P15692 (VEGFA_HUMAN) Reviewed, UniProtKB/Swiss-Prot
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January 25, 2012.
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| Protein names | Recommended name: Vascular endothelial growth factor A Short name=VEGF-A Alternative name(s): Vascular permeability factor Short name=VPF | ||||
| Gene names |
| ||||
| Organism | Homo sapiens (Human) | ||||
| Taxonomic identifier | 9606 [NCBI] | ||||
| Taxonomic lineage | Eukaryota › Metazoa › Chordata › Craniata › Vertebrata › Euteleostomi › Mammalia › Eutheria › Euarchontoglires › Primates › Haplorrhini › Catarrhini › Hominidae › Homo |
Protein attributes
| Sequence length | 232 AA. |
| Sequence status | Complete. |
| Sequence processing | The displayed sequence is further processed into a mature form. |
| Protein existence | Evidence at protein level |
General annotation (Comments)
| Function | Growth factor active in angiogenesis, vasculogenesis and endothelial cell growth. Induces endothelial cell proliferation, promotes cell migration, inhibits apoptosis and induces permeabilization of blood vessels. Binds to the FLT1/VEGFR1 and KDR/VEGFR2 receptors, heparan sulfate and heparin. NRP1/Neuropilin-1 binds isoforms VEGF-165 and VEGF-145. Isoform VEGF165B binds to KDR but does not activate downstream signaling pathways, does not activate angiogenesis and inhibits tumor growth. Ref.27 Ref.30 |
| Subunit structure | Homodimer; disulfide-linked. Also found as heterodimer with PGF By similarity. |
| Subcellular location | Secreted. Note: VEGF121 is acidic and freely secreted. VEGF165 is more basic, has heparin-binding properties and, although a signicant proportion remains cell-associated, most is freely secreted. VEGF189 is very basic, it is cell-associated after secretion and is bound avidly by heparin and the extracellular matrix, although it may be released as a soluble form by heparin, heparinase or plasmin. Ref.26 Ref.28 Ref.32 |
| Tissue specificity | Isoform VEGF189, isoform VEGF165 and isoform VEGF121 are widely expressed. Isoform VEGF206 and isoform VEGF145 are not widely expressed. |
| Induction | Regulated by growth factors, cytokines, gonadotropins, nitric oxide, hypoxia, hypoglycemia and oncogenic mutations. |
| Involvement in disease | Defects in VEGFA are a cause of susceptibility to microvascular complications of diabetes type 1 (MVCD1) [MIM:603933]. These are pathological conditions that develop in numerous tissues and organs as a consequence of diabetes mellitus. They include diabetic retinopathy, diabetic nephropathy leading to end-stage renal disease, and diabetic neuropathy. Diabetic retinopathy remains the major cause of new-onset blindness among diabetic adults. It is characterized by vascular permeability and increased tissue ischemia and angiogenesis. |
| Sequence similarities | Belongs to the PDGF/VEGF growth factor family. |
| Sequence caution | The sequence AAC63102.1 differs from that shown. Reason: Erroneous initiation. The sequence AAC63143.1 differs from that shown. Reason: Unusual initiator. The initiator methionine is coded by a non-canonical CTG leucine codon. The sequence CAC19512.2 differs from that shown. Reason: Unusual initiator. The initiator methionine is coded by a non-canonical CTG leucine codon. The sequence CAC19516.2 differs from that shown. Reason: Unusual initiator. The initiator methionine is coded by a non-canonical CTG leucine codon. |
Ontologies
Binary interactions
With | Entry | #Exp. | IntAct | Notes |
|---|---|---|---|---|
| FLT1 | P17948 | 2 | EBI-1026643,EBI-1026718 |
Alternative products
| This entry describes 13 isoforms produced by alternative promoter usage, alternative splicing and alternative initiation. [Align] [Select] Note: Additional isoforms seem to exist. | ||||||
