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UniProtKB/Swiss-Prot P09038 (FGF2_HUMAN)
Last modified
February 9, 2010.
Version 134.
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Clusters with 100%,
90%,
50% identity |
Documents (4) |
Third-party data |
Customize display | text xml rdf/xml gff fasta |
Names and origin
| Protein names | Recommended name: Heparin-binding growth factor 2 Short name=HBGF-2 Alternative name(s): Basic fibroblast growth factor Short name=BFGF | ||||
| Gene names |
| ||||
| Organism | Homo sapiens (Human) [Complete proteome] | ||||
| Taxonomic identifier | 9606 [NCBI] | ||||
| Taxonomic lineage | Eukaryota › Metazoa › Chordata › Craniata › Vertebrata › Euteleostomi › Mammalia › Eutheria › Euarchontoglires › Primates › Haplorrhini › Catarrhini › Hominidae › Homo |
Protein attributes
| Sequence length | 288 AA. |
| Sequence status | Complete. |
| Sequence processing | The displayed sequence is further processed into a mature form. |
| Protein existence | Evidence at protein level. |
General annotation (Comments)
| Function | The heparin-binding growth factors are angiogenic agents in vivo and are potent mitogens for a variety of cell types in vitro. There are differences in the tissue distribution and concentration of these 2 growth factors. Ref.11 |
| Subunit structure | Monomer. Interacts with CSPG4 and FGFBP1. Found in a complex with FGFBP1, FGF1 and FGF2. Ref.20 Ref.21 Ref.22 |
| Tissue specificity | Expressed in granulosa and cumulus cells. Expressed in hepatocellular carcinoma cells, but not in non-cancerous liver tissue. Ref.11 Ref.18 |
| Post-translational modification | Several N-termini starting at positions 94, 125, 126, 132, 143 and 162 have been identified by direct sequencing. |
| Miscellaneous | This protein binds heparin more strongly than does aFGF. |
| Sequence similarities | Belongs to the heparin-binding growth factors family. |
| Biophysicochemical properties | pH dependence: Retains almost half of its activity after treatment at pH 2.0 for 3 hours at 20 degrees Celsius. Temperature dependence: Inactivated after 3 minutes at 60 degrees Celsius or 1 minute at 80 degrees Celsius. |
| Sequence caution | The sequence AAA52448.1 differs from that shown. Reason: Frameshift at positions 25, 82, 98 and 133. The sequence AAB21432.2 differs from that shown. Reason: Frameshift at position 25. The sequence AAB21432.2 differs from that shown. Reason: Miscellaneous discrepancy. Unusual initiator. The initiator methionine is coded by a non-canonical CTG leucine codon. The sequence ABO43041.1 differs from that shown. Reason: Erroneous initiation. Translation N-terminally extended. The sequence ABO43041.1 differs from that shown. Reason: Miscellaneous discrepancy. Unusual initiator. The initiator methionine is coded by a non-canonical CTG leucine codon. The sequence CAA28027.1 differs from that shown. Reason: Frameshift at positions 25 and 102. The sequence CAA28027.1 differs from that shown. Reason: Miscellaneous discrepancy. Unusual initiator. The initiator methionine is coded by a non-canonical CTG leucine codon. The sequence CAA73868.1 differs from that shown. Reason: Frameshift at position 25. The sequence CAA73868.1 differs from that shown. Reason: Miscellaneous discrepancy. Unusual initiator. The initiator methionine is coded by a non-canonical CTG leucine codon. The sequence EAX05222.1 differs from that shown. Reason: Erroneous initiation. Translation N-terminally extended. The sequence EAX05222.1 differs from that shown. Reason: Miscellaneous discrepancy. Unusual initiator. The initiator methionine is coded by a non-canonical CTG leucine codon. |
Ontologies
Binary interactions
With | Entry | #Exp. | IntAct | Notes |
|---|---|---|---|---|
| CASP1 | P29466 | 1 | EBI-977447,EBI-516667 | |
| FGFBP1 | Q14512 | 3 | EBI-977447,EBI-953742 | |
| FGFR2 | P21802-5 | 1 | EBI-977447,EBI-1028732 |
Alternative products
| This entry describes 4 isoforms produced by alternative initiation. [Align] [Select] | ||||||
| Isoform 1 (identifier: P09038-4) This isoform has been chosen as the 'canonical' sequence. All positional information in this entry refers to it. This is also the sequence that appears in the downloadable versions of the entry. | ||||||
| Note: Starts at an alternative CUG codon. | ||||||
| Isoform 2 (identifier: P09038-1) The sequence of this isoform differs from the canonical sequence as follows: 1-78: Missing. 79-79: L → M | ||||||
| Note: Starts at an alternative CUG codon. | ||||||
| Isoform 3 (identifier: P09038-2) The sequence of this isoform differs from the canonical sequence as follows: 1-133: Missing. | ||||||
| Isoform 4 (identifier: P09038-3) The sequence of this isoform differs from the canonical sequence as follows: 1-92: Missing. 93-93: L → M | ||||||
| Note: Starts at an alternative CUG codon. |
Sequence annotation (Features)
