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UniProtKB/Swiss-Prot P08174 (DAF_HUMAN)
Last modified
February 9, 2010.
Version 128.
History...
Clusters with 100%,
90%,
50% identity |
Documents (8) |
Third-party data |
Customize display | text xml rdf/xml gff fasta |
Names and origin
| Protein names | Recommended name: Complement decay-accelerating factor Alternative name(s): CD_antigen=CD55 | ||||
| Gene names |
| ||||
| Organism | Homo sapiens (Human) [Complete proteome] | ||||
| Taxonomic identifier | 9606 [NCBI] | ||||
| Taxonomic lineage | Eukaryota › Metazoa › Chordata › Craniata › Vertebrata › Euteleostomi › Mammalia › Eutheria › Euarchontoglires › Primates › Haplorrhini › Catarrhini › Hominidae › Homo |
Protein attributes
| Sequence length | 381 AA. |
| Sequence status | Complete. |
| Sequence processing | The displayed sequence is further processed into a mature form. |
| Protein existence | Evidence at protein level. |
General annotation (Comments)
| Function | This protein recognizes C4b and C3b fragments that condense with cell-surface hydroxyl or amino groups when nascent C4b and C3b are locally generated during C4 and c3 activation. Interaction of daf with cell-associated C4b and C3b polypeptides interferes with their ability to catalyze the conversion of C2 and factor B to enzymatically active C2a and Bb and thereby prevents the formation of C4b2a and C3bBb, the amplification convertases of the complement cascade. Ref.14 |
| Subunit structure | Monomer (major form) and non-disulfide-linked, covalent homodimer (minor form). Binds to coxsackievirus A21, coxsackieviruses B1, B3 and B5, human enterovirus 70, human echoviruses 6, 7, 11, 12, 20 and 21 capsid proteins and acts as a receptor for these viruses. Ref.13 Ref.15 Ref.16 Ref.17 Ref.18 Ref.22 |
| Subcellular location | Isoform 1: Cell membrane; Single-pass type I membrane protein. Isoform 2: Cell membrane; Lipid-anchor › GPI-anchor. |
| Tissue specificity | Expressed on the plasma membranes of all cell types that are in intimate contact with plasma complement proteins. It is also found on the surfaces of epithelial cells lining extracellular compartments, and variants of the molecule are present in body fluids and in extracellular matrix. |
| Domain | The first Sushi domain (SCR1) is not necessary for function. SCR2 and SCR4 provide the proper conformation for the active site on SCR3 By similarity. Ref.13 |
| Post-translational modification | The Ser/Thr-rich domain is heavily O-glycosylated. Ref.23 |
| Polymorphism | Responsible for the Cromer blood group system. It consists of at least 8 high-incidence (Cr(a), Tc(a), Dr(a), Es(a), WES(b), UMC, IFC and GUTI) and three low-incidence (Tc(b), Tc(c) and WES(a)) antigens that reside on DAF. In the Cromer phenotypes Dr(a-) and Inab there is reduced or absent expression of DAF, respectively. In the case of the Dr(a-) phenotype, a single nucleotide substitution within exon 5 accounts for two changes: a simple amino acid substitution, Leu-199 that is the basis of the antigenic variation, and an alternative splicing event that underlies the decreased expression of DAF in this phenotype. The Inab phenotype is a very rare one in which the red blood cells lack all Cromer system antigens. The red blood cells of individuals with Inab phenotype have a deficiency of DAF, but these individuals are not known to have any associated hematologic or other abnormalities. |
| Sequence similarities | Belongs to the receptors of complement activation (RCA) family. Contains 4 Sushi (CCP/SCR) domains. |
Ontologies
Alternative products
| This entry describes 2 isoforms produced by alternative splicing. [Align] [Select] | ||||||
| Isoform 2 (identifier: P08174-1) Also known as: DAF-2; This isoform has been chosen as the 'canonical' sequence. All positional information in this entry refers to it. This is also the sequence that appears in the downloadable versions of the entry. | ||||||
| Note: GPI-anchored form. | ||||||
| Isoform 1 (identifier: P08174-2) Also known as: DAF-1; The sequence of this isoform differs from the canonical sequence as follows: 362-381: HTCFTLTGLLGTLVTMGLLT → SRPVTQAGMR...TQVYRLFLVS |
Sequence annotation (Features)
| Feature key | Position(s) | Length | Description | Graphical view | Feature identifier | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule processing | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Signal peptide | 1 – 34 | 34 | Ref.10 Ref.11 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Chain | 35 – 353 | 319 | Complement decay-accelerating factor | PRO_0000006000 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Propeptide | 354 – 381 | 28 | Removed in mature form | PRO_0000006001 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Regions | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Domain | 35 – 96 | 62 | Sushi 1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Domain | 96 – 160 | 65 | Sushi 2 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Domain | 161 – 222 | 62 | Sushi 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Domain | 223 – 285 | 63 | Sushi 4 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Compositional bias | 287 – 356 | 70 | Ser/Thr-rich | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Amino acid modifications | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Modified residue | 140 | 1 | Phosphoserine Ref.21 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Lipidation | 353 | 1 | GPI-anchor amidated serine Ref.12 Ref.19 Ref.20 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Glycosylation | 95 | 1 | N-linked (GlcNAc...) Ref.23 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Disulfide bond | 36 ↔ 81 | Ref.13 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Disulfide bond | 65 ↔ 94 | Ref.13 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Disulfide bond | 98 ↔ 145 | Ref.13 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Disulfide bond | 129 ↔ 158 | Ref.13 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Disulfide bond | 163 ↔ 204 | Ref.13 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Disulfide bond | 190 ↔ 220 | Ref.13 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Disulfide bond | 225 ↔ 267 | Ref.13 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Disulfide bond | 253 ↔ 283 | Ref.13 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Natural variations | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Alternative sequence | 362 – 381 | 20 | HTCFT…MGLLT → SRPVTQAGMRWCDRSSLQSR TPGFKRSFHFSLPSSWYYRA HVFHVDRFAWDASNHGLADL AKEELRRKYTQVYRLFLVS in isoform 1. | VSP_001200 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 52 | 1 | R → L in Tc(b) antigen. dbSNP rs28371588. Ref.3 | VAR_001997 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 52 | 1 | R → P in Tc(c) antigen. | VAR_001998 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 82 | 1 | L → R in WES(a) antigen. | VAR_001999 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 199 | 1 | S → L in Dr(a-) antigen. dbSNP rs56283594. Ref.24 | VAR_002000 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 227 | 1 | A → P in Cr(a-) antigen. dbSNP rs60822373. | VAR_002001 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 240 | 1 | R → H in GUTI(-) antigen. Ref.25 | VAR_015884 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Experimental info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence conflict | 80 | 1 | I → T in AAA52170. Ref.7 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence conflict | 80 | 1 | I → T in AAA52167. Ref.8 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence conflict | 85 | 1 | S → M in AAA52167. Ref.8 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence conflict | 187 | 1 | S → T in AAB48622. Ref.9 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence conflict | 297 | 1 | Q → H in AAB48622. Ref.9 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Helix Strand Turn | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 45 – 47 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 60 – 65 | 6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 78 – 82 | 5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 83 – 85 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 105 – 109 | 5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 113 – 115 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 124 – 129 | 6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 133 – 135 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 142 – 145 | 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 172 – 175 | 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 185 – 190 | 6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 194 – 198 | 5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 200 – 207 | 8 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 210 – 215 | 6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 219 – 222 | 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 234 – 236 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 248 – 253 | 6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 258 – 261 | 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 263 – 270 | 8 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 273 – 278 | 6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 282 – 284 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequences
| ||||||||||||||||||||||||
References
| « Hide 'large scale' references | |
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Web resources
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| SeattleSNPs |
| Virus Particle ExploreR db Icosahedral capsid structure |
Cross-references
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| UniGene | Hs.126517 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3D structure databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| PDBe RCSB PDB PDBj |
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Protein-protein interaction databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| STRING | P08174. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Proteomic databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| PRIDE | P08174. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome annotation databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Organism-specific databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| GenAtlas | Search... | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Phylogenomic databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Gene expression databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| ArrayExpress | P08174. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Bgee | P08174. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Other Resources | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| DrugBank | DB00446. Chloramphenicol. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| NextBio | 6582. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| SOURCE | Search... | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry information
| Entry name | DAF_HUMAN | ||||||||
| Accession | Primary (citable) accession number: P08174 Secondary accession number(s): B1AP14, P09679, P78361 | ||||||||
| Entry history |
| ||||||||
| Entry status | Reviewed (UniProtKB/Swiss-Prot) | ||||||||
| Annotation project | HPI (Human Proteome Initiative) | ||||||||
| Disclaimer | Any medical or genetic information present in this entry is provided for research, educational and informational purposes only. It is not in any way intended to be used as a substitute for professional medical advice, diagnosis, treatment or care. | ||||||||
Relevant documents
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