P0ABQ4 (DYR_ECOLI)
Reviewed,
UniProtKB/Swiss-Prot
Last modified
August 10, 2010.
Version 56.
History...
Names and origin
| Protein names | Recommended name: Dihydrofolate reductase EC=1.5.1.3 | ||||||
| Gene names |
| ||||||
| Organism | Escherichia coli (strain K12) [Complete proteome] [HAMAP] | ||||||
| Taxonomic identifier | 83333 [NCBI] | ||||||
| Taxonomic lineage | Bacteria › Proteobacteria › Gammaproteobacteria › Enterobacteriales › Enterobacteriaceae › Escherichia |
Protein attributes
| Sequence length | 159 AA. |
| Sequence status | Complete. |
| Protein existence | Evidence at protein level. |
General annotation (Comments)
| Function | Key enzyme in folate metabolism. Catalyzes an essential reaction for de novo glycine and purine synthesis, and for DNA precursor synthesis. |
| Catalytic activity | 5,6,7,8-tetrahydrofolate + NADP+ = 7,8-dihydrofolate + NADPH. Ref.15 |
| Pathway | |
| Miscellaneous | The strain K12 sequence is shown. Strain B [RT500] is resistant to 500 micrograms per milliliter of trimethoprim. Strain B [MB1428] is methotrexate-resistant. |
| Sequence similarities | Belongs to the dihydrofolate reductase family. Contains 1 DHFR (dihydrofolate reductase) domain. |
Ontologies
Sequence annotation (Features)
| Feature key | Position(s) | Length | Description | Graphical view | Feature identifier | |||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule processing | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Chain | 1 – 159 | 159 | Dihydrofolate reductase | PRO_0000186387 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Regions | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Domain | 1 – 158 | 158 | DHFR | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| Nucleotide binding | 13 – 19 | 7 | NADP | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| Nucleotide binding | 45 – 46 | 2 | NADP | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| Nucleotide binding | 63 – 64 | 2 | NADP | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| Nucleotide binding | 95 – 102 | 8 | NADP | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sites | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Binding site | 5 | 1 | Substrate; via carbonyl oxygen | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| Binding site | 7 | 1 | NADP; via amide nitrogen and carbonyl oxygen | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| Binding site | 27 | 1 | Substrate | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| Binding site | 52 | 1 | Substrate | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| Binding site | 57 | 1 | Substrate | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| Binding site | 76 | 1 | NADP; via carbonyl oxygen | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| Binding site | 113 | 1 | Substrate | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Natural variations | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 28 | 1 | L → R in strain: B[RT500] isozyme 2. | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 30 | 1 | W → G in strain: 1810. | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 154 | 1 | E → K in strain: B[MB1428]. | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 154 | 1 | E → Q in strain: 1810. | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Experimental info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Mutagenesis | 16 | 1 | M → F or S: Increases catalytic rate about 2-fold. Ref.15 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| Mutagenesis | 16 | 1 | M → N: Increases catalytic rate about 2-fold. Increases catalytic rate about 7-fold; when associated with L-20; Y-42; F-92; A-85 and S-152. Ref.15 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| Mutagenesis | 20 | 1 | M → I or V: Increases catalytic rate 2-fold. Ref.15 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| Mutagenesis | 20 | 1 | M → L: Increases catalytic rate 2.5-fold. Increases catalytic rate about 7-fold; when associated with N-16; Y-42; F-92; A-85 and S-152. Ref.15 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| Mutagenesis | 42 | 1 | M → V: Increases catalytic rate almost 2-fold. Ref.15 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| Mutagenesis | 42 | 1 | M → Y: Increases catalytic rate