P16621 (LAR_DROME) Reviewed, UniProtKB/Swiss-Prot
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May 1, 2013.
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| Protein names | Recommended name: Tyrosine-protein phosphatase Lar EC=3.1.3.48 Alternative name(s): Protein-tyrosine-phosphate phosphohydrolase dLAR | ||||
| Gene names |
| ||||
| Organism | Drosophila melanogaster (Fruit fly) [Reference proteome] | ||||
| Taxonomic identifier | 7227 [NCBI] | ||||
| Taxonomic lineage | Eukaryota › Metazoa › Ecdysozoa › Arthropoda › Hexapoda › Insecta › Pterygota › Neoptera › Endopterygota › Diptera › Brachycera › Muscomorpha › Ephydroidea › Drosophilidae › Drosophila › Sophophora › ![]() |
Protein attributes
| Sequence length | 2029 AA. |
| Sequence status | Complete. |
| Sequence processing | The displayed sequence is further processed into a mature form. |
| Protein existence | Evidence at protein level |
General annotation (Comments)
| Function | Possible cell adhesion receptor. It possesses an intrinsic protein tyrosine phosphatase activity (PTPase). It controls motor axon guidance. Ref.1 Ref.2 |
| Catalytic activity | Protein tyrosine phosphate + H2O = protein tyrosine + phosphate. Ref.1 |
| Subcellular location | |
| Tissue specificity | Selectively expressed in a subset of axons and pioneer neurons in the embryo. Ref.2 |
| Sequence similarities | Belongs to the protein-tyrosine phosphatase family. Receptor class 2A subfamily. Contains 9 fibronectin type-III domains. Contains 3 Ig-like C2-type (immunoglobulin-like) domains. Contains 2 tyrosine-protein phosphatase domains. |
| Sequence caution | The sequence AAK93409.1 differs from that shown. Reason: Erroneous initiation. |
Ontologies
Binary interactions
With | Entry | #Exp. | IntAct | Notes |
|---|---|---|---|---|
| Abl | P00522 | 4 | EBI-668630,EBI-534090 | |
| ena | Q8T4F7 | 2 | EBI-668630,EBI-466810 |
Sequence annotation (Features)
| Feature key | Position(s) | Length | Description | Graphical view | Feature identifier | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule processing | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Signal peptide | 1 – 32 | 32 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Chain | 33 – 2029 | 1997 | Tyrosine-protein phosphatase Lar | PRO_0000025431 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Regions | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Topological domain | 33 – 1377 | 1345 | Extracellular Potential | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Transmembrane | 1378 – 1402 | 25 | Helical; Potential | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Topological domain | 1403 – 2029 | 627 | Cytoplasmic Potential | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Domain | 36 – 128 | 93 | Ig-like C2-type 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Domain | 140 – 224 | 85 | Ig-like C2-type 2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Domain | 234 – 316 | 83 | Ig-like C2-type 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Domain | 322 – 410 | 89 | Fibronectin type-III 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Domain | 416 – 508 | 93 | Fibronectin type-III 2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Domain | 515 – 603 | 89 | Fibronectin type-III 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Domain | 610 – 704 | 95 | Fibronectin type-III 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Domain | 709 – 807 | 99 | Fibronectin type-III 5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Domain | 812 – 904 | 93 | Fibronectin type-III 6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Domain | 909 – 1002 | 94 | Fibronectin type-III 7 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Domain | 1006 – 1099 | 94 | Fibronectin type-III 8 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Domain | 1101 – 1203 | 103 | Fibronectin type-III 9 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Domain | 1474 – 1729 | 256 | Tyrosine-protein phosphatase 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Domain | 1761 – 2020 | 260 | Tyrosine-protein phosphatase 2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Region | 70 – 82 | 13 | Heparin-binding | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Region | 1670 – 1676 | 7 | Substrate binding By similarity | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sites | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Active site | 1670 | 1 | Phosphocysteine intermediate By similarity | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Active site | 1961 | 1 | Phosphocysteine intermediate By similarity | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Binding site | 1638 | 1 | Substrate By similarity | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Binding site | 1714 | 1 | Substrate By similarity | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Amino acid modifications | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Modified residue | 1572 | 1 | Phosphothreonine Ref.6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Glycosylation | 176 | 1 | N-linked (GlcNAc...) Potential | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Glycosylation | 253 | 1 | N-linked (GlcNAc...) Potential | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Glycosylation | 298 | 1 | N-linked (GlcNAc...) Potential | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Glycosylation | 553 | 1 | N-linked (GlcNAc...) Potential | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Glycosylation | 616 | 1 | N-linked (GlcNAc...) Potential | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Glycosylation | 666 | 1 | N-linked (GlcNAc...) Potential | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Glycosylation | 721 | 1 | N-linked (GlcNAc...) Potential | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Glycosylation | 774 | 1 | N-linked (GlcNAc...) Potential | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Glycosylation | 915 | 1 | N-linked (GlcNAc...) Potential | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Glycosylation | 962 | 1 | N-linked (GlcNAc...) Potential | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Glycosylation | 