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UniProtKB/Swiss-Prot P0ABD3 (BFR_ECOLI)
Last modified
December 15, 2009.
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Documents (3) |
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Names and origin
| Protein names | Recommended name: Bacterioferritin Short name=BFR Alternative name(s): Cytochrome b-1 Cytochrome b-557 | ||||
| Gene names |
| ||||
| Organism | Escherichia coli (strain K12) [Complete proteome] [HAMAP] | ||||
| Taxonomic identifier | 83333 [NCBI] | ||||
| Taxonomic lineage | Bacteria › Proteobacteria › Gammaproteobacteria › Enterobacteriales › Enterobacteriaceae › Escherichia |
Protein attributes
| Sequence length | 158 AA. |
| Sequence status | Complete. |
| Sequence processing | The displayed sequence is not processed. |
| Protein existence | Evidence at protein level. |
General annotation (Comments)
| Function | May perform analogous functions in iron detoxification and storage to that of animal ferritins. |
| Cofactor | Binds 1 heme B (iron-protoporphyrin IX) group per dimer. |
| Subunit structure | Oligomer of 24 identical subunits. |
| Miscellaneous | The di-iron binding site functions as active site where iron ions are oxidized from Fe2+ to Fe3+ before they are stored. |
| Sequence similarities | Belongs to the bacterioferritin family. Contains 1 ferritin-like diiron domain. |
Ontologies
| Keywords | |
|---|---|
| Biological process | Iron storage |
| Ligand | Heme Iron Metal-binding |
| Technical term | 3D-structure Complete proteome Direct protein sequencing |
| Gene Ontology (GO) | |
| Biological process | cellular iron ion homeostasis Inferred from electronic annotation. Source: UniProtKB-KW iron ion transportInferred from electronic annotation. Source: InterPro oxidation reductionInferred from electronic annotation. Source: InterPro |
| Cellular component | cytosol Inferred from direct assay. Source: UniProtKB membraneInferred from direct assay. Source: UniProtKB |
| Molecular function | ferric iron binding Inferred from electronic annotation. Source: InterPro oxidoreductase activityInferred from electronic annotation. Source: InterPro |
| Complete GO annotation... | |
Sequence annotation (Features)
| Feature key | Position(s) | Length | Description | Graphical view | Feature identifier | ||||||||||||||
Molecule processing | |||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Chain | 1 – 158 | 158 | Bacterioferritin | PRO_0000192592 | |||||||||||||||
Regions | |||||||||||||||||||
| Domain | 1 – 145 | 145 | Ferritin-like diiron | ||||||||||||||||
Sites | |||||||||||||||||||
| Metal binding | 18 | 1 | Iron 1 | ||||||||||||||||
| Metal binding | 51 | 1 | Iron 1 | ||||||||||||||||
| Metal binding | 51 | 1 | Iron 2 | ||||||||||||||||
| Metal binding | 52 | 1 | Iron (heme axial ligand) | ||||||||||||||||
| Metal binding | 54 | 1 | Iron 1 | ||||||||||||||||
| Metal binding | 94 | 1 | Iron 2 | ||||||||||||||||
| Metal binding | 127 | 1 | Iron 1 | ||||||||||||||||
| Metal binding | 127 | 1 | Iron 2 | ||||||||||||||||
| Metal binding | 130 | 1 | Iron 2 | ||||||||||||||||
Natural variations | |||||||||||||||||||
| Natural variant | 5 – 7 | 3 | TKV → VKI in strain: ECOR 30. | ||||||||||||||||
| Natural variant | 38 | 1 | K → M in strain: ECOR 30. | ||||||||||||||||
| Natural variant | 57 | 1 | R → K in strain: ECOR 30. | ||||||||||||||||
| Natural variant | 68 | 1 | L → I in strain: ECOR 30. | ||||||||||||||||
| Natural variant | 78 | 1 | N → G in strain: ECOR 30. | ||||||||||||||||
| Natural variant | 88 | 1 | R → Q in strain: ECOR 30. | ||||||||||||||||
| Natural variant | 92 | 1 | A → R in strain: ECOR 30. | ||||||||||||||||
| Natural variant | 96 | 1 | D → E in strain: ECOR 30. | ||||||||||||||||
| Natural variant | 100 | 1 | N → D in strain: ECOR 30. | ||||||||||||||||
| Natural variant | 106 | 1 | G → A in strain: ECOR 30. | ||||||||||||||||
| Natural variant | 125 | 1 | R → A in strain: ECOR 30. | ||||||||||||||||
| Natural variant | 142 – 144 | 3 | QKM → GKI in strain: ECOR 30. | ||||||||||||||||
| Natural variant | 152 – 158 | 7 | AQIREEG → SQIKVKD in strain: ECOR 30. | ||||||||||||||||
Experimental info | |||||||||||||||||||
| Sequence conflict | 53 | 1 | K → M AA sequence Ref.5 | ||||||||||||||||
Secondary structure | |||||||||||||||||||
Helix Strand Turn | |||||||||||||||||||
| Helix | 5 – 35 | 31 | |||||||||||||||||
| Helix | 38 – 64 | 27 | |||||||||||||||||
| Helix | 83 – 111 | 29 | |||||||||||||||||