almost 2-fold. Increases catalytic rate about 7-fold; when associated with N-16; L-20; A-85; F-92 and S-152. Ref.15 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| Mutagenesis | 85 | 1 | C → A: Decreases catalytic rate by one third. Increases catalytic rate about 7-fold; when associated with N-16; L-20; Y-42; F-92 and S-152. Ref.15 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| Mutagenesis | 92 | 1 | M → F: No effect. Increases catalytic rate about 7-fold; when associated with N-16; L-20; Y-42; A-85 and S-152. Ref.15 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| Mutagenesis | 92 | 1 | M → L: No effect. Ref.15 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| Mutagenesis | 152 | 1 | C → S: Increases catalytic rate 1.5-fold. Increases catalytic rate about 7-fold; when associated with N-16; L-20; Y-42; A-85 and F-92. Ref.15 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Helix Strand Turn | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 2 – 8 | 7 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 10 – 12 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 25 – 35 | 11 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 38 – 43 | 6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 44 – 50 | 7 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 57 – 62 | 6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 70 – 76 | 7 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 78 – 85 | 8 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 91 – 95 | 5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 98 – 101 | 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 104 – 106 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 107 – 115 | 9 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 130 – 132 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 133 – 141 | 9 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 151 – 158 | 8 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequences
| ||||||||||||||||||
References
| « Hide 'large scale' references | |
| [1] | "The amino-acid sequence of the dihydrofolate reductase of a trimethoprim-resistant strain of Escherichia coli." Stone D., Phillips A.W., Burchall J.J. Eur. J. Biochem. 72:613-624(1977) [PubMed: 320005] [Abstract] Cited for: PROTEIN SEQUENCE (ISOZYME 1). Strain: B [RT500]. |
| [2] | "Dihydrofolate reductase: the amino acid sequence of the enzyme from a methotrexate-resistant mutant of Escherichia coli." Bennett C.D., Rodkey J.A., Sondey J.M., Hirschmann R. Biochemistry 17:1328-1337(1978) [PubMed: 350268] [Abstract] Cited for: PROTEIN SEQUENCE. Strain: B [MB1428]. |
| [3] | "Nucleotide sequence of the E coli gene coding for dihydrofolate reductase." Smith D.R., Calvo J.M. Nucleic Acids Res. 8:2255-2274(1980) [PubMed: 6159575] [Abstract] Cited for: NUCLEOTIDE SEQUENCE [GENOMIC DNA]. Strain: K12. |
| [4] | "Effect of a single amino acid substitution on Escherichia coli dihydrofolate reductase catalysis and ligand binding." Baccanari D.P., Stone D., Kuyper L. J. Biol. Chem. 256:1738-1747(1981) [PubMed: 7007370] [Abstract] Cited for: PROTEIN SEQUENCE (ISOZYME 2). Strain: B [RT500]. |
| [5] | "Massive overproduction of dihydrofolate reductase in bacteria as a response to the use of trimethoprim." Flensburg J., Skoeld O. Eur. J. Biochem. 162:473-476(1987) [PubMed: 3549289] [Abstract] Cited for: NUCLEOTIDE SEQUENCE [GENOMIC DNA]. Strain: 1810. |
| [6] | "Systematic sequencing of the Escherichia coli genome: analysis of the 0-2.4 min region." Yura T., Mori H., Nagai H., Nagata T., Ishihama A., Fujita N., Isono K., Mizobuchi K., Nakata A. Nucleic Acids Res. 20:3305-3308(1992) [PubMed: 1630901] [Abstract] Cited for: NUCLEOTIDE SEQUENCE [LARGE SCALE GENOMIC DNA]. Strain: K12. |
| [7] | "The complete genome sequence of Escherichia coli K-12." Blattner F.R., Plunkett G. III, Bloch C.A., Perna N.T., Burland V., Riley M., Collado-Vides J., Glasner J.D., Rode C.K., Mayhew G.F., Gregor J., Davis N.W., Kirkpatrick H.A., Goeden M.A., Rose D.J., Mau B., Shao Y. Science 277:1453-1474(1997) [PubMed: 9278503] [Abstract] Cited for: NUCLEOTIDE SEQUENCE [LARGE SCALE GENOMIC DNA]. Strain: K12 / MG1655 / ATCC 47076. |
