P09871 (C1S_HUMAN) Reviewed, UniProtKB/Swiss-Prot
Last modified
May 1, 2013.
Version 172.
History...
Names·Attributes·General annotation·Ontologies·Interactions·Sequence annotation·Sequences·References·Web links·Cross-refs·Entry info·DocumentsCustomize order
Names·Attributes·General annotation·Ontologies·Interactions·Sequence annotation·Sequences·References·Web links·Cross-refs·Entry info·DocumentsCustomize orderNames and origin
| Protein names | Recommended name: Complement C1s subcomponent EC=3.4.21.42 Alternative name(s): C1 esterase Complement component 1 subcomponent s Cleaved into the following 2 chains: | ||
| Gene names |
| ||
| Organism | Homo sapiens (Human) [Reference proteome] | ||
| Taxonomic identifier | 9606 [NCBI] | ||
| Taxonomic lineage | Eukaryota › Metazoa › Chordata › Craniata › Vertebrata › Euteleostomi › Mammalia › Eutheria › Euarchontoglires › Primates › Haplorrhini › Catarrhini › Hominidae › Homo![]() |
Protein attributes
| Sequence length | 688 AA. |
| Sequence status | Complete. |
| Sequence processing | The displayed sequence is further processed into a mature form. |
| Protein existence | Evidence at protein level |
General annotation (Comments)
| Function | C1s B chain is a serine protease that combines with C1q and C1r to form C1, the first component of the classical pathway of the complement system. C1r activates C1s so that it can, in turn, activate C2 and C4. |
| Catalytic activity | Cleavage of Arg-|-Ala bond in complement component C4 to form C4a and C4b, and Lys(or Arg)-|-Lys bond in complement component C2 to form C2a and C2b: the 'classical' pathway C3 convertase. Ref.14 |
| Enzyme regulation | Inhibited by SERPING1. Ref.14 |
| Subunit structure | C1 is a calcium-dependent trimolecular complex of C1q, C1r and C1s in the molar ration of 1:2:2. Activated C1s is an disulfide-linked heterodimer of a heavy chain and a light chain. Ref.12 |
| Post-translational modification | The iron and 2-oxoglutarate dependent 3-hydroxylation of aspartate and asparagine is (R) stereospecific within EGF domains. |
| Involvement in disease | Complement component C1s deficiency (C1SD) [MIM:613783]: A rare defect resulting in C1 deficiency and impaired activation of the complement classical pathway. C1 deficiency generally leads to severe immune complex disease with features of systemic lupus erythematosus and glomerulonephritis. |
| Sequence similarities | Belongs to the peptidase S1 family. Contains 2 CUB domains. Contains 1 EGF-like domain. Contains 1 peptidase S1 domain. Contains 2 Sushi (CCP/SCR) domains. |
| Biophysicochemical properties | Kinetic parameters: Less efficient than MASP2 in C4 cleavage. KM=12.3 µM for complement component C2 (at 37 degrees Celsius) Ref.14 KM=1.9 µM for complement component C4 (at 37 degrees Celsius) |
Ontologies
| Keywords | |
|---|---|
| Biological process | Complement pathway Immunity Innate immunity |
| Coding sequence diversity | Polymorphism |
| Domain | EGF-like domain Repeat Signal Sushi |
| Ligand | Calcium Metal-binding |
| Molecular function | Hydrolase Protease Serine protease |
| PTM | Disulfide bond Glycoprotein Hydroxylation |
| Technical term | 3D-structure Complete proteome Direct protein sequencing Reference proteome |
| Gene Ontology (GO) | |
| Biological_process | complement activation, classical pathway Traceable author statement. Source: Reactome innate immune responseTraceable author statement. Source: Reactome proteolysisInferred from electronic annotation. Source: UniProtKB-KW |
| Cellular_component | extracellular region Traceable author statement. Source: Reactome |
| Molecular_function | calcium ion binding Inferred from electronic annotation. Source: InterPro serine-type endopeptidase activityInferred from direct assay Ref.14. Source: UniProtKB |
| Complete GO annotation... | |
Binary interactions
With | Entry | #Exp. | IntAct | Notes |
|---|---|---|---|---|
| itself | 2 | EBI-2810045,EBI-2810045 | ||
| C1R | P00736 | 3 | EBI-2810045,EBI-3926504 |
Sequence annotation (Features)
