P08236 (BGLR_HUMAN) Reviewed, UniProtKB/Swiss-Prot
Last modified
May 1, 2013.
Version 146.
History...
Names·Attributes·General annotation·Ontologies·Alt products·Sequence annotation·Sequences·References·Web links·Cross-refs·Entry info·DocumentsCustomize order
Names·Attributes·General annotation·Ontologies·Alt products·Sequence annotation·Sequences·References·Web links·Cross-refs·Entry info·DocumentsCustomize orderNames and origin
| Protein names | Recommended name: Beta-glucuronidase EC=3.2.1.31 Alternative name(s): Beta-G1 | ||
| Gene names |
| ||
| Organism | Homo sapiens (Human) [Reference proteome] | ||
| Taxonomic identifier | 9606 [NCBI] | ||
| Taxonomic lineage | Eukaryota › Metazoa › Chordata › Craniata › Vertebrata › Euteleostomi › Mammalia › Eutheria › Euarchontoglires › Primates › Haplorrhini › Catarrhini › Hominidae › Homo![]() |
Protein attributes
| Sequence length | 651 AA. |
| Sequence status | Complete. |
| Sequence processing | The displayed sequence is further processed into a mature form. |
| Protein existence | Evidence at protein level |
General annotation (Comments)
| Function | Plays an important role in the degradation of dermatan and keratan sulfates. |
| Catalytic activity | A beta-D-glucuronoside + H2O = D-glucuronate + an alcohol. |
| Enzyme regulation | Inhibited by L-aspartic acid. |
| Subunit structure | Homotetramer. |
| Subcellular location | |
| Post-translational modification | N-linked glycosylated with 3 to 4 oligosaccharide chains. Ref.11 |
| Involvement in disease | Mucopolysaccharidosis 7 (MPS7) [MIM:253220]: An autosomal recessive lysosomal storage disease characterized by inability to degrade glucuronic acid-containing glycosaminoglycans. The phenotype is highly variable, ranging from severe lethal hydrops fetalis to mild forms with survival into adulthood. Most patients with the intermediate phenotype show hepatomegaly, skeletal anomalies, coarse facies, and variable degrees of mental impairment. Mucopolysaccharidosis type 7 is associated with non-immune hydrops fetalis, a generalized edema of the fetus with fluid accumulation in the body cavities due to non-immune causes. Non-immune hydrops fetalis is not a diagnosis in itself but a symptom, a feature of many genetic disorders, and the end-stage of a wide variety of disorders. |
| Sequence similarities | Belongs to the glycosyl hydrolase 2 family. |
Ontologies
| Keywords | |
|---|---|
| Cellular component | Lysosome |
| Coding sequence diversity | Alternative splicing Polymorphism |
| Disease | Disease mutation Mucopolysaccharidosis |
| Domain | Signal |
| Molecular function | Glycosidase Hydrolase |
| PTM | Glycoprotein |
| Technical term | 3D-structure Complete proteome Direct protein sequencing Reference proteome |
| Gene Ontology (GO) | |
| Biological_process | carbohydrate metabolic process Traceable author statement. Source: Reactome hyaluronan catabolic processTraceable author statement. Source: Reactome small molecule metabolic processTraceable author statement. Source: Reactome |
| Cellular_component | lysosomal lumen Traceable author statement. Source: Reactome |
| Molecular_function | beta-glucuronidase activity Traceable author statement. Source: Reactome |
| Complete GO annotation... | |
Alternative products
| This entry describes 2 isoforms produced by alternative splicing. [Align] [Select] | ||||||
| Isoform Long (identifier: P08236-1) This isoform has been chosen as the 'canonical' sequence. All positional information in this entry refers to it. This is also the sequence that appears in the downloadable versions of the entry. | ||||||
| Isoform Short (identifier: P08236-2) The sequence of this isoform differs from the canonical sequence as follows: 305-355: Missing. |
Sequence annotation (Features)
