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UniProtKB/Swiss-Prot P08134 (RHOC_HUMAN)
Last modified
June 16, 2009.
Version 112.
History...
Clusters with 100%,
90%,
50% identity |
Documents (6) |
Third-party data |
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Names and origin
| Protein names | Recommended name: Rho-related GTP-binding protein RhoC Alternative name(s): H9 | ||||
| Gene names |
| ||||
| Organism | Homo sapiens (Human) | ||||
| Taxonomic identifier | 9606 [NCBI] | ||||
| Taxonomic lineage | Eukaryota › Metazoa › Chordata › Craniata › Vertebrata › Euteleostomi › Mammalia › Eutheria › Euarchontoglires › Primates › Haplorrhini › Catarrhini › Hominidae › Homo |
Protein attributes
| Sequence length | 193 AA. |
| Sequence status | Complete. |
| Sequence processing | The displayed sequence is further processed into a mature form. |
| Protein existence | Evidence at protein level. |
General annotation (Comments)
| Function | Regulates a signal transduction pathway linking plasma membrane receptors to the assembly of focal adhesions and actin stress fibers. |
| Subunit structure | Interacts with DIAPH1, ROCK1, ROCK2 and RTKN. Interacts with AKAP13. Ref.8 Ref.9 |
| Subcellular location | Cell membrane; Lipid-anchor; Cytoplasmic side Potential. |
| Sequence similarities | Belongs to the small GTPase superfamily. Rho family. |
Ontologies
| Keywords | |
|---|---|
| Cellular component | Cell membrane Membrane |
| Coding sequence diversity | Polymorphism |
| Ligand | GTP-binding Nucleotide-binding |
| PTM | ADP-ribosylation Lipoprotein Methylation Phosphoprotein Prenylation |
| Technical term | 3D-structure |
| Gene Ontology (GO) | |
| Biological process | positive regulation of I-kappaB kinase/NF-kappaB cascade Inferred from mutant phenotype. Source: UniProtKB small GTPase mediated signal transductionInferred from electronic annotation. Source: InterPro |
| Cellular component | intracellular Inferred from electronic annotation. Source: InterPro plasma membraneInferred from electronic annotation. Source: UniProtKB-SubCell |
| Molecular function | GTP binding Inferred from electronic annotation. Source: UniProtKB-KW GTPase activityTraceable author statement. Source: ProtInc protein bindingInferred from physical interaction. Source: IntAct signal transducer activityInferred from mutant phenotype. Source: UniProtKB |
| Complete GO annotation... | |
Binary interactions
With | Entry | #Exp. | IntAct | Notes |
|---|---|---|---|---|
| ARHGDIA | P52565 | 1 | EBI-747589,EBI-712693 | |
| CNKSR1 | Q969H4 | 1 | EBI-747589,EBI-741671 | |
| VHL | P40337 | 1 | EBI-747589,EBI-301246 |
Sequence annotation (Features)
| Feature key | Position(s) | Length | Description | Graphical view | Feature identifier | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule processing | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Chain | 1 – 190 | 190 | Rho-related GTP-binding protein RhoC | PRO_0000042022 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Propeptide | 191 – 193 | 3 | Removed in mature form By similarity | PRO_0000042023 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Regions | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Nucleotide binding | 12 – 19 | 8 | GTP By similarity | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Nucleotide binding | 59 – 63 | 5 | GTP By similarity | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Nucleotide binding | 117 – 120 | 4 | GTP By similarity | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motif | 34 – 42 | 9 | Effector region Potential | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Amino acid modifications | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Modified residue | 19 | 1 | Phosphothreonine By similarity | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Modified residue | 26 | 1 | Phosphoserine By similarity | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Modified residue | 41 | 1 | ADP-ribosylasparagine; by botulinum toxin By similarity | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Modified residue | 190 | 1 | Cysteine methyl ester By similarity | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Lipidation | 190 | 1 | S-geranylgeranyl cysteine By similarity | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Natural variations | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 120 | 1 | D → H: dbSNP rs11538959. | VAR_051974 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Helix Strand Turn | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 4 – 13 | 10 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 18 – 27 | 10 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 43 – 48 | 6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 51 – 58 | 8 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 64 – 66 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 67 – 69 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 70 – 73 | 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 78 – 85 | 8 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 89 – 97 | 9 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 99 – 106 | 8 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 112 – 117 | 6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 119 – 121 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 125 – 132 | 8 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 133 – 135 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 141 – 150 | 10 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 154 – 158 | 5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 161 – 163 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 167 – 179 | 13 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequences
| ||||||||||||||||||
References
| « Hide 'large scale' references | |
| [1] | "Coding sequence of human rho cDNAs clone 6 and clone 9." Chardin P., Madaule P., Tavitian A. Nucleic Acids Res. 16:2717-2717(1988) [PubMed: 3283705] [Abstract] Cited for: NUCLEOTIDE SEQUENCE [MRNA]. |
| [2] | Fagan K.P., Oliveira L., Pittler S.J. Submitted (OCT-1993) to the EMBL/GenBank/DDBJ databases Cited for: NUCLEOTIDE SEQUENCE [MRNA]. Tissue: Retina. |
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| [7] | "The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC)." The MGC Project Team Genome Res. 14:2121-2127(2004) [PubMed: 15489334] [Abstract] Cited for: NUCLEOTIDE SEQUENCE [LARGE SCALE MRNA]. Tissue: Skin. |
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| [9] | "AKAP-Lbc anchors protein kinase A and nucleates Galpha 12-selective Rho-mediated stress fiber formation." Diviani D., Soderling J., Scott J.D. J. Biol. Chem. 276:44247-44257(2001) [PubMed: 11546812] [Abstract] Cited for: INTERACTION WITH AKAP13. |
| [10] | Colinge J., Superti-Furga G., Bennett K.L. Submitted (OCT-2008) to UniProtKB Cited for: IDENTIFICATION [LARGE SCALE ANALYSIS], MASS SPECTROMETRY. |
| [11] | "Structural and mechanistic insights into the interaction between Rho and mammalian Dia." Rose R., Weyand M., Lammers M., Ishizaki T., Ahmadian M.R., Wittinghofer A. Nature 435:513-518(2005) [PubMed: 15864301] [Abstract] Cited for: X-RAY CRYSTALLOGRAPHY (3.0 ANGSTROMS) IN COMPLEX WITH DIAPH1. |
| + | Additional computationally mapped references. |
Cross-references
Sequence databases | |||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| X06821 mRNA. Translation: CAA29969.1. L25081 mRNA. Translation: AAC33179.1. AF498972 mRNA. Translation: AAM21119.1. CR450360 mRNA. Translation: CAG29356.1. BT019448 mRNA. Translation: AAV38255.1. AL603832 Genomic DNA. Translation: CAI14058.1. BC007245 mRNA. Translation: AAH07245.1. BC009177 mRNA. Translation: AAH09177.1. BC052808 mRNA. Translation: AAH52808.1. | |||||||||||||||||||||||||||||||
