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UniProtKB/Swiss-Prot P16333 (NCK1_HUMAN)
Last modified
February 9, 2010.
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Documents (7) |
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Names and origin
| Protein names | Recommended name: Cytoplasmic protein NCK1 Alternative name(s): NCK adaptor protein 1 Short name=Nck-1 SH2/SH3 adaptor protein NCK-alpha | ||||
| Gene names |
| ||||
| Organism | Homo sapiens (Human) [Complete proteome] | ||||
| Taxonomic identifier | 9606 [NCBI] | ||||
| Taxonomic lineage | Eukaryota › Metazoa › Chordata › Craniata › Vertebrata › Euteleostomi › Mammalia › Eutheria › Euarchontoglires › Primates › Haplorrhini › Catarrhini › Hominidae › Homo |
Protein attributes
| Sequence length | 377 AA. |
| Sequence status | Complete. |
| Sequence processing | The displayed sequence is further processed into a mature form. |
| Protein existence | Evidence at protein level. |
General annotation (Comments)
| Function | Adapter protein which associates with tyrosine-phosphorylated growth factor receptors or their cellular substrates. Maintains low levels of EIF2S1 phosphorylation by promoting its dephosphorylation by PP1. Plays a role in the DNA damage response, not in the detection of the damage by ATM/ATR, but for efficient activation of downstream effectors, such as that of CHEK2. Ref.11 Ref.12 |
| Subunit structure | Associates with BLNK, PLCG1, VAV1 and NCK1 in a B-cell antigen receptor-dependent fashion. Interacts with SOCS7. This interaction is required for nuclear import. Part of a complex containing PPP1R15B, PP1 and NCK1. Interacts with RALGPS1. Interacts with CAV2 (tyrosine phosphorylated form). Ref.12 Ref.5 Ref.6 Ref.7 Ref.8 Ref.9 |
| Subcellular location | Cytoplasm. Endoplasmic reticulum. Nucleus. Note: Mostly cytoplasmic, but shuttles between the cytoplasm and the nucleus. Import into the nucleus requires the interaction with SOCS7. Predominantly nuclear following genotoxic stresses, such as UV irradiation, hydroxyurea or mitomycin C treatments. Ref.11 Ref.12 |
| Post-translational modification | Phosphorylated on Ser and Tyr residues. Ref.3 Ref.4 Ref.10 Ref.13 Ref.14 Ref.15 Ref.18 Ref.19 |
| Sequence similarities | Contains 1 SH2 domain. Contains 3 SH3 domains. |
Ontologies
Binary interactions
Sequence annotation (Features)
| Feature key | Position(s) | Length | Description | Graphical view | Feature identifier | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule processing | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Initiator methionine | 1 | 1 | Removed | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Chain | 2 – 377 | 376 | Cytoplasmic protein NCK1 | PRO_0000096766 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Regions | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Domain | 2 – 61 | 60 | SH3 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Domain | 115 – 165 | 51 | SH3 2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Domain | 190 – 252 | 63 | SH3 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Domain | 282 – 376 | 95 | SH2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Amino acid modifications | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Modified residue | 2 | 1 | N-acetylalanine Ref.17 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Modified residue | 85 | 1 | Phosphoserine Ref.13 Ref.15 Ref.19 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Modified residue | 91 | 1 | Phosphoserine Ref.15 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Modified residue | 96 | 1 | Phosphoserine Ref.13 Ref.15 Ref.19 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Modified residue | 105 | 1 | Phosphotyrosine Ref.10 Ref.13 Ref.14 Ref.18 Ref.19 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Natural variations | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 180 | 1 | A → V: dbSNP rs13320485. | VAR_051228 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Secondary structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Helix Strand Turn | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 5 – 11 | 7 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 28 – 33 | 6 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 35 – 42 | 8 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 48 – 51 | 4 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 53 – 55 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 56 – 58 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 99 – 101 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 109 – 115 | 7 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 131 – 138 | 8 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 142 – 148 | 7 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 151 – 156 | 6 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 157 – 159 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 160 – 162 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 168 – 170 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 289 – 299 | 11 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 305 – 309 | 5 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 311 – 313 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 316 – 323 | 8 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 326 – 332 | 7 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 339 – 341 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 344 – 348 | 5 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 349 – 358 | 10 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 361 – 363 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequences
| ||||||||||||||||||
References
| « Hide 'large scale' references | |
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| + | Additional computationally mapped references. |
Cross-references