| Helix | 114 – 144 | 31 | |||||||||||||||||
| Helix | 146 – 151 | 6 | |||||||||||||||||
Sequences
| ||||||||||||||||||
References
| « Hide 'large scale' references | |
| [1] | "Cloning, sequencing, and mapping of the bacterioferritin gene (bfr) of Escherichia coli K-12." Andrews S.C., Harrison P.M., Guest J.R. J. Bacteriol. 171:3940-3947(1989) [PubMed: 2661540] [Abstract] Cited for: NUCLEOTIDE SEQUENCE [GENOMIC DNA]. Strain: K12 / W3110 / ATCC 27325 / DSM 5911. |
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| [8] | "Structure of a unique twofold symmetric haem-binding site." Frolow F., Kalb A.J., Yariv J. Nat. Struct. Biol. 1:453-460(1994) [PubMed: 7664064] [Abstract] Cited for: X-RAY CRYSTALLOGRAPHY (2.9 ANGSTROMS). |
Cross-references
Sequence databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| M27176 mRNA. Translation: AAC13987.1. AF058450 Genomic DNA. Translation: AAC14288.1. U18997 Genomic DNA. Translation: AAA58133.1. U00096 Genomic DNA. Translation: AAC76361.1. AP009048 Genomic DNA. Translation: BAE77955.1. L28106 Genomic DNA. Translation: AAC36929.1. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| PIR | FREC. JV0032. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| RefSeq | AP_004454.1. NP_417795.1. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3D structure databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| ModBase | Search... | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Protein-protein interaction databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| STRING | P0ABD3. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
2-D gel databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| ECO2DBASE | C014.3. 6TH EDITION. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome annotation databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GeneID | 947839. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GenomeReviews | Gene locus JW3298 in contig AP009048_GR. Gene locus b3336 in contig U00096_GR. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| KEGG | ecj:JW3298. eco:b3336. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Organism-specific databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| EchoBASE | EB0111. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| EcoGene | EG10113. bfr. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| CMR | Search... | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Phylogenomic databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| HOGENOM | HBG288894. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| OMA | FLDGFPN. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Enzyme and pathway databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| BioCyc | EcoCyc:EG10113-MON. ECOL168927:B3336-MON. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene expression databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genevestigator | P0ABD3. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Family and domain databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| InterPro | IPR002024. Bacterioferritin. IPR009040. Ferritin-like. IPR009078. Ferritin/RR-like. IPR008331. Ferritin_Dps. IPR012347. Ferritin_rel. [Graphical view] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Gene3D | G3DSA:1.20.1260.10. Ferritin_rel. 1 hit. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Pfam | PF00210. Ferritin. 1 hit. [Graphical view] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| PIRSF | PIRSF002560. Bacterioferritin. 1 hit. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| PRINTS | PR00601. BACFERRITIN. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| PROSITE | PS00549. BACTERIOFERRITIN. 1 hit. PS50905. FERRITIN_LIKE. 1 hit. [Graphical view] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| ProtoNet | Search... | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry information
| Entry name | BFR_ECOLI | ||||||||
| Accession | Primary (citable) accession number: P0ABD3 Secondary accession number(s): O68931, P11056, Q2M701 | ||||||||
| Entry history |
| ||||||||
| Entry status | Reviewed (UniProtKB/Swiss-Prot) | ||||||||
| Annotation project | HAMAP (High-quality Automated and Manual Annotation of microbial Proteomes) | ||||||||
Relevant documents
| Escherichia coli Escherichia coli (strain K12): entries and cross-references to EcoGene |
| PDB cross-references Index of Protein Data Bank (PDB) cross-references |
| SIMILARITY comments Index of protein domains and families |

Clusters with