| IPI | IPI00027434. | ||||||||||||||||||||||||||||||
| PIR | TVHURC. S01029. | ||||||||||||||||||||||||||||||
| RefSeq | NP_001036143.1. NP_001036144.1. NP_786886.1. | ||||||||||||||||||||||||||||||
| UniGene | Hs.502659 Hs.658289 | ||||||||||||||||||||||||||||||
3D structure databases | |||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||
| ModBase | Search... | ||||||||||||||||||||||||||||||
Protein-protein interaction databases | |||||||||||||||||||||||||||||||
| IntAct | P08134. 10 interactions. | ||||||||||||||||||||||||||||||
PTM databases | |||||||||||||||||||||||||||||||
| PhosphoSite | P08134. | ||||||||||||||||||||||||||||||
Proteomic databases | |||||||||||||||||||||||||||||||
| PRIDE | P08134. | ||||||||||||||||||||||||||||||
Genome annotation databases | |||||||||||||||||||||||||||||||
| Ensembl | ENSG00000155366. Homo sapiens. [Contig view] | ||||||||||||||||||||||||||||||
| GeneID | 389. | ||||||||||||||||||||||||||||||
| KEGG | hsa:389. | ||||||||||||||||||||||||||||||
Organism-specific databases | |||||||||||||||||||||||||||||||
| GeneCards | GC01M112955. | ||||||||||||||||||||||||||||||
| H-InvDB | HIX0000895. | ||||||||||||||||||||||||||||||
| HGNC | HGNC:669. RHOC. | ||||||||||||||||||||||||||||||
| HPA | CAB010821. | ||||||||||||||||||||||||||||||
| MIM | 165380. gene. | ||||||||||||||||||||||||||||||
| PharmGKB | PA24951. | ||||||||||||||||||||||||||||||
| GenAtlas | Search... | ||||||||||||||||||||||||||||||
Phylogenomic databases | |||||||||||||||||||||||||||||||
| HOVERGEN | P08134. | ||||||||||||||||||||||||||||||
| OMA | P08134. LRNDEST. | ||||||||||||||||||||||||||||||
Enzyme and pathway databases | |||||||||||||||||||||||||||||||
| Pathway_Interaction_DB | p75ntrpathway. p75(NTR)-mediated signaling. prlsignalingeventspathway. Signaling events mediated by PRL. | ||||||||||||||||||||||||||||||
| Reactome | REACT_11044. Signaling by Rho GTPases. | ||||||||||||||||||||||||||||||
Gene expression databases | |||||||||||||||||||||||||||||||
| Bgee | P08134. | ||||||||||||||||||||||||||||||
| CleanEx | HS_RHOC. | ||||||||||||||||||||||||||||||
| GermOnline | ENSG00000155366. Homo sapiens. | ||||||||||||||||||||||||||||||
Family and domain databases | |||||||||||||||||||||||||||||||
| InterPro | IPR003578. GTPase_Rho. IPR013753. Ras. IPR001806. Ras_GTPase. IPR005225. Small_GTP_bd. [Graphical view] | ||||||||||||||||||||||||||||||
| Pfam | PF00071. Ras. 1 hit. [Graphical view] | ||||||||||||||||||||||||||||||
| PRINTS | PR00449. RASTRNSFRMNG. | ||||||||||||||||||||||||||||||
| SMART | SM00174. RHO. 1 hit. [Graphical view] | ||||||||||||||||||||||||||||||
| TIGRFAMs | TIGR00231. small_GTP. 1 hit. | ||||||||||||||||||||||||||||||
| PROSITE | PS51420. RHO. 1 hit. [Graphical view] | ||||||||||||||||||||||||||||||
| ProtoNet | Search... | ||||||||||||||||||||||||||||||
Other Resources | |||||||||||||||||||||||||||||||
| NextBio | 1619. | ||||||||||||||||||||||||||||||
| SOURCE | Search... | ||||||||||||||||||||||||||||||
Entry information
| Entry name | RHOC_HUMAN | ||||||||
| Accession | Primary (citable) accession number: P08134 Secondary accession number(s): Q6ICN3 | ||||||||
| Entry history |
| ||||||||
| Entry status | Reviewed (UniProtKB/Swiss-Prot) | ||||||||
| Annotation project | HPI (Human Proteome Initiative) | ||||||||
Relevant documents
| Human chromosome 1 Human chromosome 1: entries, gene names and cross-references to MIM |
| Human entries with polymorphisms or disease mutations List of human entries with polymorphisms or disease mutations |
| Human polymorphisms and disease mutations Index of human polymorphisms and disease mutations |
| MIM cross-references Online Mendelian Inheritance in Man (MIM) cross-references in UniProtKB/Swiss-Prot |
| PDB cross-references Index of Protein Data Bank (PDB) cross-references |
| SIMILARITY comments Index of protein domains and families |

Clusters with


