P12355 (PSAF_SPIOL) Reviewed, UniProtKB/Swiss-Prot
Last modified
April 3, 2013.
Version 69.
History...
Names·Attributes·General annotation·Ontologies·Sequence annotation·Sequences·References·Cross-refs·Entry info·DocumentsCustomize order
Names·Attributes·General annotation·Ontologies·Sequence annotation·Sequences·References·Cross-refs·Entry info·DocumentsCustomize orderNames and origin
| Protein names | Recommended name: Photosystem I reaction center subunit III, chloroplastic Alternative name(s): Light-harvesting complex I 17 kDa protein PSI-F | ||
| Gene names |
| ||
| Organism | Spinacia oleracea (Spinach) | ||
| Taxonomic identifier | 3562 [NCBI] | ||
| Taxonomic lineage | Eukaryota › Viridiplantae › Streptophyta › Embryophyta › Tracheophyta › Spermatophyta › Magnoliophyta › eudicotyledons › core eudicotyledons › Caryophyllales › Amaranthaceae › Spinacia![]() |
Protein attributes
| Sequence length | 231 AA. |
| Sequence status | Complete. |
| Sequence processing | The displayed sequence is further processed into a mature form. |
| Protein existence | Evidence at protein level |
General annotation (Comments)
| Function | Probably participates in efficiency of electron transfer from plastocyanin to P700 (or cytochrome c553 in algae and cyanobacteria). This plastocyanin-docking protein contributes to the specific association of plastocyanin to PSI. |
| Subcellular location | |
| Sequence similarities | Belongs to the PsaF family. |
Ontologies
| Keywords | |
|---|---|
| Biological process | Photosynthesis |
| Cellular component | Chloroplast Photosystem I Plastid Thylakoid |
| Domain | Transit peptide |
| Technical term | 3D-structure Direct protein sequencing |
| Gene Ontology (GO) | |
| Biological_process | photosynthesis Inferred from electronic annotation. Source: UniProtKB-KW |
| Cellular_component | chloroplast thylakoid lumen Inferred from electronic annotation. Source: UniProtKB-SubCell photosystem I reaction centerInferred from electronic annotation. Source: InterPro |
| Complete GO annotation... | |
Sequence annotation (Features)
| Feature key | Position(s) | Length | Description | Graphical view | Feature identifier | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule processing | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Transit peptide | 1 – 77 | 77 | Chloroplast Ref.2 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Chain | 78 – 231 | 154 | Photosystem I reaction center subunit III, chloroplastic | PRO_0000029346 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Helix Strand Turn | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 85 – 87 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 89 – 96 | 8 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 99 – 101 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 105 – 107 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 119 – 122 | 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 124 – 127 | 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 130 – 133 | 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 142 – 144 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 151 – 155 | 5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 158 – 160 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 162 – 170 | 9 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 171 – 184 | 14 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 187 – 189 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 194 – 196 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 201 – 203 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 207 – 210 | 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 217 – 220 | 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 223 – 226 | 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 228 – 230 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequences
| ||||||||||||||||||
References
| [1] | "Nucleotide sequence of cDNA clones encoding the entire precursor polypeptides for subunits IV and V of the photosystem I reaction center from spinach." Steppuhn J., Hermans J., Nechushtai R., Ljungberg U., Thuemmler F., Lottspeich F., Herrmann R.G. FEBS Lett. 237:218-224(1988) [PubMed] [Europe PMC] [Abstract] Cited for: NUCLEOTIDE SEQUENCE [MRNA]. |
| [2] | "Identification of the plastocyanin binding subunit of photosystem I." Hippler M., Ratajczak R., Haehnel W. FEBS Lett. 250:280-284(1989) Cited for: PROTEIN SEQUENCE OF 78-91. |
| + | Additional computationally mapped references. |
Cross-references
Sequence databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| EMBL GenBank DDBJ | X13133 mRNA. Translation: CAA31523.1. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| PIR | F1SP3. S00451. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3D structure databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| PDBe RCSB PDB PDBj |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| ProteinModelPortal | P12355. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| SMR | P12355. Positions 78-231. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| ModBase | Search... | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Protocols and materials databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| StructuralBiologyKnowledgebase | Search... | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Family and domain databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Gene3D | 1.10.8.110. 1 hit. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| InterPro | IPR003666. PSI_PsaF. [Graphical view] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Pfam | PF02507. PSI_PsaF. 1 hit. [Graphical view] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| SUPFAM | SSF81536. PSI_PsaF. 1 hit. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| ProtoNet | Search... | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Other | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| EvolutionaryTrace | P12355. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry information
| Entry name | PSAF_SPIOL | ||||||||
| Accession | Primary (citable) accession number: P12355 | ||||||||
| Entry history |
| ||||||||
| Entry status | Reviewed (UniProtKB/Swiss-Prot) | ||||||||
| Annotation program | Plant Protein Annotation Program | ||||||||
Relevant documents
| PDB cross-references Index of Protein Data Bank (PDB) cross-references |
| SIMILARITY comments Index of protein domains and families |

Clusters with
