P08563 (POLS_RUBVM) Reviewed, UniProtKB/Swiss-Prot
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April 3, 2013.
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| Protein names | Recommended name: Structural polyprotein Alternative name(s): p110 Cleaved into the following 3 chains:
|
| Organism | Rubella virus (strain M33) (RUBV) [Complete proteome] |
| Taxonomic identifier | 11043 [NCBI] |
| Taxonomic lineage | Viruses › ssRNA positive-strand viruses, no DNA stage › Togaviridae › Rubivirus › ![]() |
| Virus host | Homo sapiens (Human) [TaxID: 9606] |
Protein attributes
| Sequence length | 1063 AA. |
| Sequence status | Complete. |
| Sequence processing | The displayed sequence is further processed into a mature form. |
| Protein existence | Evidence at protein level |
General annotation (Comments)
| Function | Capsid protein interacts with genomic RNA and assembles into icosaedric core particles. The resulting nucleocapsid eventually associates with the cytoplasmic domain of E2 at the cell membrane, leading to budding and formation of mature virions. Phosphorylation negatively regulates RNA-binding activity, possibly delaying virion assembly during the viral replication phase. Capsid protein dimerizes and becomes disulfide-linked in the virion, but this interaction seems not to be important for its biological function. Modulates genomic RNA replication. Modulates subgenomic RNA synthesis by interacting with human C1QBP/SF2P32. Induces both perinuclear clustering of mitochondria and the formation of electron-dense intermitochondrial plaques, both hallmarks of rubella virus infected cells. Induces apoptosis when expressed in transfected cells. Ref.14 Ref.15 E2 envelope glycoprotein is responsible for viral attachment to target host cell, by binding to the cell receptor. Its transport to the plasma membrane depends on interaction with E1 protein. Ref.14 Ref.15 E1 envelope glycoprotein is a class II viral fusion protein. Fusion activity is inactive as long as E1 is bound to E2 in mature virion. After virus attachment to target cell and clathrin-mediated endocytosis, acidification of the endosome would induce dissociation of E1/E2 heterodimer and concomitant trimerization of the E1 subunits. This E1 homotrimer is fusion active, and promotes release of viral nucleocapsid in cytoplasm after endosome and viral membrane fusion By similarity. E1 cytoplasmic tail modulates virus release, and the tyrosines residues are critical for this function. Ref.14 Ref.15 |
| Subunit structure | Capsid protein homooligomerizes. Forms a dimer shortly after synthesis, this dimer become disulfide-linked in the virion. Interacts with human C1QBP. E1 and E2 envelope glycoproteins heterodimerize. Ref.11 |
| Subcellular location | Capsid protein: Virion. Host cytoplasm. Host mitochondrion. Note: The capsid protein is concentrated around Golgi region. Ref.5 Ref.6 Ref.8 E1 envelope glycoprotein: Virion membrane; Single-pass type I membrane protein. Host Golgi apparatus membrane; Single-pass type I membrane protein. Note: E1 and E2 form heterodimer in the endoplasmic reticulum before they are transported to and retained in the Golgi complex, where virus assembly occurs. E1 possesses an endoplasmic reticulum retention signal, and unassembled E2 and E1 subunits are retained in the endoplasmic reticulum. Presumably, assembly of E2 and E1 would mask the signal, thereby allowing transport of the heterodimer to the Golgi complex. Ref.5 Ref.6 Ref.8 E2 envelope glycoprotein: Virion membrane; Single-pass type I membrane protein. Host Golgi apparatus membrane; Single-pass type I membrane protein. Note: E1 and E2 form heterodimer in the endoplasmic reticulum before they are transported to and retained in the Golgi complex, where virus assembly occurs. E1 possesses an endoplasmic reticulum retention signal, and unassembled E2 and E1 subunits are retained in the endoplasmic reticulum. Presumably, assembly of E2 and E1 would mask the signal, thereby allowing transport of the heterodimer to the Golgi complex. Ref.5 Ref.6 Ref.8 |
| Domain | The signal peptide at the C-terminus remains bound to the mature capsid protein. It may have a role as an anchor peptide, localizing the capsid assembly at the Golgi complex, where budding occurs. |
| Post-translational modification | Specific enzymatic cleavages in vivo yield mature proteins. An internal signal peptide at the capsid C-terminus directs E2-E1 sequences of the polyprotein precursor to the endoplasmic reticulum. Signal peptidase cleaves the precursor between Capsid and E2, releasing the capsid in the cytoplasm and the E2 N-terminus in ER. Another signal peptide at E2 C-terminus directs E1 to the ER, with a similar mechanism. Capsid is phosphorylated on Ser-46 by host. This phosphorylation negatively regulates capsid protein RNA-binding activity. Dephosphorylated by human PP1A By similarity. Ref.17 |
| Miscellaneous | Structural polyprotein is translated from a subgenomic RNA synthesized during togaviruses replication. |
| Sequence caution | The sequence CAA28880.1 differs from that shown. Reason: Frameshift at several positions. |
Ontologies
Sequence annotation (Features)
| Feature key | Position(s) | Length | Description | Graphical view | Feature identifier | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule processing | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Chain | 1 – 300 | 300 | Capsid protein | PRO_0000041302 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Signal peptide | 278 – 300 | 23 | Not cleaved Potential | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Chain | 301 – 582 | 282 | E2 envelope glycoprotein | PRO_0000041303 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Signal peptide | 563 – 582 | 20 | Not cleaved Potential | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Chain | 583 – 1063 | 481 | E1 envelope glycoprotein | PRO_0000041304 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Regions | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Topological domain | 301 – 534 | 234 | Extracellular Potential | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Transmembrane | 535 – 555 | 21 | Helical; Note=Golgi