| Feature key | Position(s) | Length | Description | Graphical view | Feature identifier | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule processing | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Propeptide | 1 – 142 | 142 | Or 93, or 124, or 125, or 131, or 161 | PRO_0000008932 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Chain | 143 – 288 | 146 | Heparin-binding growth factor 2 | PRO_0000008933 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Regions | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Region | 261 – 277 | 17 | Heparin-binding By similarity | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motif | 179 – 181 | 3 | Cell attachment site; atypical Potential | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motif | 221 – 223 | 3 | Cell attachment site; atypical Potential | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sites | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Binding site | 169 | 1 | Heparin By similarity | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Natural variations | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Alternative sequence | 1 – 133 | 133 | Missing in isoform 3. | VSP_037383 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Alternative sequence | 1 – 92 | 92 | Missing in isoform 4. | VSP_037384 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Alternative sequence | 1 – 78 | 78 | Missing in isoform 2. | VSP_038236 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Alternative sequence | 79 | 1 | L → M in isoform 2. | VSP_038237 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Alternative sequence | 93 | 1 | L → M in isoform 4. | VSP_037385 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Experimental info | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence conflict | 25 | 1 | G → R in AAA52448. Ref.10 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence conflict | 50 | 1 | H → Q in AAA52448. Ref.10 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence conflict | 59 | 1 | A → R in AAA52448. Ref.10 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Secondary structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Helix Strand Turn | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 163 – 167 | 5 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 168 – 171 | 4 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 172 – 176 | 5 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 182 – 185 | 4 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 191 – 193 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 195 – 201 | 7 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 204 – 209 | 6 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 210 – 213 | 4 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 214 – 218 | 5 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 224 – 229 | 6 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 232 – 234 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 236 – 240 | 5 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 246 – 253 | 8 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 264 – 266 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 269 – 271 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 277 – 279 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 281 – 284 | 4 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequences
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
References
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| + | Additional computationally mapped references. |
Cross-references
Sequence databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| EMBL GenBank DDBJ | X04431 Genomic DNA. Translation: CAA28027.1. Sequence problems. X04432 Genomic DNA. Translation: CAA28028.1. X04433 Genomic DNA. Translation: CAA28029.1. J04513 mRNA. Translation: AAA52531.1. J04513 mRNA. Translation: AAA52532.1. J04513 mRNA. Translation: AAA52533.1. AB451321 mRNA. Translation: BAG70135.1. AB451450 mRNA. Translation: BAG70264.1. EF506888 Genomic DNA. Translation: ABO43041.1. Sequence problems. AC021205 Genomic DNA. No translation available. CH471056 Genomic DNA. Translation: EAX05222.1. Sequence problems. S81809 Genomic DNA. Translation: AAB21432.2. Sequence problems. Y13468 Genomic DNA. Translation: CAA73868.1. Sequence problems. M27968 mRNA. Translation: AAA52448.1. Frameshift. M17599 mRNA. Translation: AAA52534.1. AY820133 mRNA. Translation: AAV70487.1. S47380 mRNA. Translation: AAD13853.1. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IPI | IPI00154603. IPI00930195. IPI00930557. IPI00946154. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| PIR | A32398. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| RefSeq | NP_001997.5. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| UniGene | Hs.284244 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3D structure databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| PDBe RCSB PDB PDBj |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| ModBase | Search... | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Protein-protein interaction databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| DIP | DIP-4012N. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IntAct | P09038. 5 interactions. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| STRING | P09038. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PTM databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| PhosphoSite | P09038. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Proteomic databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| PRIDE | P09038. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome annotation databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Ensembl | ENST00000264498; ENSP00000264498; ENSG00000138685; Homo sapiens. [Genome view] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GeneID | 2247. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| KEGG | hsa:2247. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Organism-specific databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| CTD | 2247. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GeneCards | GC04P124027. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| H-InvDB | HIX0031422. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| HGNC | HGNC:3676. FGF2. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| HPA | CAB000125. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MIM | 134920. gene. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| PharmGKB | PA28115. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GenAtlas | Search... | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Phylogenomic databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| eggNOG | prNOG13573. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| HOVERGEN | P09038. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| InParanoid | P09038. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Enzyme and pathway databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Pathway_Interaction_DB | angiopoietinreceptor_pathway. Angiopoietin receptor Tie2-mediated signaling. fgf_pathway. FGF signaling pathway. glypican_1pathway. Glypican 1 network. avb3_integrin_pathway. Integrins in angiogenesis. syndecan_4_pathway. Syndecan-4-mediated signaling events. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Reactome | REACT_9470. Signaling by FGFR. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene expression databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| ArrayExpress | P09038. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Bgee | P09038. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| CleanEx | HS_FGF2. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genevestigator | P09038. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GermOnline | ENSG00000138685. Homo sapiens. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Family and domain databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| InterPro | IPR008996. Cytokine_IL1-like. IPR002209. GF_heparin_bd. IPR002348. IL1_HBGF. [Graphical view] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| PANTHER | PTHR11486. IL1_HBGF. 1 hit. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Pfam | PF00167. FGF. 1 hit. [Graphical view] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| PRINTS | PR00263. HBGFFGF. PR00262. IL1HBGF. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| SMART | SM00442. FGF. 1 hit. [Graphical view] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| PROSITE | PS00247. HBGF_FGF. 1 hit. [Graphical view] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Other Resources | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| DrugBank | DB00686. Pentosan Polysulfate. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| NextBio | 9095. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| SOURCE | Search... | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry information
| Entry name | FGF2_HUMAN | ||||||||
| Accession | Primary (citable) accession number: P09038 Secondary accession number(s): A4LBB8 Q9UCS6 | ||||||||
| Entry history |
| ||||||||
| Entry status | Reviewed (UniProtKB/Swiss-Prot) | ||||||||
| Annotation project | HPI (Human Proteome Initiative) | ||||||||
| Disclaimer | Any medical or genetic information present in this entry is provided for research, educational and informational purposes only. It is not in any way intended to be used as a substitute for professional medical advice, diagnosis, treatment or care. | ||||||||
Relevant documents
| Human chromosome 4 Human chromosome 4: entries, gene names and cross-references to MIM |
| MIM cross-references Online Mendelian Inheritance in Man (MIM) cross-references in UniProtKB/Swiss-Prot |
| PDB cross-references Index of Protein Data Bank (PDB) cross-references |
| SIMILARITY comments Index of protein domains and families |

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