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UniProtKB/Swiss-Prot P12004 (PCNA_HUMAN)
Last modified
November 25, 2008.
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90%,
50% identity |
Documents (4) |
Third-party data |
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Names and origin
| Protein names | Recommended name: Proliferating cell nuclear antigen Short name=PCNA Alternative name(s): Cyclin | ||
| Gene names |
| ||
| Organism | Homo sapiens (Human) | ||
| Taxonomic identifier | 9606 [NCBI] | ||
| Taxonomic lineage | Eukaryota › Metazoa › Chordata › Craniata › Vertebrata › Euteleostomi › Mammalia › Eutheria › Euarchontoglires › Primates › Haplorrhini › Catarrhini › Hominidae › Homo |
Protein attributes
| Sequence length | 261 AA. |
| Sequence status | Complete. |
| Sequence processing | The displayed sequence is not processed. |
| Protein existence | Evidence at protein level. |
General annotation (Comments)
| Function | This protein is an auxiliary protein of DNA polymerase delta and is involved in the control of eukaryotic DNA replication by increasing the polymerase's processibility during elongation of the leading strand. |
| Subunit structure | Homotrimer. Interacts with KCTD10. Interacts with PPP1R15A By similarity. Forms a complex with activator 1 heteropentamer in the presence of ATP. Interacts with POLH, POLK, DNMT1, ERCC5/XPG, FEN1, CDC6, APEX2 and POLDIP2. Interacts with EXO1 and SHPRH. Forms a ternary complex with DNTTIP2 and core histone. Interacts with POLD1, POLD3 and POLD4. |
| Subcellular location | |
| Post-translational modification | Upon methyl methanesulfonate-induced DNA damage, mono-ubiquitinated by the UBE2B-RAD18 complex on Lys-164. This induces non-canonical poly-ubiquitination on Lys-164 through 'Lys-63' linkage of ubiquitin moieties by the E2 complex UBE2N-UBE2V2 and the E3 ligase SHPRH, whih is required for DNA repair. |
| Involvement in disease | Antibodies are present in sera from patients with systemic lupus erythematosus. |
| Sequence similarities | Belongs to the PCNA family. |
Ontologies
Binary interactions
With | Entry | #Exp. | IntAct | Notes |
|---|---|---|---|---|
| BARD1 | Q99728 | 1 | EBI-358311,EBI-473181 | |
| CDKN2A | P42771 | 3 | EBI-358311,EBI-375053 | |
| CHAF1A | Q13111 | 1 | EBI-358311,EBI-1020839 | |
| CSTF1 | Q05048 | 1 | EBI-358311,EBI-1789619 | |
| FEN1 | P39748 | 2 | EBI-358311,EBI-707816 | |
| Gadd45g | Q9Z111 | 4 | EBI-358311,EBI-1173616 | From a different organism. |
| PPP1CC | P36873-1 | 1 | EBI-358311,EBI-356289 |
Sequence annotation (Features)
| Feature key | Position(s) | Length | Description | Graphical view | Feature identifier | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule processing | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Chain | 1 – 261 | 261 | Proliferating cell nuclear antigen | PRO_0000149158 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Regions | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| DNA binding | 61 – 80 | 20 | Potential | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Amino acid modifications | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Cross-link | 164 | Glycyl lysine isopeptide (Lys-Gly) (interchain with G-Cter in ubiquitin) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Experimental info | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Mutagenesis | 164 | 1 | K → R: Abolishes ubiquitination. No effect on interaction with SHPRH | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Secondary structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Helix Strand Turn | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 2 – 7 | 6 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 10 – 20 | 11 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 24 – 31 | 8 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 34 – 40 | 7 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 44 – 53 | 10 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 54 – 56 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 57 – 64 | 8 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 66 – 71 | 6 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 72 – 79 | 8 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 87 – 92 | 6 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 97 – 104 | 8 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 108 – 117 | 10 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 134 – 140 | 7 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 141 – 152 | 12 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 156 – 163 | 8 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 166 – 173 | 8 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 176 – 182 | 7 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 196 – 201 | 6 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 203 – 208 | 6 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 209 – 215 | 7 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 216 – 221 | 6 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 223 – 229 | 7 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 235 – 241 | 7 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 242 – 244 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 245 – 251 | 7 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequences
| ||||||||||||||||||
References
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| + | Additional computationally mapped references. |
Cross-references
Sequence databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| M15796 mRNA. Translation: AAA35736.1. J04718 Genomic DNA. Translation: AAA60040.1. AF527838 Genomic DNA. Translation: AAM78556.1. AL121924 Genomic DNA. Translation: CAC27344.1. BC000491 mRNA. Translation: AAH00491.1. BC062439 mRNA. Translation: AAH62439.1. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| PIR | WMHUET. A27445. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| RefSeq | NP_002583.1. NP_872590.1. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| UniGene | Hs.147433 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3D structure databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| ModBase | Search... | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Protein-protein interaction databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| DIP | DIP:1098N. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IntAct | P12004. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PTM databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| PhosphoSite | P12004. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Polymorphism databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| NIEHS-SNPs | Search... | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
2-D gel databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| SWISS-2DPAGE | P12004. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Proteomic databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| PeptideAtlas | P12004. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome annotation databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Ensembl | ENSG00000132646. Homo sapiens. [Contig view] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GeneID | 5111. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| KEGG | hsa:5111. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Organism-specific databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| H-InvDB | HIX0015618. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| HGNC | HGNC:8729. PCNA. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| HPA | CAB000148. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MIM | 176740. gene. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| PharmGKB | PA263. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GenAtlas | Search... | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GeneCards | Search... | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Phylogenomic databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| HOVERGEN | P12004. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Enzyme and pathway databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Reactome | REACT_152. Cell Cycle, Mitotic. REACT_216. DNA Repair. REACT_383. DNA Replication. REACT_7970. Telomere Maintenance. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene expression databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| ArrayExpress | P12004. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| CleanEx | HS_PCNA. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GermOnline | ENSG00000132646. Homo sapiens. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Family and domain databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| InterPro | IPR000730. Pr_cel_nuc_antig. [Graphical view] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| PANTHER | PTHR11352. Pr_cel_nuc_antig. 1 hit. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Pfam | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||

Clusters with