| Feature key | Position(s) | Length | Description | Graphical view | Feature identifier | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule processing | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Signal peptide | 1 – 22 | 22 | Ref.8 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Chain | 23 – 651 | 629 | Beta-glucuronidase | PRO_0000012161 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sites | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Active site | 451 | 1 | Proton donor | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Amino acid modifications | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Glycosylation | 173 | 1 | N-linked (GlcNAc...) Ref.13 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Glycosylation | 272 | 1 | N-linked (GlcNAc...) Ref.11 Ref.12 Ref.13 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Glycosylation | 420 | 1 | N-linked (GlcNAc...) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Glycosylation | 631 | 1 | N-linked (GlcNAc...) Ref.13 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Natural variations | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Alternative sequence | 305 – 355 | 51 | Missing in isoform Short. | VSP_001799 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 30 | 1 | P → S in MPS7. | VAR_058511 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 38 | 1 | C → G in MPS7; very mild phenotype. Ref.26 | VAR_037914 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 52 | 1 | S → F in MPS7; loss of activity. Ref.25 | VAR_037915 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 136 | 1 | G → R in MPS7. Ref.23 | VAR_037916 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 148 | 1 | P → S in MPS7. Ref.22 | VAR_037917 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 150 | 1 | E → K in MPS7. Ref.23 | VAR_037918 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 152 | 1 | D → G in MPS7. | VAR_058512 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 152 | 1 | D → N Reduced activity levels without apparent pathogenic consequences. Ref.21 Ref.26 | VAR_037919 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 176 | 1 | L → F in MPS7. Ref.20 Ref.21 Ref.23 Ref.27 | VAR_037920 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 216 | 1 | R → W in MPS7. Ref.16 Ref.23 | VAR_003196 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 243 | 1 | L → P in MPS7. | VAR_058513 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 320 | 1 | Y → C in MPS7. Ref.23 | VAR_037921 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 320 | 1 | Y → S in MPS7. Ref.23 | VAR_037922 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 339 | 1 | N → S in MPS7. | VAR_058514 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 350 | 1 | K → N in MPS7. Ref.28 | VAR_037923 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 351 | 1 | H → Y in MPS7. Ref.23 | VAR_037924 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 354 | 1 | A → V in MPS7. Ref.17 | VAR_003197 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 361 – 369 | 9 | Missing in MPS7. | VAR_058515 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 362 | 1 | D → N in MPS7. | VAR_058516 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 364 | 1 | P → L in MPS7. | VAR_058517 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 374 | 1 | R → C in MPS7. Ref.23 | VAR_037925 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 376 | 1 | L → F. Corresponds to variant rs11559283 [ dbSNP | Ensembl ]. | VAR_055884 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 382 | 1 | R → C in MPS7. Ref.18 Ref.23 | VAR_003198 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 382 | 1 | R → H in MPS7. Ref.23 | VAR_037926 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 408 | 1 | P → S in MPS7. Ref.24 | VAR_037927 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 415 | 1 | P → L in MPS7. Ref.24 | VAR_037928 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 435 | 1 | R → P in MPS7. Ref.23 | VAR_037929 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 477 | 1 | R → W in MPS7. Ref.23 | VAR_037930 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 495 | 1 | Y → C in MPS7. Ref.22 | VAR_037931 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 508 | 1 | Y → C in MPS7. Ref.23 | VAR_037932 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 