| [8] | "Highly accurate genome sequences of Escherichia coli K-12 strains MG1655 and W3110." Hayashi K., Morooka N., Yamamoto Y., Fujita K., Isono K., Choi S., Ohtsubo E., Baba T., Wanner B.L., Mori H., Horiuchi T. Mol. Syst. Biol. 2:E1-E5(2006) [PubMed: 16738553] [Abstract] Cited for: NUCLEOTIDE SEQUENCE [LARGE SCALE GENOMIC DNA]. Strain: K12 / W3110 / ATCC 27325 / DSM 5911. |
| [9] | "Crystal structures of Escherichia coli and Lactobacillus casei dihydrofolate reductase refined at 1.7-A resolution. II. Environment of bound NADPH and implications for catalysis." Filman D.J., Bolin J.T., Matthews D.A., Kraut J. J. Biol. Chem. 257:13663-13672(1982) [PubMed: 6815179] [Abstract] Cited for: X-RAY CRYSTALLOGRAPHY (1.7 ANGSTROMS). |
| [10] | "Crystal structures of Escherichia coli dihydrofolate reductase: the NADP+ holoenzyme and the folate.NADP+ ternary complex. Substrate binding and a model for the transition state." Bystroff C., Oatley S.J., Kraut J. Biochemistry 29:3263-3277(1990) [PubMed: 2185835] [Abstract] Cited for: X-RAY CRYSTALLOGRAPHY (2.4 ANGSTROMS). |
| [11] | "Crystal structure of unliganded Escherichia coli dihydrofolate reductase. Ligand-induced conformational changes and cooperativity in binding." Bystroff C., Kraut J. Biochemistry 30:2227-2239(1991) [PubMed: 1998681] [Abstract] Cited for: X-RAY CRYSTALLOGRAPHY (2.3 ANGSTROMS). |
| [12] | "Isomorphous crystal structures of Escherichia coli dihydrofolate reductase complexed with folate, 5-deazafolate, and 5,10-dideazatetrahydrofolate: mechanistic implications." Reyes V.M., Sawaya M.R., Brown K.A., Kraut J. Biochemistry 34:2710-2723(1995) [PubMed: 7873554] [Abstract] Cited for: X-RAY CRYSTALLOGRAPHY (1.85 ANGSTROMS) IN COMPLEXES WITH NADPH; FOLATE; 5-DEAZAFOLATE AND 5,10-DIDEAZATETRAHYDROFOLATE. |
| [13] | "Crystal structures of Escherichia coli dihydrofolate reductase complexed with 5-formyltetrahydrofolate (folinic acid) in two space groups: evidence for enolization of pteridine O4." Lee H., Reyes V.M., Kraut J. Biochemistry 35:7012-7020(1996) [PubMed: 8679526] [Abstract] Cited for: X-RAY CRYSTALLOGRAPHY (1.90 ANGSTROMS) IN COMPLEX WITH 5-FORMYLTETRAHYDROFOLATE. |
| [14] | "Loop and subdomain movements in the mechanism of Escherichia coli dihydrofolate reductase: crystallographic evidence." Sawaya M.R., Kraut J. Biochemistry 36:586-603(1997) [PubMed: 9012674] [Abstract] Cited for: X-RAY CRYSTALLOGRAPHY (1.55 ANGSTROMS) IN COMPLEXES WITH NADPH; METHOTREXATE AND TETRAHYDROFOLATE. |
| [15] | "Evolutional design of a hyperactive cysteine- and methionine-free mutant of Escherichia coli dihydrofolate reductase." Iwakura M., Maki K., Takahashi H., Takenawa T., Yokota A., Katayanagi K., Kamiyama T., Gekko K. J. Biol. Chem. 281:13234-13246(2006) [PubMed: 16510443] [Abstract] Cited for: X-RAY CRYSTALLOGRAPHY (1.90 ANGSTROMS) IN COMPLEX WITH FOLATE, MASS SPECTROMETRY, CATALYTIC ACTIVITY, MUTAGENESIS OF MET-16; MET-20; MET-42; CYS-85; MET-92 AND CYS-152. |
| [16] | "A 2.13 A structure of E. coli dihydrofolate reductase bound to a novel competitive inhibitor reveals a new binding surface involving the M20 loop region." Summerfield R.L., Daigle D.M., Mayer S., Mallik D., Hughes D.W., Jackson S.G., Sulek M., Organ M.G., Brown E.D., Junop M.S. J. Med. Chem. 49:6977-6986(2006) [PubMed: 17125251] [Abstract] Cited for: X-RAY CRYSTALLOGRAPHY (2.13 ANGSTROMS). |
| [17] | "Neutron diffraction studies of Escherichia coli dihydrofolate reductase complexed with methotrexate." Bennett B., Langan P., Coates L., Mustyakimov M., Schoenborn B., Howell E.E., Dealwis C. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 103:18493-18498(2006) [PubMed: 17130456] [Abstract] Cited for: STRUCTURE BY NEUTRON DIFFRACTION (2.20 ANGSTROMS) IN COMPLEX WITH METHOTREXATE. |
| [18] | "X-ray structure of the ternary MTX.NADPH complex of the anthrax dihydrofolate reductase: a pharmacophore for dual-site inhibitor design." Bennett B.C., Wan Q., Ahmad M.F., Langan P., Dealwis C.G. J. Struct. Biol. 166:162-171(2009) [PubMed: 19374017] [Abstract] Cited for: X-RAY CRYSTALLOGRAPHY (1.50 ANGSTROMS) IN COMPLEX WITH METHOTREXATE AND NADPH. |
| + | Additional computationally mapped references. |
Cross-references