retention signal; Potential | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Topological domain | 556 – 582 | 27 | Cytoplasmic Potential | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Topological domain | 583 – 1028 | 446 | Extracellular Potential | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Transmembrane | 1029 – 1049 | 21 | Helical; Note=Endoplasmic reticulum retention signal; Potential | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Topological domain | 1050 – 1063 | 14 | Cytoplasmic Potential | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Region | 30 – 69 | 40 | Human C1QBP/SF2P32-binding | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sites | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Site | 300 – 301 | 2 | Cleavage; by host signal peptidase Potential | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Site | 582 – 583 | 2 | Cleavage; by host signal peptidase Potential | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Amino acid modifications | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Modified residue | 46 | 1 | Phosphoserine; by host Ref.17 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Glycosylation | 658 | 1 | N-linked (GlcNAc...); by host Ref.16 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Glycosylation | 759 | 1 | N-linked (GlcNAc...); by host Ref.16 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Glycosylation | 791 | 1 | N-linked (GlcNAc...); by host Ref.16 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Disulfide bond | 590 ↔ 595 | By similarity | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Disulfide bond | 619 ↔ 824 | By similarity | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Disulfide bond | 641 ↔ 653 | By similarity | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Disulfide bond | 699 ↔ 712 | By similarity | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Disulfide bond | 758 ↔ 767 | By similarity | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Disulfide bond | 807 ↔ 817 | By similarity | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Disulfide bond | 931 ↔ 934 | By similarity | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Disulfide bond | 950 ↔ 983 | By similarity | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Natural variations | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 272 | 1 | H → R in strain: Isolate HPV77 vaccine. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 411 | 1 | S → Y in strain: Isolate HPV77 vaccine. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 412 | 1 | T → I in strain: Isolate HPV77 vaccine. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 413 | 1 | T → A in strain: Isolate HPV77 vaccine. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 609 | 1 | R → G in strain: Isolate HPV77 vaccine. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Experimental info | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Mutagenesis | 35 – 43 | 9 | RRPRPPRQR → AAPAPPAQA: Complete loss of human C1QBP/SF2P32-binding. 90% loss of virus production from infected cell. Ref.18 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Mutagenesis | 60 – 68 | 9 | RRRRGNRGR → AAAAGNAGA: Complete loss of human C1QBP/SF2P32-binding. 90% loss of virus production from infected cell. Ref.18 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Mutagenesis | 153 | 1 | C → S: Complete loss of Capsid dimerization. No effect on particle budding. Ref.7 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Mutagenesis | 658 | 1 | N → I: Complete loss of infectivity. Ref.16 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Mutagenesis | 664 | 1 | C → S: Prevents E1-E2 heterodimer formation, and subsequent transport of to the plasma membrane. Complete loss of fusion activity in vitro. Ref.9 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Mutagenesis | 675 | 1 | G → D: Complete loss of fusion activity in vitro. 90% loss of infectivity in vivo. No effect on virus assembly. Ref.9 Ref.13 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Mutagenesis | 686 | 1 | P → G: 99.9% loss of infectivity. No effect on virus assembly. No effect on fusion activity in vitro. Ref.9 Ref.13 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Mutagenesis | 759 | 1 | N → I: No effect on infectivity. Ref.16 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Mutagenesis | 791 | 1 | N → I: Complete loss of infectivity. Ref.16 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Mutagenesis | 1046 | 1 | L → A: No effect on virus production from infected cell. Ref.10 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Mutagenesis | 1048 | 1 | C → A: No effect on virus production from infected cell. Ref.10 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Mutagenesis | 1049 | 1 | C → A: No effect on virus production from infected cell. Ref.10 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Mutagenesis | 1052 | 1 | C → A: No effect on virus production from infected cell. Ref.10 Ref.12 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Mutagenesis | 1053 | 1 | L → A: 90% loss of virus production from infected cell. Ref.10 Ref.12 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Mutagenesis | 1054 | 1 | Y → A: Complete loss of virus production from infected cell. Ref.12 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Mutagenesis | 1055 | 1 | Y → S: Complete loss of virus production from infected cell. Ref.12 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Mutagenesis | 1056 | 1 | L → A: 90% loss of virus production from infected cell. Ref.12 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Mutagenesis | 1057 | 1 | R → S: 98% loss of virus production from infected cell. Ref.12 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Mutagenesis | 1058 | 1 | G → C: 98% loss of virus production from infected cell. Ref.12 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Mutagenesis | 1059 | 1 | A → S: 90% loss of virus production from infected cell. Ref.12 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Mutagenesis | 1060 | 1 | I → V: No effect on virus production from infected cell. Ref.12 