| Feature key | Position(s) | Length | Description | Graphical view | Feature identifier | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule processing | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Signal peptide | 1 – 15 | 15 | Ref.8 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Chain | 16 – 688 | 673 | Complement C1s subcomponent | PRO_0000027586 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Chain | 16 – 437 | 422 | Complement C1s subcomponent heavy chain | PRO_0000027587 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Chain | 438 – 688 | 251 | Complement C1s subcomponent light chain | PRO_0000027588 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Regions | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Domain | 16 – 130 | 115 | CUB 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Domain | 131 – 172 | 42 | EGF-like; calcium-binding | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Domain | 175 – 290 | 116 | CUB 2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Domain | 292 – 356 | 65 | Sushi 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Domain | 357 – 423 | 67 | Sushi 2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Domain | 438 – 680 | 243 | Peptidase S1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sites | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Active site | 475 | 1 | Charge relay system | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Active site | 529 | 1 | Charge relay system | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Active site | 632 | 1 | Charge relay system | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Metal binding | 60 | 1 | Calcium | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Metal binding | 68 | 1 | Calcium | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Metal binding | 113 | 1 | Calcium | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Metal binding | 131 | 1 | Calcium | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Metal binding | 132 | 1 | Calcium; via carbonyl oxygen | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Metal binding | 134 | 1 | Calcium | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Metal binding | 149 | 1 | Calcium | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Metal binding | 150 | 1 | Calcium; via carbonyl oxygen | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Metal binding | 153 | 1 | Calcium; via carbonyl oxygen | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Amino acid modifications | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Modified residue | 149 | 1 | (3R)-3-hydroxyasparagine Ref.10 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Glycosylation | 174 | 1 | N-linked (GlcNAc...) Ref.10 Ref.17 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Glycosylation | 406 | 1 | N-linked (GlcNAc...) Ref.16 Ref.17 Ref.19 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Disulfide bond | 65 ↔ 83 | Ref.12 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Disulfide bond | 135 ↔ 147 | Ref.12 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Disulfide bond | 143 ↔ 156 | Ref.12 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Disulfide bond | 158 ↔ 171 | Ref.12 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Disulfide bond | 175 ↔ 202 | Ref.12 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Disulfide bond | 234 ↔ 251 | Ref.12 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Disulfide bond | 294 ↔ 341 | Ref.12 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Disulfide bond | 321 ↔ 354 | Ref.12 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Disulfide bond | 359 ↔ 403 | Ref.12 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Disulfide bond | 386 ↔ 421 | Ref.12 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Disulfide bond | 425 ↔ 549 | Interchain (between heavy and light chains) Ref.12 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Disulfide bond | 595 ↔ 618 | Ref.12 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Disulfide bond | 628 ↔ 659 | Ref.12 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Natural variations | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 119 | 1 | R → H. Corresponds