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UniProtKB/Swiss-Prot P11310 (ACADM_HUMAN)
Last modified
October 13, 2009.
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Third-party data |
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Names and origin
| Protein names | Recommended name: Medium-chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial Short name=MCAD EC=1.3.99.3 | ||
| Gene names |
| ||
| Organism | Homo sapiens (Human) [Complete proteome] | ||
| Taxonomic identifier | 9606 [NCBI] | ||
| Taxonomic lineage | Eukaryota › Metazoa › Chordata › Craniata › Vertebrata › Euteleostomi › Mammalia › Eutheria › Euarchontoglires › Primates › Haplorrhini › Catarrhini › Hominidae › Homo |
Protein attributes
| Sequence length | 421 AA. |
| Sequence status | Complete. |
| Sequence processing | The displayed sequence is further processed into a mature form. |
| Protein existence | Evidence at protein level. |
General annotation (Comments)
| Function | This enzyme is specific for acyl chain lengths of 4 to 16. |
| Catalytic activity | Acyl-CoA + acceptor = 2,3-dehydroacyl-CoA + reduced acceptor. |
| Cofactor | FAD. |
| Pathway | |
| Subunit structure | Homotetramer. Interacts with the heterodimeric electron transfer flavoprotein ETF. Ref.9 Ref.10 Ref.11 |
| Subcellular location | |
| Involvement in disease | Defects in ACADM are the cause of medium-chain acyl-CoA dehydrogenase deficiency (MCAD deficiency) [MIM:201450]. It is an autosomal recessive disease which causes fasting hypoglycemia, hepatic dysfunction, and encephalopathy, often resulting in death in infancy. The disease frequency is one in 13000. |
| Miscellaneous | A number of straight-chain acyl-CoA dehydrogenases of different substrate specificities are present in mammalian tissues. Utilizes the electron transfer flavoprotein (ETF) as electron acceptor that transfers the electrons to the main mitochondrial respiratory chain via ETF-ubiquinone oxidoreductase (ETF dehydrogenase). |
| Sequence similarities | Belongs to the acyl-CoA dehydrogenase family. |
Ontologies
| Keywords | |
|---|---|
| Biological process | Fatty acid metabolism Lipid metabolism |
| Cellular component | Mitochondrion |
| Coding sequence diversity | Polymorphism |
| Disease | Disease mutation |
| Domain | Transit peptide |
| Ligand | FAD Flavoprotein |
| Molecular function | Oxidoreductase |
| PTM | Acetylation |
| Technical term | 3D-structure Complete proteome Direct protein sequencing |
| Gene Ontology (GO) | |
| Biological process | fatty acid beta-oxidation Ref.6 Inferred from mutant phenotype. Source: UniProtKB oxidation reductionInferred from electronic annotation. Source: UniProtKB-KW |
| Cellular component | mitochondrial matrix Inferred from electronic annotation. Source: UniProtKB-SubCell |
| Molecular function | FAD binding Inferred from electronic annotation. Source: InterPro acyl-CoA dehydrogenase activity Ref.6Inferred from mutant phenotype. Source: UniProtKB electron carrier activityInferred from electronic annotation. Source: InterPro |
| Complete GO annotation... | |
Sequence annotation (Features)
| Feature key | Position(s) | Length | Description | Graphical view | Feature identifier | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule processing | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Transit peptide | 1 – 25 | 25 | Mitochondrion | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Chain | 26 – 421 | 396 | Medium-chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial | PRO_0000000502 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Regions | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Nucleotide binding | 158 – 167 | 10 | FAD | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Nucleotide binding | 191 – 193 | 3 | FAD | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Nucleotide binding | 306 – 308 | 3 | FAD | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Nucleotide binding | 316 – 317 | 2 | FAD | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Nucleotide binding | 374 – 378 | 5 | FAD | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Nucleotide binding | 403 – 405 | 3 | FAD | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Region | 278 – 281 | 4 | Substrate binding | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sites | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Active site | 401 | 1 | Proton acceptor | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Binding site | 167 | 1 | Substrate; via carbonyl oxygen | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Binding site | 402 | 1 | Substrate; via amide nitrogen | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Amino acid modifications | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Modified residue | 212 | 1 | N6-acetyllysine Ref.8 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Modified residue | 279 | 1 | N6-acetyllysine Ref.8 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Modified residue | 301 | 1 | N6-acetyllysine Ref.8 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Natural variations | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 53 | 1 | R → C in MCAD deficiency. | VAR_000317 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 67 | 1 | Y → H in MCAD deficiency; mild. Ref.24 | VAR_013698 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 78 | 1 | I → T in MCAD deficiency. Ref.24 | VAR_015954 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 115 – 116 | 2 | Missing in MCAD deficiency. | VAR_000318 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 116 | 1 | C → Y in MCAD deficiency. Ref.21 | VAR_015955 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 121 | 1 | T → I in MCAD deficiency. Ref.24 | VAR_015956 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 132 | 1 | P → R in a breast cancer sample; somatic mutation. Ref.27 | VAR_035716 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 149 | 1 | M → I in MCAD deficiency. Ref.15 | VAR_000319 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 193 | 1 | T → A in MCAD deficiency; the thermostability is markedly decreased. Ref.21 Ref.22 | VAR_000320 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 195 | 1 | G → R in MCAD deficiency. Ref.20 | VAR_000321 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 206 | 1 | R → L in MCAD deficiency. Ref.23 | VAR_015957 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 244 | 1 | C → R in MCAD deficiency. Ref.15 | VAR_000322 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 245 | 1 | S → L in MCAD deficiency. Ref.25 | VAR_013699 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 267 | 1 | G → R in MCAD deficiency. Ref.15 | VAR_000323 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 281 | 1 | R → T in MCAD deficiency; mild or benign clinical phenotype. Ref.26 | VAR_013700 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 310 | 1 | G → R in MCAD deficiency. Ref.24 | VAR_015958 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 326 | 1 | M → T in MCAD deficiency. Ref.18 | VAR_000324 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 329 | 1 | K → E in MCAD deficiency; most common variant. Ref.23 Ref.26 Ref.6 Ref.13 Ref.14 Ref.16 Ref.17 | VAR_000325 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 336 | 1 | S → R in MCAD deficiency. Ref.18 | VAR_000326 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 352 | 1 | Y → C in MCAD deficiency. Ref.21 | VAR_015959 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 375 | 1 | I → T in MCAD deficiency. Ref.15 | VAR_000327 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Experimental info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Mutagenesis | 86 | 1 | L → M: Strongly reduced rate of electron transfer to ETF. Ref.10 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Mutagenesis | 98 | 1 | L → W: Strongly reduced rate of electron transfer to ETF. Ref.10 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Mutagenesis | 100 | 1 | L → Y: Strongly reduced rate of electron transfer to ETF. Ref.10 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Mutagenesis | 108 | 1 | I → M: Strongly reduced rate of electron transfer to ETF. Ref.10 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Mutagenesis | 191 | 1 | W → A: Loss of electron transfer to ETF. Ref.11 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Mutagenesis | 191 | 1 | W → F: Reduces rate of electron transfer to ETF about six-fold. Ref.11 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Mutagenesis | 237 | 1 | E → A: Strongly reduced rate of electron transfer to ETF. Ref.10 Ref.11 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Mutagenesis | 384 | 1 | E → A: Reduces rate of electron transfer to ETF three-fold. Ref.10 Ref.11 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Mutagenesis | 384 | 1 | E → Q: Reduces rate of electron transfer to ETF two-fold. Ref.10 Ref.11 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence conflict | 10 | 1 | R → RCSLQ in AAF63626. Ref.3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence conflict | 356 | 1 | I → T in AAF63626. Ref.3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Helix Strand Turn | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 36 – 38 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 43 – 59 | 17 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 61 – 70 | 10 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 75 – 84 | 10 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 93 – 95 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 102 – 115 | 14 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 117 – 129 | 13 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 131 – 136 | 6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 139 – 151 | 13 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 156 – 159 | 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 165 – 168 | 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 169 – 171 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 175 – 178 | 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 180 – 193 | 14 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 194 – 197 | 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 199 – 206 | 8 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 215 – 217 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 219 – 225 | 7 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 231 – 233 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 239 – 241 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 247 – 258 | 12 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 259 – 261 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 262 – 265 | 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 269 – 303 | 35 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 313 – 315 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 317 – 345 | 29 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 351 – 376 | 26 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 377 – 379 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 387 – 394 | 8 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 395 – 398 | 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 399 – 401 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 404 – 417 | 14 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequences
| ||||||||||||||||||
References
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| + | Additional computationally mapped references. |
Cross-references
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| IPI | IPI00005040. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| PIR | DEHUCM. A29031. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| RefSeq | NP_000007.1. NP_001120800.1. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| UniGene | Hs.445040 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3D structure databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| ModBase | Search... | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Protein-protein interaction databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| STRING | P11310. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
2-D gel databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| REPRODUCTION-2DPAGE | IPI00005040. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Proteomic databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| PRIDE | P11310. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome annotation databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| UCSC | uc001dgw.2. human. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Organism-specific databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| CTD | 34. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GeneCards | GC01P075902. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| H-InvDB | HIX0000706. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| HGNC | HGNC:89. ACADM. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| HPA | HPA006198. HPA026542. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MIM | 201450. phenotype. 607008. gene. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orphanet | 42. Acyl-CoA dehydrogenase, medium chain, deficiency of. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| PharmGKB | PA24425. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GenAtlas | Search... | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Phylogenomic databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| HOVERGEN | P11310. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Enzyme and pathway databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| BRENDA | 1.3.99.3. 247. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Pathway_Interaction_DB | hnf3bpathway. FOXA2 and FOXA3 transcription factor networks. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Reactome | REACT_602. Metabolism of lipids and lipoproteins. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene expression databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| ArrayExpress | P11310. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Bgee | P11310. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| CleanEx | HS_ACADM. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genevestigator | P11310. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GermOnline | ENSG00000117054. Homo sapiens. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Family and domain databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| InterPro | IPR006089. Acyl-CoA_DH_CS. IPR006092. Acyl-CoA_DH_N. IPR006090. Acyl-CoA_Oxase/DH_1. IPR006091. Acyl-CoA_Oxase/DH_M. IPR013786. AcylCoA_DH/ox_N. IPR013764. AcylCoA_oxidase/DH_1/2_C. [Graphical view] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Gene3D | G3DSA:2.40.110.10. Acyl_CoA_DH/ox_M. 1 hit. G3DSA:1.10.540.10. AcylCoA_DH/ox_N. 1 hit. G3DSA:1.20.140.10. AcylCoA_DH_1/2_C. 1 hit. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Pfam | PF00441. Acyl-CoA_dh_1. 1 hit. PF02770. Acyl-CoA_dh_M. 1 hit. PF02771. Acyl-CoA_dh_N. 1 hit. [Graphical view] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| PROSITE | PS00072. ACYL_COA_DH_1. 1 hit. PS00073. ACYL_COA_DH_2. 1 hit. [Graphical view] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| ProtoNet | Search... | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Other Resources | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| NextBio | 131. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| SOURCE | Search... | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry information
| Entry name | ACADM_HUMAN | ||||||||
| Accession | Primary (citable) accession number: P11310 Secondary accession number(s): Q9NYF1 | ||||||||
| Entry history |
| ||||||||
| Entry status | Reviewed (UniProtKB/Swiss-Prot) | ||||||||
| Annotation project | HPI (Human Proteome Initiative) | ||||||||
| Disclaimer | Any medical or genetic information present in this entry is provided for research, educational and informational purposes only. It is not in any way intended to be used as a substitute for professional medical advice, diagnosis, treatment or care. | ||||||||
Relevant documents
| Human chromosome 1 Human chromosome 1: entries, gene names and cross-references to MIM |
| Human entries with polymorphisms or disease mutations List of human entries with polymorphisms or disease mutations |
| Human polymorphisms and disease mutations Index of human polymorphisms and disease mutations |
| MIM cross-references Online Mendelian Inheritance in Man (MIM) cross-references in UniProtKB/Swiss-Prot |
| PATHWAY comments Index of metabolic and biosynthesis pathways |
| PDB cross-references Index of Protein Data Bank (PDB) cross-references |
| SIMILARITY comments Index of protein domains and families |

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