540 | 1 | E → K in MPS7. | VAR_058518 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 572 | 1 | G → D in MPS7. Ref.23 | VAR_037933 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 577 | 1 | R → L in MPS7; loss of activity. Ref.28 | VAR_037934 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 606 | 1 | K → N in MPS7. Ref.23 | VAR_037935 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 607 | 1 | G → A in MPS7. | VAR_058519 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 611 | 1 | R → W in MPS7. Ref.17 | VAR_003199 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 619 | 1 | A → V in MPS7. Ref.18 | VAR_003200 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 626 | 1 | Y → H in MPS7; very mild phenotype. Ref.26 | VAR_037936 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 627 | 1 | W → C in MPS7. Ref.19 Ref.23 | VAR_003201 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 649 | 1 | L → P. Ref.1 Ref.20 Corresponds to variant rs9530 [ dbSNP | Ensembl ]. | VAR_016179 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Helix Strand Turn | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 33 – 35 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 38 – 40 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 43 – 49 | 7 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 52 – 55 | 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 57 – 60 | 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 63 – 65 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 68 – 71 | 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 75 – 81 | 7 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 84 – 86 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 90 – 93 | 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 97 – 105 | 9 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 109 – 113 | 5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 117 – 124 | 8 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 128 – 134 | 7 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 137 – 147 | 11 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 149 – 152 | 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 154 – 157 | 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 166 – 173 | 8 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 180 – 182 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 185 – 188 | 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 192 – 194 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 200 – 203 | 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 206 – 208 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 218 – 238 | 21 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 241 – 252 | 12 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 256 – 263 | 8 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 265 – 267 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 269 – 282 | 14 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 291 – 293 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 294 – 296 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 301 – 311 | 11 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 314 – 324 | 11 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 329 – 331 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 336 – 338 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 341 – 343 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 345 – 349 | 5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 355 – 357 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 363 – 376 | 14 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 380 – 382 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 390 – 399 | 10 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 402 – 406 | 5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 415 – 417 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 420 – 437 | 18 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 443 – 451 | 9 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 457 – 473 | 17 