Sequence databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| EMBL GenBank DDBJ | J01609 Genomic DNA. Translation: AAA87976.1. X05108 Genomic DNA. Translation: CAA28755.1. U00096 Genomic DNA. Translation: AAC73159.1. AP009048 Genomic DNA. Translation: BAB96616.1. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| PIR | RDECD. A93704. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| RefSeq | AP_000712.1. NP_414590.1. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3D structure databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| PDBe RCSB PDB PDBj |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| ProteinModelPortal | P0ABQ4. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| ModBase | Search... | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Protein-protein interaction databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| DIP | DIP-35824N. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MINT | MINT-1239602. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| STRING | P0ABQ4. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
2-D gel databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| SWISS-2DPAGE | P0ABQ4. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| ECO2DBASE | B020.0. 6TH EDITION. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome annotation databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| EnsemblBacteria | EBESCT00000002161; EBESCP00000002161; EBESCG00000001770. EBESCT00000015691; EBESCP00000014982; EBESCG00000014751. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GeneID | 944790. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GenomeReviews | Gene locus JW0047 in contig AP009048_GR. Gene locus b0048 in contig U00096_GR. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| KEGG | ecj:JW0047. eco:b0048. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Organism-specific databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| EchoBASE | EB0322. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| EcoGene | EG10326. folA. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| CMR | Search... | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Phylogenomic databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| eggNOG | COG0262. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| HOGENOM | HBG665708. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| OMA | IRRTIIA. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| ProtClustDB | PRK10769. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Enzyme and pathway databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| BioCyc | EcoCyc:DIHYDROFOLATEREDUCT-MONOMER. MetaCyc:DIHYDROFOLATEREDUCT-MONOMER. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene expression databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genevestigator | P0ABQ4. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Family and domain databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| InterPro | IPR012259. DHFR. IPR017925. Dihydrofolate_reductase_CS. IPR001796. Dihydrofolate_reductase_dom. [Graphical view] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| PANTHER | PTHR11549:SF1. DHFR. 1 hit. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Pfam | PF00186. DHFR_1. 1 hit. [Graphical view] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| PRINTS | PR00070. DHFR. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| PROSITE | PS00075. DHFR_1. 1 hit. PS51330. DHFR_2. 1 hit. [Graphical view] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| ProtoNet | Search... | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Other Resources | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| BindingDB | P0ABQ4. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry information
| Entry name | DYR_ECOLI | ||||||||
| Accession | Primary (citable) accession number: P0ABQ4 Secondary accession number(s): P00379 | ||||||||
| Entry history |
| ||||||||
| Entry status | Reviewed (UniProtKB/Swiss-Prot) | ||||||||
| Annotation project | HAMAP (High-quality Automated and Manual Annotation of microbial Proteomes) | ||||||||
Relevant documents
| Escherichia coli Escherichia coli (strain K12): entries and cross-references to EcoGene |
| PATHWAY comments Index of metabolic and biosynthesis pathways |
| PDB cross-references Index of Protein Data Bank (PDB) cross-references |
| SIMILARITY comments Index of protein domains and families |

Clusters with


