P15289 (ARSA_HUMAN) Reviewed, UniProtKB/Swiss-Prot
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May 16, 2012.
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| Protein names | Recommended name: Arylsulfatase A Short name=ASA EC=3.1.6.8 Alternative name(s): Cerebroside-sulfatase Cleaved into the following 2 chains: | ||
| Gene names |
| ||
| Organism | Homo sapiens (Human) | ||
| Taxonomic identifier | 9606 [NCBI] | ||
| Taxonomic lineage | Eukaryota › Metazoa › Chordata › Craniata › Vertebrata › Euteleostomi › Mammalia › Eutheria › Euarchontoglires › Primates › Haplorrhini › Catarrhini › Hominidae › Homo |
Protein attributes
| Sequence length | 507 AA. |
| Sequence status | Complete. |
| Sequence processing | The displayed sequence is further processed into a mature form. |
| Protein existence | Evidence at protein level |
General annotation (Comments)
| Function | Hydrolyzes cerebroside sulfate. |
| Catalytic activity | A cerebroside 3-sulfate + H2O = a cerebroside + sulfate. |
| Cofactor | Binds 1 calcium ion per subunit. Ref.14 |
| Enzyme regulation | Inhibited by phosphate. The phosphate forms a covalent bond with the active site 3-oxoalanine. Ref.14 |
| Subunit structure | Homodimer at neutral pH and homooctamer at acidic pH. Exists both as a single chain of 58 kDa (component A) or as a chain of 50 kDa (component B) linked by disulfide bond(s) to a 7 kDa chain (component C). Interacts with SUMF1. Ref.8 Ref.12 Ref.14 |
| Subcellular location | |
| Post-translational modification | The conversion to 3-oxoalanine (also known as C-formylglycine, FGly), of a serine or cysteine residue in prokaryotes and of a cysteine residue in eukaryotes, is critical for catalytic activity. This post-translational modification is severely defective in multiple sulfatase deficiency (MSD). |
| Involvement in disease | Defects in ARSA are a cause of leukodystrophy metachromatic (MLD) [MIM:250100]. MLD is a disease due to a lysosomal storage defect. It is characterized by intralysosomal storage of cerebroside-3-sulfate in neural and non-neural tissues, with a diffuse loss of myelin in the central nervous system. Progressive demyelination causes a variety of neurological symptoms, including gait disturbances, ataxias, optical atrophy, dementia, seizures, and spastic tetraparesis. Three forms of the disease can be distinguished according to the age at onset: late-infantile, juvenile and adult. Ref.18 Ref.19 Ref.20 Ref.21 Ref.22 Ref.23 Ref.24 Ref.25 Ref.26 Ref.27 Ref.28 Ref.29 Ref.30 Ref.31 Ref.32 Ref.34 Ref.35 Ref.36 Ref.37 Ref.40 Ref.41 Ref.43 Ref.44 Ref.45 Ref.46 Ref.47 Ref.48 Ref.49 Ref.50 Ref.51 Ref.52 Ref.53 Ref.54 Ref.55 Ref.56 Ref.57 Ref.58 Ref.59 Ref.60 Ref.61 Ref.62 Arylsulfatase A activity is defective in multiple sulfatase deficiency (MSD) [MIM:272200]. A clinically and biochemically heterogeneous disorder caused by the simultaneous impairment of all sulfatases, due to defective post-translational modification and activation. It combines features of individual sulfatase deficiencies such as metachromatic leukodystrophy, mucopolysaccharidosis, chondrodysplasia punctata, hydrocephalus, ichthyosis, neurologic deterioration and developmental delay. Note=Arylsulfatase A activity is impaired in multiple sulfatase deficiency due to mutations in SUMF1. SUMF1 mutations result in defective post-translational modification of ARSA at residue Cys-69 that is not converted to 3-oxoalanine. Ref.9 Ref.10 |
| Miscellaneous | The metal cofactor was first identified as magnesium ion, based on the structure of the recombinant protein, but when purified from human placenta, the protein contains 1 calcium ion per subunit. |
| Sequence similarities | Belongs to the sulfatase family. |
| Sequence caution | The sequence AAB03341.1 differs from that shown. Reason: Erroneous initiation. |
Ontologies
| Keywords | |
|---|---|
| Cellular component | Lysosome |
| Coding sequence diversity | Polymorphism |
| Disease | Disease mutation Ichthyosis Leukodystrophy Metachromatic leukodystrophy |
| Domain | Signal |
| Ligand | Calcium Metal-binding |
| Molecular function | Hydrolase |
| PTM | Disulfide bond Glycoprotein |
| Technical term | 3D-structure Complete proteome Direct protein sequencing Reference proteome |
| Gene Ontology (GO) | |
| Biological process | glycosphingolipid metabolic process Traceable author statement. Source: Reactome small molecule metabolic processTraceable author statement. Source: Reactome |
| Cellular component | lysosomal lumen Traceable author statement. Source: Reactome |
| Molecular function | arylsulfatase activity Traceable author statement Ref.1. Source: ProtInc calcium ion bindingInferred from direct assay Ref.14. Source: UniProtKB cerebroside-sulfatase activityTraceable author statement. Source: Reactome |
