P12282 (MOEB_ECOLI) Reviewed, UniProtKB/Swiss-Prot
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January 25, 2012.
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| Protein names | Recommended name: Sulfur carrier protein moaD adenylyltransferase EC=2.7.7.n4 Alternative name(s): MoaD protein adenylase Molybdopterin-converting factor subunit 1 adenylase | ||||||
| Gene names |
| ||||||
| Organism | Escherichia coli (strain K12) | ||||||
| Taxonomic identifier | 83333 [NCBI] | ||||||
| Taxonomic lineage | Bacteria › Proteobacteria › Gammaproteobacteria › Enterobacteriales › Enterobacteriaceae › Escherichia |
Protein attributes
| Sequence length | 249 AA. |
| Sequence status | Complete. |
| Protein existence | Evidence at protein level |
General annotation (Comments)
| Function | Catalyzes the adenylation by ATP of the carboxyl group of the C-terminal glycine of sulfur carrier protein moaD. Ref.5 Ref.6 |
| Catalytic activity | ATP + [molybdopterin-synthase sulfur-carrier protein]-Gly-Gly = AMP + [molybdopterin-synthase sulfur-carrier protein]-Gly-Gly-AMP + diphosphate. Ref.6 |
| Cofactor | Binds 1 zinc ion per subunit. Ref.6 |
| Pathway | |
| Subunit structure | Homodimer. Forms a stable heterotetrameric complex of 2 moeB and 2 moaD during adenylation of moaD. Ref.6 |
| Sequence similarities | Belongs to the hesA/moeB/thiF family. |
| Mass spectrometry | Molecular mass is 26563 Da from positions 1 - 249. Determined by ESI. Ref.6 |
Ontologies
| Keywords | |
|---|---|
| Biological process | Molybdenum cofactor biosynthesis |
| Ligand | ATP-binding Metal-binding Nucleotide-binding Zinc |
| Molecular function | Nucleotidyltransferase Transferase |
| Technical term | 3D-structure Complete proteome Reference proteome |
| Gene Ontology (GO) | |
| Biological process | Mo-molybdopterin cofactor biosynthetic process Inferred from electronic annotation. Source: UniProtKB-KW |
| Molecular function | ATP binding Inferred from electronic annotation. Source: UniProtKB-KW metal ion bindingInferred from electronic annotation. Source: UniProtKB-KW nucleotidyltransferase activityInferred from electronic annotation. Source: UniProtKB-KW protein bindingInferred from physical interaction Ref.7. Source: IntAct |
| Complete GO annotation... | |
Binary interactions
With | Entry | #Exp. | IntAct | Notes |
|---|---|---|---|---|
| moaD | P30748 | 3 | EBI-554435,EBI-554366 |
Sequence annotation (Features)
| Feature key | Position(s) | Length | Description | Graphical view | Feature identifier | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule processing | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Chain | 1 – 249 | 249 | Sulfur carrier protein moaD adenylyltransferase | PRO_0000120575 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Regions | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Nucleotide binding | 69 – 73 | 5 | ATP | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Nucleotide binding | 130 – 131 | 2 | ATP | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sites | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Metal binding | 172 | 1 | Zinc | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Metal binding | 175 | 1 | Zinc | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Metal binding | 244 | 1 | Zinc | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Metal binding | 247 | 1 | Zinc | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Binding site | 41 | 1 | ATP; via amide nitrogen | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Binding site | 62 | 1 | ATP | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Binding site | 86 | 1 | ATP | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Experimental info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Mutagenesis | 14 | 1 | R → A or K: No effect. Ref.7 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Mutagenesis | 14 | 1 | R → A: No activity; when associated with A-73. Ref.7 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Mutagenesis | 44 | 1 | C → A: No effect. Ref.6 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Mutagenesis | 73 | 1 | R → A: No effect. No activity; when associated with A-14. Ref.7 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Mutagenesis | 73 | 1 | R → K: Substantially reduced activity. Ref.7 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Mutagenesis | 128 | 1 | C → A: No effect. Ref.6 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Mutagenesis | 128 | 1 | C → Y: No activity. Ref.6 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Mutagenesis | 130 | 1 | D → A: No activity. Ref.7 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Mutagenesis | 130 | 1 | D → E: Substantially reduced activity. Ref.7 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Mutagenesis | 142 | 1 | C → A: No effect. Ref.6 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Mutagenesis | 172 | 1 | C → A: No zinc bound and no enzyme activity. Ref.6 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Mutagenesis | 175 | 1 | C → A: No zinc bound and no enzyme activity. Ref.6 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Mutagenesis | 187 | 1 | C → A: No effect. Ref.6 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Mutagenesis | 231 | 1 | C → A: No effect. Ref.6 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Mutagenesis | 244 | 1 | C → A: No zinc bound and almost no enzyme activity. Ref.6 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Mutagenesis | 247 | 1 | C → A: No zinc bound and almost no enzyme activity. Ref.6 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Helix Strand Turn | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 6 – 11 | 6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 13 – 16 | 