SubmitCancel

Skip Header

You are using a version of browser that may not display all the features of this website. Please consider upgrading your browser.

P16154

- TOXA_PEPDI

UniProt

P16154 - TOXA_PEPDI

(max 400 entries)x

Your basket is currently empty.

Select item(s) and click on "Add to basket" to create your own collection here
(400 entries max)

Protein
Toxin A
Gene
toxA, tcdA
Organism
Peptoclostridium difficile (Clostridium difficile)
Status
Reviewed - Annotation score: 2 out of 5 - Experimental evidence at protein leveli

Functioni

Only after the enteral delivery of the enterotoxin A may the characteristic disease called pseudomembranous colitis be induced.

GO - Molecular functioni

  1. transferase activity, transferring glycosyl groups Source: InterPro

GO - Biological processi

  1. pathogenesis Source: UniProtKB-KW
Complete GO annotation...

Keywords - Molecular functioni

Enterotoxin, Toxin

Protein family/group databases

CAZyiGT44. Glycosyltransferase Family 44.
MEROPSiC80.002.
TCDBi1.C.57.1.2. the clostridial cytotoxin (cct) family.

Names & Taxonomyi

Protein namesi
Recommended name:
Toxin A
Gene namesi
Name:toxA
Synonyms:tcdA
OrganismiPeptoclostridium difficile (Clostridium difficile)
Taxonomic identifieri1496 [NCBI]
Taxonomic lineageiBacteriaFirmicutesClostridiaClostridialesPeptostreptococcaceaePeptoclostridium

PTM / Processingi

Molecule processing

Feature keyPosition(s)LengthDescriptionGraphical viewFeature identifierActions
Chaini1 – 27102710Toxin A
PRO_0000072634Add
BLAST

Structurei

Secondary structure

Legend: HelixTurnBeta strand
Show more details
Feature keyPosition(s)LengthDescriptionGraphical viewFeature identifierActions
Helixi6 – 127
Helixi21 – 3414
Helixi41 – 6121
Helixi68 – 8821
Beta strandi95 – 1006
Helixi108 – 12013
Turni121 – 1233
Beta strandi124 – 1307
Helixi137 – 16024
Helixi167 – 19226
Helixi201 – 21212
Helixi217 – 23216
Turni233 – 2353
Beta strandi236 – 2383
Turni239 – 2435
Helixi248 – 25811
Turni259 – 2613
Helixi264 – 27916
Beta strandi281 – 2844
Turni294 – 2996
Helixi308 – 32316
Helixi334 – 3363
Helixi339 – 35012
Helixi355 – 3573
Beta strandi366 – 3683
Beta strandi373 – 3775
Beta strandi380 – 3889
Helixi393 – 41725
Turni418 – 4203
Helixi423 – 43513
Turni440 – 4423
Helixi443 – 4497
Helixi452 – 4543
Turni455 – 4573
Helixi464 – 4674
Helixi470 – 48213
Helixi494 – 4974
Helixi498 – 5003
Helixi504 – 5063
Helixi512 – 5176
Helixi523 – 53614
Helixi558 – 5636
Helixi565 – 5695
Beta strandi578 – 5858
Helixi590 – 60213
Helixi604 – 6063
Beta strandi607 – 6115
Helixi612 – 6176
Beta strandi619 – 6235
Beta strandi630 – 6345
Helixi640 – 6423
Beta strandi646 – 6538
Helixi670 – 68415
Turni685 – 6873
Beta strandi691 – 70111
Helixi709 – 7113
Helixi713 – 72816
Helixi734 – 7363
Beta strandi737 – 7415
Beta strandi746 – 7483
Beta strandi754 – 7574
Helixi766 – 7716
Beta strandi778 – 7836
Turni784 – 7874
Beta strandi788 – 7958
Beta strandi2395 – 23973
Beta strandi2399 – 24013
Beta strandi2410 – 24123
Beta strandi2424 – 24296
Beta strandi2442 – 24454
Beta strandi2448 – 24514
Beta strandi2454 – 24574
Beta strandi2462 – 24654
Beta strandi2468 – 24725
Beta strandi2474 – 24785
Beta strandi2482 – 24865
Beta strandi2489 – 24935
Turni2495 – 24973
Beta strandi2503 – 25075
Beta strandi2510 – 25145
Beta strandi2523 – 25275
Beta strandi2530 – 25345
Beta strandi2553 – 25586
Beta strandi2561 – 25655
Beta strandi2574 – 25785
Beta strandi2581 – 25855
Turni2587 – 25893
Beta strandi2590 – 25934
Beta strandi2595 – 25995
Beta strandi2602 – 26076
Beta strandi2614 – 26185
Beta strandi2621 – 26266
Beta strandi2644 – 26496
Beta strandi2652 – 26565
Beta strandi2660 – 26623
Beta strandi2665 – 26695
Beta strandi2672 – 26765
Turni2678 – 26803
Beta strandi2686 – 26916
Beta strandi2694 – 26985

