P09038 (FGF2_HUMAN) Reviewed, UniProtKB/Swiss-Prot
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| Protein names | Recommended name: Heparin-binding growth factor 2 Short name=HBGF-2 Alternative name(s): Basic fibroblast growth factor Short name=bFGF | ||||
| Gene names |
| ||||
| Organism | Homo sapiens (Human) | ||||
| Taxonomic identifier | 9606 [NCBI] | ||||
| Taxonomic lineage | Eukaryota › Metazoa › Chordata › Craniata › Vertebrata › Euteleostomi › Mammalia › Eutheria › Euarchontoglires › Primates › Haplorrhini › Catarrhini › Hominidae › Homo |
Protein attributes
| Sequence length | 288 AA. |
| Sequence status | Complete. |
| Sequence processing | The displayed sequence is further processed into a mature form. |
| Protein existence | Evidence at protein level |
General annotation (Comments)
| Function | Plays an important role in the regulation of cell survival, cell division, angiogenesis, cell differentiation and cell migration. Functions as potent mitogen in vitro. Ref.11 Ref.20 |
| Subunit structure | Monomer. Homodimer. Interacts with FGFR1, FGFR2, FGFR3 and FGFR4. Affinity between fibroblast growth factors (FGFs) and their receptors is increased by heparan sulfate glycosaminoglycans that function as coreceptors. Interacts with CSPG4, FGFBP1 and TEC. Found in a complex with FGFBP1, FGF1 and FGF2. Ref.20 Ref.21 Ref.22 Ref.23 Ref.24 |
| Subcellular location | Secreted. Note: Exported from cells by an endoplasmic reticulum (ER)/Golgi-independent mechanism. Unconventional secretion of FGF2 occurs by direct translocation across the plasma membrane. Ref.24 |
| Tissue specificity | Expressed in granulosa and cumulus cells. Expressed in hepatocellular carcinoma cells, but not in non-cancerous liver tissue. Ref.11 Ref.18 |
| Post-translational modification | Phosphorylation at Tyr-215 regulates FGF2 unconventional secretion. Several N-termini starting at positions 94, 125, 126, 132, 143 and 162 have been identified by direct sequencing. |
| Miscellaneous | This protein binds heparin more strongly than does aFGF. |
| Sequence similarities | Belongs to the heparin-binding growth factors family. |
| Biophysicochemical properties | pH dependence: Retains almost half of its activity after treatment at pH 2.0 for 3 hours at 20 degrees Celsius. Ref.11 Temperature dependence: Inactivated after 3 minutes at 60 degrees Celsius or 1 minute at 80 degrees Celsius. |
| Sequence caution | The sequence AAA52448.1 differs from that shown. Reason: Frameshift at positions 25, 82, 98 and 133. The sequence AAB21432.2 differs from that shown. Reason: Frameshift at position 25. The sequence AAB21432.2 differs from that shown. Reason: Unusual initiator. The initiator methionine is coded by a non-canonical CTG leucine codon. The sequence ABO43041.1 differs from that shown. Reason: Erroneous initiation. Translation N-terminally extended. The sequence ABO43041.1 differs from that shown. Reason: Unusual initiator. The initiator methionine is coded by a non-canonical CTG leucine codon. The sequence CAA28027.1 differs from that shown. Reason: Frameshift at positions 25 and 102. The sequence CAA28027.1 differs from that shown. Reason: Unusual initiator. The initiator methionine is coded by a non-canonical CTG leucine codon. The sequence CAA73868.1 differs from that shown. Reason: Frameshift at position 25. The sequence CAA73868.1 differs from that shown. Reason: Unusual initiator. The initiator methionine is coded by a non-canonical CTG leucine codon. The sequence EAX05222.1 differs from that shown. Reason: Erroneous initiation. Translation N-terminally extended. The sequence EAX05222.1 differs from that shown. Reason: Unusual initiator. The initiator methionine is coded by a non-canonical CTG leucine codon. |
Ontologies
Binary interactions
With | Entry | #Exp. | IntAct | Notes |
|---|---|---|---|---|
| CASP1 | P29466 | 2 | EBI-977447,EBI-516667 | |
| FGFBP1 | Q14512 | 3 | EBI-977447,EBI-953742 | |
| FGFR1 | P11362 | 2 | EBI-977447,EBI-1028277 | |
| FGFR2 | P21802 | 3 | EBI-977447,EBI-1028658 |
Alternative products
| This entry describes 4 isoforms produced by alternative initiation. [Align] [Select] | ||||||
| Isoform 1 (identifier: P09038-4) This isoform has been chosen as the 'canonical' sequence. All positional information in this entry refers to it. This is also the sequence that appears in the downloadable versions of the entry. | ||||||
| Note: Starts at an alternative CUG codon. | ||||||
| Isoform 2 (identifier: P09038-1) The sequence of this isoform differs from the canonical sequence as follows: 1-78: Missing. 79-79: L → M | ||||||
| Note: Starts at an alternative CUG codon. | ||||||
| Isoform 3 (identifier: P09038-2) The sequence of this isoform differs from the canonical sequence as follows: 1-133: Missing. | ||||||
| Isoform 4 (identifier: P09038-3) The sequence of this isoform differs from the canonical sequence as follows: 1-92: Missing. 93-93: L → M | ||||||
| Note: Starts at an alternative CUG codon. |
Sequence annotation (Features)
| Feature key | Position(s) | Length | Description | Graphical view | Feature identifier | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule processing | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Propeptide | 1 – 142 | 142 | Or 93, or 124, or 125, or 131, or 161 | PRO_0000008932 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Chain | 143 – 288 | 146 | Heparin-binding growth factor 2 | PRO_0000008933 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Regions | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Region | 261 – 277 | 17 | Heparin-binding By similarity | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motif | 179 – 181 | 3 | Cell attachment site; atypical Potential | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motif | 221 – 223 | 3 | Cell attachment site; atypical Potential | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sites | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Binding site | 169 | 1 | Heparin By similarity | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Amino acid modifications | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Modified residue | 215 | 1 | Phosphotyrosine; by TEC Ref.24 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Natural variations | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Alternative sequence | 1 – 133 | 133 | Missing in isoform 3. | VSP_037383 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Alternative sequence | 1 – 92 | 92 | Missing in isoform 4. | VSP_037384 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Alternative sequence | 1 – 78 | 78 | Missing in isoform 2. | VSP_038236 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Alternative sequence | 79 | 1 | L → M in isoform 2. | VSP_038237 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Alternative sequence | 93 | 1 | L → M in isoform 4. | VSP_037385 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Experimental info | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence conflict | 25 | 1 | G → R in AAA52448. Ref.10 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence conflict | 50 | 1 | H → Q in AAA52448. Ref.10 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence conflict | 59 | 1 | A → R in AAA52448. Ref.10 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Secondary structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Helix Strand Turn | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 163 – 167 | 5 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 168 – 171 | 4 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 172 – 176 | 5 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 182 – 185 | 4 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 191 – 193 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 195 – 201 | 7 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 204 – 209 | 6 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 210 – 213 | 4 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 214 – 218 | 5 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 224 – 229 | 6 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 232 – 234 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 236 – 240 | 5 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 246 – 253 | 8 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 264 – 266 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 269 – 271 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 277 – 279 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 281 – 284 | 4 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequences
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
References
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Web resources
Cross-references
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| IPI | IPI00154603. IPI00930195. IPI00930557. IPI00946154. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| PIR | A32398. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| RefSeq | NP_001997.5. NM_002006.4. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| UniGene | Hs.284244. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| ModBase | Search... | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| IntAct | P09038. 5 interactions. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MINT | MINT-222469. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| STRING | P09038. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PTM databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| PhosphoSite | P09038. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Polymorphism databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| DMDM | 261260095. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Proteomic databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| PRIDE | P09038. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Protocols and materials databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| StructuralBiologyKnowledgebase | Search... | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Organism-specific databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| HPA | CAB000125. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MIM | 134920. gene. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| neXtProt | NX_P09038. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| PharmGKB | PA28115. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GenAtlas | Search... | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Phylogenomic databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| eggNOG | prNOG13573. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GeneTree | ENSGT00600000084030. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| HOVERGEN | HBG107917. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| InParanoid | P09038. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| OrthoDB | EOG4K0QPR. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Enzyme and pathway databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Pathway_Interaction_DB | angiopoietinreceptor_pathway. Angiopoietin receptor Tie2-mediated signaling. fgf_pathway. FGF signaling pathway. glypican_1pathway. Glypican 1 network. avb3_integrin_pathway. Integrins in angiogenesis. syndecan_4_pathway. Syndecan-4-mediated signaling events. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Reactome | REACT_111102. Signal Transduction. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene expression databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| ArrayExpress | P09038. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Bgee | P09038. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| CleanEx | HS_FGF2. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genevestigator | P09038. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GermOnline | ENSG00000138685. Homo sapiens. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Family and domain databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| InterPro | IPR008996. Cytokine_IL1-like. IPR002209. GF_heparin-bd. IPR002348. IL1_HBGF. [Graphical view] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| KO | K04358. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| PANTHER | PTHR11486. IL1_HBGF. 1 hit. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Pfam | PF00167. FGF. 1 hit. [Graphical view] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| PRINTS | PR00263. HBGFFGF. PR00262. IL1HBGF. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| SMART | SM00442. FGF. 1 hit. [Graphical view] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| SUPFAM | SSF50353. Cytok_IL1_like. 1 hit. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| PROSITE | PS00247. HBGF_FGF. 1 hit. [Graphical view] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| ProtoNet | Search... | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Other | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| DrugBank | DB00686. Pentosan Polysulfate. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| NextBio | 9095. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| SOURCE | Search... | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry information
| Entry name | FGF2_HUMAN | ||||||||
| Accession | Primary (citable) accession number: P09038 Secondary accession number(s): A4LBB8 Q9UCS6 | ||||||||
| Entry history |
| ||||||||
| Entry status | Reviewed (UniProtKB/Swiss-Prot) | ||||||||
| Annotation program | Chordata Protein Annotation Program | ||||||||
| Disclaimer | Any medical or genetic information present in this entry is provided for research, educational and informational purposes only. It is not in any way intended to be used as a substitute for professional medical advice, diagnosis, treatment or care. | ||||||||
Relevant documents
| Human chromosome 4 Human chromosome 4: entries, gene names and cross-references to MIM |
| MIM cross-references Online Mendelian Inheritance in Man (MIM) cross-references in UniProtKB/Swiss-Prot |
| PDB cross-references Index of Protein Data Bank (PDB) cross-references |
| SIMILARITY comments Index of protein domains and families |

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