Reviewed,
UniProtKB/Swiss-Prot P11405 (T2M1_MORSP)
Last modified
November 3, 2009.
Version 61.
History...
Clusters with 100%,
90%,
50% identity |
Documents (2) |
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Names and origin · Protein attributes · General annotation (Comments) · Ontologies · Sequence annotation (Features) · Sequences · References · Cross-references · Entry information · Relevant documents
Names and origin
| Protein names | Recommended name: Type-2 restriction enzyme MspI Short name=R.MspI EC=3.1.21.4 Alternative name(s): Type II restriction enzyme MspI Endonuclease MspI | ||
| Gene names |
| ||
| Organism | Moraxella sp. | ||
| Taxonomic identifier | 479 [NCBI] | ||
| Taxonomic lineage | Bacteria › Proteobacteria › Gammaproteobacteria › Pseudomonadales › Moraxellaceae › Moraxella |
Protein attributes
| Sequence length | 262 AA. |
| Sequence status | Complete. |
| Sequence processing | The displayed sequence is not processed. |
| Protein existence | Evidence at protein level. |
General annotation (Comments)
| Function | Recognizes the double-stranded sequence CCGG and cleaves after C-1. |
| Catalytic activity | Endonucleolytic cleavage of DNA to give specific double-stranded fragments with terminal 5'-phosphates. |
Ontologies
| Keywords | |
|---|---|
| Biological process | Restriction system |
| Molecular function | Endonuclease Hydrolase Nuclease |
| Technical term | 3D-structure |
| Gene Ontology (GO) | |
| Biological process | DNA restriction-modification system Inferred from electronic annotation. Source: UniProtKB-KW |
| Molecular function | DNA binding Inferred from electronic annotation. Source: InterPro Type II site-specific deoxyribonuclease activityInferred from electronic annotation. Source: EC |
| Complete GO annotation... | |
Sequence annotation (Features)
| Feature key | Position(s) | Length | Description | Graphical view | Feature identifier | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule processing | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Chain | 1 – 262 | 262 | Type-2 restriction enzyme MspI | PRO_0000077338 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Secondary structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Helix Strand Turn | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 4 – 12 | 9 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 15 – 17 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 23 – 41 | 19 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 45 – 51 | 7 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 57 – 69 | 13 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 74 – 76 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 77 – 84 | 8 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 100 – 106 | 7 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 111 – 124 | 14 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 126 – 131 | 6 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 133 – 140 | 8 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 146 – 157 | 12 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 165 – 175 | 11 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 176 – 178 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 179 – 188 | 10 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 202 – 210 | 9 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 213 – 221 | 9 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 222 – 234 | 13 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 239 – 242 | 4 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 244 – 249 | 6 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 252 – 255 | 4 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequences
| ||||||||||||||||||
References
| [1] | "Cloning and characterization of the genes encoding the MspI restriction modification system." Lin P.M., Lee C.H., Roberts R.J. Nucleic Acids Res. 17:3001-3011(1989) [PubMed: 2471145] [Abstract] Cited for: NUCLEOTIDE SEQUENCE [GENOMIC DNA]. Strain: ATCC 49670. |
| + | Additional computationally mapped references. |
Cross-references
Sequence databases | |||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| X14191 Genomic DNA. Translation: CAA32394.1. | |||||||||||||||||||
| PIR | NDKE2M. S04187. | ||||||||||||||||||
3D structure databases | |||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||
| ModBase | Search... | ||||||||||||||||||
Protein family/group databases | |||||||||||||||||||
| REBASE | 1277. MspI. | ||||||||||||||||||
Family and domain databases | |||||||||||||||||||
| InterPro | IPR015291. Restrict_endonuc_II_MspI. [Graphical view] | ||||||||||||||||||
| Pfam | PF09208. Endonuc-MspI. 1 hit. [Graphical view] | ||||||||||||||||||
| ProtoNet | Search... | ||||||||||||||||||
Entry information
| Entry name | T2M1_MORSP | ||||||||
| Accession | Primary (citable) accession number: P11405 | ||||||||
| Entry history |
| ||||||||
| Entry status | Reviewed (UniProtKB/Swiss-Prot) | ||||||||
| Annotation project | HAMAP (High-quality Automated and Manual Annotation of microbial Proteomes) | ||||||||
Relevant documents
| PDB cross-references Index of Protein Data Bank (PDB) cross-references |
| Restriction enzymes and methylases Classification of restriction enzymes and methylases and list of entries |

Clusters with