3D structure databases

Select the link destinations:
PDBe
RCSB PDB
PDBj
Links Updated
EntryMethodResolution (Å)ChainPositionsPDBsum
2F6EX-ray1.85A2583-2709[»]
2G7CX-ray2.00A/B2456-2710[»]
2QJ6X-ray2.50A/B2387-2706[»]
3HO6X-ray1.60A/B543-809[»]
4DMVX-ray1.50A1-541[»]
4DMWX-ray2.50A1-541[»]
ProteinModelPortaliP16154.
SMRiP16154. Positions 1-542, 1862-1980, 2254-2706.

Miscellaneous databases

EvolutionaryTraceiP16154.

Family & Domainsi

Domains and Repeats

Feature keyPosition(s)LengthDescriptionGraphical viewFeature identifierActions
Domaini583 – 768186Peptidase C80
Add
BLAST
Repeati1810 – 182920Cell wall-binding 1
Add
BLAST
Repeati1851 – 187020Cell wall-binding 2
Add
BLAST
Repeati1872 – 189120Cell wall-binding 3
Add
BLAST
Repeati1923 – 194220Cell wall-binding 4
Add
BLAST
Repeati1943 – 196220Cell wall-binding 5
Add
BLAST
Repeati1964 – 198320Cell wall-binding 6
Add
BLAST
Repeati1985 – 200420Cell wall-binding 7
Add
BLAST
Repeati2006 – 202520Cell wall-binding 8
Add
BLAST
Repeati2057 – 207620Cell wall-binding 9
Add
BLAST
Repeati2077 – 209620Cell wall-binding 10
Add
BLAST
Repeati2098 – 211720Cell wall-binding 11
Add
BLAST
Repeati2119 – 213820Cell wall-binding 12
Add
BLAST
Repeati2140 – 215920Cell wall-binding 13
Add
BLAST
Repeati2191 – 221020Cell wall-binding 14
Add
BLAST
Repeati2211 – 223020Cell wall-binding 15
Add
BLAST
Repeati2232 – 225120Cell wall-binding 16
Add
BLAST
Repeati2252 – 227120Cell wall-binding 17
Add
BLAST
Repeati2305 – 232420Cell wall-binding 18
Add
BLAST
Repeati2325 – 234420Cell wall-binding 19
Add
BLAST
Repeati2346 – 236520Cell wall-binding 20
Add
BLAST
Repeati2367 – 238620Cell wall-binding 21
Add
BLAST
Repeati2388 – 240720Cell wall-binding 22
Add
BLAST
Repeati2439 – 245820Cell wall-binding 23
Add
BLAST
Repeati2459 – 247820Cell wall-binding 24
Add
BLAST
Repeati2480 – 249920Cell wall-binding 25
Add
BLAST
Repeati2501 – 252020Cell wall-binding 26
Add
BLAST
Repeati2552 – 257120Cell wall-binding 27
Add
BLAST
Repeati2572 – 259120Cell wall-binding 28
Add
BLAST
Repeati2593 – 261220Cell wall-binding 29
Add
BLAST
Repeati2643 – 266220Cell wall-binding 30
Add
BLAST
Repeati2663 – 268220Cell wall-binding 31
Add
BLAST
Repeati2685 – 270420Cell wall-binding 32
Add
BLAST

Domaini

The C-terminal part of toxin A consists of a 833 AA repetitive structure. This part of toxin A is composed of five different oligopeptides.