1183 | 1 | N-linked (GlcNAc...) Potential | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Glycosylation | 1304 | 1 | N-linked (GlcNAc...) Potential | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Disulfide bond | 57 ↔ 111 | Ref.7 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Disulfide bond | 161 ↔ 209 | Ref.7 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Disulfide bond | 256 ↔ 301 | Potential | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Experimental info | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence conflict | 480 – 481 | 2 | EL → DV Ref.1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence conflict | 480 – 481 | 2 | EL → DV Ref.2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Secondary structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Helix Strand Turn | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 37 – 40 | 4 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 45 – 48 | 4 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 53 – 60 | 8 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 66 – 71 | 6 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 83 – 88 | 6 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 89 – 91 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 92 – 99 | 8 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 102 – 104 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 107 – 114 | 8 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 116 – 118 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 120 – 130 | 11 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 141 – 144 | 4 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 149 – 152 | 4 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 157 – 159 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 162 – 164 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 170 – 175 | 6 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 187 – 190 | 4 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 193 – 196 | 4 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 201 – 203 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 205 – 213 | 9 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 216 – 219 | 4 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 223 – 228 | 6 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequences
| ||||||||||||||||||
References
| « Hide 'large scale' references | |
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| + | Additional computationally mapped references. |
Cross-references
Sequence databases | |||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| EMBL GenBank DDBJ | M27700 mRNA. Translation: AAA28668.1. U36857 U36856 Genomic DNA. Translation: AAC47002.1.AE014134 Genomic DNA. Translation: AAF53837.3. AY051985 mRNA. Translation: AAK93409.1. Different initiation. | ||||||||||||||||||
| PIR | TDFFLK. A36182. | ||||||||||||||||||
| RefSeq | NP_523604.2. NM_078880.3. | ||||||||||||||||||
| UniGene | Dm.24416. | ||||||||||||||||||
3D structure databases | |||||||||||||||||||
| PDBe RCSB PDB PDBj |
| ||||||||||||||||||
| ProteinModelPortal | P16621. | ||||||||||||||||||
| SMR | P16621. Positions 32-1010, 1448-2024. | ||||||||||||||||||
| ModBase | Search... | ||||||||||||||||||
Protein-protein interaction databases | |||||||||||||||||||
| DIP | DIP-38648N. | ||||||||||||||||||
| IntAct | P16621. 2 interactions. | ||||||||||||||||||
Proteomic databases | |||||||||||||||||||
| PaxDb | P16621. | ||||||||||||||||||
Protocols and materials databases | |||||||||||||||||||
| StructuralBiologyKnowledgebase | Search... | ||||||||||||||||||
Genome annotation databases | |||||||||||||||||||
| EnsemblMetazoa | FBtr0081260; FBpp0080801; FBgn0000464. | ||||||||||||||||||
| GeneID | 35259. | ||||||||||||||||||
| KEGG | dme:Dmel_CG10443. | ||||||||||||||||||
| UCSC | CG10443-RA. d. melanogaster. | ||||||||||||||||||
Organism-specific databases | |||||||||||||||||||
| CTD | 104121. | ||||||||||||||||||
| FlyBase | FBgn0000464. Lar. | ||||||||||||||||||
Phylogenomic databases | |||||||||||||||||||
| eggNOG | COG5599. | ||||||||||||||||||
| GeneTree | ENSGT00590000082937. | ||||||||||||||||||
| InParanoid | P16621. | ||||||||||||||||||
| KO | K05695. | ||||||||||||||||||
| OrthoDB | EOG444J14. | ||||||||||||||||||
| PhylomeDB | P16621. | ||||||||||||||||||
Gene expression databases | |||||||||||||||||||
| Bgee | P16621. | ||||||||||||||||||
| GermOnline | CG10443. Drosophila melanogaster. | ||||||||||||||||||
Family and domain databases | |||||||||||||||||||
| Gene3D | 2.60.40.10. 12 hits. | ||||||||||||||||||
| InterPro | IPR003961. Fibronectin_type3. IPR007110. Ig-like_dom. IPR013783. Ig-like_fold. IPR013098. Ig_I-set. IPR003598. Ig_sub2. IPR000387. Tyr/Dual-sp_Pase. IPR016130. Tyr_Pase_AS. IPR000242. Tyr_Pase_rcpt/non-rcpt. [Graphical view] | ||||||||||||||||||
| Pfam | PF00041. fn3. 9 hits. PF07679. I-set. 3 hits. PF00102. Y_phosphatase. 2 hits. [Graphical view] | ||||||||||||||||||
| PRINTS | PR00700. PRTYPHPHTASE. | ||||||||||||||||||
| SMART | SM00060. FN3. 9 hits. SM00408. IGc2. 3 hits. SM00194. PTPc. 2 hits. [Graphical view] | ||||||||||||||||||
| SUPFAM | SSF49265. FN_III-like. 9 hits. | ||||||||||||||||||
| PROSITE | PS50853. FN3. 9 hits. PS50835. IG_LIKE. 3 hits. PS00383. TYR_PHOSPHATASE_1. 2 hits. PS50056. TYR_PHOSPHATASE_2. 2 hits. PS50055. TYR_PHOSPHATASE_PTP. 2 hits. [Graphical view] | ||||||||||||||||||
| ProtoNet | Search... | ||||||||||||||||||
Other | |||||||||||||||||||
| EvolutionaryTrace | P16621. | ||||||||||||||||||
| GenomeRNAi | 35259. | ||||||||||||||||||
| NextBio | 792660. | ||||||||||||||||||
Entry information
| Entry name | LAR_DROME | ||||||||
| Accession | Primary (citable) accession number: P16621 Secondary accession number(s): Q960M3, Q9VIS8 | ||||||||
| Entry history |
| ||||||||
| Entry status | Reviewed (UniProtKB/Swiss-Prot) | ||||||||
| Annotation program | Drosophila annotation project | ||||||||
Relevant documents
| Drosophila Drosophila: entries, gene names and cross-references to FlyBase |
| PDB cross-references Index of Protein Data Bank (PDB) cross-references |
| SIMILARITY comments Index of protein domains and families |

Clusters with
