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UniProtKB/Swiss-Prot P12830 (CADH1_HUMAN)
Last modified
November 25, 2008.
Version 116.
History...
Clusters with 100%,
90%,
50% identity |
Documents (8) |
Third-party data |
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Names and origin
| Protein names | Recommended name: Epithelial cadherin Short name=E-cadherin Alternative name(s): Cadherin-1 Uvomorulin CAM 120/80 CD_antigen=CD324 Cleaved into the following 3 chains: 1- Recommended name: E-Cad/CTF1 2- Recommended name: E-Cad/CTF2 3- Recommended name: E-Cad/CTF3 | ||||
| Gene names |
| ||||
| Organism | Homo sapiens (Human) | ||||
| Taxonomic identifier | 9606 [NCBI] | ||||
| Taxonomic lineage | Eukaryota › Metazoa › Chordata › Craniata › Vertebrata › Euteleostomi › Mammalia › Eutheria › Euarchontoglires › Primates › Haplorrhini › Catarrhini › Hominidae › Homo |
Protein attributes
| Sequence length | 882 AA. |
| Sequence status | Complete. |
| Sequence processing | The displayed sequence is further processed into a mature form. |
| Protein existence | Evidence at protein level. |
General annotation (Comments)
| Function | Cadherins are calcium-dependent cell adhesion proteins. They preferentially interact with themselves in a homophilic manner in connecting cells; cadherins may thus contribute to the sorting of heterogeneous cell types. CDH1 is involved in mechanisms regulating cell-cell adhesions, mobility and proliferation of epithelial cells. Has a potent invasive suppressor role. It is a ligand for integrin alpha-E/beta-7. E-Cad/CTF2 promotes non-amyloidogenic degradation of Abeta precursors. Has a strong inhibitory effect on APP C99 and C83 production. |
| Subunit structure | Homodimer; disulfide-linked. Interacts directly, via the cytoplasmic domain, with CTNNB1 or JUP to form the PSEN1/cadherin/catenin adhesion complex which connects to the actin skeleton through the actin binding of alpha-catenin. Interaction with PSEN1, cleaves CDH1 resulting in the disassociation of cadherin-based adherens junctions (CAJs). Interacts with AJAP1, CTNND1 and DLGAP5. |
| Subcellular location | Cell junction. Cell membrane; Single-pass type I membrane protein. Note= Colocalizes with DLGAP5 at sites of cell-cell contact in intestinal epithelial cells. Anchored to actin microfilaments through association with alpha-, beta- and gamma-catenin. Sequential proteolysis induced by apoptosis or calcium influx, results in translocation from sites of cell-cell contact to the cytoplasm. |
| Tissue specificity | Non-neural epithelial tissues. |
| Post-translational modification | During apoptosis or with calcium influx, cleaved by a membrane-bound metalloproteinase (ADAM10), PS1/gamma-secretase and caspase-3 to produce fragments of about 38 kDa (E-CAD/CTF1), 33 kDa (E-CAD/CTF2) and 29 kDa (E-CAD/CTF3), respectively. Processing by the metalloproteinase, induced by calcium influx, causes disruption of cell-cell adhesion and the subsequent release of beta-catenin into the cytoplasm. The residual membrane-tethered cleavage product is rapidly degraded via an intracellular proteolytic pathway. Cleavage by caspase-3 releases the cytoplasmic tail resulting in disintegration of the actin microfilament system. The gamma-secretase-mediated cleavage promotes disaaaembly of adherens junctions. |
| Involvement in disease | Defects in CDH1 are involved in dysfunction of the cell-cell adhesion system, triggering cancer invasion (gastric, breast, ovary, endometrium and thyroid) and metastasis. Defects in CDH1 are a cause of hereditary diffuse gastric cancer (HDGC) [MIM:137215]. Defects in CDH1 are a cause of susceptibility to endometrial cancer [MIM:608089]. |
| Sequence similarities | Contains 5 cadherin domains. |
| Sequence caution | The sequence AAA61259.1 differs from that shown. Reason: Frameshift at positions 16, 22, 25, 28, 31, 34, 52, 67, 73, 76, 94, 102, 633 and 636. |
Ontologies
Binary interactions
With | Entry | #Exp. | IntAct | Notes |
|---|---|---|---|---|
| CTNNB1 | P35222 | 1 | EBI-727477,EBI-491549 | |
| FGFR1 | P11362 | 1 | EBI-727477,EBI-1028277 | |
| inlA | P25146 | 1 | EBI-727477,EBI-1035388 | From a different organism. |
| PPP1CA | P62136 | 2 | EBI-727477,EBI-357253 | |
| PRKD1 | Q15139 | 3 | EBI-727477,EBI-1181072 |
Sequence annotation (Features)
| Feature key | Position(s) | Length | Description | Graphical view | Feature identifier | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule processing | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Signal peptide | 1 – 22 | 22 | Potential | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Propeptide | 23 – 154 | 132 | Potential | PRO_0000003715 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Chain | 155 – 882 | 728 | Epithelial cadherin | PRO_0000003716 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Chain | 701 – 882 | 182 | E-Cad/CTF1 | PRO_0000236067 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Chain | 732 – 882 | 151 | E-Cad/CTF2 | PRO_0000236068 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Chain | 751 – 882 | 132 | E-Cad/CTF3 | PRO_0000236069 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Regions | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Topological domain | 155 – 709 | 555 | Extracellular Potential | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Transmembrane | 710 – 730 | 21 | Potential | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Topological domain | 731 – 882 | 152 | Cytoplasmic Potential | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Domain | 155 – 262 | 108 | Cadherin 1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Domain | 263 – 375 | 113 | Cadherin 2 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Domain | 376 – 486 | 111 | Cadherin 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Domain | 487 – 593 | 107 | Cadherin 4 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Domain | 594 – 697 | 104 | Cadherin 5 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Region | 758 – 769 | 12 | Required for binding CTNND1 and PSEN1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Region | 811 – 882 | 72 | Required for binding alpha, beta and gamma catenins | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Compositional bias | 838 – 851 | 14 | Ser-rich | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sites | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Site | 700 – 701 | 2 | Cleavage; by a metalloproteinase | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Site | 731 – 732 | 2 | Cleavage; by gamma-secretase/PS1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Site | 750 – 751 | 2 | Cleavage; by caspase-3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Amino acid modifications | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Modified residue | 838 | 1 | Phosphoserine By similarity | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Modified residue | 840 | 1 | Phosphoserine By similarity | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Modified residue | 846 | 1 | Phosphoserine By similarity | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Glycosylation | 558 | 1 | N-linked (GlcNAc...) Potential | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Glycosylation | 637 | 1 | N-linked (GlcNAc...) Potential | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Disulfide bond | 163 | Interchain | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Natural variations | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 123 | 1 | H → Y in diffuse gastric cancer. | VAR_001306 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 193 | 1 | T → P in diffuse gastric cancer. | VAR_001307 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 244 | 1 | D → G in HDGC. | VAR_008712 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 270 | 1 | S → A May contribute to prostate cancer. | VAR_013970 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 274 – 277 | 4 | Missing in gastric adenocarcinoma. | VAR_001308 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 282 | 1 | M → I in a breast cancer sample; somatic mutation. | VAR_033026 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 315 | 1 | N → S in lobular breast carcinoma. | VAR_001309 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 336 | 1 | E → D | VAR_001310 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 340 | 1 | T → A in HDGC and colorectal cancer. | VAR_013971 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 370 | 1 | D → A in diffuse gastric cancer. | VAR_001311 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 400 | 1 | Missing in gastric carcinoma; loss of heterozygosity. | VAR_001312 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 418 – 423 | 6 | Missing in gastric carcinoma. | VAR_001313 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 463 | 1 | E → Q in diffuse gastric cancer. | VAR_001314 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 470 | 1 | T → I | VAR_001315 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 473 | 1 | V → D in diffuse gastric cancer. | VAR_001317 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 478 | 1 | L → P | VAR_023357 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 487 | 1 | V → A in HDGC. | VAR_008713 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 592 | 1 | A → T in thyroid cancer; may play a role in colorectal carcinogenesis. | VAR_001318 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 598 | 1 | R → Q in diffuse gastric cancer. | VAR_001319 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 617 | 1 | A → T in endometrial cancer; loss of heterozygosity; also found as a polymorphism. | VAR_001320 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 630 | 1 | L → V: dbSNP rs2276331. | VAR_021868 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 695 | 1 | C → R: dbSNP rs9282655. | VAR_021869 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 711 | 1 | L → V in endometrial cancer. | VAR_001321 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 777 | 1 | D → N in a breast cancer sample; somatic mutation. | VAR_033027 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 832 | 1 | V → M | VAR_023358 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 838 | 1 | S → G in ovarian cancer; loss of heterozygosity. | VAR_001322 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 880 | 1 | E → K | VAR_023359 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Experimental info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Mutagenesis | 759 – 761 | 3 | GGG → AAA: Binds to CTNNB1 but abolishes formation of the PSEN1/CTNNB1 complex; when associated with CTNNB1 D-431. Abolishes binding PSEN1. Abolishes gamma-secretase cleavage | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence conflict | 10 | 1 | A → G in AAA61259. Ref.3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence conflict | 29 | 1 | H → L in AAA61259. Ref.3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence conflict | 47 | 1 | E → R in AAA61259. Ref.3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence conflict | 70 – 71 | 2 | SL → P in AAA61259. Ref.3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence conflict | 483 | 1 | A → G in AAA61259. Ref.3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence conflict | 530 | 1 | A → R in AAA61259. Ref.3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence conflict | 543 | 1 | S → F in CAA79356. Ref.2 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence conflict | 615 | 1 | I → H in AAA61259. Ref.3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence conflict | 634 – 636 | 3 | ASA → RVP in AAA61259. Ref.3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence conflict | 868 | 1 | R → P in AAA61259. Ref.3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence conflict | 882 | 1 | D → H in AAA61259. Ref.3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Helix Strand Turn | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 161 – 164 | 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 169 – 177 | 9 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 181 – 184 | 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 188 – 195 | 8 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 196 – 198 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 199 – 201 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 204 – 207 | 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 209 – 211 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 213 – 216 | 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 222 – 224 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 227 – 236 | 10 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 241 – 243 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 246 – 253 | 8 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 261 – 272 | 12 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 280 – 283 | 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 292 – 294 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||

Clusters with