P15494 (BEV1A_BETPN) Reviewed, UniProtKB/Swiss-Prot
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April 3, 2013.
Version 91.
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Names·Attributes·General annotation·Ontologies·Sequence annotation·Sequences·References·Cross-refs·Entry info·DocumentsCustomize orderNames and origin
| Protein names | Recommended name: Major pollen allergen Bet v 1-A Alternative name(s): Allergen Bet v I-A Allergen=Bet v 1-A | ||||
| Gene names |
| ||||
| Organism | Betula pendula (European white birch) (Betula verrucosa) | ||||
| Taxonomic identifier | 3505 [NCBI] | ||||
| Taxonomic lineage | Eukaryota › Viridiplantae › Streptophyta › Embryophyta › Tracheophyta › Spermatophyta › Magnoliophyta › eudicotyledons › core eudicotyledons › rosids › fabids › Fagales › Betulaceae › Betula![]() |
Protein attributes
| Sequence length | 160 AA. |
| Sequence status | Complete. |
| Sequence processing | The displayed sequence is further processed into a mature form. |
| Protein existence | Evidence at protein level |
General annotation (Comments)
| Function | May be a general steroid carrier protein By similarity. |
| Subcellular location | |
| Allergenic properties | Causes an allergic reaction in human. Is a cause of type I allergic reactions in Europe, North America and USSR. |
| Sequence similarities | Belongs to the BetVI family. |
Ontologies
| Keywords | |
|---|---|
| Biological process | Plant defense |
| Cellular component | Cytoplasm |
| Disease | Allergen |
| Molecular function | Pathogenesis-related protein |
| Technical term | 3D-structure Direct protein sequencing |
| Gene Ontology (GO) | |
| Biological_process | defense response Inferred from electronic annotation. Source: UniProtKB-KW response to biotic stimulusInferred from electronic annotation. Source: UniProtKB-KW |
| Cellular_component | cytoplasm Inferred from electronic annotation. Source: UniProtKB-SubCell |
| Complete GO annotation... | |
Sequence annotation (Features)
| Feature key | Position(s) | Length | Description | Graphical view | Feature identifier | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule processing | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Initiator methionine | 1 | 1 | Removed Ref.1 Ref.3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Chain | 2 – 160 | 159 | Major pollen allergen Bet v 1-A | PRO_0000154174 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sites | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Binding site | 70 | 1 | Substrate By similarity | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Binding site | 95 | 1 | Substrate By similarity | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Binding site | 121 | 1 | Substrate By similarity | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Binding site | 127 | 1 | Substrate By similarity | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Natural variations | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 63 | 1 | F → L. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Experimental info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Mutagenesis | 29 | 1 | N → T: Slightly reduced interaction with BV16; when associated with N-33. Ref.8 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Mutagenesis | 33 | 1 | K → N: Slightly reduced interaction with BV16; when associated with T-29. Ref.8 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Mutagenesis | 46 | 1 | E → S: Strongly reduced interaction with BV16, hypoallergenic. Ref.8 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Mutagenesis | 48 | 1 | N → S: Slightly reduced interaction with BV16. Ref.8 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Mutagenesis | 61 | 1 | E → S: Slightly reduced interaction with BV16. Ref.8 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Mutagenesis | 109 | 1 | P → G: Slightly reduced interaction with BV16. Ref.8 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Helix Strand Turn | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 3 – 14 | 12 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 16 – 23 | 8 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 24 – 26 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 27 – 34 | 8 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 36 – 38 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 41 – 46 | 6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 48 – 50 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 54 – 58 | 5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 61 – 64 | 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 66 – 76 | 11 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 77 – 80 | 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 81 – 89 | 9 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 93 – 95 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 96 – 107 | 12 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 109 – 111 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 113 – 125 | 13 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 131 – 154 | 24 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 156 – 159 | 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequences
| ||||||||||||||||||
References