Sequence similaritiesi

Belongs to the peptidase C80 family.

Keywords - Domaini

Repeat

Family and domain databases

InterProiIPR018337. Cell_wall/Cho-bd_repeat.
IPR029044. Nucleotide-diphossugar_trans.
IPR020974. Pept_C80_RTX.
IPR024770. TcdA/TcdB_cat.
IPR024772. TcdA/TcdB_N.
IPR024769. TcdA/TcdB_pore_forming.
[Graphical view]
PfamiPF01473. CW_binding_1. 12 hits.
PF11713. Peptidase_C80. 1 hit.
PF12919. TcdA_TcdB. 1 hit.
PF12920. TcdA_TcdB_pore. 1 hit.
PF12918. TcdB_N. 1 hit.
[Graphical view]
SUPFAMiSSF53448. SSF53448. 1 hit.
PROSITEiPS51170. CW. 32 hits.
[Graphical view]

Sequencei

Sequence statusi: Complete.

P16154-1 [UniParc]FASTAAdd to Basket

« Hide

MSLISKEELI KLAYSIRPRE NEYKTILTNL DEYNKLTTNN NENKYLQLKK     50
LNESIDVFMN KYKTSSRNRA LSNLKKDILK EVILIKNSNT SPVEKNLHFV 100
WIGGEVSDIA LEYIKQWADI NAEYNIKLWY DSEAFLVNTL KKAIVESSTT 150
EALQLLEEEI QNPQFDNMKF YKKRMEFIYD RQKRFINYYK SQINKPTVPT 200
IDDIIKSHLV SEYNRDETVL ESYRTNSLRK INSNHGIDIR ANSLFTEQEL 250
LNIYSQELLN RGNLAAASDI VRLLALKNFG GVYLDVDMLP GIHSDLFKTI 300
SRPSSIGLDR WEMIKLEAIM KYKKYINNYT SENFDKLDQQ LKDNFKLIIE 350
SKSEKSEIFS KLENLNVSDL EIKIAFALGS VINQALISKQ GSYLTNLVIE 400
QVKNRYQFLN QHLNPAIESD NNFTDTTKIF HDSLFNSATA ENSMFLTKIA 450
PYLQVGFMPE ARSTISLSGP GAYASAYYDF INLQENTIEK TLKASDLIEF 500
KFPENNLSQL TEQEINSLWS FDQASAKYQF EKYVRDYTGG SLSEDNGVDF 550
NKNTALDKNY LLNNKIPSNN VEEAGSKNYV HYIIQLQGDD ISYEATCNLF 600
SKNPKNSIII QRNMNESAKS YFLSDDGESI LELNKYRIPE RLKNKEKVKV 650
TFIGHGKDEF NTSEFARLSV DSLSNEISSF LDTIKLDISP KNVEVNLLGC 700
NMFSYDFNVE ETYPGKLLLS IMDKITSTLP DVNKNSITIG ANQYEVRINS 750
EGRKELLAHS GKWINKEEAI MSDLSSKEYI FFDSIDNKLK AKSKNIPGLA 800
SISEDIKTLL LDASVSPDTK FILNNLKLNI ESSIGDYIYY EKLEPVKNII 850
HNSIDDLIDE FNLLENVSDE LYELKKLNNL DEKYLISFED ISKNNSTYSV 900
RFINKSNGES VYVETEKEIF SKYSEHITKE ISTIKNSIIT DVNGNLLDNI 950
QLDHTSQVNT LNAAFFIQSL IDYSSNKDVL NDLSTSVKVQ LYAQLFSTGL 1000
NTIYDSIQLV NLISNAVNDT INVLPTITEG IPIVSTILDG INLGAAIKEL 1050
LDEHDPLLKK ELEAKVGVLA INMSLSIAAT VASIVGIGAE VTIFLLPIAG 1100
ISAGIPSLVN NELILHDKAT SVVNYFNHLS ESKKYGPLKT EDDKILVPID 1150
DLVISEIDFN NNSIKLGTCN ILAMEGGSGH TVTGNIDHFF SSPSISSHIP 1200