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 19 – 21 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 22 – 31 | 10 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 33 – 37 | 5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 41 – 53 | 13 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 56 – 61 | 6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 68 – 72 | 5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 79 – 81 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 86 – 97 | 12 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 101 – 106 | 6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 112 – 120 | 9 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 122 – 127 | 6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 132 – 145 | 14 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 149 – 156 | 8 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 158 – 164 | 7 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 173 – 177 | 5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 194 – 213 | 20 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 220 – 227 | 8 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 228 – 231 | 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 232 – 237 | 6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 245 – 247 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequences
| ||||||||||||||||||
References
| « Hide 'large scale' references | |
| [1] | "Cloning and sequencing of the Escherichia coli chlEN operon involved in molybdopterin biosynthesis." Nohno T., Kasai Y., Saito T. J. Bacteriol. 170:4097-4102(1988) [PubMed: 3045084] [Abstract] Cited for: NUCLEOTIDE SEQUENCE [GENOMIC DNA]. Strain: K12 / W3110 / ZK126. |
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| [7] | "Mechanism of ubiquitin activation revealed by the structure of a bacterial MoeB-MoaD complex." Lake M.W., Wuebbens M.M., Rajagopalan K.V., Schindelin H. Nature 414:325-329(2001) [PubMed: 11713534] [Abstract] Cited for: X-RAY CRYSTALLOGRAPHY (1.7 ANGSTROMS) IN COMPLEXES WITH MOAD; ZINC; MOAD AND ATP AND MOAD-ADENYLATE, MUTAGENESIS OF ARG-14; ARG-73 AND ASP-130, REACTION MECHANISM. |
| + | Additional computationally mapped references. |
Cross-references
Sequence databases | |||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| EMBL GenBank DDBJ | M21151 Genomic DNA. Translation: AAA23580.1. U00096 Genomic DNA. Translation: AAC73913.1. AP009048 Genomic DNA. Translation: BAA35514.1. | ||||||||||||||||||||||||
| PIR | B32352. | ||||||||||||||||||||||||
| RefSeq | NP_415347.1. NC_000913.2. | ||||||||||||||||||||||||
3D structure databases | |||||||||||||||||||||||||
| PDBe RCSB PDB PDBj |
| ||||||||||||||||||||||||
| ProteinModelPortal | P12282. | ||||||||||||||||||||||||
| SMR | P12282. Positions 2-248. | ||||||||||||||||||||||||
| ModBase | Search... | ||||||||||||||||||||||||
Protein-protein interaction databases | |||||||||||||||||||||||||
| DIP | DIP-10241N. | ||||||||||||||||||||||||
| IntAct | P12282. 15 interactions. | ||||||||||||||||||||||||
| MINT | MINT-222244. | ||||||||||||||||||||||||
Protocols and materials databases | |||||||||||||||||||||||||
| StructuralBiologyKnowledgebase | Search... | ||||||||||||||||||||||||
Genome annotation databases | |||||||||||||||||||||||||
| EnsemblBacteria | EBESCT00000004863; EBESCP00000004863; EBESCG00000003968. EBESCT00000014359; EBESCP00000013650; EBESCG00000013420. | ||||||||||||||||||||||||
| GeneID | 945452. | ||||||||||||||||||||||||
| GenomeReviews | Gene locus JW0810 in contig AP009048_GR. Gene locus b0826 in contig U00096_GR. | ||||||||||||||||||||||||
| KEGG | ecj:JW0810. eco:b0826. | ||||||||||||||||||||||||
| PATRIC | 32116855. VBIEscCol129921_0853. | ||||||||||||||||||||||||
Organism-specific databases | |||||||||||||||||||||||||
| EchoBASE | EB0152. | ||||||||||||||||||||||||
| EcoGene | EG10154. moeB. | ||||||||||||||||||||||||
Phylogenomic databases | |||||||||||||||||||||||||
| eggNOG | COG0476. | ||||||||||||||||||||||||
| GeneTree | EBGT00050000010430. | ||||||||||||||||||||||||
| HOGENOM | HBG535305. | ||||||||||||||||||||||||
| OMA | DFDGQET. | ||||||||||||||||||||||||
| PhylomeDB | P12282. | ||||||||||||||||||||||||
| ProtClustDB | PRK05690. | ||||||||||||||||||||||||
Enzyme and pathway databases | |||||||||||||||||||||||||
| BioCyc | EcoCyc:EG10154-MONOMER. MetaCyc:EG10154-MONOMER. | ||||||||||||||||||||||||
Gene expression databases | |||||||||||||||||||||||||
| Genevestigator | P12282. | ||||||||||||||||||||||||
Family and domain databases | |||||||||||||||||||||||||
| InterPro | IPR007901. MoeZ_MoeB. IPR009036. Molybdenum_cofac_synth_MoeB. IPR012730. Mopterin_Synthase_Sase_MoeB. IPR016040. NAD(P)-bd_dom. IPR000594. ThiF_NAD_FAD-bd. [Graphical view] | ||||||||||||||||||||||||
| Gene3D | G3DSA:3.40.50.720. NAD(P)-bd. 1 hit. | ||||||||||||||||||||||||
| KO | K11996. | ||||||||||||||||||||||||
| Pfam | PF05237. MoeZ_MoeB. 1 hit. PF00899. ThiF. 1 hit. [Graphical view] | ||||||||||||||||||||||||
| SUPFAM | SSF69572. MoeB. 1 hit. | ||||||||||||||||||||||||
| TIGRFAMs | TIGR02355. MoeB. 1 hit. | ||||||||||||||||||||||||
| ProtoNet | Search... | ||||||||||||||||||||||||
Entry information
| Entry name | MOEB_ECOLI | ||||||||
| Accession | Primary (citable) accession number: P12282 | ||||||||
| Entry history |
| ||||||||
| Entry status | Reviewed (UniProtKB/Swiss-Prot) | ||||||||
| Annotation program | Prokaryotic Protein Annotation Program | ||||||||
Relevant documents
| Escherichia coli Escherichia coli (strain K12): entries and cross-references to EcoGene |
| PATHWAY comments Index of metabolic and biosynthesis pathways |
| PDB cross-references Index of Protein Data Bank (PDB) cross-references |
| SIMILARITY comments Index of protein domains and families |

Clusters with