P11215 (ITAM_HUMAN) Reviewed, UniProtKB/Swiss-Prot
Last modified
May 1, 2013.
Version 151.
History...
Names·Attributes·General annotation·Ontologies·Sequence annotation·Sequences·References·Cross-refs·Entry info·DocumentsCustomize order
Names·Attributes·General annotation·Ontologies·Sequence annotation·Sequences·References·Cross-refs·Entry info·DocumentsCustomize orderNames and origin
| Protein names | Recommended name: Integrin alpha-M Alternative name(s): CD11 antigen-like family member B CR-3 alpha chain Cell surface glycoprotein MAC-1 subunit alpha Leukocyte adhesion receptor MO1 Neutrophil adherence receptor CD_antigen=CD11b | ||||
| Gene names |
| ||||
| Organism | Homo sapiens (Human) [Reference proteome] | ||||
| Taxonomic identifier | 9606 [NCBI] | ||||
| Taxonomic lineage | Eukaryota › Metazoa › Chordata › Craniata › Vertebrata › Euteleostomi › Mammalia › Eutheria › Euarchontoglires › Primates › Haplorrhini › Catarrhini › Hominidae › Homo![]() |
Protein attributes
| Sequence length | 1152 AA. |
| Sequence status | Complete. |
| Sequence processing | The displayed sequence is further processed into a mature form. |
| Protein existence | Evidence at protein level |
General annotation (Comments)
| Function | Integrin alpha-M/beta-2 is implicated in various adhesive interactions of monocytes, macrophages and granulocytes as well as in mediating the uptake of complement-coated particles. It is identical with CR-3, the receptor for the iC3b fragment of the third complement component. It probably recognizes the R-G-D peptide in C3b. Integrin alpha-M/beta-2 is also a receptor for fibrinogen, factor X and ICAM1. It recognizes P1 and P2 peptides of fibrinogen gamma chain. |
| Subunit structure | Heterodimer of an alpha and a beta subunit. Alpha-M associates with beta-2. Interacts with JAM3. Ref.10 Ref.11 |
| Subcellular location | |
| Tissue specificity | Predominantly expressed in monocytes and granulocytes. |
| Domain | The integrin I-domain (insert) is a VWFA domain. Integrins with I-domains do not undergo protease cleavage. |
| Involvement in disease | Systemic lupus erythematosus 6 (SLEB6) [MIM:609939]: A chronic, relapsing, inflammatory, and often febrile multisystemic disorder of connective tissue, characterized principally by involvement of the skin, joints, kidneys and serosal membranes. It is of unknown etiology, but is thought to represent a failure of the regulatory mechanisms of the autoimmune system. The disease is marked by a wide range of system dysfunctions, an elevated erythrocyte sedimentation rate, and the formation of LE cells in the blood or bone marrow. |
| Sequence similarities | Belongs to the integrin alpha chain family. Contains 7 FG-GAP repeats. Contains 1 VWFA domain. |
Ontologies
Sequence annotation (Features)
| Feature key | Position(s) | Length | Description | Graphical view | Feature identifier | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule processing | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Signal peptide | 1 – 16 | 16 | Ref.9 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Chain | 17 – 1152 | 1136 | Integrin alpha-M | PRO_0000016289 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Regions | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Topological domain | 17 – 1104 | 1088 | Extracellular Potential | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Transmembrane | 1105 – 1128 | 24 | Helical; Potential | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Topological domain | 1129 – 1152 | 24 | Cytoplasmic Potential | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Repeat | 18 – 75 | 58 | FG-GAP 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Repeat | 76 – 135 | 60 | FG-GAP 2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Domain | 150 – 328 | 179 | VWFA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Repeat | 339 – 390 | 52 | FG-GAP 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Repeat | 391 – 444 | 54 | FG-GAP 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Repeat | 445 – 503 | 59 | FG-GAP 5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Repeat | 506 – 564 | 59 | FG-GAP 6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Repeat | 569 – 629 | 61 | FG-GAP 7 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Calcium binding | 465 – 473 | 9 | Potential | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Calcium binding | 529 – 537 | 9 | Potential | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Calcium binding | 592 – 600 | 9 | Potential | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motif | 1131 – 1135 | 5 | GFFKR motif | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Amino acid modifications | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Glycosylation | 86 | 1 | N-linked (GlcNAc...) Potential | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Glycosylation | 240 | 1 | N-linked (GlcNAc...) Potential | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Glycosylation | 391 | 1 | N-linked (GlcNAc...) Potential | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Glycosylation | 469 | 1 | N-linked (GlcNAc...) Potential | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Glycosylation | 692 | 1 | N-linked (GlcNAc...) Potential | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Glycosylation | 696 | 1 | N-linked (GlcNAc...) Potential | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Glycosylation | 734 | 1 | N-linked (GlcNAc...) Potential | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Glycosylation | 801 | 1 | N-linked (GlcNAc...) Potential | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Glycosylation | 880 | 1 | N-linked (GlcNAc...) Potential | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Glycosylation | 900 | 1 | N-linked (GlcNAc...) Ref.12 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Glycosylation | 911 | 1 | N-linked (GlcNAc...) Potential | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Glycosylation | 940 | 1 | N-linked (GlcNAc...) Ref.12 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Glycosylation | 946 | 1 | N-linked (GlcNAc...) Ref.12 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Glycosylation | 978 | 1 | N-linked (GlcNAc...) Potential | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Glycosylation | 993 | 1 | N-linked (GlcNAc...) Potential | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Glycosylation | 1021 | 1 | N-linked (GlcNAc...) Potential | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Glycosylation | 1044 | 1 | N-linked (GlcNAc...) Potential | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Glycosylation | 1050 | 1 | N-linked (GlcNAc...) Potential | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Glycosylation | 1075 | 1 | N-linked (GlcNAc...) Potential | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Disulfide bond | 66 ↔ 73 | By similarity | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Disulfide bond | 105 ↔ 123 | By similarity | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Disulfide bond | 654 ↔ 711 | By similarity | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Disulfide bond | 770 ↔ 776 | By similarity | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Disulfide bond | 847 ↔ 864 | By similarity | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Disulfide bond | 998 ↔ 1022 | By similarity | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Disulfide bond | 1027 ↔ 1032 | By similarity | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Natural variations | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 77 | 1 | R → H Influences susceptibility to SLE. Ref.17 Corresponds to variant rs1143679 [ dbSNP | Ensembl ]. | VAR_043870 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 441 | 1 | M → T. Ref.5 Corresponds to variant rs11861251 [ dbSNP | Ensembl ]. | VAR_043871 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 858 | 1 | A → V. Corresponds to variant rs1143683 [ dbSNP | Ensembl ]. | VAR_043872 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 1146 | 1 | P → S. Corresponds to variant rs1143678 [ dbSNP | Ensembl ]. | VAR_043873 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Experimental info | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence conflict | 499 | 1 | G → GQ Ref.1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence conflict | 499 | 1 | G → GQ Ref.6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence conflict | 965 | 1 | L → P Ref.2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence conflict | 965 | 1 | L → P Ref.3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Secondary structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Helix Strand Turn | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 149 – 156 | 8 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 163 – 180 | 18 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 185 – 200 | 16 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 202 – 207 | 6 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 211 – 215 | 5 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 227 – 236 | 10 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 237 – 239 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 241 – 243 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 249 – 259 | 11 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 268 – 270 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 272 – 277 | 6 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 280 – 288 | 9 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 289 – 291 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 294 – 303 | 10 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 308 – 311 | 4 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 312 – 317 | 6 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 318 – 324 | 7 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 325 – 333 | 9 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 1130 – 1132 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 1133 – 1143 | 11 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 1147 – 1149 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequences