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 479 – 483 | 5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 487 – 489 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 493 – 495 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 497 – 502 | 6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 505 – 507 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 508 – 510 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 514 – 516 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 517 – 532 | 16 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 536 – 540 | 5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 559 – 574 | 16 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 575 – 580 | 6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 581 – 587 | 7 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 600 – 604 | 5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 617 – 631 | 15 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequences
| ||||||||||||||||||||||||
References
| « Hide 'large scale' references | |
| [1] | "Cloning, sequencing, and expression of cDNA for human beta-glucuronidase." Oshima A., Kyle J.W., Miller R.D., Hoffmann J.W., Powell P.P., Grubb J.H., Sly W.S., Tropak M., Guise K.S., Gravel R.A. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 84:685-689(1987) [PubMed] [Europe PMC] [Abstract] Cited for: NUCLEOTIDE SEQUENCE [MRNA], VARIANT PRO-649, ALTERNATIVE SPLICING. Tissue: Placenta. |
| [2] | Totoki Y., Toyoda A., Takeda T., Sakaki Y., Tanaka A., Yokoyama S. Submitted (APR-2005) to the EMBL/GenBank/DDBJ databases Cited for: NUCLEOTIDE SEQUENCE [LARGE SCALE MRNA]. |
| [3] | "The DNA sequence of human chromosome 7." Hillier L.W., Fulton R.S., Fulton L.A., Graves T.A., Pepin K.H., Wagner-McPherson C., Layman D., Maas J., Jaeger S., Walker R., Wylie K., Sekhon M., Becker M.C., O'Laughlin M.D., Schaller M.E., Fewell G.A., Delehaunty K.D., Miner T.L. Wilson R.K.Nature 424:157-164(2003) [PubMed] [Europe PMC] [Abstract] Cited for: NUCLEOTIDE SEQUENCE [LARGE SCALE GENOMIC DNA]. |
| [4] | "Human chromosome 7: DNA sequence and biology." Scherer S.W., Cheung J., MacDonald J.R., Osborne L.R., Nakabayashi K., Herbrick J.-A., Carson A.R., Parker-Katiraee L., Skaug J., Khaja R., Zhang J., Hudek A.K., Li M., Haddad M., Duggan G.E., Fernandez B.A., Kanematsu E., Gentles S. Tsui L.-C.Science 300:767-772(2003) [PubMed] [Europe PMC] [Abstract] Cited for: NUCLEOTIDE SEQUENCE [LARGE SCALE GENOMIC DNA]. |
| [5] | Mural R.J., Istrail S., Sutton G.G., Florea L., Halpern A.L., Mobarry C.M., Lippert R., Walenz B., Shatkay H., Dew I., Miller J.R., Flanigan M.J., Edwards N.J., Bolanos R., Fasulo D., Halldorsson B.V., Hannenhalli S., Turner R. Venter J.C.Submitted (JUL-2005) to the EMBL/GenBank/DDBJ databases Cited for: NUCLEOTIDE SEQUENCE [LARGE SCALE GENOMIC DNA]. |
| [6] | "The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC)." The MGC Project Team Genome Res. 14:2121-2127(2004) [PubMed] [Europe PMC] [Abstract] Cited for: NUCLEOTIDE SEQUENCE [LARGE SCALE MRNA]. Tissue: Colon. |
| [7] | "Analysis of the 5' flanking region of the human beta-glucuronidase gene." Shipley J.M., Miller R.D., Wu B.M., Grubb J.H., Christensen S.G., Kyle J.W., Sly W.S. Genomics 10:1009-1018(1991) [PubMed] [Europe PMC] [Abstract] Cited for: NUCLEOTIDE SEQUENCE [GENOMIC DNA] OF 1-70. |
| [8] | "Characterization of the subunits and sugar moiety of human placental and leukemic beta-glucuronidase." Tanaka J., Gasa S., Sakurada K., Miyazaki T., Kasai M., Makita A. Biol. Chem. Hoppe-Seyler 373:57-62(1992) [PubMed] [Europe PMC] [Abstract] Cited for: PROTEIN SEQUENCE OF 23-32 AND 160-175. Tissue: Placenta. |
| [9] | "Isolation and expression in Escherichia coli of a cDNA clone encoding human beta-glucuronidase." Guise K.S., Korneluk R.G., Waye J., Lamhonwah A.-M., Quan F., Palmer R., Ganschow R.E., Sly W.S., Gravel R.A. Gene 34:105-110(1985) [PubMed] [Europe PMC] [Abstract] Cited for: NUCLEOTIDE SEQUENCE [MRNA] OF 520-585. Tissue: Fibroblast. |