| Complete GO annotation... | |
Sequence annotation (Features)
| Feature key | Position(s) | Length | Description | Graphical view | Feature identifier | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule processing | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Signal peptide | 1 – 18 | 18 | Ref.8 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Chain | 19 – 507 | 489 | Arylsulfatase A | PRO_0000033417 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Chain | 19 – 444 | 426 | Arylsulfatase A component B | PRO_0000033418 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Chain | 448 – 507 | 60 | Arylsulfatase A component C | PRO_0000033419 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sites | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Active site | 125 | 1 | Ref.14 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Metal binding | 29 | 1 | Calcium | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Metal binding | 30 | 1 | Calcium | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Metal binding | 69 | 1 | Calcium; via 3-oxoalanine | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Metal binding | 281 | 1 | Calcium | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Metal binding | 282 | 1 | Calcium | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Binding site | 123 | 1 | Substrate | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Binding site | 150 | 1 | Substrate | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Binding site | 229 | 1 | Substrate | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Binding site | 302 | 1 | Substrate | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Amino acid modifications | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Modified residue | 69 | 1 | 3-oxoalanine (Cys) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Glycosylation | 158 | 1 | N-linked (GlcNAc...) Ref.11 Ref.14 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Glycosylation | 184 | 1 | N-linked (GlcNAc...) Ref.14 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Glycosylation | 350 | 1 | N-linked (GlcNAc...) Ref.11 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Disulfide bond | 156 ↔ 172 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Disulfide bond | 161 ↔ 168 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Disulfide bond | 300 ↔ 414 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Disulfide bond | 488 ↔ 500 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Disulfide bond | 489 ↔ 502 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Disulfide bond | 493 ↔ 499 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Natural variations | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 18 | 1 | A → D in MLD; enzyme activity reduced to 5% of wild-type enzyme. Ref.59 | VAR_054164 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 29 | 1 | D → N in MLD; infantile-onset; causes a severe reduction of enzyme activity. Ref.56 | VAR_054165 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 30 | 1 | D → H in MLD; enzyme activity reduced to 2.4% of wild-type enzyme. Ref.59 | VAR_054166 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 32 | 1 | G → S in MLD; late-infantile form. Ref.44 | VAR_054167 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 52 | 1 | L → P in MLD; loss of enzymatic activity. Ref.60 | VAR_067414 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 68 | 1 | L → P in MLD; late-infantile form. Ref.44 | VAR_054168 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 76 | 1 | L → P. Ref.42 | VAR_007243 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 82 | 1 | P → L in MLD; late-infantile-onset. Ref.5 Ref.31 Corresponds to variant rs6151411 [ dbSNP | Ensembl ]. | VAR_007244 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 84 | 1 | R → Q in MLD; mild. Ref.21 Ref.59 Corresponds to variant rs74315458 [ dbSNP | Ensembl ]. | VAR_007245 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 84 | 1 | R → W in MLD; juvenile form. Ref.44 | VAR_054169 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 86 | 1 | G → D in MLD; severe; no enzyme residual activity; leads to a decreased stability of the mutant enzyme; causes an arrest of the mutant enzyme polypeptide in a prelysosomal compartment. Ref.29 Ref.47 Corresponds to variant rs74315460 [ dbSNP | Ensembl ]. | VAR_007246 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 94 | 1 | P → A in MLD; adult form. Ref.44 | VAR_054170 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 95 | 1 | S → N in MLD. Ref.35 | VAR_007247 