to variant rs12146727 [ dbSNP | Ensembl ]. | VAR_033643 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 327 | 1 | V → L. Corresponds to variant rs2239170 [ dbSNP | Ensembl ]. | VAR_033644 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 383 | 1 | R → H. Corresponds to variant rs20573 [ dbSNP | Ensembl ]. | VAR_014565 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Experimental info | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence conflict | 294 | 1 | C → K AA sequence Ref.8 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence conflict | 513 | 1 | G → GG Ref.7 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence conflict | 573 | 1 | T → A AA sequence Ref.9 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence conflict | 645 – 646 | 2 | TK → GR AA sequence Ref.9 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Secondary structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Helix Strand Turn | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 19 – 24 | 6 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 26 – 29 | 4 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 34 – 43 | 10 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 48 – 58 | 11 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 63 – 65 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 67 – 73 | 7 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 80 – 82 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 84 – 86 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 96 – 112 | 17 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 122 – 131 | 10 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 134 – 136 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 143 – 150 | 8 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 153 – 157 | 5 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 368 – 370 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 381 – 386 | 6 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 388 – 390 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 391 – 393 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 399 – 403 | 5 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 409 – 411 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 412 – 414 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 421 – 423 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 446 – 448 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 452 – 455 | 4 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 456 – 459 | 4 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 460 – 466 | 7 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 469 – 472 | 4 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 474 – 477 | 4 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 505 – 510 | 6 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 531 – 537 | 7 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 555 – 557 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 564 – 570 | 7 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 583 – 590 | 8 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 592 – 596 | 5 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 616 – 620 | 5 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 635 – 639 | 5 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 647 – 655 | 9 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 661 – 667 | 7 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 668 – 671 | 4 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 672 – 681 | 10 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequences
| ||||||||||||||||||
References
| « Hide 'large scale' references | |
| [1] | "Molecular cloning of cDNA for human complement component C1s. The complete amino acid sequence." McKinnon C.M., Carter P.E., Smyth S.J., Dunbar B., Fothergill J.E. Eur. J. Biochem. 169:547-553(1987) [PubMed] [Europe PMC] [Abstract] Cited for: NUCLEOTIDE SEQUENCE [MRNA]. Tissue: Liver. |
| [2] | "Complete cDNA sequence of human complement Cls and close physical linkage of the homologous genes Cls and Clr." Tosi M., Duponchel C., Meo T., Julier C. Biochemistry 26:8516-8524(1987) [PubMed] [Europe PMC] [Abstract] Cited for: NUCLEOTIDE SEQUENCE [MRNA]. |