SLSIYSAIGI ETENLDFSKK IMMLPNAPSR VFWWETGAVP GLRSLENDGT 1250
RLLDSIRDLY PGKFYWRFYA FFDYAITTLK PVYEDTNIKI KLDKDTRNFI 1300
MPTITTNEIR NKLSYSFDGA GGTYSLLLSS YPISTNINLS KDDLWIFNID 1350
NEVREISIEN GTIKKGKLIK DVLSKIDINK NKLIIGNQTI DFSGDIDNKD 1400
RYIFLTCELD DKISLIIEIN LVAKSYSLLL SGDKNYLISN LSNTIEKINT 1450
LGLDSKNIAY NYTDESNNKY FGAISKTSQK SIIHYKKDSK NILEFYNDST 1500
LEFNSKDFIA EDINVFMKDD INTITGKYYV DNNTDKSIDF SISLVSKNQV 1550
KVNGLYLNES VYSSYLDFVK NSDGHHNTSN FMNLFLDNIS FWKLFGFENI 1600
NFVIDKYFTL VGKTNLGYVE FICDNNKNID IYFGEWKTSS SKSTIFSGNG 1650
RNVVVEPIYN PDTGEDISTS LDFSYEPLYG IDRYINKVLI APDLYTSLIN 1700
INTNYYSNEY YPEIIVLNPN TFHKKVNINL DSSSFEYKWS TEGSDFILVR 1750
YLEESNKKIL QKIRIKGILS NTQSFNKMSI DFKDIKKLSL GYIMSNFKSF 1800
NSENELDRDH LGFKIIDNKT YYYDEDSKLV KGLININNSL FYFDPIEFNL 1850
VTGWQTINGK KYYFDINTGA ALTSYKIING KHFYFNNDGV MQLGVFKGPD 1900
GFEYFAPANT QNNNIEGQAI VYQSKFLTLN GKKYYFDNNS KAVTGWRIIN 1950
NEKYYFNPNN AIAAVGLQVI DNNKYYFNPD TAIISKGWQT VNGSRYYFDT 2000
DTAIAFNGYK TIDGKHFYFD SDCVVKIGVF STSNGFEYFA PANTYNNNIE 2050
GQAIVYQSKF LTLNGKKYYF DNNSKAVTGL QTIDSKKYYF NTNTAEAATG 2100
WQTIDGKKYY FNTNTAEAAT GWQTIDGKKY YFNTNTAIAS TGYTIINGKH 2150
FYFNTDGIMQ IGVFKGPNGF EYFAPANTDA NNIEGQAILY QNEFLTLNGK 2200
KYYFGSDSKA VTGWRIINNK KYYFNPNNAI AAIHLCTINN DKYYFSYDGI 2250
LQNGYITIER NNFYFDANNE SKMVTGVFKG PNGFEYFAPA NTHNNNIEGQ 2300
AIVYQNKFLT LNGKKYYFDN DSKAVTGWQT IDGKKYYFNL NTAEAATGWQ 2350
TIDGKKYYFN LNTAEAATGW QTIDGKKYYF NTNTFIASTG YTSINGKHFY 2400
FNTDGIMQIG VFKGPNGFEY FAPANTDANN IEGQAILYQN KFLTLNGKKY 2450
YFGSDSKAVT GLRTIDGKKY YFNTNTAVAV TGWQTINGKK YYFNTNTSIA 2500
STGYTIISGK HFYFNTDGIM QIGVFKGPDG FEYFAPANTD ANNIEGQAIR 2550
YQNRFLYLHD NIYYFGNNSK AATGWVTIDG NRYYFEPNTA MGANGYKTID 2600
NKNFYFRNGL PQIGVFKGSN GFEYFAPANT DANNIEGQAI RYQNRFLHLL 2650
GKIYYFGNNS KAVTGWQTIN GKVYYFMPDT AMAAAGGLFE IDGVIYFFGV 2700
DGVKAPGIYG 2710
Length:2,710
Mass (Da):308,056
Last modified:February 1, 1996 - v2
Checksum:i0A6E52CE84C14421
GO

Sequence databases

Select the link destinations:
EMBL
GenBank
DDBJ
Links Updated
X51797 Genomic DNA. Translation: CAA36094.1.
M30307 Genomic DNA. Translation: AAA23283.1.
X92982 Genomic DNA. Translation: CAA63564.1.
PIRiA37052.

