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UniProtKB/Swiss-Prot P08164 (NADE_BACSU)
Last modified
June 16, 2009.
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Documents (4) |
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Names and origin
| Protein names | Recommended name: NH(3)-dependent NAD(+) synthetase EC=6.3.1.5 Alternative name(s): Spore outgrowth factor B Sporulation protein outB General stress protein 38 Short name=GSP38 | ||||||
| Gene names |
| ||||||
| Organism | Bacillus subtilis [Complete proteome] [HAMAP] | ||||||
| Taxonomic identifier | 1423 [NCBI] | ||||||
| Taxonomic lineage | Bacteria › Firmicutes › Bacillales › Bacillaceae › Bacillus |
Protein attributes
| Sequence length | 272 AA. |
| Sequence status | Complete. |
| Sequence processing | The displayed sequence is further processed into a mature form. |
| Protein existence | Evidence at protein level. |
General annotation (Comments)
| Function | Catalyzes a key step in NAD biosynthesis, transforming deamido-NAD into NAD by a two-step reaction. HAMAP MF_00193 |
| Catalytic activity | ATP + deamido-NAD+ + NH3 = AMP + diphosphate + NAD+. HAMAP MF_00193 |
| Pathway | Cofactor biosynthesis; NAD(+) biosynthesis; NAD(+) from deamido-NAD(+) (ammonia route): step 1/1. HAMAP MF_00193 |
| Subunit structure | Homodimer. HAMAP MF_00193 |
| Induction | By heat shock, salt stress, oxidative stress, glucose limitation and oxygen limitation. HAMAP MF_00193 |
| Post-translational modification | Phosphorylated. Ref.5 |
| Sequence similarities | Belongs to the NAD synthetase family. |
| biophysicochemical properties | pH dependence: Optimum pH is 8.5. HAMAP MF_00193 |
Ontologies
| Keywords | |
|---|---|
| Biological process | Sporulation Stress response |
| Ligand | ATP-binding NAD Nucleotide-binding |
| Molecular function | Ligase |
| PTM | Phosphoprotein |
| Technical term | 3D-structure Complete proteome Direct protein sequencing |
| Gene Ontology (GO) | |
| Biological process | NAD biosynthetic process Inferred from electronic annotation. Source: HAMAP response to stressInferred from electronic annotation. Source: UniProtKB-KW sporulation resulting in formation of a cellular sporeInferred from electronic annotation. Source: UniProtKB-KW |
| Molecular function | ATP binding Inferred from electronic annotation. Source: HAMAP NAD+ synthase (glutamine-hydrolyzing) activityInferred from electronic annotation. Source: InterPro NAD+ synthase activityInferred from electronic annotation. Source: EC |
| Complete GO annotation... | |
Sequence annotation (Features)
| Feature key | Position(s) | Length | Description | Graphical view | Feature identifier | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule processing | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Initiator methionine | 1 | 1 | Removed Ref.5 Ref.4 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Chain | 2 – 272 | 271 | NH(3)-dependent NAD(+) synthetase HAMAP MF_00193 | PRO_0000152159 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Regions | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Nucleotide binding | 45 – 52 | 8 | ATP HAMAP MF_00193 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Nucleotide binding | 168 – 178 | 11 | NAD HAMAP MF_00193 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sites | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Binding site | 33 | 1 | NAD HAMAP MF_00193 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Binding site | 79 | 1 | ATP HAMAP MF_00193 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Binding site | 85 | 1 | ATP HAMAP MF_00193 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Binding site | 138 | 1 | NAD HAMAP MF_00193 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Binding site | 158 | 1 | ATP HAMAP MF_00193 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Binding site | 209 | 1 | ATP HAMAP MF_00193 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Binding site | 224 | 1 | NAD HAMAP MF_00193 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Binding site | 259 | 1 | NAD HAMAP MF_00193 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Helix Strand Turn | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 3 – 11 | 9 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 19 – 37 | 19 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 41 – 45 | 5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 50 – 68 | 19 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 74 – 79 | 6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 82 – 84 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 88 – 98 | 11 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 101 – 105 | 5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 109 – 123 | 15 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 129 – 151 | 23 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 154 – 156 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 161 – 164 | 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 165 – 167 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 171 – 175 | 5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 181 – 184 | 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 187 – 196 | 10 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 202 – 205 | 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 214 – 216 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 221 – 225 | 5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 229 – 236 | 8 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 243 – 255 | 13 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 257 – 260 | 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequences
| ||||||||||||||||||
References
| « Hide 'large scale' references | |
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Cross-references
Sequence databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| M15811 Genomic DNA. Translation: AAA22635.1. D50453 Genomic DNA. Translation: BAA08947.1. AL009126 Genomic DNA. Translation: CAB12107.1. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| PIR | A26936. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| RefSeq | NP_388195.1. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3D structure databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| ModBase | Search... | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome annotation databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GeneID | 938339. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GenomeReviews | Gene locus BSU03130 in contig AL009126_GR. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| KEGG | bsu:BSU03130. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| NMPDR | fig|224308.1.peg.314. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Organism-specific databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| SubtiList | BG10694. nadE. [Micado] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| CMR | Search... | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Phylogenomic databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| HOGENOM | P08164. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| OMA | P08164. ADLEEDR. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Enzyme and pathway databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| BioCyc | BSUB224308:BSU0314-MON. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| BRENDA | 6.3.1.5. 150. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Family and domain databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| HAMAP | MF_00193. [Tree] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| InterPro | IPR003694. NAD_synthase. IPR014729. Rossmann-like_a/b/a_fold. [Graphical view] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Gene3D | G3DSA:3.40.50.620. Rossmann-like_a/b/a_fold. 1 hit. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Pfam | PF02540. NAD_synthase. 1 hit. [Graphical view] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| TIGRFAMs | TIGR00552. nadE. 1 hit. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| ProtoNet | Search... | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Other Resources | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| DrugBank | DB00131. Adenosine monophosphate. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry information
| Entry name | NADE_BACSU | ||||||||
| Accession | Primary (citable) accession number: P08164 | ||||||||
| Entry history |
| ||||||||
| Entry status | Reviewed (UniProtKB/Swiss-Prot) | ||||||||
| Annotation project | HAMAP (High-quality Automated and Manual Annotation of microbial Proteomes) | ||||||||
Relevant documents
| Bacillus subtilis Bacillus subtilis (strain 168): entries, gene names and cross-references to SubtiList |
| PATHWAY comments Index of metabolic and biosynthesis pathways |
| PDB cross-references Index of Protein Data Bank (PDB) cross-references |
| SIMILARITY comments Index of protein domains and families |

Clusters with