| Isoform VEGF206 (identifier: P15692-1) This isoform has been chosen as the 'canonical' sequence. All positional information in this entry refers to it. This is also the sequence that appears in the downloadable versions of the entry. | ||||||
| Isoform VEGF189 (identifier: P15692-2) The sequence of this isoform differs from the canonical sequence as follows: 166-182: Missing. | ||||||
| Isoform VEGF183 (identifier: P15692-3) The sequence of this isoform differs from the canonical sequence as follows: 160-182: Missing. | ||||||
| Isoform VEGF165 (identifier: P15692-4) Also known as: VEGF; The sequence of this isoform differs from the canonical sequence as follows: 141-141: K → N 142-182: Missing. | ||||||
| Isoform VEGF148 (identifier: P15692-5) The sequence of this isoform differs from the canonical sequence as follows: 141-141: K → N 142-182: Missing. 215-215: A → M 216-232: Missing. | ||||||
| Isoform VEGF145 (identifier: P15692-6) The sequence of this isoform differs from the canonical sequence as follows: 166-226: Missing. | ||||||
| Isoform VEGF165B (identifier: P15692-8) The sequence of this isoform differs from the canonical sequence as follows: 141-141: K → N 142-182: Missing. 227-232: CDKPRR → SLTRKD | ||||||
| Isoform VEGF121 (identifier: P15692-9) The sequence of this isoform differs from the canonical sequence as follows: 142-226: Missing. | ||||||
| Note: No experimental confirmation available. | ||||||
| Isoform VEGF111 (identifier: P15692-10) The sequence of this isoform differs from the canonical sequence as follows: 132-226: Missing. | ||||||
| Note: No experimental confirmation available. | ||||||
| Isoform L-VEGF165 (identifier: P15692-11) The sequence of this isoform differs from the canonical sequence as follows: 1-1: M → MTDRQTDTAP...AGPGRASETM 141-141: K → N 142-182: Missing. | ||||||
| Note: Produced by alternative promoter usage and alternative initiation. Starts at an alternative upstream CUG codon. Post-translationally processed to produce the secreted VEGF peptide and a N-terminal peptide N-VEGF. The unprocessed protein and the N-VEGF peptide may localize to the nucleus (PubMed:15896327), the endoplasmic reticulum and the Golgi (PubMed:11731620) or the extracellular matrix (PubMed:11563986). | ||||||
| Isoform L-VEGF121 (identifier: P15692-12) The sequence of this isoform differs from the canonical sequence as follows: 1-1: M → MTDRQTDTAP...AGPGRASETM 142-226: Missing. | ||||||
| Note: Produced by alternative promoter usage and alternative initiation. Starts at an alternative upstream CUG codon. Post-translationally processed to produce the secreted VEGF peptide and a N-terminal peptide N-VEGF. The unprocessed protein and the N-VEGF peptide may localize to the nucleus (PubMed:15896327), the endoplasmic reticulum and the Golgi (PubMed:11731620) or the extracellular matrix (PubMed:11563986). | ||||||
| Isoform L-VEGF189 (identifier: P15692-13) The sequence of this isoform differs from the canonical sequence as follows: 1-1: M → MTDRQTDTAP...AGPGRASETM 166-182: Missing. | ||||||
| Note: Produced by alternative promoter usage and alternative initiation. Starts at an alternative upstream CUG codon. Post-translationally processed to produce the secreted VEGF peptide and a N-terminal peptide N-VEGF. The unprocessed protein and the N-VEGF peptide may localize to the nucleus (PubMed:15896327), the endoplasmic reticulum and the Golgi (PubMed:11731620) or the extracellular matrix (PubMed:11563986). | ||||||
| Isoform L-VEGF206 (identifier: P15692-14) The sequence of this isoform differs from the canonical sequence as follows: 1-1: M → MTDRQTDTAP...AGPGRASETM | ||||||