| [1] | "The gene coding for the major birch pollen allergen Betv1, is highly homologous to a pea disease resistance response gene." Breiteneder H., Pettenburger K., Bito A., Valenta R., Kraft D., Rumpold H., Scheiner O., Breitenbach M. EMBO J. 8:1935-1938(1989) [PubMed] [Europe PMC] [Abstract] Cited for: NUCLEOTIDE SEQUENCE [MRNA], PROTEIN SEQUENCE OF 2-35. Tissue: Pollen. |
| [2] | Larsen J.N. Submitted (SEP-1996) to the EMBL/GenBank/DDBJ databases Cited for: NUCLEOTIDE SEQUENCE [MRNA]. Tissue: Pollen. |
| [3] | "Isoforms of Bet v 1, the major birch pollen allergen, analyzed by liquid chromatography, mass spectrometry, and cDNA cloning." Swoboda I., Jilek A., Ferreira F., Engel E., Hoffman-Sommergruber K., Scheiner O., Kraft D., Breiteneder H., Pittenauer E., Schmid E., Vicente O., Heberle-Bors E., Ahorn H., Breitenbach M. J. Biol. Chem. 270:2607-2613(1995) [PubMed] [Europe PMC] [Abstract] Cited for: PROTEIN SEQUENCE OF 2-160. Tissue: Pollen. |
| [4] | "Purification and N-terminal amino acid sequence of two birch pollen isoallergens (Bet v I and Bet v II)." Elsayed S., Vik H. Int. Arch. Allergy Appl. Immunol. 93:378-384(1990) [PubMed] [Europe PMC] [Abstract] Cited for: PARTIAL PROTEIN SEQUENCE. |
| [5] | "Secondary structure and tertiary fold of the birch pollen allergen Bet v 1 in solution." Faber C., Lindemann A., Sticht H., Ejchart A., Kungl A., Susani M., Frank R.W., Kraft D., Breitenbach M., Roesch P. J. Biol. Chem. 271:19243-19250(1996) [PubMed] [Europe PMC] [Abstract] Cited for: STRUCTURE BY NMR. |
| [6] | "X-ray and NMR structure of Bet v 1, the origin of birch pollen allergy." Gajhede M., Osmark P., Poulsen F.M., Ipsen H., Larsen J.N., van Neerven R.J.J., Schou C., Loewenstein H., Spangfort M.D. Nat. Struct. Biol. 3:1040-1045(1996) [PubMed] [Europe PMC] [Abstract] Cited for: X-RAY CRYSTALLOGRAPHY (2.0 ANGSTROMS), STRUCTURE BY NMR. |
| [7] | "Dominant epitopes and allergic cross-reactivity: complex formation between a Fab fragment of a monoclonal murine IgG antibody and the major allergen from birch pollen Bet v 1." Mirza O., Henriksen A., Ipsen H., Larsen J.N., Wissenbach M., Spangfort M.D., Gajhede M. J. Immunol. 165:331-338(2000) [PubMed] [Europe PMC] [Abstract] Cited for: X-RAY CRYSTALLOGRAPHY (2.9 ANGSTROMS) IN COMPLEX WITH THE FAB FRAGMENT FROM A MURINE MONOCLONAL IGG1 AB. |
| [8] | "Dominating IgE-binding epitope of Bet v 1, the major allergen of birch pollen, characterized by X-ray crystallography and site-directed mutagenesis." Spangfort M.D., Mirza O., Ipsen H., Van Neerven R.J., Gajhede M., Larsen J.N. J. Immunol. 171:3084-3090(2003) [PubMed] [Europe PMC] [Abstract] Cited for: X-RAY CRYSTALLOGRAPHY (3.1 ANGSTROMS) IN COMPLEX WITH THE FAB FRAGMENT FROM THE HUMAN MONOCLONAL BV16 IMMUNOGLOBULIN, MUTAGENESIS OF ASN-29; LYS-33; GLU-46; ASN-48; GLU-61 AND PRO-109. |
| + | Additional computationally mapped references. |
Cross-references
Sequence databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| EMBL GenBank DDBJ | X15877 mRNA. Translation: CAA33887.1. Z80098 mRNA. Translation: CAB02153.1. Z80099 mRNA. Translation: CAB02154.1. Z80104 mRNA. Translation: CAB02159.1. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| PIR | S05376. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3D structure databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| PDBe RCSB PDB PDBj |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| ProteinModelPortal | P15494. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| SMR | P15494. Positions 2-160. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| ModBase | Search... | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Protein family/group databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Allergome | 123. Bet v 1.2801. 89. Bet v 1. 90. Bet v 1.0101. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Protocols and materials databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| StructuralBiologyKnowledgebase | Search... | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Family and domain databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Gene3D | 3.30.530.20. 1 hit. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| InterPro | IPR024949. Bet_v_I_allergen. IPR000916. Bet_v_I_dom. IPR023393. START-like_dom. [Graphical view] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Pfam | PF00407. Bet_v_1. 1 hit. [Graphical view] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| PRINTS | PR00634. BETALLERGEN. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| PROSITE | PS00451. PATHOGENESIS_BETVI. 1 hit. [Graphical view] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| ProtoNet | Search... | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Other | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| EvolutionaryTrace | P15494. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry information
| Entry name | BEV1A_BETPN | ||||||||
| Accession | Primary (citable) accession number: P15494 Secondary accession number(s): Q96369 | ||||||||
| Entry history |
| ||||||||
| Entry status | Reviewed (UniProtKB/Swiss-Prot) | ||||||||
| Annotation program | Plant Protein Annotation Program | ||||||||
Relevant documents
| Allergens Nomenclature of allergens and list of entries |
| PDB cross-references Index of Protein Data Bank (PDB) cross-references |
| SIMILARITY comments Index of protein domains and families |

Clusters with