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 96 | 1 | S → F in MLD; severe. Ref.19 Corresponds to variant rs74315456 [ dbSNP | Ensembl ]. | VAR_007248 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 96 | 1 | S → L in MLD; severe; no enzyme residual activity. Ref.29 | VAR_007249 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 99 | 1 | G → D in MLD; adult type. Ref.18 Ref.62 Corresponds to variant rs74315455 [ dbSNP | Ensembl ]. | VAR_007250 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 99 | 1 | G → V in MLD; late-infantile form. Ref.44 | VAR_054171 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 119 | 1 | G → R in MLD; juvenile-onset. Ref.35 | VAR_007251 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 122 | 1 | G → S in MLD; adult type; rs74315461. Ref.25 | VAR_007252 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 135 | 1 | L → P in MLD. Ref.37 Corresponds to variant rs121434215 [ dbSNP | Ensembl ]. | VAR_007253 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 136 | 1 | P → L in MLD; severe late-infantile type; loss of enzymatic activity. Ref.30 Corresponds to variant rs74315462 [ dbSNP | Ensembl ]. | VAR_007254 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 136 | 1 | P → S in MLD; late-infantile form. Ref.44 Ref.55 | VAR_054172 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 137 | 1 | Missing in MLD. Ref.59 | VAR_054173 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 138 | 1 | H → D in MLD; significantly lower activity than wild-type protein. Ref.60 | VAR_067415 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 143 | 1 | R → G in MLD; juvenile/adult-onset; generates 5% as much activity as the parallel normal control. Ref.49 | VAR_054174 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 148 | 1 | P → L in MLD; juvenile-onset. Ref.46 | VAR_054175 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 152 | 1 | D → Y in MLD. Ref.35 | VAR_007255 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 153 | 1 | Q → H in MLD; late-infantile form; no enzyme residual activity. Ref.32 | VAR_054176 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 154 | 1 | G → D in MLD. Ref.59 Corresponds to variant rs74315463 [ dbSNP | Ensembl ]. | VAR_007256 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 155 | 1 | P → L in MLD; juvenile-onset. Ref.54 | VAR_054177 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 155 | 1 | P → R in MLD. Corresponds to variant rs74315464 [ dbSNP | Ensembl ]. | VAR_007257 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 156 | 1 | C → R in MLD; adult type; enzyme activity reduced to 50% of wild-type enzyme. Ref.56 | VAR_054178 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 167 | 1 | P → R in MLD. Corresponds to variant rs74315465 [ dbSNP | Ensembl ]. | VAR_007258 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 169 | 1 | D → N in MLD. Corresponds to variant rs74315466 [ dbSNP | Ensembl ]. | VAR_007259 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 172 | 1 | C → Y in MLD; juvenile-onset. Ref.31 | VAR_007260 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 179 | 1 | I → S in MLD; mild. Ref.37 Ref.45 Ref.56 Ref.59 Ref.61 Corresponds to variant rs74315457 [ dbSNP | Ensembl ]. | VAR_007261 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 181 | 1 | L → Q in MLD; infantile form. Ref.54 | VAR_054179 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 190 | 1 | Q → H in MLD; no enzyme residual activity. Ref.29 | VAR_054180 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 191 | 1 | P → T in MLD; juvenile-onset. Ref.46 | VAR_054181 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 193 | 1 | W → C. Ref.5 Ref.20 Ref.42 Ref.44 Ref.50 Ref.56 Corresponds to variant rs6151415 [ dbSNP | Ensembl ]. | VAR_007262 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 201 | 1 | Y → C in MLD; juvenile-onset; low amounts of residual enzyme activity; leads to a decreased stability of the mutant enzyme; causes an arrest of the mutant enzyme polypeptide in a prelysosomal compartment. Ref.31 Ref.47 Ref.59 | VAR_007263 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 212 | 1 | A → P in MLD; loss of enzymatic activity. Ref.59 Ref.60 | VAR_054182 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 212 | 1 | A → V in MLD. Ref.26 Ref.44 Ref.54 Corresponds to variant rs74315467 [ dbSNP | Ensembl ]. | VAR_007264 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 217 | 1 | R → H in MLD; enzyme activity reduced to 15.6% of wild-type enzyme. Ref.59 Corresponds to variant rs148403406 [ dbSNP | Ensembl ]. | VAR_054183 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 219 | 1 | F → V in MLD; enzyme activity reduced