| Note: Gene prediction based on EST data. Produced by alternative promoter usage and alternative initiation. Starts at an alternative upstream CUG codon. |
Sequence annotation (Features)
| Feature key | Position(s) | Length | Description | Graphical view | Feature identifier | |||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule processing | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Signal peptide | 1 – 26 | 26 | Ref.22 Ref.23 Ref.24 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| Chain | 27 – 232 | 206 | Vascular endothelial growth factor A | PRO_0000023386 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Amino acid modifications | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Modified residue | 147 | 1 | N6-acetyllysine Ref.33 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| Modified residue | 149 | 1 | N6-acetyllysine Ref.33 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| Modified residue | 152 | 1 | N6-acetyllysine Ref.33 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| Glycosylation | 101 | 1 | N-linked (GlcNAc...) | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| Disulfide bond | 52 ↔ 94 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Disulfide bond | 77 | Interchain | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Disulfide bond | 83 ↔ 128 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Disulfide bond | 86 | Interchain | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Disulfide bond | 87 ↔ 130 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Natural variations | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Alternative sequence | 1 | 1 | M → MTDRQTDTAPSPSYHLLPGR RRTVDAAASRGQGPEPAPGG GVEGVGARGVALKLFVQLLG CSRFGGAVVRAGEAEPSGAA RSASSGREEPQPEEGEEEEE KEEERGPQWRLGARKPGSWT GEAAVCADSAPAARAPQALA RASGRGGRVARRGAEESGPP HSPSRRGSASRAGPGRASET M in isoform L-VEGF165, isoform L-VEGF121, isoform L-VEGF189 and isoform L-VEGF206. | VSP_038745 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
| Alternative sequence | 132 – 226 | 95 | Missing in isoform VEGF111. | VSP_026781 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
| Alternative sequence | 141 | 1 | K → N in isoform VEGF148, isoform VEGF165, isoform VEGF165B and isoform L-VEGF165. | VSP_004618 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
| Alternative sequence | 142 – 226 | 85 | Missing in isoform VEGF121 and isoform L-VEGF121. | VSP_004620 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
| Alternative sequence | 142 – 182 | 41 | Missing in isoform VEGF148, isoform VEGF165, isoform VEGF165B and isoform L-VEGF165. | VSP_004619 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
| Alternative sequence | 160 – 182 | 23 | Missing in isoform VEGF183. | VSP_004621 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
| Alternative sequence | 166 – 226 | 61 | Missing in isoform VEGF145. | VSP_004623 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
| Alternative sequence | 166 – 182 | 17 | Missing in isoform VEGF189 and isoform L-VEGF189. | VSP_004622 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
| Alternative sequence | 215 | 1 | A → M in isoform VEGF148. | VSP_004624 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
| Alternative sequence | 216 – 232 | 17 | Missing in isoform VEGF148. | VSP_004625 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