| [3] | "Human genes for complement components C1r and C1s in a close tail-to-tail arrangement." Kusumoto H., Hirosawa S., Salier J.-P., Hagen F.S., Kurachi K. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 85:7307-7311(1988) [PubMed] [Europe PMC] [Abstract] Cited for: NUCLEOTIDE SEQUENCE [MRNA]. |
| [4] | Mural R.J., Istrail S., Sutton G.G., Florea L., Halpern A.L., Mobarry C.M., Lippert R., Walenz B., Shatkay H., Dew I., Miller J.R., Flanigan M.J., Edwards N.J., Bolanos R., Fasulo D., Halldorsson B.V., Hannenhalli S., Turner R. Venter J.C.Submitted (SEP-2005) to the EMBL/GenBank/DDBJ databases Cited for: NUCLEOTIDE SEQUENCE [LARGE SCALE GENOMIC DNA]. |
| [5] | "The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC)." The MGC Project Team Genome Res. 14:2121-2127(2004) [PubMed] [Europe PMC] [Abstract] Cited for: NUCLEOTIDE SEQUENCE [LARGE SCALE MRNA]. Tissue: PNS. |
| [6] | "Two lineages of mannose-binding lectin-associated serine protease (MASP) in vertebrates." Endo Y., Takahashi M., Nakao M., Saiga H., Sekine H., Matsushita M., Nonaka M., Fujita T. J. Immunol. 161:4924-4930(1998) [PubMed] [Europe PMC] [Abstract] Cited for: NUCLEOTIDE SEQUENCE [GENOMIC DNA] OF 1-329. Tissue: Peripheral blood leukocyte. |
| [7] | "Complement genes C1r and C1s feature an intronless serine protease domain closely related to haptoglobin." Tosi M., Duponchel C., Meo T., Couture-Tosi E. J. Mol. Biol. 208:709-714(1989) [PubMed] [Europe PMC] [Abstract] Cited for: NUCLEOTIDE SEQUENCE OF 291-688. |
| [8] | "Human complement component C1s. Partial sequence determination of the heavy chain and identification of the peptide bond cleaved during activation." Spycher S.E., Nick H., Rickli E.E. Eur. J. Biochem. 156:49-57(1986) [PubMed] [Europe PMC] [Abstract] Cited for: PROTEIN SEQUENCE OF 16-61; 168-219; 287-334 AND 384-445. |
| [9] | "The serine proteinase chain of human complement component C1s. Cyanogen bromide cleavage and N-terminal sequences of the fragments." Carter P.E., Dunbar B., Fothergill J.E. Biochem. J. 215:565-571(1983) [PubMed] [Europe PMC] [Abstract] Cited for: PROTEIN SEQUENCE OF 438-500; 503-534; 542-601; 617-623 AND 626-656. |
| [10] | "Chemical and functional characterization of a fragment of C1-s containing the epidermal growth factor homology region." Thielens N.M., van Dorsselaer A., Gagnon J., Arlaud G.J. Biochemistry 29:3570-3578(1990) [PubMed] [Europe PMC] [Abstract] Cited for: PARTIAL PROTEIN SEQUENCE, GLYCOSYLATION AT ASN-174, HYDROXYLATION AT ASN-149. |
| [11] | "Effect of lactoperoxidase-catalyzed iodination on the Ca(2+)-dependent interactions of human C1s. Location of the iodination sites." Illy C., Thielens N.M., Gagnon J., Arlaud G.J. Biochemistry 30:7135-7141(1991) [PubMed] [Europe PMC] [Abstract] Cited for: PARTIAL PROTEIN SEQUENCE. Tissue: Plasma. |
| [12] | "Identification of the disulfide bonds of human complement C1s." Hess D., Schaller J., Rickli E.E. Biochemistry 30:2827-2833(1991) [PubMed] [Europe PMC] [Abstract] Cited for: DISULFIDE BONDS. |
| [13] | "Structure of the catalytic region of human complement protease C1s: study by chemical cross-linking and three-dimensional homology modeling." Rossi V., Gaboriaud C., Lacroix M., Ulrich J., Fontecilla-Camps J.-C., Gagnon J., Arlaud G.J. Biochemistry 34:7311-7321(1995) [PubMed] [Europe PMC] [Abstract] Cited for: PARTIAL PROTEIN SEQUENCE, 3D-STRUCTURE MODELING OF CATALYTIC DOMAIN. |
| [14] | "Substrate specificities of recombinant mannan-binding lectin-associated serine proteases-1 and -2." Rossi V., Cseh S., Bally I., Thielens N.M., Jensenius J.C., Arlaud G.J. J. Biol. Chem. 276:40880-40887(2001) [PubMed] [Europe PMC] [Abstract] Cited for: CATALYTIC ACTIVITY, BIOPHYSICOCHEMICAL PROPERTIES, ENZYME REGULATION. |
| [15] | "Molecular basis of a selective C1s deficiency associated with early onset multiple autoimmune diseases." Dragon-Durey M.-A., Quartier P., Fremeaux-Bacchi V., Blouin J., de Barace C., Prieur A.-M., Weiss L., Fridman W.-H. J. Immunol. 166:7612-7616(2001) [PubMed] [Europe PMC] [Abstract] Cited for: INVOLVEMENT IN COMPLEMENT COMPONENT C1S DEFICIENCY. |
