P17063 (GIA1_GIAIN) Reviewed, UniProtKB/Swiss-Prot
Last modified
April 3, 2013.
Version 75.
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| Protein names | Recommended name: Giardin subunit alpha-1 |
| Organism | Giardia intestinalis (Giardia lamblia) |
| Taxonomic identifier | 5741 [NCBI] |
| Taxonomic lineage | Eukaryota › Diplomonadida › Hexamitidae › Giardiinae › Giardia![]() |
Protein attributes
| Sequence length | 295 AA. |
| Sequence status | Complete. |
| Protein existence | Evidence at protein level |
General annotation (Comments)
| Function | Giardins are involved in parasite attachment to the intestinal mucosa and in the cytoskeletal disassembly and reassembly that marks the transition from infectious trophozoite to transmissible cyst. They may interact with other cytoskeletal proteins such as microtubules in the microribbons or crossbridges, to maintain the integrity of the ventral disk. |
| Subcellular location | Cytoplasm › cytoskeleton. Note: Most likely in the edges of the ventral disk microribbons. |
| Sequence similarities | Belongs to the giardin subunit alpha family. Contains 1 annexin repeat. |
Ontologies
| Keywords | |
|---|---|
| Cellular component | Cytoplasm Cytoskeleton Microtubule |
| Domain | Annexin |
| Technical term | 3D-structure Direct protein sequencing |
| Gene Ontology (GO) | |
| Biological_process | cytoskeleton organization Inferred from electronic annotation. Source: InterPro |
| Cellular_component | cytoplasm Inferred from electronic annotation. Source: UniProtKB-KW microtubuleInferred from electronic annotation. Source: UniProtKB-KW |
| Molecular_function | calcium ion binding Inferred from electronic annotation. Source: InterPro calcium-dependent phospholipid bindingInferred from electronic annotation. Source: InterPro |
| Complete GO annotation... | |
Sequence annotation (Features)
| Feature key | Position(s) | Length | Description | Graphical view | Feature identifier | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule processing | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Chain | 1 – 295 | 295 | Giardin subunit alpha-1 | PRO_0000067522 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Regions | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Repeat | 4 – 69 | 66 | Annexin | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Secondary structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Helix Strand Turn | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 4 – 16 | 13 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 20 – 28 | 9 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 32 – 46 | 15 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 50 – 57 | 8 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 62 – 70 | 9 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 74 – 87 | 14 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 92 – 99 | 8 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 104 – 118 | 15 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 122 – 130 | 9 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 132 – 134 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 135 – 145 | 11 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 155 – 167 | 13 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 171 – 180 | 10 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 183 – 196 | 14 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 197 – 199 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 201 – 208 | 8 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 211 – 225 | 15 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 227 – 240 | 14 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 245 – 255 | 11 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 256 – 258 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 262 – 265 | 4 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 266 – 268 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 272 – 279 | 8 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 284 – 292 | 9 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequences
| ||||||||||||||||||
References
| [1] | "Ultrastructural localization of giardins to the edges of disk microribbons of Giarida lamblia and the nucleotide and deduced protein sequence of alpha giardin." Peattie D.A., Alonso R.A., Hein A., Caulfield J.P. J. Cell Biol. 109:2323-2335(1989) [PubMed] [Europe PMC] [Abstract] Cited for: NUCLEOTIDE SEQUENCE [GENOMIC DNA], PROTEIN SEQUENCE OF 3-31. Strain: Portland-1. |
| [2] | "Nucleotide sequence of a second alpha giardin gene and molecular analysis of the alpha giardin genes and transcripts in Giardia lamblia." Alonso R.A., Peattie D.A. Mol. Biochem. Parasitol. 50:95-104(1992) [PubMed] [Europe PMC] [Abstract] Cited for: NUCLEOTIDE SEQUENCE [GENOMIC DNA]. Strain: Portland-1. |
Cross-references
Sequence databases | |||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| EMBL GenBank DDBJ | X52485 Genomic DNA. Translation: CAA36727.1. | ||||||||||||||||||
| PIR | A33735. | ||||||||||||||||||
3D structure databases | |||||||||||||||||||
| PDBe RCSB PDB PDBj |
| ||||||||||||||||||
| ProteinModelPortal | P17063. | ||||||||||||||||||
| ModBase | Search... | ||||||||||||||||||
Protocols and materials databases | |||||||||||||||||||
| StructuralBiologyKnowledgebase | Search... | ||||||||||||||||||
Family and domain databases | |||||||||||||||||||
| Gene3D | 1.10.220.10. 1 hit. | ||||||||||||||||||
| InterPro | IPR008088. Alpha_giardin. IPR001464. Annexin. IPR018502. Annexin_repeat. [Graphical view] | ||||||||||||||||||
| Pfam | PF00191. Annexin. 1 hit. [Graphical view] | ||||||||||||||||||
| PRINTS | PR01712. ALPHAGIARDIN. | ||||||||||||||||||
| SMART | SM00335. ANX. 1 hit. [Graphical view] | ||||||||||||||||||
| SUPFAM | SSF47874. Annexin. 1 hit. | ||||||||||||||||||
| ProtoNet | Search... | ||||||||||||||||||
Entry information
| Entry name | GIA1_GIAIN | ||||||||
| Accession | Primary (citable) accession number: P17063 | ||||||||
| Entry history |
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| Entry status | Reviewed (UniProtKB/Swiss-Prot) | ||||||||
Relevant documents
| PDB cross-references Index of Protein Data Bank (PDB) cross-references |
| SIMILARITY comments Index of protein domains and families |

Clusters with