| Alternative sequence | 227 – 232 | 6 | CDKPRR → SLTRKD in isoform VEGF165B. | VSP_014783 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Experimental info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence conflict | 87 | 1 | C → S in AAC63143. Ref.8 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence conflict | 210 | 1 | D → H in AAC63143. Ref.8 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Helix Strand Turn | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 43 – 50 | 8 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 51 – 60 | 10 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 61 – 64 | 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 66 – 68 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 71 – 84 | 14 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 93 – 109 | 17 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 116 – 131 | 16 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 189 – 191 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 195 – 197 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 199 – 201 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 204 – 208 | 5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 210 – 214 | 5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 215 – 217 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 219 – 221 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 222 – 225 | 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 226 – 228 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequences
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
References
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| [1] | "Vascular endothelial growth factor is a secreted angiogenic mitogen." Leung D.W., Cachianes G., Kuang W.-J., Goeddel D.V., Ferrara N. Science 246:1306-1309(1989) [PubMed: 2479986] [Abstract] Cited for: NUCLEOTIDE SEQUENCE [MRNA] (ISOFORMS VEGF189 AND VEGF165). |
| [2] | "Vascular permeability factor, an endothelial cell mitogen related to PDGF." Keck P.J., Hauser S.D., Krivi G., Sanzo K., Warren T., Feder J., Connolly D.T. Science 246:1309-1312(1989) [PubMed: 2479987] [Abstract] Cited for: NUCLEOTIDE SEQUENCE [MRNA] (ISOFORM VEGF189), PARTIAL PROTEIN SEQUENCE. |
| [3] | "The human gene for vascular endothelial growth factor. Multiple protein forms are encoded through alternative exon splicing." Tischer E., Mitchell R., Hartman T., Silva M., Gospodarowicz D., Fiddes J.C., Abraham J.A. J. Biol. Chem. 266:11947-11954(1991) [PubMed: 1711045] [Abstract] Cited for: NUCLEOTIDE SEQUENCE [GENOMIC DNA] (ISOFORM VEGF189). |
| [4] | "The vascular endothelial growth factor family: identification of a fourth molecular species and characterization of alternative splicing of RNA." Houck K.A., Ferrara N., Winer J., Cachianes G., Li B., Leung D.W. Mol. Endocrinol. 5:1806-1814(1991) [PubMed: 1791831] [Abstract] Cited for: NUCLEOTIDE SEQUENCE [GENOMIC DNA / MRNA] (ISOFORM VEGF206). |
| [5] | "AIDS-associated Kaposi's sarcoma cells in culture express vascular endothelial growth factor." Weindel K., Marme D., Weich H.A. Biochem. Biophys. Res. Commun. 183:1167-1174(1992) [PubMed: 1567395] [Abstract] Cited for: NUCLEOTIDE SEQUENCE [MRNA] (ISOFORM VEGF165). |
| [6] | "VEGF145, a secreted vascular endothelial growth factor isoform that binds to extracellular matrix." Poltorak Z., Cohen T., Sivan R., Kandelis Y., Spira G., Vlodavsky I., Keshet E., Neufeld G. J. Biol. Chem. 272:7151-7158(1997) [PubMed: 9054410] [Abstract] Cited for: NUCLEOTIDE SEQUENCE [MRNA] (ISOFORM VEGF145). |
| [7] | "Identification and characterization of a new splicing variant of vascular endothelial growth factor: VEGF183." Lei J., Jiang A., Pei D. Biochim. Biophys. Acta 1443:400-406(1998) [PubMed: 9878851] [Abstract] Cited for: NUCLEOTIDE SEQUENCE [MRNA] (ISOFORM VEGF183). Tissue: Kidney. |