| [10] | "A novel inhibitor of beta-glucuronidase: L-aspartic acid." Kreamer B.L., Siegel F.L., Gourley G.R. Pediatr. Res. 50:460-466(2001) [PubMed] [Europe PMC] [Abstract] Cited for: INHIBITION BY L-ASPARTIC ACID. |
| [11] | "Identification and quantification of N-linked glycoproteins using hydrazide chemistry, stable isotope labeling and mass spectrometry." Zhang H., Li X.-J., Martin D.B., Aebersold R. Nat. Biotechnol. 21:660-666(2003) [PubMed] [Europe PMC] [Abstract] Cited for: GLYCOSYLATION AT ASN-272. |
| [12] | "Human plasma N-glycoproteome analysis by immunoaffinity subtraction, hydrazide chemistry, and mass spectrometry." Liu T., Qian W.-J., Gritsenko M.A., Camp D.G. II, Monroe M.E., Moore R.J., Smith R.D. J. Proteome Res. 4:2070-2080(2005) [PubMed] [Europe PMC] [Abstract] Cited for: GLYCOSYLATION [LARGE SCALE ANALYSIS] AT ASN-272, MASS SPECTROMETRY. Tissue: Plasma. |
| [13] | "Glycoproteomics analysis of human liver tissue by combination of multiple enzyme digestion and hydrazide chemistry." Chen R., Jiang X., Sun D., Han G., Wang F., Ye M., Wang L., Zou H. J. Proteome Res. 8:651-661(2009) [PubMed] [Europe PMC] [Abstract] Cited for: GLYCOSYLATION [LARGE SCALE ANALYSIS] AT ASN-173; ASN-272 AND ASN-631, MASS SPECTROMETRY. Tissue: Liver. |
| [14] | "Structure of human beta-glucuronidase reveals candidate lysosomal targeting and active-site motifs." Jain S., Drendel W.B., Chen Z.W., Mathews F.S., Sly W.S., Grubb J.H. Nat. Struct. Biol. 3:375-381(1996) [PubMed] [Europe PMC] [Abstract] Cited for: X-RAY CRYSTALLOGRAPHY (2.6 ANGSTROMS). |
| [15] | "Mutations and polymorphisms in GUSB gene in mucopolysaccharidosis VII (Sly Syndrome)." Tomatsu S., Montano A.M., Dung V.C., Grubb J.H., Sly W.S. Hum. Mutat. 30:511-519(2009) [PubMed] [Europe PMC] [Abstract] Cited for: REVIEW ON VARIANTS. |
| [16] | "Molecular analysis of a patient with hydrops fetalis caused by beta-glucuronidase deficiency, and evidence for additional pseudogenes." Vervoort R., Lissens W., Liebaers I. Hum. Mutat. 2:443-445(1993) [PubMed] [Europe PMC] [Abstract] Cited for: VARIANT MPS7 TRP-216. |
| [17] | "Mutational studies in a patient with the hydrops fetalis form of mucopolysaccharidosis type VII." Wu B.M., Sly W.S. Hum. Mutat. 2:446-457(1993) [PubMed] [Europe PMC] [Abstract] Cited for: VARIANTS MPS7 VAL-354 AND TRP-611. |
| [18] | "Mucopolysaccharidosis type VII: characterization of mutations and molecular heterogeneity." Tomatsu S., Fukuda S., Sukegawa K., Ikedo Y., Yamada S., Yamada Y., Sasaki T., Okamoto H., Kuwahara T., Yamaguchi S., Kiman T., Shintaku H., Isshiki G., Orii T. Am. J. Hum. Genet. 48:89-96(1991) [PubMed] [Europe PMC] [Abstract] Cited for: VARIANTS MPS7 CYS-382 AND VAL-619. |
| [19] | "Mutational analysis of a patient with mucopolysaccharidosis type VII, and identification of pseudogenes." Shipley J.M., Klinkenberg M., Wu B.M., Bachinsky D.R., Grubb J.H., Sly W.S. Am. J. Hum. Genet. 52:517-526(1993) [PubMed] [Europe PMC] [Abstract] Cited for: VARIANT MPS7 CYS-627. |
| [20] | "Overexpression rescues the mutant phenotype of L176F mutation causing beta-glucuronidase deficiency mucopolysaccharidosis in two Mennonite siblings." Wu B.M., Tomatsu S., Fukuda S., Sukegawa K., Orii T., Sly W.S. J. Biol. Chem. 269:23681-23688(1994) [PubMed] [Europe PMC] [Abstract] Cited for: VARIANT MPS7 PHE-176, VARIANT PRO-649. |
| [21] | "A pseudodeficiency allele (D152N) of the human beta-glucuronidase gene." Vervoort R., Islam M.R., Sly W., Chabas A., Wevers R., de Jong J., Liebaers I., Lissens W. Am. J. Hum. Genet. 57:798-804(1995) [PubMed] [Europe PMC] [Abstract] Cited for: VARIANT MPS7 PHE-176, VARIANT ASN-152, CHARACTERIZATION OF VARIANT ASN-152. |
| [22] | "Four novel mutations in mucopolysaccharidosis type VII including a unique base substitution in exon 10 of the beta-glucuronidase gene that creates a novel 5'-splice site." Yamada S., Tomatsu S., Sly W.S., Islam R., Wenger D.A., Fukuda S., Sukegawa K., Orii T. Hum. Mol. Genet. 4:651-655(1995) [PubMed] [Europe PMC] [Abstract] Cited for: VARIANTS MPS7 SER-148 AND CYS-495. |
