Reviewed,
UniProtKB/Swiss-Prot P0A3E0 (FLAV_ANASO)
Last modified
June 16, 2009.
Version 31.
History...
Clusters with 100%,
90%,
50% identity |
Documents (2) |
Third-party data |
Customize display | text xml rdf/xml gff fasta |
Names and origin
| Protein names | Recommended name: Flavodoxin | ||
| Gene names |
| ||
| Organism | Anabaena sp. (strain PCC 7119) | ||
| Taxonomic identifier | 1168 [NCBI] | ||
| Taxonomic lineage | Bacteria › Cyanobacteria › Nostocales › Nostocaceae › Nostoc |
Protein attributes
| Sequence length | 170 AA. |
| Sequence status | Complete. |
| Sequence processing | The displayed sequence is further processed into a mature form. |
| Protein existence | Evidence at protein level. |
General annotation (Comments)
| Function | Low-potential electron donor to a number of redox enzymes. |
| Cofactor | FMN. |
| Sequence similarities | Belongs to the flavodoxin family. Contains 1 flavodoxin-like domain. |
Ontologies
| Keywords | |
|---|---|
| Biological process | Electron transport Transport |
| Ligand | FMN Flavoprotein |
| Technical term | 3D-structure Direct protein sequencing |
| Gene Ontology (GO) | |
| Biological process | cellular response to iron ion starvation Traceable author statement. Source: UniProtKB electron transport chainInferred from electronic annotation. Source: UniProtKB-KW transportInferred from electronic annotation. Source: UniProtKB-KW |
| Molecular function | FMN binding Traceable author statement. Source: UniProtKB electron carrier activityInferred from direct assay. Source: UniProtKB oxidoreductase activityInferred from electronic annotation. Source: InterPro protein bindingInferred from physical interaction. Source: UniProtKB |
| Complete GO annotation... | |
Binary interactions
With | Entry | #Exp. | IntAct | Notes |
|---|---|---|---|---|
| FDXR | P08165 | 3 | EBI-593907,EBI-593948 | From a different organism. |
| PETH | P10933 | 1 | EBI-593907,EBI-931306 | From a different organism. |
| petH | P21890 | 5 | EBI-593907,EBI-593915 |
Sequence annotation (Features)
| Feature key | Position(s) | Length | Description | Graphical view | Feature identifier | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule processing | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Initiator methionine | 1 | 1 | Removed Ref.2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Chain | 2 – 170 | 169 | Flavodoxin | PRO_0000171600 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Regions | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Domain | 5 – 165 | 161 | Flavodoxin-like | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Secondary structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Helix Strand Turn | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 4 – 9 | 6 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 12 – 14 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 15 – 27 | 13 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 29 – 31 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 32 – 36 | 5 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 37 – 39 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 42 – 47 | 6 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 49 – 58 | 10 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 59 – 61 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 65 – 71 | 7 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 72 – 76 | 5 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 83 – 89 | 7 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 92 – 97 | 6 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 101 – 112 | 12 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 138 – 144 | 7 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 146 – 148 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 150 – 152 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 153 – 168 | 16 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequences
| ||||||||||||||||||
References
| [1] | "Isolation and overexpression in Escherichia coli of the flavodoxin gene from Anabaena PCC 7119." Fillat M.F., Borrias W.E., Weisbeek P.J. Biochem. J. 280:187-191(1991) [PubMed: 1720613] [Abstract] Cited for: NUCLEOTIDE SEQUENCE [GENOMIC DNA]. |
| [2] | "Structural and chemical properties of a flavodoxin from Anabaena PCC 7119." Fillat M.F., Edmondson D.E., Gomez-Moreno C. Biochim. Biophys. Acta 1040:301-307(1990) [PubMed: 2119231] [Abstract] Cited for: PROTEIN SEQUENCE OF 2-37. |
| [3] | "Energetics of a hydrogen bond (charged and neutral) and of a cation-pi interaction in apoflavodoxin." Fernandez-Recio J., Romero A., Sancho J. J. Mol. Biol. 290:319-330(1999) [PubMed: 10388575] [Abstract] Cited for: X-RAY CRYSTALLOGRAPHY (2.0 ANGSTROMS). |
| + | Additional computationally mapped references. |
Cross-references
Sequence databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| S68006 Genomic DNA. Translation: AAB20462.1. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3D structure databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| ModBase | Search... | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Protein-protein interaction databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IntAct | P0A3E0. 3 interactions. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Family and domain databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| InterPro | IPR008254. Flavodoxin/NO_synth. IPR001226. Flavodoxin_CS. IPR010086. Flavodoxin_lc. [Graphical view] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Pfam | PF00258. Flavodoxin_1. 1 hit. [Graphical view] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| TIGRFAMs | TIGR01752. flav_long. 1 hit. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| PROSITE | PS00201. FLAVODOXIN. 1 hit. PS50902. FLAVODOXIN_LIKE. 1 hit. [Graphical view] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| ProtoNet | Search... | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry information
| Entry name | FLAV_ANASO | ||||||||
| Accession | Primary (citable) accession number: P0A3E0 Secondary accession number(s): P11241 | ||||||||
| Entry history |
| ||||||||
| Entry status | Reviewed (UniProtKB/Swiss-Prot) | ||||||||
| Annotation project | HAMAP (High-quality Automated and Manual Annotation of microbial Proteomes) | ||||||||
Relevant documents
| PDB cross-references Index of Protein Data Bank (PDB) cross-references |
| SIMILARITY comments Index of protein domains and families |

Clusters with