| [8] | "Identification of a human VPF/VEGF 3' untranslated region mediating hypoxia-induced mRNA stability." Claffey K.P., Shih S.-C., Mullen A., Dziennis S., Cusick J.L., Abrams K.R., Lee S.W., Detmar M. Mol. Biol. Cell 9:469-481(1998) [PubMed: 9450968] [Abstract] Cited for: NUCLEOTIDE SEQUENCE [MRNA] (ISOFORM L-VEGF165). Tissue: Mammary gland. |
| [9] | "Heterogeneous vascular endothelial growth factor (VEGF) isoform mRNA and receptor mRNA expression in human glomeruli, and the identification of VEGF148 mRNA, a novel truncated splice variant." Whittle C.J., Gillespie K.M., Harrison R., Mathieson P.W., Harper S.J. Clin. Sci. 97:303-312(1999) [PubMed: 10464055] [Abstract] Cited for: NUCLEOTIDE SEQUENCE [MRNA] (ISOFORM VEGF148). Tissue: Renal glomerulus. |
| [10] | "VEGF165b, an inhibitory splice variant of vascular endothelial growth factor, is down-regulated in renal cell carcinoma." Bates D.O., Cui T.-G., Doughty J.M., Winkler M., Sugiono M., Shields J.D., Peat D., Gillatt D., Harper S.J. Cancer Res. 62:4123-4131(2002) [PubMed: 12124351] [Abstract] Cited for: NUCLEOTIDE SEQUENCE [MRNA] (ISOFORM VEGF165B). Tissue: Kidney. |
| [11] | "Human cDNA for the vascular endothelial growth factor isoform VEGF165." Murata H., Fukushima J., Hattori S., Okuda K., Yanagi H. Submitted (DEC-1998) to the EMBL/GenBank/DDBJ databases Cited for: NUCLEOTIDE SEQUENCE [MRNA] (ISOFORM VEGF165). Tissue: Hemangioendothelioma. |
| [12] | "Human cDNA for vascular endothelial growth factor isoform VEGF121." Sato J.D., Whitney R.G. Submitted (DEC-1999) to the EMBL/GenBank/DDBJ databases Cited for: NUCLEOTIDE SEQUENCE [MRNA] (ISOFORM VEGF121). |
| [13] | "Cloning of vascular endothelial growth factor (VEGF) cDNA." Liu J., Peng X., Yuan J., Qiang B. Submitted (JUL-2001) to the EMBL/GenBank/DDBJ databases Cited for: NUCLEOTIDE SEQUENCE [MRNA] (ISOFORM VEGF165). |
| [14] | "Cloning and identification of vascular endothelial growth factor isoform VEGF165." Shan Z.X., Yu X.Y., Lin Q.X., Fu Y.H., Zheng M., Tan H.H., Lin S.G. Submitted (FEB-2002) to the EMBL/GenBank/DDBJ databases Cited for: NUCLEOTIDE SEQUENCE [MRNA] (ISOFORM VEGF165). Tissue: Heart. |
| [15] | "Cloning and characterization of VEGF from LnCAP cells, a line of prostate cancer cells." Koul S., Johnson T., Meacham R.B., Koul H.K. Submitted (SEP-2004) to the EMBL/GenBank/DDBJ databases Cited for: NUCLEOTIDE SEQUENCE [MRNA] (ISOFORM VEGF165). |
| [16] | "VEGF111, a new VEGF-A variant lacking exons 5, 6 and 7." Mineur P.J., Colige A.C., Lambert C.A. Submitted (OCT-2005) to the EMBL/GenBank/DDBJ databases Cited for: NUCLEOTIDE SEQUENCE [MRNA] (ISOFORM VEGF111). |
| [17] | "Human protein factory for converting the transcriptome into an in vitro-expressed proteome." Goshima N., Kawamura Y., Fukumoto A., Miura A., Honma R., Satoh R., Wakamatsu A., Yamamoto J., Kimura K., Nishikawa T., Andoh T., Iida Y., Ishikawa K., Ito E., Kagawa N., Kaminaga C., Kanehori K., Kawakami B. Nomura N.Nat. Methods 5:1011-1017(2008) [PubMed: 19054851] [Abstract] Cited for: NUCLEOTIDE SEQUENCE [LARGE SCALE MRNA] (ISOFORM VEGF165). |
| [18] | "The DNA sequence and analysis of human chromosome 6." Mungall A.J., Palmer S.A., Sims S.K., Edwards C.A., Ashurst J.L., Wilming L., Jones M.C., Horton R., Hunt S.E., Scott C.E., Gilbert J.G.R., Clamp M.E., Bethel G., Milne S., Ainscough R., Almeida J.P., Ambrose K.D., Andrews T.D. Beck S.Nature 425:805-811(2003) [PubMed: 14574404] [Abstract] Cited for: NUCLEOTIDE SEQUENCE [LARGE SCALE GENOMIC DNA]. |
| [19] | Mural R.J., Istrail S., Sutton G.G., Florea L., Halpern A.L., Mobarry C.M., Lippert R., Walenz B., Shatkay H., Dew I., Miller J.R., Flanigan M.J., Edwards N.J., Bolanos R., Fasulo D., Halldorsson B.V., Hannenhalli S., Turner R. Venter J.C.Submitted (JUL-2005) to the EMBL/GenBank/DDBJ databases Cited for: NUCLEOTIDE SEQUENCE [LARGE SCALE GENOMIC DNA]. |