to less than 1% of normal activity. Ref.58 | VAR_054184 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 224 | 1 | A → V in MLD. Ref.26 Corresponds to variant rs74315468 [ dbSNP | Ensembl ]. | VAR_007265 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 227 | 1 | H → Y in MLD; late-infantile form. Ref.44 | VAR_054185 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 231 | 1 | P → T in MLD. Corresponds to variant rs74315469 [ dbSNP | Ensembl ]. | VAR_007266 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 244 | 1 | R → C in MLD; juvenile-onset. Corresponds to variant rs74315470 [ dbSNP | Ensembl ]. | VAR_007267 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 244 | 1 | R → H in MLD; infantile-onset. Ref.35 | VAR_007268 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 245 | 1 | G → R in MLD; severe. Ref.23 Corresponds to variant rs74315471 [ dbSNP | Ensembl ]. | VAR_007269 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 247 | 1 | F → S in MLD. Ref.55 Ref.61 | VAR_054186 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 250 | 1 | S → Y in MLD; infantile-onset. Ref.35 | VAR_007270 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 253 | 1 | E → K in MLD; late-infantile. Ref.51 Ref.59 Corresponds to variant rs74315483 [ dbSNP | Ensembl ]. | VAR_054187 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 255 | 1 | D → H in MLD; late-infantile form; no enzyme residual activity; leads to a decreased stability of the mutant enzyme; causes an arrest of the mutant enzyme polypeptide in a prelysosomal compartment. Ref.44 Ref.47 Corresponds to variant rs80338819 [ dbSNP | Ensembl ]. | VAR_054188 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 274 | 1 | T → M in MLD; severe; 35% of normal activity. Ref.27 Ref.29 Ref.33 Corresponds to variant rs74315472 [ dbSNP | Ensembl ]. | VAR_007271 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 281 | 1 | D → Y in MLD. Ref.45 | VAR_054189 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 282 | 1 | N → S in MLD; enzyme activity reduced to 0.6% of wild-type enzyme. Ref.59 | VAR_054190 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 286 | 1 | T → P in MLD; adult type. Ref.48 Corresponds to variant rs28940894 [ dbSNP | Ensembl ]. | VAR_054191 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 288 | 1 | R → C in MLD. Ref.61 Corresponds to variant rs74315473 [ dbSNP | Ensembl ]. | VAR_007272 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 288 | 1 | R → H in MLD; adult form. Ref.44 | VAR_054192 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 293 | 1 | G → D in MLD; late-onset. Ref.57 | VAR_054193 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 293 | 1 | G → S in MLD; adult type; causes a severe reduction of enzyme activity. Ref.56 | VAR_054194 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 294 | 1 | C → Y in MLD; juvenile-onset; causes a severe reduction of enzyme activity. Ref.56 | VAR_054195 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 295 | 1 | S → Y in MLD; severe. Ref.26 Corresponds to variant rs74315474 [ dbSNP | Ensembl ]. | VAR_007273 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 298 | 1 | L → S in MLD; late-infantile form; complete loss of enzyme activity. Ref.41 | VAR_054196 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 300 | 1 | C → F in MLD; late-infantile-onset; enzyme activity reduced to less than 1%; the mutant protein is unstable; results in more rapid enzyme degradation in lysosomes; addition of the cysteine protease inhibitor leupeptin does not increase the amount of the enzyme activity; strongly interferes with the octamerization process of the enzyme at low pH. Ref.43 Ref.52 Ref.53 | VAR_008132 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 302 | 1 | K → N in MLD; enzyme activity reduced to 2.8% of wild-type enzyme. Ref.59 | VAR_054197 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 304 | 1 | T → M in MLD; loss of enzymatic activity. Ref.60 | VAR_067416 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 306 | 1 | Y → H in MLD; juvenile-onset. Ref.54 | VAR_054198 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 307 | 1 | E → K in MLD; loss of enzymatic activity. Ref.60 | VAR_067417 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 308 | 1 | G → D in MLD; late-infantile form. Ref.44 | VAR_054199 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 308 | 1 | G → V in MLD; late-infantile form; no enzyme residual activity. Ref.32 | VAR_054200 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 309 | 1 | G → S in MLD; severe; 13% of normal activity. Ref.22 Ref.56 Corresponds to variant rs74315459 [ dbSNP | Ensembl ]. | VAR_007274 