | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sites | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Metal binding | 360 | 1 | Iron; catalytic | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Metal binding | 365 | 1 | Iron; catalytic | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Metal binding | 540 | 1 | Iron; catalytic | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Metal binding | 544 | 1 | Iron; catalytic By similarity | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Metal binding | 663 | 1 | Iron; via carboxylate; catalytic By similarity | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Natural variations | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 259 | 1 | E → K: dbSNP rs4987104. | VAR_030471 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 261 | 1 | Q → R: dbSNP rs1126667. Ref.2 Ref.4 Ref.5 Ref.11 | VAR_018743 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 298 | 1 | A → T | VAR_004279 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 322 | 1 | N → S: dbSNP rs434473. Ref.4 Ref.1 Ref.3 | VAR_018744 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 430 | 1 | R → H: dbSNP rs11571342. Ref.4 | VAR_018745 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Experimental info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence conflict | 189 – 192 | 4 | RVYT → PCLH in AAA51533. Ref.3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence conflict | 345 | 1 | S → C in AAA51533. Ref.3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence conflict | 389 | 1 | L → P in AAA60056. Ref.1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Helix Strand Turn | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 183 – 195 | 13 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 198 – 200 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 203 – 207 | 5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 213 – 221 | 9 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 225 – 230 | 6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 231 – 233 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 258 – 269 | 12 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 273 – 277 | 5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 279 – 281 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 300 – 306 | 7 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 311 – 319 | 9 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 325 – 327 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 337 – 357 | 21 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 358 – 364 | 7 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 365 – 378 | 14 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 384 – 389 | 6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 390 – 392 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 426 – 434 | 9 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 438 – 441 | 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 443 – 449 | 7 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 459 – 475 | 17 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 479 – 482 | 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 486 – 489 | 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 493 – 503 | 11 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 510 – 512 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 522 – 536 | 15 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 538 – 544 | 7 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 548 – 551 | 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 554 – 556 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 567 – 571 | 5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 574 – 577 | 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 584 – 597 | 14 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 619 – 643 | 25 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 654 – 656 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 657 – 660 | 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequences
| ||||||||||||||||||
References
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| [2] | "Cloning of the cDNA for human 12-lipoxygenase." Izumi T., Hoshiko S., Raadmark O., Samuelsson B. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 87:7477-7481(1990) [PubMed: 2217179] [Abstract] Cited for: NUCLEOTIDE SEQUENCE [MRNA], VARIANT ARG-261. |
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| + | Additional computationally mapped references. |
Cross-references