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Mutagenesis | 1061 | 1 | A → S: 90% loss of virus production from infected cell. Ref.12 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Mutagenesis | 1062 | 1 | P → S: 90% loss of virus production from infected cell. Ref.12 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Mutagenesis | 1063 | 1 | R → S: 98% loss of virus production from infected cell. Ref.12 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence conflict | 42 – 69 | 28 | QRDSS…NRGRG → HARLQHLPEMTPAVTPEGPA PPRTGAW in CAA28880. Ref.1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence conflict | 175 | 1 | T → I in CAA28880. Ref.1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence conflict | 445 – 471 | 27 | RHGAD…PTRFG → PTALTPGAVGDLRAVHHRPV PAYPVC in CAA28880. Ref.1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence conflict | 485 | 1 | V → I in CAA28880. Ref.1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence conflict | 562 – 577 | 16 | RGAAA…LQGYN → PAPPPPSPQSSCRGTT in CAA28880. Ref.1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence conflict | 993 – 994 | 2 | RV → GH in CAA28880. Ref.1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence conflict | 995 – 1063 | 69 | Missing in CAA28880. Ref.1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Secondary structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Helix Strand Turn | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 585 – 589 | 5 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 599 – 601 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 603 – 621 | 19 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 625 – 634 | 10 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 641 – 647 | 7 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 650 – 657 | 8 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 659 – 670 | 12 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 672 – 674 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 676 – 678 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 681 – 683 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 689 – 694 | 6 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 698 – 703 | 6 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 716 – 718 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 721 – 729 | 9 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 733 – 735 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 737 – 753 | 17 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 756 – 760 | 5 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 766 – 768 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 770 – 777 | 8 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 785 – 790 | 6 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 797 – 804 | 8 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 807 – 813 | 7 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 815 – 817 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 818 – 821 | 4 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 824 – 826 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 836 – 839 | 4 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 845 – 848 | 4 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 855 – 862 | 8 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 869 – 875 | 7 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 878 – 880 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 881 – 883 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 885 – 892 | 8 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 894 – 896 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 904 – 910 | 7 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 924 – 936 | 13 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 938 – 944 | 7 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 946 – 948 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 950 – 954 | 5 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 957 – 962 | 6 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 964 – 971 | 8 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 980 – 989 | 10 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 991 – 995 | 5 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 997 – 1001 | 5 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 1002 – 1004 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 1005 – 1008 | 4 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 1010 – 1014 | 5 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequences
| ||||||||||||||||||
References
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Cross-references
Sequence databases | |||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| EMBL GenBank DDBJ | X05259 mRNA. Translation: CAA28880.1. Sequence problems. M30776 Genomic RNA. Translation: AAA47421.1. Sequence problems. | ||||||||||||||||||||||||||||||
| PIR | GNWVR3. A27505. GNWV77. JQ0087. | ||||||||||||||||||||||||||||||
3D structure databases | |||||||||||||||||||||||||||||||
| PDBe RCSB PDB PDBj |
| ||||||||||||||||||||||||||||||
| ModBase | Search... | ||||||||||||||||||||||||||||||
Protocols and materials databases | |||||||||||||||||||||||||||||||
| StructuralBiologyKnowledgebase | Search... | ||||||||||||||||||||||||||||||
Family and domain databases | |||||||||||||||||||||||||||||||
| InterPro | IPR008819. Rubella_Capsid. IPR008820. Rubella_E1. IPR008821. Rubella_E2. [Graphical view] | ||||||||||||||||||||||||||||||
| Pfam | PF05750. Rubella_Capsid. 1 hit. PF05748. Rubella_E1. 1 hit. PF05749. Rubella_E2. 1 hit. [Graphical view] | ||||||||||||||||||||||||||||||
| ProtoNet | Search... | ||||||||||||||||||||||||||||||
Entry information
| Entry name | POLS_RUBVM | ||||||||
| Accession | Primary (citable) accession number: P08563 Secondary accession number(s): P21480 Q86375 | ||||||||
| Entry history |
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| Entry status | Reviewed (UniProtKB/Swiss-Prot) | ||||||||
| Annotation program | Viral Protein Annotation Program | ||||||||
Relevant documents
| PDB cross-references Index of Protein Data Bank (PDB) cross-references |

Clusters with