| [16] | "Human plasma N-glycoproteome analysis by immunoaffinity subtraction, hydrazide chemistry, and mass spectrometry." Liu T., Qian W.-J., Gritsenko M.A., Camp D.G. II, Monroe M.E., Moore R.J., Smith R.D. J. Proteome Res. 4:2070-2080(2005) [PubMed] [Europe PMC] [Abstract] Cited for: GLYCOSYLATION [LARGE SCALE ANALYSIS] AT ASN-406, MASS SPECTROMETRY. Tissue: Plasma. |
| [17] | "Glycoproteomics analysis of human liver tissue by combination of multiple enzyme digestion and hydrazide chemistry." Chen R., Jiang X., Sun D., Han G., Wang F., Ye M., Wang L., Zou H. J. Proteome Res. 8:651-661(2009) [PubMed] [Europe PMC] [Abstract] Cited for: GLYCOSYLATION [LARGE SCALE ANALYSIS] AT ASN-174 AND ASN-406, MASS SPECTROMETRY. Tissue: Liver. |
| [18] | "Crystal structure of the catalytic domain of human complement c1s: a serine protease with a handle." Gaboriaud C., Rossi V., Bally I., Arlaud G.J., Fontecilla-Camps J.-C. EMBO J. 19:1755-1765(2000) [PubMed] [Europe PMC] [Abstract] Cited for: X-RAY CRYSTALLOGRAPHY (1.7 ANGSTROMS) OF 358-688. |
| [19] | "X-ray structure of the Ca2+-binding interaction domain of C1s. Insights into the assembly of the C1 complex of complement." Gregory L.A., Thielens N.M., Arlaud G.J., Fontecilla-Camps J.-C., Gaboriaud C. J. Biol. Chem. 278:32157-32164(2003) [PubMed] [Europe PMC] [Abstract] Cited for: X-RAY CRYSTALLOGRAPHY (1.5 ANGSTROMS) OF 16-174, CALCIUM-BINDING SITES, GLYCOSYLATION AT ASN-406. |
| + | Additional computationally mapped references. |
Web resources
| C1Sbase C1S mutation db |
Cross-references
Sequence databases | |||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| EMBL GenBank DDBJ | X06596 mRNA. Translation: CAA29817.1. M18767 mRNA. Translation: AAA51853.1. J04080 mRNA. Translation: AAA51852.1. CH471116 Genomic DNA. Translation: EAW88689.1. CH471116 Genomic DNA. Translation: EAW88690.1. BC056903 mRNA. Translation: AAH56903.1. AB009076 Genomic DNA. Translation: BAA86864.1. | ||||||||||||||||||
| IPI | IPI00017696. | ||||||||||||||||||
| PIR | C1HUS. A40496. | ||||||||||||||||||
| RefSeq | NP_001725.1. NM_001734.3. NP_958850.1. NM_201442.2. | ||||||||||||||||||
| UniGene | Hs.458355. | ||||||||||||||||||
3D structure databases | |||||||||||||||||||
| PDBe RCSB PDB PDBj |
| ||||||||||||||||||
| ProteinModelPortal | P09871. | ||||||||||||||||||
| ModBase | Search... | ||||||||||||||||||
Protein-protein interaction databases | |||||||||||||||||||
| IntAct | P09871. 7 interactions. | ||||||||||||||||||
Protein family/group databases | |||||||||||||||||||
| MEROPS | S01.193. | ||||||||||||||||||
PTM databases | |||||||||||||||||||
| PhosphoSite | P09871. | ||||||||||||||||||
Polymorphism databases | |||||||||||||||||||
| DMDM | 115205. | ||||||||||||||||||
2D gel databases | |||||||||||||||||||
| SWISS-2DPAGE | P09871. | ||||||||||||||||||
Proteomic databases | |||||||||||||||||||
| PaxDb | P09871. | ||||||||||||||||||
| PeptideAtlas | P09871. | ||||||||||||||||||
| PRIDE | P09871. | ||||||||||||||||||
Protocols and materials databases | |||||||||||||||||||
| StructuralBiologyKnowledgebase | Search... | ||||||||||||||||||
Genome annotation databases | |||||||||||||||||||
| Ensembl | ENST00000328916; ENSP00000328173; ENSG00000182326. ENST00000360817; ENSP00000354057; ENSG00000182326. ENST00000406697; ENSP00000385035; ENSG00000182326. ENST00000594877; ENSP00000471707; ENSG00000269882. ENST00000595575; ENSP00000469947; ENSG00000269882. ENST00000600933; ENSP00000469899; ENSG00000269882. | ||||||||||||||||||
| GeneID | 716. | ||||||||||||||||||
| KEGG | hsa:716. | ||||||||||||||||||
| UCSC | uc001qsj.3. human. | ||||||||||||||||||
Organism-specific databases | |||||||||||||||||||
| CTD | 716. | ||||||||||||||||||
| GeneCards | GC12P007096. | ||||||||||||||||||
| HGNC | HGNC:1247. C1S. | ||||||||||||||||||
| HPA | CAB016722. HPA018852. | ||||||||||||||||||
| MIM | 120580. gene. 613783. phenotype. | ||||||||||||||||||
| neXtProt | NX_P09871. | ||||||||||||||||||
| Orphanet | 169147. Immunodeficiency due to an early component of complement deficiency. | ||||||||||||||||||
