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UniProtKB/Swiss-Prot P11802 (CDK4_HUMAN)
Last modified
November 25, 2008.
Version 113.
History...
Clusters with 100%,
90%,
50% identity |
Documents (8) |
Third-party data |
Customize display | text xml rdf/xml gff fasta |
Names and origin
| Protein names | Recommended name: Cell division protein kinase 4 EC=2.7.11.22 Alternative name(s): Cyclin-dependent kinase 4 PSK-J3 | ||
| Gene names |
| ||
| Organism | Homo sapiens (Human) | ||
| Taxonomic identifier | 9606 [NCBI] | ||
| Taxonomic lineage | Eukaryota › Metazoa › Chordata › Craniata › Vertebrata › Euteleostomi › Mammalia › Eutheria › Euarchontoglires › Primates › Haplorrhini › Catarrhini › Hominidae › Homo |
Protein attributes
| Sequence length | 303 AA. |
| Sequence status | Complete. |
| Sequence processing | The displayed sequence is not processed. |
| Protein existence | Evidence at protein level. |
General annotation (Comments)
| Function | Probably involved in the control of the cell cycle. |
| Catalytic activity | ATP + a protein = ADP + a phosphoprotein. |
| Enzyme regulation | Phosphorylation at Thr-172 is necessary for enzymatic activity By similarity. |
| Subunit structure | Forms a stable complex with D-type G1 cyclins. Interacts with SEI1 and ZNF655/VIK. |
| Involvement in disease | CDK4 mutations are involved in tumor formation. Defects in CDK4 are the cause of cutaneous malignant melanoma 3 (CMM3) [MIM:609048, 155600]. Malignant melanoma is a malignant neoplasm of melanocytes, arising de novo or from a preexisting benign nevus, which occurs most often in the skin but also may involve other sites. |
| Sequence similarities | Belongs to the protein kinase superfamily. CMGC Ser/Thr protein kinase family. CDC2/CDKX subfamily. Contains 1 protein kinase domain. |
Ontologies
Binary interactions
With | Entry | #Exp. | IntAct | Notes |
|---|---|---|---|---|
| ACTR3B | Q9P1U1 | 1 | EBI-295644,EBI-1047175 | |
| CCND1 | P24385 | 6 | EBI-295644,EBI-375001 | |
| CCND2 | P30279 | 1 | EBI-295644,EBI-748789 | |
| CCND3 | P30281 | 3 | EBI-295644,EBI-375013 | |
| CDC37 | Q16543 | 4 | EBI-295644,EBI-295634 | |
| CDC7 | O00311 | 1 | EBI-295644,EBI-374980 | |
| CDKN1A | P38936 | 2 | EBI-295644,EBI-375077 | |
| CDKN1B | P46527 | 2 | EBI-295644,EBI-519280 | |
| CDKN1C | P49918 | 1 | EBI-295644,EBI-519256 | |
| CDKN2A | P42771 | 5 | EBI-295644,EBI-375053 | |
| CDKN2B | P42772 | 2 | EBI-295644,EBI-711280 | |
| CDKN2C | P42773 | 1 | EBI-295644,EBI-711290 | |
| DBNL | Q9UJU6 | 1 | EBI-295644,EBI-751783 | |
| GEMIN4 | P57678 | 1 | EBI-295644,EBI-356700 | |
| LYN | P07948 | 1 | EBI-295644,EBI-79452 | |
| MCM2 | P49736 | 1 | EBI-295644,EBI-374819 | |
| PPP1CA | P62136 | 1 | EBI-295644,EBI-357253 | |
| PPP1CC | P36873-1 | 1 | EBI-295644,EBI-356289 | |
| RPRM | Q9NS64 | 1 | EBI-295644,EBI-1052363 | |
| SMC1A | Q14683 | 1 | EBI-295644,EBI-80690 | |
| SMC3 | Q9UQE7 | 1 | EBI-295644,EBI-80718 | |
| ZNF655 | Q8N720 | 2 | EBI-295644,EBI-625509 |
Sequence annotation (Features)
| Feature key | Position(s) | Length | Description | Graphical view | Feature identifier | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule processing | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Chain | 1 – 303 | 303 | Cell division protein kinase 4 | PRO_0000085778 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Regions | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Domain | 6 – 295 | 290 | Protein kinase | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Nucleotide binding | 12 – 20 | 9 | ATP By similarity | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Compositional bias | 42 – 48 | 7 | Poly-Gly | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sites | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Active site | 140 | 1 | Proton acceptor By similarity | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Binding site | 35 | 1 | ATP By similarity | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Amino acid modifications | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Modified residue | 172 | 1 | Phosphothreonine; by CAK By similarity | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Natural variations | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 24 | 1 | R → C in CMM3; somatic and familial; generates a dominant oncogene resistant to inhibition by p16(INK4a). dbSNP rs11547328. | VAR_006200 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 24 | 1 | R → H in CMM3. | VAR_006201 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 41 | 1 | N → S in CMM3; sporadic. | VAR_021152 