| ||||||||||||||||||
References
| « Hide 'large scale' references | |
| [1] | "The human leukocyte adhesion glycoprotein Mac-1 (complement receptor type 3, CD11b) alpha subunit. Cloning, primary structure, and relation to the integrins, von Willebrand factor and factor B." Corbi A.L., Kishimoto T.K., Miller L.J., Springer T.A. J. Biol. Chem. 263:12403-12411(1988) [PubMed] [Europe PMC] [Abstract] Cited for: NUCLEOTIDE SEQUENCE [MRNA]. |
| [2] | "Molecular cloning of the alpha subunit of human and guinea pig leukocyte adhesion glycoprotein Mo1: chromosomal localization and homology to the alpha subunits of integrins." Arnaout M.A., Remold-O'Donnell E., Pierce M.W., Harris P., Tenen D.G. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 85:2776-2780(1988) [PubMed] [Europe PMC] [Abstract] Cited for: NUCLEOTIDE SEQUENCE [MRNA]. |
| [3] | "Amino acid sequence of the alpha subunit of human leukocyte adhesion receptor Mo1 (complement receptor type 3)." Arnaout M.A., Gupta S.K., Pierce M.W., Tenen D.G. J. Cell Biol. 106:2153-2158(1988) [PubMed] [Europe PMC] [Abstract] Cited for: NUCLEOTIDE SEQUENCE [MRNA]. |
| [4] | "Structural analysis of the CD11b gene and phylogenetic analysis of the alpha-integrin gene family demonstrate remarkable conservation of genomic organization and suggest early diversification during evolution." Fleming J.C., Pahl H.L., Gonzalez D.A., Smith T.F., Tenen D.G. J. Immunol. 150:480-490(1993) [PubMed] [Europe PMC] [Abstract] Cited for: NUCLEOTIDE SEQUENCE [GENOMIC DNA]. |
| [5] | "The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC)." The MGC Project Team Genome Res. 14:2121-2127(2004) [PubMed] [Europe PMC] [Abstract] Cited for: NUCLEOTIDE SEQUENCE [LARGE SCALE MRNA], VARIANT THR-441. |
| [6] | "cDNA sequence for the alpha M subunit of the human neutrophil adherence receptor indicates homology to integrin alpha subunits." Hickstein D.D., Hickey M.J., Ozols J., Baker D.M., Back A.L., Roth G.J. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 86:257-261(1989) [PubMed] [Europe PMC] [Abstract] Cited for: NUCLEOTIDE SEQUENCE [MRNA] OF 9-1152. |
| [7] | "The promoter of the CD11b gene directs myeloid-specific and developmentally regulated expression." Shelley C.S., Arnaout M.A. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 88:10525-10529(1991) [PubMed] [Europe PMC] [Abstract] Cited for: NUCLEOTIDE SEQUENCE [GENOMIC DNA] OF 1-9. |
| [8] | "Characterization of the myeloid-specific CD11b promoter." Pahl H.L., Rosmarin A.G., Tenen D.G. Blood 79:865-870(1992) [PubMed] [Europe PMC] [Abstract] Cited for: NUCLEOTIDE SEQUENCE [GENOMIC DNA] OF 1-9. Tissue: Blood. |
| [9] | "N-terminal sequence of human leukocyte glycoprotein Mo1: conservation across species and homology to platelet IIb/IIIa." Pierce M.W., Remold-O'Donnell E., Todd R.F. III, Arnaout M.A. Biochim. Biophys. Acta 874:368-371(1986) [PubMed] [Europe PMC] [Abstract] Cited for: PROTEIN SEQUENCE OF 17-31. |
| [10] | "The junctional adhesion molecule 3 (JAM-3) on human platelets is a counterreceptor for the leukocyte integrin Mac-1." Santoso S., Sachs U.J.H., Kroll H., Linder M., Ruf A., Preissner K.T., Chavakis T. J. Exp. Med. 196:679-691(2002) [PubMed] [Europe PMC] [Abstract] Cited for: INTERACTION WITH JAM3. |
| [11] | "JAM-C is a component of desmosomes and a ligand for CD11b/CD18-mediated neutrophil transepithelial migration." Zen K., Babbin B.A., Liu Y., Whelan J.B., Nusrat A., Parkos C.A. Mol. Biol. Cell 15:3926-3937(2004) [PubMed] [Europe PMC] [Abstract] Cited for: INTERACTION WITH JAM3. |
| [12] | "Glycoproteomics analysis of human liver tissue by combination of multiple enzyme digestion and hydrazide chemistry." Chen R., Jiang X., Sun D., Han G., Wang F., Ye M., Wang L., Zou H. J. Proteome Res. 8:651-661(2009) [PubMed] [Europe PMC] [Abstract] Cited for: GLYCOSYLATION [LARGE SCALE ANALYSIS] AT ASN-900; ASN-940 AND ASN-946, MASS SPECTROMETRY. Tissue: Liver. |
| [13] | "Crystal structure of the A domain from the alpha subunit of integrin CR3 (CD11b/CD18)." Lee J.O., Rieu P., Arnaout M.A., Liddington R. Cell 80:631-638(1995) [PubMed] [Europe PMC] [Abstract] Cited for: X-RAY CRYSTALLOGRAPHY (1.7 ANGSTROMS) OF 148-331. |