Sequence databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| EMBL GenBank DDBJ | X17576 mRNA. Translation: CAA35599.1. BC006403 mRNA. Translation: AAH06403.1. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IPI | IPI00028065. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| PIR | S08636. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| RefSeq | NP_006144.1. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| UniGene | Hs.477693 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3D structure databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| PDBe RCSB PDB PDBj |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| SMR | P16333. Positions 7-165, 112-251, 190-254, 194-360. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| ModBase | Search... | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Protein-protein interaction databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| DIP | DIP-639N. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IntAct | P16333. 165 interactions. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| STRING | P16333. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PTM databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| PhosphoSite | P16333. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Proteomic databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| PeptideAtlas | P16333. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| PRIDE | P16333. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome annotation databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Ensembl | ENST00000288986; ENSP00000288986; ENSG00000158092; Homo sapiens. [Genome view] ENST00000481752; ENSP00000417273; ENSG00000158092; Homo sapiens. [Genome view] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GeneID | 4690. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| KEGG | hsa:4690. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| UCSC | uc003erh.1. human. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Organism-specific databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| CTD | 4690. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GeneCards | GC03P138063. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| H-InvDB | HIX0003707. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| HGNC | HGNC:7664. NCK1. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| HPA | CAB005063. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MIM | 600508. gene. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| PharmGKB | PA31466. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GenAtlas | Search... | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Phylogenomic databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| eggNOG | prNOG16125. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| HOGENOM | HBG387920. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| HOVERGEN | P16333. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| InParanoid | P16333. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| OMA | NERGNEG. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| OrthoDB | EOG980MFS. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| PhylomeDB | P16333. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Enzyme and pathway databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Pathway_Interaction_DB | angiopoietinreceptor_pathway. Angiopoietin receptor Tie2-mediated signaling. ephbfwdpathway. EPHB forward signaling. insulin_pathway. Insulin Pathway. pdgfrbpathway. PDGFR-beta signaling pathway. met_pathway. Signaling events activated by Hepatocyte Growth Factor Receptor (c-Met). vegfr1_2_pathway. Signaling events mediated by VEGFR1 and VEGFR2. ret_pathway. Signaling events regulated by Ret tyrosine kinase. tcrpathway. TCR signaling in naive CD4+ T cells. vegfr1_pathway. VEGFR1 specific signals. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Reactome | REACT_16888. Signaling by PDGF. REACT_18266. Axon guidance. REACT_6900. Signaling in Immune system. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene expression databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| ArrayExpress | P16333. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Bgee | P16333. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| CleanEx | HS_NCK1. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genevestigator | P16333. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GermOnline | ENSG00000158092. Homo sapiens. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Family and domain databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| InterPro | IPR017304. Cytoplasmic_NCK. IPR000980. SH2. IPR001452. SH3_domain. IPR020473. SH3_region. [Graphical view] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Gene3D | G3DSA:3.30.505.10. SH2. 1 hit. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Pfam | PF00017. SH2. 1 hit. PF00018. SH3_1. 3 hits. [Graphical view] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| PIRSF | PIRSF037874. Cytoplasmic_NCK. 1 hit. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| PRINTS | PR00401. SH2DOMAIN. PR00452. SH3DOMAIN. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| SMART | SM00252. SH2. 1 hit. SM00326. SH3. 3 hits. [Graphical view] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| PROSITE | PS50001. SH2. 1 hit. PS50002. SH3. 3 hits. [Graphical view] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| ProtoNet | Search... | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Other Resources | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| NextBio | 18086. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| PMAP-CutDB | P16333. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| SOURCE | Search... | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry information
| Entry name | NCK1_HUMAN | ||||||||
| Accession | Primary (citable) accession number: P16333 | ||||||||
| Entry history |
| ||||||||
| Entry status | Reviewed (UniProtKB/Swiss-Prot) | ||||||||
| Annotation project | HPI (Human Proteome Initiative) | ||||||||
| Disclaimer | Any medical or genetic information present in this entry is provided for research, educational and informational purposes only. It is not in any way intended to be used as a substitute for professional medical advice, diagnosis, treatment or care. | ||||||||
Relevant documents
| Human chromosome 3 Human chromosome 3: entries, gene names and cross-references to MIM |
| Human entries with polymorphisms or disease mutations List of human entries with polymorphisms or disease mutations |
| Human polymorphisms and disease mutations Index of human polymorphisms and disease mutations |
| MIM cross-references Online Mendelian Inheritance in Man (MIM) cross-references in UniProtKB/Swiss-Prot |
| PDB cross-references Index of Protein Data Bank (PDB) cross-references |
| SIMILARITY comments Index of protein domains and families |
| Forthcoming format changes Announcement of forthcoming format changes |

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