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 311 | 1 | R → Q in MLD; juvenile-onset. Ref.31 | VAR_007275 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 312 | 1 | E → D in MLD; low amounts of residual enzyme activity; leads to a decreased stability of the mutant enzyme. Ref.47 | VAR_054201 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 314 | 1 | A → T in MLD; infantile-onset. Ref.35 | VAR_007276 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 325 | 1 | G → S in MLD; juvenile-onset. Ref.54 Corresponds to variant rs148092995 [ dbSNP | Ensembl ]. | VAR_054202 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 327 | 1 | T → I in MLD; late-infantile form. Ref.44 | VAR_054203 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 335 | 1 | D → V in MLD; late-infantile-onset; loss of enzymatic activity. Ref.31 Ref.33 Ref.46 Ref.54 Ref.61 Corresponds to variant rs74315475 [ dbSNP | Ensembl ]. | VAR_007277 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 350 | 1 | N → S Associated with arylsulfatase A pseudodeficiency; appears to be responsible for the small size of the enzyme produced by pseudodeficiency fibroblasts because it leads to loss of an N-glycosylation site. Ref.5 Ref.17 Ref.44 Ref.51 Ref.57 Corresponds to variant rs2071421 [ dbSNP | Ensembl ]. | VAR_007278 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 356 | 1 | F → V. Ref.5 Corresponds to variant rs6151422 [ dbSNP | Ensembl ]. | VAR_018838 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 367 | 1 | K → N in MLD. Ref.35 | VAR_007279 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 370 | 1 | R → Q in MLD; mild. Corresponds to variant rs74315477 [ dbSNP | Ensembl ]. | VAR_007280 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 370 | 1 | R → W in MLD; severe; no enzyme residual activity. Ref.29 Ref.59 Corresponds to variant rs74315476 [ dbSNP | Ensembl ]. | VAR_007281 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 376 | 1 | Y → N in MLD; enzyme activity reduced to 4.7% of wild-type enzyme. Ref.59 | VAR_054204 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 377 | 1 | P → L in MLD; severe. Ref.44 Corresponds to variant rs74315478 [ dbSNP | Ensembl ]. | VAR_007282 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 381 | 1 | D → E in MLD; early-infantile form. Ref.55 | VAR_054205 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 382 | 1 | E → K in MLD; intermediate. Ref.61 Corresponds to variant rs74315479 [ dbSNP | Ensembl ]. | VAR_007283 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 384 | 1 | R → C in MLD. Ref.35 | VAR_007284 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 390 | 1 | R → Q in MLD; juvenile-onset. Ref.40 Ref.61 | VAR_007285 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 390 | 1 | R → W in MLD; late-infantile and juvenile-onset. Ref.31 Ref.59 Ref.61 Corresponds to variant rs74315480 [ dbSNP | Ensembl ]. | VAR_007286 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 391 | 1 | T → S. Ref.5 Ref.7 Ref.20 Ref.42 Ref.44 Ref.48 Ref.50 Ref.51 Ref.56 Corresponds to variant rs743616 [ dbSNP | Ensembl ]. | VAR_007287 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 397 | 1 | H → Y in MLD; adult-onset. Ref.40 Ref.46 Ref.61 | VAR_007288 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 398 | 1 | Missing in MLD. | VAR_007289 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 406 – 408 | 3 | Missing in MLD; late-infantile-onset. | VAR_007290 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 406 | 1 | S → G in MLD; loss of enzymatic activity. Ref.60 | VAR_067418 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 408 | 1 | T → I in MLD; adult type. Ref.50 Corresponds to variant rs28940895 [ dbSNP | Ensembl ]. | VAR_054206 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 409 | 1 | T → I in MLD; mild. Ref.28 Ref.62 Corresponds to variant rs74315481 [ dbSNP | Ensembl ]. | VAR_054207 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 425 | 1 | P → T in MLD; juvenile-onset; retains about 12% of specific enzyme activity; the mutant protein is unstable; results in more rapid enzyme degradation in lysosomes; addition of the cysteine protease inhibitor leupeptin increases the amount of the enzyme activity; displays a modest reduction in the octamerization process of the enzyme at low pH. Ref.43 Ref.52 Ref.53 Corresponds to variant rs74315485 [ dbSNP | Ensembl ]. | VAR_008133 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 426 | 1 | P → L in MLD; juvenile/adult-onset; mild; common mutation. Ref.20 Ref.24 Ref.46 Ref.51 Ref.54 Ref.55 Ref.56 Ref.61 Corresponds to variant rs28940893 [ dbSNP | Ensembl ]. | VAR_007291 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 