| [14] | "Two conformations of the integrin A-domain (I-domain): a pathway for activation?" Lee J.O., Bankston L.A., Arnaout M.A., Liddington R.C. Structure 3:1333-1340(1995) [PubMed] [Europe PMC] [Abstract] Cited for: X-RAY CRYSTALLOGRAPHY (2.0 ANGSTROMS) OF 148-334. |
| [15] | "Cation binding to the integrin CD11b I domain and activation model assessment." Baldwin E.T., Sarver R.W., Bryant G.L. Jr., Curry K.A., Fairbanks M.B., Finzel B.C., Garlick R.L., Heinrikson R.L., Horton N.C., Kelley L.L., Mildner A.M., Moon J.B., Mott J.E., Mutchler V.T., Tomich C.S., Watenpaugh K.D., Wiley V.H. Structure 6:923-935(1998) [PubMed] [Europe PMC] [Abstract] Cited for: X-RAY CRYSTALLOGRAPHY (2.7 ANGSTROMS) OF 148-337. |
| [16] | "Experimental support for a beta-propeller domain in integrin alpha-subunits and a calcium binding site on its lower surface." Oxvig C., Springer T.A. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 95:4870-4875(1998) [PubMed] [Europe PMC] [Abstract] Cited for: 3D-STRUCTURE MODELING OF 17-616. |
| [17] | "A nonsynonymous functional variant in integrin-alpha(M) (encoded by ITGAM) is associated with systemic lupus erythematosus." Nath S.K., Han S., Kim-Howard X., Kelly J.A., Viswanathan P., Gilkeson G.S., Chen W., Zhu C., McEver R.P., Kimberly R.P., Alarcon-Riquelme M.E., Vyse T.J., Li Q.-Z., Wakeland E.K., Merrill J.T., James J.A., Kaufman K.M., Guthridge J.M., Harley J.B. Nat. Genet. 40:152-154(2008) [PubMed] [Europe PMC] [Abstract] Cited for: INVOLVEMENT IN SUSCEPTIBILITY TO SLE, VARIANT HIS-77. |
| [18] | "Genome-wide association scan in women with systemic lupus erythematosus identifies susceptibility variants in ITGAM, PXK, KIAA1542 and other loci." Harley J.B., Alarcon-Riquelme M.E., Criswell L.A., Jacob C.O., Kimberly R.P., Moser K.L., Tsao B.P., Vyse T.J., Langefeld C.D., Nath S.K., Guthridge J.M., Cobb B.L., Mirel D.B., Marion M.C., Williams A.H., Divers J., Wang W., Frank S.G. Kelly J.A.Nat. Genet. 40:204-210(2008) [PubMed] [Europe PMC] [Abstract] Cited for: INVOLVEMENT IN SUSCEPTIBILITY TO SLE. |
| + | Additional computationally mapped references. |
Cross-references
Sequence databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| EMBL GenBank DDBJ | J03925 mRNA. Translation: AAA59544.1. M18044 mRNA. Translation: AAA59491.1. S52227 S52226 Genomic DNA. Translation: AAB24821.1.BC096346 mRNA. Translation: AAH96346.1. BC096348 mRNA. Translation: AAH96348.1. BC099660 mRNA. Translation: AAH99660.1. J04145 mRNA. Translation: AAA59903.1. M76724 Genomic DNA. Translation: AAA58410.1. M84477 Genomic DNA. Translation: AAA51960.1. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IPI | IPI00217987. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| PIR | RWHU1B. A31108. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| RefSeq | NP_000623.2. NM_000632.3. NP_001139280.1. NM_001145808.1. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| UniGene | Hs.172631. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3D structure databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| PDBe RCSB PDB PDBj |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| ProteinModelPortal | P11215. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| ModBase | Search... | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Protein-protein interaction databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MINT | MINT-1489258. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| STRING | 9606.ENSP00000287497. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PTM databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| PhosphoSite | P11215. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Polymorphism databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| DMDM | 1708572. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Proteomic databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| PaxDb | P11215. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| PRIDE | P11215. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Protocols and materials databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| StructuralBiologyKnowledgebase | Search... | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome annotation databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Ensembl | ENST00000287497; ENSP00000287497; ENSG00000169896. ENST00000544665; ENSP00000441691; ENSG00000169896. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GeneID | 3684. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| KEGG | hsa:3684. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| UCSC | uc002ebq.3. human. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Organism-specific databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| CTD | 3684. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GeneCards | GC16P031271. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| HGNC | HGNC:6149. ITGAM. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| HPA | CAB025091. HPA002274. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MIM | 120980. gene. 609939. phenotype. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| neXtProt | NX_P11215. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| PharmGKB | PA29949. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GenAtlas | Search... | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Phylogenomic databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| eggNOG | NOG301393. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| HOGENOM | HOG000113114. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| HOVERGEN | HBG100530. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| InParanoid | P11215. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| KO | K06461. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| OrthoDB | EOG4TQM86. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Enzyme and pathway databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Pathway_Interaction_DB | amb2_neutrophils_pathway. amb2 Integrin signaling. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Reactome | REACT_111102. Signal Transduction. REACT_604. Hemostasis. REACT_6900. Immune System. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene expression databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| ArrayExpress | P11215. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Bgee | P11215. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| CleanEx | HS_ITGAM. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genevestigator | P11215. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GermOnline | ENSG00000169896. Homo sapiens. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Family and domain databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| InterPro | IPR013517. FG-GAP. IPR013519. Int_alpha_beta-p. IPR000413. Integrin_alpha. IPR013649. Integrin_alpha-2. IPR018184. Integrin_alpha_C_CS. IPR002035. VWF_A. [Graphical view] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Pfam | PF01839. FG-GAP. 1 hit. PF00357. Integrin_alpha. 1 hit. PF08441. Integrin_alpha2. 1 hit. PF00092. VWA. 1 hit. [Graphical view] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| PRINTS | PR01185. INTEGRINA. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| SMART | SM00191. Int_alpha. 5 hits. SM00327. VWA. 1 hit. [Graphical view] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| PROSITE | PS51470. FG_GAP. 7 hits. PS00242. INTEGRIN_ALPHA. 1 hit. PS50234. VWFA. 1 hit. [Graphical view] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| ProtoNet | Search... | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Other | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| BindingDB | P11215. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| ChEMBL | CHEMBL3826. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| EvolutionaryTrace | P11215. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GenomeRNAi | 3684. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| NextBio | 14419. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| SOURCE | Search... | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry information
| Entry name | ITAM_HUMAN | ||||||||
| Accession | Primary (citable) accession number: P11215 Secondary accession number(s): Q4VAK0, Q4VAK2 | ||||||||
| Entry history |
| ||||||||
| Entry status | Reviewed (UniProtKB/Swiss-Prot) | ||||||||
| Annotation program | Chordata Protein Annotation Program | ||||||||
| Disclaimer | Any medical or genetic information present in this entry is provided for research, educational and informational purposes only. It is not in any way intended to be used as a substitute for professional medical advice, diagnosis, treatment or care. | ||||||||
Relevant documents
| Human cell differentiation molecules CD nomenclature of surface proteins of human leucocytes and list of entries |
| Human chromosome 16 Human chromosome 16: entries, gene names and cross-references to MIM |
| Human entries with polymorphisms or disease mutations List of human entries with polymorphisms or disease mutations |
| Human polymorphisms and disease mutations Index of human polymorphisms and disease mutations |
| MIM cross-references Online Mendelian Inheritance in Man (MIM) cross-references in UniProtKB/Swiss-Prot |
| PDB cross-references Index of Protein Data Bank (PDB) cross-references |
| SIMILARITY comments Index of protein domains and families |

Clusters with