Sequence databases | |||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| M35418 mRNA. Translation: AAA60056.1. M58704 mRNA. Translation: AAA59523.1. M62982 mRNA. Translation: AAA51533.1. AY527817 Genomic DNA. Translation: AAS00094.1. BC069557 mRNA. Translation: AAH69557.1. D12638 Genomic DNA. Translation: BAA02162.1. M87004 Genomic DNA. Translation: AAA51587.1. S68587 mRNA. Translation: AAD14020.1. AF143883 mRNA. Translation: AAD32700.1. | |||||||||||||||||||
| IPI | IPI00218915. | ||||||||||||||||||
| PIR | A38283. | ||||||||||||||||||
| RefSeq | NP_000688.2. | ||||||||||||||||||
| UniGene | Hs.654431 | ||||||||||||||||||
3D structure databases | |||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||
| ModBase | Search... | ||||||||||||||||||
Protein-protein interaction databases | |||||||||||||||||||
| IntAct | P18054. 4 interactions. | ||||||||||||||||||
| STRING | P18054. | ||||||||||||||||||
Proteomic databases | |||||||||||||||||||
| PRIDE | P18054. | ||||||||||||||||||
Genome annotation databases | |||||||||||||||||||
| Ensembl | ENST00000251535; ENSP00000251535; ENSG00000108839; Homo sapiens. [Genome view] ENST00000406228; ENSP00000384466; ENSG00000108839; Homo sapiens. [Genome view] | ||||||||||||||||||
| GeneID | 239. | ||||||||||||||||||
| KEGG | hsa:239. | ||||||||||||||||||
| NMPDR | fig|9606.3.peg.12986. | ||||||||||||||||||
| UCSC | uc002gdx.2. human. | ||||||||||||||||||
Organism-specific databases | |||||||||||||||||||
| CTD | 239. | ||||||||||||||||||
| GeneCards | GC17P006840. | ||||||||||||||||||
| H-InvDB | HIX0039067. | ||||||||||||||||||
| HGNC | HGNC:429. ALOX12. | ||||||||||||||||||
| HPA | CAB019287. HPA010691. | ||||||||||||||||||
| MIM | 152391. gene. | ||||||||||||||||||
| PharmGKB | PA45. | ||||||||||||||||||
| GenAtlas | Search... | ||||||||||||||||||
Phylogenomic databases | |||||||||||||||||||
| HOGENOM | P18054. | ||||||||||||||||||
| HOVERGEN | P18054. | ||||||||||||||||||
| OMA | ACLQMAI. | ||||||||||||||||||
Enzyme and pathway databases | |||||||||||||||||||
| BRENDA | 1.13.11.31. 247. | ||||||||||||||||||
Gene expression databases | |||||||||||||||||||
| ArrayExpress | P18054. | ||||||||||||||||||
| Bgee | P18054. | ||||||||||||||||||
| CleanEx | HS_ALOX12. | ||||||||||||||||||
| Genevestigator | P18054. | ||||||||||||||||||
| GermOnline | ENSG00000108839. Homo sapiens. | ||||||||||||||||||
Family and domain databases | |||||||||||||||||||
| InterPro | IPR000907. LipOase. IPR013819. LipOase_C. IPR001024. LipOase_LH2. IPR001885. LipOase_mml. [Graphical view] | ||||||||||||||||||
| Gene3D | G3DSA:2.60.60.20. Lipase_LipOase. 1 hit. | ||||||||||||||||||
| PANTHER | PTHR11771. LipOase. 1 hit. | ||||||||||||||||||
| Pfam | PF00305. Lipoxygenase. 1 hit. PF01477. PLAT. 1 hit. [Graphical view] | ||||||||||||||||||
| PRINTS | PR00087. LIPOXYGENASE. PR00467. MAMLPOXGNASE. | ||||||||||||||||||
| SMART | SM00308. LH2. 1 hit. [Graphical view] | ||||||||||||||||||
| PROSITE | PS00711. LIPOXYGENASE_1. 1 hit. PS00081. LIPOXYGENASE_2. 1 hit. PS51393. LIPOXYGENASE_3. 1 hit. PS50095. PLAT. 1 hit. [Graphical view] | ||||||||||||||||||
| ProtoNet | Search... | ||||||||||||||||||
Other Resources | |||||||||||||||||||
| NextBio | 952. | ||||||||||||||||||
| SOURCE | Search... | ||||||||||||||||||
Entry information
| Entry name | LOX12_HUMAN | ||||||||
| Accession | Primary (citable) accession number: P18054 Secondary accession number(s): O95569, Q6ISF8, Q9UQM4 | ||||||||
| Entry history |
| ||||||||
| Entry status | Reviewed (UniProtKB/Swiss-Prot) | ||||||||
| Annotation project | HPI (Human Proteome Initiative) | ||||||||
| Disclaimer | Any medical or genetic information present in this entry is provided for research, educational and informational purposes only. It is not in any way intended to be used as a substitute for professional medical advice, diagnosis, treatment or care. | ||||||||
Relevant documents
| Human chromosome 17 Human chromosome 17: entries, gene names and cross-references to MIM |
| Human entries with polymorphisms or disease mutations List of human entries with polymorphisms or disease mutations |
| Human polymorphisms and disease mutations Index of human polymorphisms and disease mutations |
| MIM cross-references Online Mendelian Inheritance in Man (MIM) cross-references in UniProtKB/Swiss-Prot |
| PATHWAY comments Index of metabolic and biosynthesis pathways |
| PDB cross-references Index of Protein Data Bank (PDB) cross-references |
| SIMILARITY comments Index of protein domains and families |

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