P12755 (SKI_HUMAN) Reviewed, UniProtKB/Swiss-Prot
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May 1, 2013.
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| Protein names | Recommended name: Ski oncogene Alternative name(s): Proto-oncogene c-Ski | ||
| Gene names |
| ||
| Organism | Homo sapiens (Human) [Reference proteome] | ||
| Taxonomic identifier | 9606 [NCBI] | ||
| Taxonomic lineage | Eukaryota › Metazoa › Chordata › Craniata › Vertebrata › Euteleostomi › Mammalia › Eutheria › Euarchontoglires › Primates › Haplorrhini › Catarrhini › Hominidae › Homo![]() |
Protein attributes
| Sequence length | 728 AA. |
| Sequence status | Complete. |
| Protein existence | Evidence at protein level |
General annotation (Comments)
| Function | May play a role in terminal differentiation of skeletal muscle cells but not in the determination of cells to the myogenic lineage. Functions as a repressor of TGF-beta signaling. Ref.4 |
| Subunit structure | Interacts with SMAD2, SMAD3 and SMAD4. Interacts with HIPK2. Part of a complex with HIPK2 and SMAD1/2/3. Interacts with PRDM16 and SMAD3; the interaction with PRDM16 promotes the recruitment SMAD3-HDAC1 complex on the promoter of TGF-beta target genes. Ref.3 Ref.4 |
| Subcellular location | |
| Sequence similarities | Belongs to the SKI family. |
Ontologies
Binary interactions
With | Entry | #Exp. | IntAct | Notes |
|---|---|---|---|---|
| Fam89b | Q9QUI1 | 6 | EBI-347281,EBI-6503100 | From a different organism. |
| NCOR1 | O75376 | 2 | EBI-347281,EBI-347233 | |
| Ncor1 | Q60974 | 5 | EBI-347281,EBI-349004 | From a different organism. |
| SIN3A | Q96ST3 | 3 | EBI-347281,EBI-347218 | |
| SMAD4 | Q13485 | 3 | EBI-347281,EBI-347263 |
Sequence annotation (Features)
| Feature key | Position(s) | Length | Description | Graphical view | Feature identifier | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule processing | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Chain | 1 – 728 | 728 | Ski oncogene | PRO_0000129382 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Regions | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Coiled coil | 536 – 710 | 175 | Potential | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Amino acid modifications | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Modified residue | 480 | 1 | Phosphoserine Ref.5 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Helix Strand Turn | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 101 – 105 | 5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 108 – 115 | 8 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 118 – 122 | 5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 123 – 127 | 5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 128 – 133 | 6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 136 – 145 | 10 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 155 – 163 | 9 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 175 – 178 | 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 179 – 190 | 12 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 219 – 222 | 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 228 – 232 | 5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 234 – 236 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 245 – 247 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 248 – 250 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 256 – 259 | 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 269 – 275 | 7 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 278 – 280 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 281 – 284 | 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 296 – 310 | 15 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequences
| ||||||||||||||||||
References
| « Hide 'large scale' references | |
| [1] | "Isolation of human cDNA clones of ski and the ski-related gene, sno." Nomura N., Sasamoto S., Ishii S., Date T., Matsui M., Ishizaki R. Nucleic Acids Res. 17:5489-5500(1989) [PubMed] [Europe PMC] [Abstract] Cited for: NUCLEOTIDE SEQUENCE [MRNA]. |
| [2] | "The DNA sequence and biological annotation of human chromosome 1." Gregory S.G., Barlow K.F., McLay K.E., Kaul R., Swarbreck D., Dunham A., Scott C.E., Howe K.L., Woodfine K., Spencer C.C.A., Jones M.C., Gillson C., Searle S., Zhou Y., Kokocinski F., McDonald L., Evans R., Phillips K. Bentley D.R.Nature 441:315-321(2006) [PubMed] [Europe PMC] [Abstract] Cited for: NUCLEOTIDE SEQUENCE [LARGE SCALE GENOMIC DNA]. |
| [3] | "Requirement of the co-repressor homeodomain-interacting protein kinase 2 for ski-mediated inhibition of bone morphogenetic protein-induced transcriptional activation." Harada J., Kokura K., Kanei-Ishii C., Nomura T., Khan M.M., Kim Y., Ishii S. J. Biol. Chem. 278:38998-39005(2003) [PubMed] [Europe PMC] [Abstract] Cited for: INTERACTION WITH HIPK2; SMAD2; SMAD3 AND SMAD4. |
| [4] | "SKI and MEL1 cooperate to inhibit transforming growth factor-beta signal in gastric cancer cells." Takahata M., Inoue Y., Tsuda H., Imoto I., Koinuma D., Hayashi M., Ichikura T., Yamori T., Nagasaki K., Yoshida M., Matsuoka M., Morishita K., Yuki K., Hanyu A., Miyazawa K., Inazawa J., Miyazono K., Imamura T. J. Biol. Chem. 284:3334-3344(2009) [PubMed] [Europe PMC] [Abstract] Cited for: FUNCTION, INTERACTION WITH PRDM16 AND SMAD3. |
| [5] | "Quantitative phosphoproteomic analysis of T cell receptor signaling reveals system-wide modulation of protein-protein interactions." Mayya V., Lundgren D.H., Hwang S.-I., Rezaul K., Wu L., Eng J.K., Rodionov V., Han D.K. Sci. Signal. 2:RA46-RA46(2009) [PubMed] [Europe PMC] [Abstract] Cited for: PHOSPHORYLATION [LARGE SCALE ANALYSIS] AT SER-480, MASS SPECTROMETRY. Tissue: Leukemic T-cell. |
| + | Additional computationally mapped references. |
Cross-references
Sequence databases | |||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| EMBL GenBank DDBJ | X15218 mRNA. Translation: CAA33288.1. AL590822 Genomic DNA. No translation available. | ||||||||||||||||||
| IPI | IPI00220921. | ||||||||||||||||||
| PIR | TVHUSK. S06053. | ||||||||||||||||||
| RefSeq | NP_003027.1. NM_003036.3. | ||||||||||||||||||
| UniGene | Hs.656507. | ||||||||||||||||||
3D structure databases | |||||||||||||||||||
| PDBe RCSB PDB PDBj |
| ||||||||||||||||||
| ProteinModelPortal | P12755. | ||||||||||||||||||
| ModBase | Search... | ||||||||||||||||||
Protein-protein interaction databases | |||||||||||||||||||
| IntAct | P12755. 9 interactions. | ||||||||||||||||||
| MINT | MINT-269973. | ||||||||||||||||||
| STRING | 9606.ENSP00000367797. | ||||||||||||||||||
PTM databases | |||||||||||||||||||
| PhosphoSite | P12755. | ||||||||||||||||||
Polymorphism databases | |||||||||||||||||||
| DMDM | 134517. | ||||||||||||||||||
Proteomic databases | |||||||||||||||||||
| PaxDb | P12755. | ||||||||||||||||||
| PRIDE | P12755. | ||||||||||||||||||
Protocols and materials databases | |||||||||||||||||||
| StructuralBiologyKnowledgebase | Search... | ||||||||||||||||||