| PharmGKB | PA25636. | ||||||||||||||||||
| GenAtlas | Search... | ||||||||||||||||||
Phylogenomic databases | |||||||||||||||||||
| eggNOG | COG5640. | ||||||||||||||||||
| HOVERGEN | HBG000559. | ||||||||||||||||||
| InParanoid | P09871. | ||||||||||||||||||
| KO | K01331. | ||||||||||||||||||
| OMA | NGSWVNE. | ||||||||||||||||||
| OrthoDB | EOG4H19VC. | ||||||||||||||||||
| PhylomeDB | P09871. | ||||||||||||||||||
Enzyme and pathway databases | |||||||||||||||||||
| Reactome | REACT_6900. Immune System. | ||||||||||||||||||
Gene expression databases | |||||||||||||||||||
| ArrayExpress | P09871. | ||||||||||||||||||
| Bgee | P09871. | ||||||||||||||||||
| Genevestigator | P09871. | ||||||||||||||||||
| GermOnline | ENSG00000182326. Homo sapiens. | ||||||||||||||||||
Family and domain databases | |||||||||||||||||||
| Gene3D | 2.60.120.290. 2 hits. | ||||||||||||||||||
| InterPro | IPR000859. CUB_dom. IPR001881. EGF-like_Ca-bd. IPR000152. EGF-type_Asp/Asn_hydroxyl_site. IPR018097. EGF_Ca-bd_CS. IPR024175. Pept_S1A_C1r/C1S/mannan-bd. IPR001254. Peptidase_S1. IPR018114. Peptidase_S1_AS. IPR001314. Peptidase_S1A. IPR000436. Sushi_SCR_CCP. IPR009003. Trypsin-like_Pept_dom. [Graphical view] | ||||||||||||||||||
| Pfam | PF00431. CUB. 2 hits. PF07645. EGF_CA. 1 hit. PF00084. Sushi. 2 hits. PF00089. Trypsin. 1 hit. [Graphical view] | ||||||||||||||||||
| PIRSF | PIRSF001155. C1r_C1s_MASP. 1 hit. | ||||||||||||||||||
| PRINTS | PR00722. CHYMOTRYPSIN. | ||||||||||||||||||
| SMART | SM00032. CCP. 2 hits. SM00042. CUB. 2 hits. SM00179. EGF_CA. 1 hit. SM00020. Tryp_SPc. 1 hit. [Graphical view] | ||||||||||||||||||
| SUPFAM | SSF57535. Complement_control_module. 2 hits. SSF49854. CUB. 2 hits. SSF50494. Pept_Ser_Cys. 1 hit. | ||||||||||||||||||
| PROSITE | PS00010. ASX_HYDROXYL. 1 hit. PS01180. CUB. 2 hits. PS00022. EGF_1. False negative. PS01186. EGF_2. False negative. PS50026. EGF_3. False negative. PS01187. EGF_CA. 1 hit. PS50923. SUSHI. 2 hits. PS50240. TRYPSIN_DOM. 1 hit. PS00134. TRYPSIN_HIS. False negative. PS00135. TRYPSIN_SER. 1 hit. [Graphical view] | ||||||||||||||||||
| ProtoNet | Search... | ||||||||||||||||||
Other | |||||||||||||||||||
| BindingDB | P09871. | ||||||||||||||||||
| ChEMBL | CHEMBL3913. | ||||||||||||||||||
| ChiTaRS | C1S. human. | ||||||||||||||||||
| DrugBank | DB00054. Abciximab. DB00051. Adalimumab. DB00074. Basiliximab. DB00002. Cetuximab. DB00005. Etanercept. DB00056. Gemtuzumab ozogamicin. DB00078. Ibritumomab. DB00028. Immune globulin. DB00075. Muromonab. DB00073. Rituximab. DB00072. Trastuzumab. | ||||||||||||||||||
| EvolutionaryTrace | P09871. | ||||||||||||||||||
| GenomeRNAi | 716. | ||||||||||||||||||
| NextBio | 2912. | ||||||||||||||||||
| PMAP-CutDB | P09871. | ||||||||||||||||||
| SOURCE | Search... | ||||||||||||||||||
Entry information
| Entry name | C1S_HUMAN | ||||||||
| Accession | Primary (citable) accession number: P09871 Secondary accession number(s): D3DUT4 Q9UM14 | ||||||||
| Entry history |
| ||||||||
| Entry status | Reviewed (UniProtKB/Swiss-Prot) | ||||||||
| Annotation program | Chordata Protein Annotation Program | ||||||||
| Disclaimer | Any medical or genetic information present in this entry is provided for research, educational and informational purposes only. It is not in any way intended to be used as a substitute for professional medical advice, diagnosis, treatment or care. | ||||||||
Relevant documents
| Peptidase families Classification of peptidase families and list of entries |
| Human chromosome 12 Human chromosome 12: entries, gene names and cross-references to MIM |
| Human entries with polymorphisms or disease mutations List of human entries with polymorphisms or disease mutations |
| Human polymorphisms and disease mutations Index of human polymorphisms and disease mutations |
| MIM cross-references Online Mendelian Inheritance in Man (MIM) cross-references in UniProtKB/Swiss-Prot |
| PDB cross-references Index of Protein Data Bank (PDB) cross-references |
| SIMILARITY comments Index of protein domains and families |

Clusters with