| [20] | "The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC)." The MGC Project Team Genome Res. 14:2121-2127(2004) [PubMed: 15489334] [Abstract] Cited for: PARTIAL NUCLEOTIDE SEQUENCE [LARGE SCALE MRNA] (ISOFORM L-VEGF121). Tissue: Lung. |
| [21] | SeattleSNPs variation discovery resource Submitted (OCT-2001) to the EMBL/GenBank/DDBJ databases Cited for: NUCLEOTIDE SEQUENCE [GENOMIC DNA] OF 23-232. |
| [22] | "Synthesis and assembly of functionally active human vascular endothelial growth factor homodimers in insect cells." Fiebich B.L., Jaeger B., Schoellmann C., Weindel K., Wilting J., Kochs G., Marme D., Hug H., Weich H.A. Eur. J. Biochem. 211:19-26(1993) [PubMed: 7678805] [Abstract] Cited for: PROTEIN SEQUENCE OF 27-41. |
| [23] | "Signal peptide prediction based on analysis of experimentally verified cleavage sites." Zhang Z., Henzel W.J. Protein Sci. 13:2819-2824(2004) [PubMed: 15340161] [Abstract] Cited for: PROTEIN SEQUENCE OF 27-41. |
| [24] | "Human vascular permeability factor. Isolation from U937 cells." Connolly D.T., Olander J.V., Heuvelman D., Nelson R., Monsell R., Siegel N., Haymore B.L., Leimgruber R., Feder J. J. Biol. Chem. 264:20017-20024(1989) [PubMed: 2584205] [Abstract] Cited for: PRELIMINARY PROTEIN SEQUENCE OF 27-36; 43-50 AND 59-81. |
| [25] | "Human Muller cells express VEGF183, a novel spliced variant of vascular endothelial growth factor." Jingjing L., Xue Y., Agarwal N., Roque R.S. Invest. Ophthalmol. Vis. Sci. 40:752-759(1999) [PubMed: 10067980] [Abstract] Cited for: NUCLEOTIDE SEQUENCE [MRNA] OF 114-209 (ISOFORM VEGF183). Tissue: Retina. |
| [26] | "A precursor form of vascular endothelial growth factor arises by initiation from an upstream in-frame CUG codon." Tee M.K., Jaffe R.B. Biochem. J. 359:219-226(2001) [PubMed: 11563986] [Abstract] Cited for: ALTERNATIVE SPLICING (ISOFORMS L-VEGF121 AND L-VEGF165), PROCESSING, SUBCELLULAR LOCATION. |
| [27] | "Vascular endothelial growth factor induces cyclooxygenase-dependent proliferation of endothelial cells via the VEGF-2 receptor." Murphy J.F., Fitzgerald D.J. FASEB J. 15:1667-1669(2001) [PubMed: 11427521] [Abstract] Cited for: FUNCTION. |
| [28] | "New vascular endothelial growth factor isoform generated by internal ribosome entry site-driven CUG translation initiation." Huez I., Bornes S., Bresson D., Creancier L., Prats H. Mol. Endocrinol. 15:2197-2210(2001) [PubMed: 11731620] [Abstract] Cited for: ALTERNATIVE SPLICING (ISOFORM L-VEGF189), PROCESSING, SUBCELLULAR LOCATION. |
| [29] | "A common polymorphism in the 5'-untranslated region of the VEGF gene is associated with diabetic retinopathy in type 2 diabetes." Awata T., Inoue K., Kurihara S., Ohkubo T., Watanabe M., Inukai K., Inoue I., Katayama S. Diabetes 51:1635-1639(2002) [PubMed: 11978667] [Abstract] Cited for: INVOLVEMENT IN MICROVASCULAR COMPLICATIONS OF DIABETES. |
| [30] | "VEGF165b, an inhibitory vascular endothelial growth factor splice variant: mechanism of action, in vivo effect on angiogenesis and endogenous protein expression." Woolard J., Wang W.-Y., Bevan H.S., Qiu Y., Morbidelli L., Pritchard-Jones R.O., Cui T.-G., Sugiono M., Waine E., Perrin R., Foster R., Digby-Bell J., Shields J.D., Whittles C.E., Mushens R.E., Gillatt D.A., Ziche M., Harper S.J., Bates D.O. Cancer Res. 64:7822-7835(2004) [PubMed: 15520188] [Abstract] Cited for: FUNCTION (ISOFORM VEGF165B). |
| [31] | "Control of the vascular endothelial growth factor internal ribosome entry site (IRES) activity and translation initiation by alternatively spliced coding sequences." Bornes S., Boulard M., Hieblot C., Zanibellato C., Iacovoni J.S., Prats H., Touriol C. J. Biol. Chem. 279:18717-18726(2004) [PubMed: 14764596] [Abstract] Cited for: ALTERNATIVE SPLICING (ISOFORMS L-VEGF121; L-VEGF165 AND L-VEGF189). |
