P0CB51 (CHI1_COCPS) Reviewed, UniProtKB/Swiss-Prot
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May 31, 2011.
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Names·Attributes·General annotation·Ontologies·Sequence annotation·Sequences·References·Cross-refs·Entry info·DocumentsCustomize orderNames and origin
| Protein names | Recommended name: Endochitinase 1 EC=3.2.1.14 Alternative name(s): CiX1 Complement-fixation antigen Short name=CF-AG Short name=CF-antigen | ||||
| Gene names |
| ||||
| Organism | Coccidioides posadasii (strain RMSCC 757 / Silveira) (Valley fever fungus) [Complete proteome] | ||||
| Taxonomic identifier | 443226 [NCBI] | ||||
| Taxonomic lineage | Eukaryota › Fungi › Dikarya › Ascomycota › Pezizomycotina › Eurotiomycetes › Eurotiomycetidae › Onygenales › mitosporic Onygenales › Coccidioides |
Protein attributes
| Sequence length | 427 AA. |
| Sequence status | Complete. |
| Sequence processing | The displayed sequence is further processed into a mature form. |
| Protein existence | Evidence at protein level |
General annotation (Comments)
| Catalytic activity | Random hydrolysis of N-acetyl-beta-D-glucosaminide (1->4)-beta-linkages in chitin and chitodextrins. |
| Sequence similarities | Belongs to the glycosyl hydrolase 18 family. Chitinase class II subfamily. |
| Biophysicochemical properties | pH dependence: Optimum pH is 6.0. Active from pH 4 to 8. Ref.9 |
| Sequence caution | The sequence BAE20289.1 differs from that shown. Reason: Erroneous gene model prediction. The sequence BAE20290.1 differs from that shown. Reason: Erroneous gene model prediction. The sequence BAE20291.1 differs from that shown. Reason: Erroneous gene model prediction. The sequence BAE20292.1 differs from that shown. Reason: Erroneous gene model prediction. The sequence BAE20293.1 differs from that shown. Reason: Erroneous gene model prediction. The sequence BAE20294.1 differs from that shown. Reason: Erroneous gene model prediction. The sequence BAE20295.1 differs from that shown. Reason: Erroneous gene model prediction. The sequence BAE20298.1 differs from that shown. Reason: Erroneous gene model prediction. The sequence BAE20301.1 differs from that shown. Reason: Erroneous gene model prediction. The sequence BAE20302.1 differs from that shown. Reason: Erroneous gene model prediction. The sequence BAE20304.1 differs from that shown. Reason: Erroneous gene model prediction. The sequence BAE20305.1 differs from that shown. Reason: Erroneous gene model prediction. The sequence BAE20306.1 differs from that shown. Reason: Erroneous gene model prediction. The sequence BAE20307.1 differs from that shown. Reason: Erroneous gene model prediction. |
Ontologies
| Keywords | |
|---|---|
| Biological process | Carbohydrate metabolism Chitin degradation Polysaccharide degradation |
| Domain | Signal |
| Ligand | Chitin-binding |
| Molecular function | Glycosidase Hydrolase |
| PTM | Glycoprotein |
| Technical term | 3D-structure Complete proteome Direct protein sequencing |
| Gene Ontology (GO) | |
| Biological process | chitin catabolic process Inferred from electronic annotation. Source: UniProtKB-KW |
| Molecular function | cation binding Inferred from electronic annotation. Source: InterPro chitin bindingInferred from electronic annotation. Source: UniProtKB-KW chitinase activityInferred from electronic annotation. Source: EC |
| Complete GO annotation... | |
Sequence annotation (Features)
| Feature key | Position(s) | Length | Description | Graphical view | Feature identifier | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule processing | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Signal peptide | 1 – 17 | 17 | Ref.5 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Chain | 18 – 427 | 410 | Endochitinase 1 | PRO_0000011927 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sites | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Active site | 171 | 1 | Proton donor | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Site | 169 | 1 | Transition state stabilizer | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Amino acid modifications | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Glycosylation | 387 | 1 | N-linked (GlcNAc...) Potential | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Natural variations | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 13 | 1 | T → I in strain: IFM 50993. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 26 | 1 | Y → S in strain: IFM 45811, IFM 45812, IFM 45813, IFM 45817, IFM 4935, IFM 4945, IFM 50993, IFM 50994, IFM 51112, IFM 54194, IFM 54195, IFM 54196, RMSCC 1036 / AZ1 and RMSCC 2128 / TX1. Ref.6 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 103 | 1 | N → K in strain: IFM 45811, IFM 45817, IFM 4945 and IFM 50994. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 109 | 1 | I → T in strain: IFM 45811, IFM 45817, IFM 4945 and IFM 50994. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Experimental info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Mutagenesis | 169 | 1 | D → N: Loss of function. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Mutagenesis | 171 | 1 | E → Q: Loss of function. Ref.10 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence conflict | 19 | 1 | S → P AA sequence Ref.5 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence conflict | 31 | 1 | E → G AA sequence Ref.5 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence conflict | 40 | 1 | S → A AA sequence Ref.8 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence conflict | 47 | 1 | W → R AA sequence Ref.8 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence conflict | 199 | 1 | K → N in AAA96515. Ref.1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence conflict | 199 | 1 | K → N in AAB06687. Ref.1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Helix Strand Turn | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 38 – 45 | 8 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 46 – 49 | 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 56 – 58 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 61 – 63 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 65 – 74 | 10 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 80 – 83 | 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 85 – 88 | 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 101 – 103 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 107 – 118 | 12 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 123 – 129 | 7 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 130 – 133 | 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 134 – 136 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 138 – 141 | 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 144 – 161 | 18 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 164 – 169 | 6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 176 – 198 | 23 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 207 – 213 | 7 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 216 – 219 | 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 224 – 228 | 5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 232 – 237 | 6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 262 – 264 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 269 – 278 | 10 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 283 – 285 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 286 – 297 | 12 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 314 – 316 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 319 – 321 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 322 – 324 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 331 – 335 | 5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 336 – 339 | 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 340 – 345 | 6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 346 – 349 | 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 350 – 353 | 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 357 – 369 | 13 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 374 – 378 | 5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 390 – 397 | 8 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 401 – 403 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 419 – 422 | 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequences
| ||||||||||||||||||
References
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Cross-references
Sequence databases | |||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| EMBL GenBank DDBJ | U51271 Genomic DNA. Translation: AAA96515.1. U33265 mRNA. Translation: AAB06687.1. U60806 Genomic DNA. Translation: AAB48566.1. U60807 mRNA. Translation: AAB48567.1. GL636504 Genomic DNA. Translation: EFW14650.1. AB232745 Genomic DNA. Translation: BAE20289.1. Sequence problems. AB232746 Genomic DNA. Translation: BAE20290.1. Sequence problems. AB232747 Genomic DNA. Translation: BAE20291.1. Sequence problems. AB232748 Genomic DNA. Translation: BAE20292.1. Sequence problems. AB232749 Genomic DNA. Translation: BAE20293.1. Sequence problems. AB232750 Genomic DNA. Translation: BAE20294.1. Sequence problems. AB232751 Genomic DNA. Translation: BAE20295.1. Sequence problems. AB232754 Genomic DNA. Translation: BAE20298.1. Sequence problems. AB232757 Genomic DNA. Translation: BAE20301.1. Sequence problems. AB232758 Genomic DNA. Translation: BAE20302.1. Sequence problems. AB232760 Genomic DNA. Translation: BAE20304.1. Sequence problems. AB232761 Genomic DNA. Translation: BAE20305.1. Sequence problems. AB232762 Genomic DNA. Translation: BAE20306.1. Sequence problems. AB232763 Genomic DNA. Translation: BAE20307.1. Sequence problems. AJ408862 Genomic DNA. Translation: CAC29128.1. AJ408863 Genomic DNA. Translation: CAC29129.1. AJ408864 Genomic DNA. Translation: CAC29130.1. | ||||||||||||||||||||||||||||||
| PIR | JC4565. | ||||||||||||||||||||||||||||||
3D structure databases | |||||||||||||||||||||||||||||||
| PDBe RCSB PDB PDBj |
| ||||||||||||||||||||||||||||||
| ProteinModelPortal | P0CB51. | ||||||||||||||||||||||||||||||
| ModBase | Search... | ||||||||||||||||||||||||||||||
Protein family/group databases | |||||||||||||||||||||||||||||||
| CAZy | GH18. Glycoside Hydrolase Family 18. | ||||||||||||||||||||||||||||||
Protocols and materials databases | |||||||||||||||||||||||||||||||
| StructuralBiologyKnowledgebase | Search... | ||||||||||||||||||||||||||||||
Family and domain databases | |||||||||||||||||||||||||||||||
| InterPro | IPR011583. Chitinase_II. IPR001223. Glyco_hydro18cat. IPR001579. Glyco_hydro_18_chit_AS. IPR013781. Glyco_hydro_subgr_catalytic. IPR017853. Glycoside_hydrolase_SF. [Graphical view] | ||||||||||||||||||||||||||||||
| Gene3D | G3DSA:3.20.20.80. Glyco_hydro_cat. 2 hits. | ||||||||||||||||||||||||||||||
| Pfam | PF00704. Glyco_hydro_18. 1 hit. [Graphical view] | ||||||||||||||||||||||||||||||
| SMART | SM00636. Glyco_18. 1 hit. [Graphical view] | ||||||||||||||||||||||||||||||
| SUPFAM | SSF51445. Glyco_hydro_cat. 1 hit. | ||||||||||||||||||||||||||||||
| PROSITE | PS01095. CHITINASE_18. 1 hit. [Graphical view] | ||||||||||||||||||||||||||||||
| ProtoNet | Search... | ||||||||||||||||||||||||||||||
Entry information
| Entry name | CHI1_COCPS | ||||||||
| Accession | Primary (citable) accession number: P0CB51 Secondary accession number(s): E9DFQ8 Q9C2W1 | ||||||||
| Entry history |
| ||||||||
| Entry status | Reviewed (UniProtKB/Swiss-Prot) | ||||||||
| Annotation program | Fungal Protein Annotation Program | ||||||||
Relevant documents
| Glycosyl hydrolases Classification of glycosyl hydrolase families and list of entries |
| PDB cross-references Index of Protein Data Bank (PDB) cross-references |
| SIMILARITY comments Index of protein domains and families |

Clusters with