| [23] | "Molecular analysis of patients with beta-glucuronidase deficiency presenting as hydrops fetalis or as early mucopolysaccharidosis VII." Vervoort R., Islam M.R., Sly W.S., Zabot M.T., Kleijer W.J., Chabas A., Fensom A., Young E.P., Liebaers I., Lissens W. Am. J. Hum. Genet. 58:457-471(1996) [PubMed] [Europe PMC] [Abstract] Cited for: VARIANTS MPS7 ARG-136; LYS-150; PHE-176; TRP-216; CYS-320; SER-320; TYR-351; CYS-374; CYS-382; HIS-382; PRO-435; TRP-477; CYS-508; ASP-572; ASN-606 AND CYS-627. |
| [24] | "beta-Glucuronidase P408S, P415L mutations: evidence that both mutations combine to produce an MPS VII allele in certain Mexican patients." Islam M.R., Vervoort R., Lissens W., Hoo J.J., Valentino L.A., Sly W.S. Hum. Genet. 98:281-284(1996) [PubMed] [Europe PMC] [Abstract] Cited for: VARIANTS MPS7 SER-408 AND LEU-415. |
| [25] | "Molecular analysis of the beta-glucuronidase gene: novel mutations in mucopolysaccharidosis type VII and heterogeneity of the polyadenylation region." Vervoort R., Buist N.R., Kleijer W.J., Wevers R., Fryns J.P., Liebaers I., Lissens W. Hum. Genet. 99:462-468(1997) [PubMed] [Europe PMC] [Abstract] Cited for: VARIANT MPS7 PHE-52, CHARACTERIZATION OF VARIANT MPS7 PHE-52. |
| [26] | "Low beta-glucuronidase enzyme activity and mutations in the human beta-glucuronidase gene in mild mucopolysaccharidosis type VII, pseudodeficiency and a heterozygote." Vervoort R., Gitzelmann R., Bosshard N., Maire I., Liebaers I., Lissens W. Hum. Genet. 102:69-78(1998) [PubMed] [Europe PMC] [Abstract] Cited for: VARIANT ASN-152, VARIANTS MPS7 GLY-38 AND HIS-626. |
| [27] | "Mucopolysaccharidosis VII: clinical, biochemical and molecular investigation of a Brazilian family." Schwartz I., Silva L.R., Leistner S., Todeschini L.A., Burin M.G., Pina-Neto J.M., Islam R.M., Shah G.N., Sly W.S., Giugliani R. Clin. Genet. 64:172-175(2003) [PubMed] [Europe PMC] [Abstract] Cited for: VARIANT MPS7 PHE-176. |
| [28] | "Mutational analysis in longest known survivor of mucopolysaccharidosis type VII." Storch S., Wittenstein B., Islam R., Ullrich K., Sly W.S., Braulke T. Hum. Genet. 112:190-194(2003) [PubMed] [Europe PMC] [Abstract] Cited for: VARIANTS MPS7 ASN-350 AND LEU-577, CHARACTERIZATION OF VARIANT MPS7 ASN-350 LEU-577. |
| + | Additional computationally mapped references. |
Web resources
Cross-references
Sequence databases | |||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| EMBL GenBank DDBJ | M15182 mRNA. Translation: AAA52561.1. AK223406 mRNA. Translation: BAD97126.1. AC073261 Genomic DNA. Translation: AAQ96851.1. CH236961 Genomic DNA. Translation: EAL23740.1. CH471140 Genomic DNA. Translation: EAX07951.1. BC014142 mRNA. Translation: AAH14142.1. M65002 Genomic DNA. Translation: AAA52622.1. M10618 mRNA. Translation: AAA52621.1. S72462 Genomic DNA. Translation: AAD14101.1. | ||||||||||||||||||
| IPI | IPI00027745. IPI00219516. | ||||||||||||||||||
| PIR | A26581. | ||||||||||||||||||
| RefSeq | NP_000172.2. NM_000181.3. | ||||||||||||||||||
| UniGene | Hs.255230. | ||||||||||||||||||
3D structure databases | |||||||||||||||||||
| PDBe RCSB PDB PDBj |
| ||||||||||||||||||
| ProteinModelPortal | P08236. | ||||||||||||||||||
| ModBase | Search... | ||||||||||||||||||
Protein-protein interaction databases | |||||||||||||||||||
| DIP | DIP-29724N. | ||||||||||||||||||
| IntAct | P08236. 2 interactions. | ||||||||||||||||||
| MINT | MINT-4054501. | ||||||||||||||||||
| STRING | 9606.ENSP00000302728. | ||||||||||||||||||
Protein family/group databases | |||||||||||||||||||
| CAZy | GH2. Glycoside Hydrolase Family 2. | ||||||||||||||||||
PTM databases | |||||||||||||||||||
| PhosphoSite | P08236. | ||||||||||||||||||
Polymorphism databases | |||||||||||||||||||
| DMDM | 146345377. | ||||||||||||||||||
Proteomic databases | |||||||||||||||||||
| PaxDb | P08236. | ||||||||||||||||||
| PRIDE | P08236. | ||||||||||||||||||
Protocols and materials databases | |||||||||||||||||||
| DNASU | 2990. | ||||||||||||||||||
| StructuralBiologyKnowledgebase | Search... | ||||||||||||||||||
Genome annotation databases | |||||||||||||||||||
