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UniProtKB/Swiss-Prot P09038 (FGF2_HUMAN)
Last modified
September 2, 2008.
Version 115.
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90%,
50% identity |
Documents (4) |
Third-party data |
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Names and origin
| Protein names | Recommended name: Heparin-binding growth factor 2 Short name=HBGF-2 Alternative name(s): Basic fibroblast growth factor Short name=BFGF | ||||
| Gene names |
| ||||
| Organism | Homo sapiens (Human) | ||||
| Taxonomic identifier | 9606 [NCBI] | ||||
| Taxonomic lineage | Eukaryota › Metazoa › Chordata › Craniata › Vertebrata › Euteleostomi › Mammalia › Eutheria › Euarchontoglires › Primates › Haplorrhini › Catarrhini › Hominidae › Homo |
Protein attributes
| Sequence length | 155 AA. |
| Sequence status | Complete. |
| Sequence processing | The displayed sequence is further processed into a mature form. |
| Protein existence | Evidence at protein level. |
General annotation (Comments)
| Function | The heparin-binding growth factors are angiogenic agents in vivo and are potent mitogens for a variety of cell types in vitro. There are differences in the tissue distribution and concentration of these 2 growth factors. |
| Subunit structure | Monomer. Interacts with CSPG4 and FGFBP1. Found in a complex with FGFBP1, FGF1 and FGF2. |
| Miscellaneous | This protein binds heparin more strongly than does aFGF. |
| Sequence similarities | Belongs to the heparin-binding growth factors family. |
Ontologies
Keywords | |
|---|---|
| Biological process | Angiogenesis Differentiation |
| Ligand | Heparin-binding |
| Molecular function | Developmental protein Growth factor Mitogen |
| Technical term | 3D-structure Direct protein sequencing |
Gene Ontology (GO) | |
| Biological process | Ras protein signal transduction Traceable author statement. Source: ProtInc activation of MAPK activityTraceable author statement. Source: ProtInc chemotaxisTraceable author statement. Source: ProtInc fibroblast growth factor receptor signaling pathwayInferred from Experiment. Source: Reactome nervous system developmentTraceable author statement. Source: ProtInc organ morphogenesisTraceable author statement. Source: ProtInc positive regulation of cardiac muscle cell proliferationInferred from direct assay. Source: UniProtKB |
| Cellular component | extracellular space Ref.4 Traceable author statement. Source: ProtInc |
| Molecular function | protein binding Ref.12 Inferred from physical interaction. Source: UniProtKB |
| Complete GO annotation... | |
Binary interactions
With | Entry | #Exp. | IntAct | Notes |
|---|---|---|---|---|
| CASP1 | P29466 | 1 | EBI-977447,EBI-516667 | |
| FGFBP1 | Q14512 | 3 | EBI-977447,EBI-953742 | |
| FGFR2 | P21802-5 | 1 | EBI-977447,EBI-1028732 |
Sequence annotation (Features)
| Feature key | Position(s) | Length | Description | Graphical view | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule processing | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Propeptide | 1 – 9 | 9 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Chain | 10 – 155 | 146 | Heparin-binding growth factor 2 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Regions | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Region | 128 – 144 | 17 | Heparin-binding By similarity | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motif | 46 – 48 | 3 | Cell attachment site; atypical Potential | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motif | 88 – 90 | 3 | Cell attachment site; atypical Potential | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sites | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Binding site | 36 | 1 | Heparin By similarity | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Helix Strand Turn | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 30 – 34 | 5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 35 – 38 | 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 39 – 43 | 5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 49 – 52 | 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 58 – 60 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 62 – 68 | 7 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 71 – 76 | 6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 77 – 80 | 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 81 – 85 | 5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 91 – 96 | 6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 99 – 101 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 103 – 107 | 5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 113 – 120 | 8 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 131 – 133 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 136 – 138 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 144 – 146 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 148 – 151 | 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequences
| ||||||||||||||||||
References
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| + | Additional computationally mapped references. |
Cross-references
Sequence databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| X04431 Genomic DNA. Translation: CAA28027.1. X04432 Genomic DNA. Translation: CAA28028.1. X04433 Genomic DNA. Translation: CAA28029.1. M17599 mRNA. Translation: AAA52534.1. Different initiation. M27968 mRNA. Translation: AAA52448.1. J04513 mRNA. Translation: AAA52533.1. Different initiation. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| PIR | A32398. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| RefSeq | NP_001997.5. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| UniGene | Hs.284244 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3D structure databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| ModBase | Search... | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Protein-protein interaction databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| DIP | DIP:4012N. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IntAct | P09038. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome annotation databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Ensembl | ENSG00000138685. Homo sapiens. [Contig view] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GeneID | 2247. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| KEGG | hsa:2247. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Organism-specific databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| H-InvDB | HIX0031422. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| HGNC | HGNC:3676. FGF2. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| HPA | CAB000125. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MIM | 134920. gene. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| PharmGKB | PA28115. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GenAtlas | Search... | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GeneCards | Search... | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Phylogenomic databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| HOVERGEN | P09038. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Enzyme and pathway databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Reactome | REACT_9470. Signaling by FGFR. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene expression databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| ArrayExpress | P09038. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| CleanEx | HS_FGF2. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GermOnline | ENSG00000138685. Homo sapiens. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Family and domain databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| InterPro | IPR002209. GF_heparin_bd. IPR002348. IL1_HBGF. [Graphical view] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| PANTHER | PTHR11486. IL1_HBGF. 1 hit. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Pfam | PF00167. FGF. 1 hit. [Graphical view] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| PRINTS | PR00263. HBGFFGF. PR00262. IL1HBGF. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| ProDom | PD000831. IL1_HBGF. 1 hit. [Graphical view] [Entries sharing at least one domain] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| SMART | SM00442. FGF. 1 hit. [Graphical view] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| PROSITE | PS00247. HBGF_FGF. 1 hit. [Graphical view] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| BLOCKS | Search... | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Other Resources | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| DrugBank | DB00686. Pentosan Polysulfate. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| LinkHub | P09038. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| SOURCE | Search... | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| ProtoNet | Search... | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry information
| Entry name | FGF2_HUMAN | ||||||||
| Accession | Primary (citable) accession number: P09038 | ||||||||
| Entry history |
| ||||||||
| Entry status | Reviewed (UniProtKB/Swiss-Prot) | ||||||||
| Annotation project | HPI (Human Proteome Initiative) | ||||||||
Relevant documents
| Human chromosome 4 Human chromosome 4: entries, gene names and cross-references to MIM |
| MIM cross-references Online Mendelian Inheritance in Man (MIM) cross-references in UniProtKB/Swiss-Prot |
| PDB cross-references Index of Protein Data Bank (PDB) cross-references |
| SIMILARITY comments Index of protein domains and families |

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