Genome annotation databases | |||||||||||||||||||
| Ensembl | ENST00000378536; ENSP00000367797; ENSG00000157933. | ||||||||||||||||||
| GeneID | 6497. | ||||||||||||||||||
| KEGG | hsa:6497. | ||||||||||||||||||
| UCSC | uc001aja.4. human. | ||||||||||||||||||
Organism-specific databases | |||||||||||||||||||
| CTD | 6497. | ||||||||||||||||||
| GeneCards | GC01P002173. | ||||||||||||||||||
| HGNC | HGNC:10896. SKI. | ||||||||||||||||||
| HPA | CAB010449. | ||||||||||||||||||
| MIM | 164780. gene. | ||||||||||||||||||
| neXtProt | NX_P12755. | ||||||||||||||||||
| PharmGKB | PA35796. | ||||||||||||||||||
| GenAtlas | Search... | ||||||||||||||||||
Phylogenomic databases | |||||||||||||||||||
| eggNOG | NOG82850. | ||||||||||||||||||
| HOGENOM | HOG000039989. | ||||||||||||||||||
| HOVERGEN | HBG006599. | ||||||||||||||||||
| InParanoid | P12755. | ||||||||||||||||||
| OMA | TERCETI. | ||||||||||||||||||
| OrthoDB | EOG44QT1K. | ||||||||||||||||||
| PhylomeDB | P12755. | ||||||||||||||||||
Enzyme and pathway databases | |||||||||||||||||||
| Pathway_Interaction_DB | bmppathway. BMP receptor signaling. smad2_3nuclearpathway. Regulation of nuclear SMAD2/3 signaling. | ||||||||||||||||||
| Reactome | REACT_111102. Signal Transduction. REACT_71. Gene Expression. | ||||||||||||||||||
Gene expression databases | |||||||||||||||||||
| ArrayExpress | P12755. | ||||||||||||||||||
| Bgee | P12755. | ||||||||||||||||||
| CleanEx | HS_SKI. | ||||||||||||||||||
| Genevestigator | P12755. | ||||||||||||||||||
| GermOnline | ENSG00000157933. Homo sapiens. | ||||||||||||||||||
Family and domain databases | |||||||||||||||||||
| Gene3D | 3.10.260.20. 1 hit. 3.10.390.10. 1 hit. | ||||||||||||||||||
| InterPro | IPR014890. c-SKI_SMAD4-bd_dom. IPR009061. DNA-bd_dom_put. IPR010919. SAND_dom-like. IPR003380. Transform_Ski. IPR023216. Tscrpt_reg_SKI_SnoN. [Graphical view] | ||||||||||||||||||
| PANTHER | PTHR10005. PTHR10005. 1 hit. | ||||||||||||||||||
| Pfam | PF08782. c-SKI_SMAD_bind. 1 hit. PF02437. Ski_Sno. 1 hit. [Graphical view] | ||||||||||||||||||
| SMART | SM01046. c-SKI_SMAD_bind. 1 hit. [Graphical view] | ||||||||||||||||||
| SUPFAM | SSF46955. Putativ_DNA_bind. 1 hit. SSF63763. SAND_like. 1 hit. | ||||||||||||||||||
| ProtoNet | Search... | ||||||||||||||||||
Other | |||||||||||||||||||
| ChiTaRS | SKI. human. | ||||||||||||||||||
| EvolutionaryTrace | P12755. | ||||||||||||||||||
| GenomeRNAi | 6497. | ||||||||||||||||||
| NextBio | 25255. | ||||||||||||||||||
| SOURCE | Search... | ||||||||||||||||||
Entry information
| Entry name | SKI_HUMAN | ||||||||
| Accession | Primary (citable) accession number: P12755 Secondary accession number(s): Q5SYT7 | ||||||||
| Entry history |
| ||||||||
| Entry status | Reviewed (UniProtKB/Swiss-Prot) | ||||||||
| Annotation program | Chordata Protein Annotation Program | ||||||||
| Disclaimer | Any medical or genetic information present in this entry is provided for research, educational and informational purposes only. It is not in any way intended to be used as a substitute for professional medical advice, diagnosis, treatment or care. | ||||||||
Relevant documents
| Human chromosome 1 Human chromosome 1: entries, gene names and cross-references to MIM |
| MIM cross-references Online Mendelian Inheritance in Man (MIM) cross-references in UniProtKB/Swiss-Prot |
| PDB cross-references Index of Protein Data Bank (PDB) cross-references |
| SIMILARITY comments Index of protein domains and families |

Clusters with