Cross-referencesi

Sequence databases

Select the link destinations:
EMBL
GenBank
DDBJ
Links Updated
X51797 Genomic DNA. Translation: CAA36094.1 .
M30307 Genomic DNA. Translation: AAA23283.1 .
X92982 Genomic DNA. Translation: CAA63564.1 .
PIRi A37052.

3D structure databases

Select the link destinations:
PDBe
RCSB PDB
PDBj
Links Updated
Entry Method Resolution (Å) Chain Positions PDBsum
2F6E X-ray 1.85 A 2583-2709 [» ]
2G7C X-ray 2.00 A/B 2456-2710 [» ]
2QJ6 X-ray 2.50 A/B 2387-2706 [» ]
3HO6 X-ray 1.60 A/B 543-809 [» ]
4DMV X-ray 1.50 A 1-541 [» ]
4DMW X-ray 2.50 A 1-541 [» ]
ProteinModelPortali P16154.
SMRi P16154. Positions 1-542, 1862-1980, 2254-2706.
ModBasei Search...
MobiDBi Search...

Protein family/group databases

CAZyi GT44. Glycosyltransferase Family 44.
MEROPSi C80.002.
TCDBi 1.C.57.1.2. the clostridial cytotoxin (cct) family.

Protocols and materials databases

Structural Biology Knowledgebase Search...

Miscellaneous databases

EvolutionaryTracei P16154.

Family and domain databases

InterProi IPR018337. Cell_wall/Cho-bd_repeat.
IPR029044. Nucleotide-diphossugar_trans.
IPR020974. Pept_C80_RTX.
IPR024770. TcdA/TcdB_cat.
IPR024772. TcdA/TcdB_N.
IPR024769. TcdA/TcdB_pore_forming.
[Graphical view ]
Pfami PF01473. CW_binding_1. 12 hits.
PF11713. Peptidase_C80. 1 hit.
PF12919. TcdA_TcdB. 1 hit.
PF12920. TcdA_TcdB_pore. 1 hit.
PF12918. TcdB_N. 1 hit.
[Graphical view ]
SUPFAMi SSF53448. SSF53448. 1 hit.
PROSITEi PS51170. CW. 32 hits.
[Graphical view ]
ProtoNeti Search...

Publicationsi

  1. "Nucleotide sequence of Clostridium difficile toxin A."
    Sauerborn M., von Eichel-Streiber C.
    Nucleic Acids Res. 18:1629-1630(1990) [PubMed] [Europe PMC] [Abstract]
    Cited for: NUCLEOTIDE SEQUENCE [GENOMIC DNA].
    Strain: ATCC 4325 / VPI 10463.
  2. "Molecular characterization of the Clostridium difficile toxin A gene."
    Dove C.H., Wang S.-Z., Price S.B., Phelps C.J., Lyerly D.M., Wilkins T.D., Johnson J.L.
    Infect. Immun. 58:480-488(1990) [PubMed] [Europe PMC] [Abstract]
    Cited for: NUCLEOTIDE SEQUENCE [GENOMIC DNA].
    Strain: ATCC 4325 / VPI 10463.
  3. von Eichel-Streiber C.
    Submitted (JAN-1997) to the EMBL/GenBank/DDBJ databases
    Cited for: NUCLEOTIDE SEQUENCE [GENOMIC DNA].
    Strain: ATCC 4325 / VPI 10463.

Entry informationi

Entry nameiTOXA_PEPDI
AccessioniPrimary (citable) accession number: P16154
Entry historyi
Integrated into UniProtKB/Swiss-Prot: April 1, 1990
Last sequence update: February 1, 1996
Last modified: June 11, 2014
This is version 80 of the entry and version 2 of the sequence. [Complete history]
Entry statusiReviewed (UniProtKB/Swiss-Prot)
Annotation programProkaryotic Protein Annotation Program

Miscellaneousi

Keywords - Technical termi

3D-structure

Documents

  1. PDB cross-references
    Index of Protein Data Bank (PDB) cross-references
  2. Peptidase families
    Classification of peptidase families and list of entries
  3. SIMILARITY comments
    Index of protein domains and families

External Data

Dasty 3

Similar proteinsi