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 82 | 1 | R → Q: dbSNP rs3211612. | VAR_029153 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 122 | 1 | R → H | VAR_041976 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Secondary structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Helix Strand Turn | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 7 – 15 | 9 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 18 – 25 | 8 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 26 – 29 | 4 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 30 – 40 | 11 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 46 – 48 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 51 – 66 | 16 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 74 – 81 | 8 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 83 – 94 | 12 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 100 – 104 | 5 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 114 – 133 | 20 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 143 – 145 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 146 – 148 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 154 – 156 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 164 – 166 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 168 – 170 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 173 – 175 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 176 – 179 | 4 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 183 – 186 | 4 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 194 – 209 | 16 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 219 – 230 | 12 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 235 – 237 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 246 – 248 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 257 – 260 | 4 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 266 – 275 | 10 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 280 – 282 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 286 – 291 | 6 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 293 – 295 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequences
| ||||||||||||||||||
References
| « Hide 'large scale' references | |
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| + | Additional computationally mapped references. |
Cross-references
Sequence databases | |||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| M14505 mRNA. Translation: AAA35673.1. U81031 Genomic DNA. Translation: AAC39521.2. Z48970 mRNA. Translation: CAA88834.1. U37022 Genomic DNA. Translation: AAC50506.1. AF507942 Genomic DNA. Translation: AAM23014.1. BC003644 mRNA. Translation: AAH03644.1. BC005864 mRNA. Translation: AAH05864.1. BC010153 mRNA. Translation: AAH10153.1. S67448 Genomic DNA. Translation: AAD13991.1. | |||||||||||||
| PIR | I52695. S52841. | ||||||||||||
| RefSeq | NP_000066.1. | ||||||||||||
| UniGene | Hs.95577 | ||||||||||||
3D structure databases | |||||||||||||
| |||||||||||||
| ModBase | Search... | ||||||||||||
Protein-protein interaction databases | |||||||||||||
| DIP | DIP:24211N. DIP:875N. | ||||||||||||
| IntAct | P11802. | ||||||||||||
PTM databases | |||||||||||||
| PhosphoSite | P11802. | ||||||||||||
Polymorphism databases | |||||||||||||
| NIEHS-SNPs | Search... | ||||||||||||
Genome annotation databases | |||||||||||||
| Ensembl | ENSG00000135446. Homo sapiens. [Contig view] | ||||||||||||
| GeneID | 1019. | ||||||||||||
| KEGG | hsa:1019. | ||||||||||||
Organism-specific databases | |||||||||||||
| H-InvDB | HIX0010753. | ||||||||||||
| HGNC | HGNC:1773. CDK4. | ||||||||||||
| HPA | CAB015153. | ||||||||||||
| MIM | 123829. gene. 155600. phenotype. 609048. phenotype. | ||||||||||||
| Orphanet | 618. Melanoma, familial. | ||||||||||||
| PharmGKB | PA102. | ||||||||||||
| GenAtlas | Search... | ||||||||||||
| GeneCards | Search... | ||||||||||||
Phylogenomic databases | |||||||||||||
| HOGENOM | P11802. | ||||||||||||
| HOVERGEN | P11802. | ||||||||||||
Enzyme and pathway databases | |||||||||||||
| Reactome | REACT_152. Cell Cycle, Mitotic. | ||||||||||||
Gene expression databases | |||||||||||||
| ArrayExpress | P11802. | ||||||||||||
| CleanEx | HS_CDK4. | ||||||||||||
| GermOnline | ENSG00000135446. Homo sapiens. | ||||||||||||
Family and domain databases | |||||||||||||
| InterPro | IPR000719. Prot_kinase_core. IPR017441. Protein_kinase_ATP_bd_CS. IPR017442. Se/Thr_pkinase-rel. IPR008271. Ser_thr_pkin_AS. IPR002290. Ser_thr_pkinase. [Graphical view] | ||||||||||||
| Pfam | PF0 | ||||||||||||

Clusters with