| [32] | "Nuclear localization of long-VEGF is associated with hypoxia and tumor angiogenesis." Rosenbaum-Dekel Y., Fuchs A., Yakirevich E., Azriel A., Mazareb S., Resnick M.B., Levi B.Z. Biochem. Biophys. Res. Commun. 332:271-278(2005) [PubMed: 15896327] [Abstract] Cited for: ALTERNATIVE SPLICING (ISOFORMS L-VEGF121 AND L-VEGF165), PROCESSING, SUBCELLULAR LOCATION. |
| [33] | "Substrate and functional diversity of lysine acetylation revealed by a proteomics survey." Kim S.C., Sprung R., Chen Y., Xu Y., Ball H., Pei J., Cheng T., Kho Y., Xiao H., Xiao L., Grishin N.V., White M., Yang X.-J., Zhao Y. Mol. Cell 23:607-618(2006) [PubMed: 16916647] [Abstract] Cited for: ACETYLATION [LARGE SCALE ANALYSIS] AT LYS-147; LYS-149 AND LYS-152, MASS SPECTROMETRY. Tissue: Cervix carcinoma. |
| [34] | "Vascular endothelial growth factor: crystal structure and functional mapping of the kinase domain receptor binding site." Muller Y.A., Li B., Christinger H.W., Wells J.A., Cunningham B.C., de Vos A.M. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 94:7192-7197(1997) [PubMed: 9207067] [Abstract] Cited for: X-RAY CRYSTALLOGRAPHY (2.5 ANGSTROMS) OF 34-135. |
| [35] | "1H, 13C, and 15N backbone assignment and secondary structure of the receptor-binding domain of vascular endothelial growth factor." Fairbrother W.J., Champe M.A., Christinger H.W., Keyt B.A., Starovasnik M.A. Protein Sci. 6:2250-2260(1997) [PubMed: 9336848] [Abstract] Cited for: STRUCTURE BY NMR OF 34-135. |
| [36] | "The crystal structure of vascular endothelial growth factor (VEGF) refined to 1.93-A resolution: multiple copy flexibility and receptor binding." Muller Y.A., Christinger H.W., Keyt B.A., de Vos A.M. Structure 5:1325-1338(1997) [PubMed: 9351807] [Abstract] Cited for: X-RAY CRYSTALLOGRAPHY (1.93 ANGSTROMS) OF 34-135. |
| [37] | "Crystal structure of the complex between VEGF and a receptor-blocking peptide." Wiesmann C., Christinger H.W., Cochran A.G., Cunningham B.C., Fairbrother W.J., Keenan C.J., Meng G., de Vos A.M. Biochemistry 37:17765-17772(1998) [PubMed: 9922142] [Abstract] Cited for: X-RAY CRYSTALLOGRAPHY (1.9 ANGSTROMS) OF 39-134. |
| [38] | "Solution structure of the heparin-binding domain of vascular endothelial growth factor." Fairbrother W.J., Champe M.A., Christinger H.W., Keyt B.A., Starovasnik M.A. Structure 6:637-648(1998) [PubMed: 9634701] [Abstract] Cited for: STRUCTURE BY NMR OF 137-215. |
| + | Additional computationally mapped references. |
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Cross-references
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Entry information
| Entry name | VEGFA_HUMAN | ||||||||
| Accession | Primary (citable) accession number: P15692 Secondary accession number(s): B5BU86 Q9UL23 | ||||||||
| Entry history |
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| Entry status | Reviewed (UniProtKB/Swiss-Prot) | ||||||||
| Annotation program | Chordata Protein Annotation Program | ||||||||
| Disclaimer | Any medical or genetic information present in this entry is provided for research, educational and informational purposes only. It is not in any way intended to be used as a substitute for professional medical advice, diagnosis, treatment or care. | ||||||||
Relevant documents
| Human chromosome 6 Human chromosome 6: entries, gene names and cross-references to MIM |
| MIM cross-references Online Mendelian Inheritance in Man (MIM) cross-references in UniProtKB/Swiss-Prot |
| PDB cross-references Index of Protein Data Bank (PDB) cross-references |
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