428 | 1 | L → P in MLD; late-infantile form. Ref.34 Ref.59 | VAR_054208 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 429 | 1 | Y → S in MLD; adult-onset. Ref.54 | VAR_054209 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 440 | 1 | N → S. Ref.5 Corresponds to variant rs6151427 [ dbSNP | Ensembl ]. | VAR_018839 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 464 | 1 | A → V. Ref.42 | VAR_007292 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 469 | 1 | A → G in MLD; early-infantile form. Ref.55 | VAR_054210 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 489 | 1 | C → G in MLD; late-onset. Ref.57 | VAR_054211 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 496 | 1 | R → H. Ref.5 Ref.35 Ref.39 Corresponds to variant rs6151428 [ dbSNP | Ensembl ]. | VAR_007293 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Experimental info | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Mutagenesis | 69 | 1 | C → A: Abolishes enzyme activity. Ref.13 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Mutagenesis | 69 | 1 | C → S: Strongly decreases enzyme activity. Ref.13 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Secondary structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Helix Strand Turn | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 22 – 30 | 9 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 37 – 39 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 47 – 54 | 8 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 56 – 63 | 8 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 65 – 68 | 4 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 69 – 78 | 10 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 82 – 85 | 4 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 107 – 112 | 6 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 113 – 115 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 117 – 122 | 6 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 130 – 132 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 136 – 139 | 4 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 142 – 146 | 5 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 153 – 155 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 159 – 162 | 4 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 163 – 165 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 181 – 183 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 186 – 191 | 6 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 194 – 196 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 197 – 214 | 18 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 219 – 224 | 6 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 229 – 231 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 236 – 241 | 6 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 242 – 244 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 245 – 267 | 23 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 271 – 273 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 274 – 282 | 9 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 286 – 291 | 6 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 304 – 306 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 307 – 310 | 4 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 315 – 317 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 319 – 321 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 324 – 327 | 4 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 333 – 335 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 336 – 343 | 8 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 359 – 363 | 5 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 372 – 375 | 4 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 382 – 384 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 387 – 391 | 5 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 394 – 400 | 7 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 404 – 406 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 412 – 414 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 421 – 430 | 10 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 431 – 433 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 450 – 469 | 20 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 477 – 479 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 483 – 485 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 496 – 499 | 4 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequences
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References
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Entry information
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