| Ensembl | ENST00000304895; ENSP00000302728; ENSG00000169919. ENST00000345660; ENSP00000340734; ENSG00000169919. | ||||||||||||||||||
| GeneID | 2990. | ||||||||||||||||||
| KEGG | hsa:2990. | ||||||||||||||||||
| UCSC | uc003tun.3. human. | ||||||||||||||||||
Organism-specific databases | |||||||||||||||||||
| CTD | 2990. | ||||||||||||||||||
| GeneCards | GC07M065425. | ||||||||||||||||||
| H-InvDB | HIX0057492. | ||||||||||||||||||
| HGNC | HGNC:4696. GUSB. | ||||||||||||||||||
| HPA | HPA036322. | ||||||||||||||||||
| MIM | 253220. phenotype. 611499. gene. | ||||||||||||||||||
| neXtProt | NX_P08236. | ||||||||||||||||||
| Orphanet | 584. Mucopolysaccharidosis type 7. | ||||||||||||||||||
| PharmGKB | PA29075. | ||||||||||||||||||
| GenAtlas | Search... | ||||||||||||||||||
Phylogenomic databases | |||||||||||||||||||
| eggNOG | COG3250. | ||||||||||||||||||
| HOGENOM | HOG000120896. | ||||||||||||||||||
| HOVERGEN | HBG004843. | ||||||||||||||||||
| InParanoid | P08236. | ||||||||||||||||||
| KO | K01195. | ||||||||||||||||||
| OMA | GHMEVIQ. | ||||||||||||||||||
| OrthoDB | EOG4X97GN. | ||||||||||||||||||
| PhylomeDB | P08236. | ||||||||||||||||||
Enzyme and pathway databases | |||||||||||||||||||
| Reactome | REACT_111217. Metabolism. REACT_116125. Disease. | ||||||||||||||||||
Gene expression databases | |||||||||||||||||||
| ArrayExpress | P08236. | ||||||||||||||||||
| Bgee | P08236. | ||||||||||||||||||
| CleanEx | HS_GUSB. | ||||||||||||||||||
| Genevestigator | P08236. | ||||||||||||||||||
| GermOnline | ENSG00000169919. Homo sapiens. | ||||||||||||||||||
Family and domain databases | |||||||||||||||||||
| Gene3D | 2.60.40.320. 1 hit. 3.20.20.80. 1 hit. | ||||||||||||||||||
| InterPro | IPR008979. Galactose-bd-like. IPR006101. Glyco_hydro_2. IPR013812. Glyco_hydro_2/20_Ig-like. IPR023232. Glyco_hydro_2_AS. IPR023230. Glyco_hydro_2_CS. IPR006102. Glyco_hydro_2_Ig-like. IPR006104. Glyco_hydro_2_N. IPR006103. Glyco_hydro_2_TIM. IPR013781. Glyco_hydro_catalytic_dom. IPR017853. Glycoside_hydrolase_SF. [Graphical view] | ||||||||||||||||||
| Pfam | PF00703. Glyco_hydro_2. 1 hit. PF02836. Glyco_hydro_2_C. 1 hit. PF02837. Glyco_hydro_2_N. 1 hit. [Graphical view] | ||||||||||||||||||
| PRINTS | PR00132. GLHYDRLASE2. | ||||||||||||||||||
| SUPFAM | SSF49785. Gal_bind_like. 1 hit. SSF49303. Glyco_hydro_2Ig. 1 hit. SSF51445. Glyco_hydro_cat. 1 hit. | ||||||||||||||||||
| PROSITE | PS00719. GLYCOSYL_HYDROL_F2_1. 1 hit. PS00608. GLYCOSYL_HYDROL_F2_2. 1 hit. [Graphical view] | ||||||||||||||||||
| ProtoNet | Search... | ||||||||||||||||||
Other | |||||||||||||||||||
| ChEMBL | CHEMBL2728. | ||||||||||||||||||
| EvolutionaryTrace | P08236. | ||||||||||||||||||
| GenomeRNAi | 2990. | ||||||||||||||||||
| NextBio | 11852. | ||||||||||||||||||
| SOURCE | Search... | ||||||||||||||||||
Entry information
| Entry name | BGLR_HUMAN | ||||||||
| Accession | Primary (citable) accession number: P08236 Secondary accession number(s): Q549U0, Q96CL9 | ||||||||
| Entry history |
| ||||||||
| Entry status | Reviewed (UniProtKB/Swiss-Prot) | ||||||||
| Annotation program | Chordata Protein Annotation Program | ||||||||
| Disclaimer | Any medical or genetic information present in this entry is provided for research, educational and informational purposes only. It is not in any way intended to be used as a substitute for professional medical advice, diagnosis, treatment or care. | ||||||||
Relevant documents
| Glycosyl hydrolases Classification of glycosyl hydrolase families and list of entries |
| Human chromosome 7 Human chromosome 7: entries, gene names and cross-references to MIM |
| Human entries with polymorphisms or disease mutations List of human entries with polymorphisms or disease mutations |
| Human polymorphisms and disease mutations Index of human polymorphisms and disease mutations |
| MIM cross-references Online Mendelian Inheritance in Man (MIM) cross-references in UniProtKB/Swiss-Prot |
| PDB cross-references Index of Protein Data Bank (PDB) cross-references |
| SIMILARITY comments Index of protein domains and families |

Clusters with
