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UniProtKB/Swiss-Prot P07953 (F261_RAT)
Last modified
June 16, 2009.
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Names and origin · Protein attributes · General annotation (Comments) · Ontologies · Binary interactions · Alternative products · Sequence annotation (Features) · Sequences · References · Cross-references · Entry information · Relevant documents
Names and origin
| Protein names | Recommended name: 6-phosphofructo-2-kinase/fructose-2,6-biphosphatase 1 Alternative name(s): 6PF-2-K/Fru-2,6-P2ASE liver isozyme Including the following 2 domains: 1- Recommended name: 6-phosphofructo-2-kinase EC=2.7.1.105 2- Recommended name: Fructose-2,6-bisphosphatase EC=3.1.3.46 | ||
| Gene names |
| ||
| Organism | Rattus norvegicus (Rat) | ||
| Taxonomic identifier | 10116 [NCBI] | ||
| Taxonomic lineage | Eukaryota › Metazoa › Chordata › Craniata › Vertebrata › Euteleostomi › Mammalia › Eutheria › Euarchontoglires › Glires › Rodentia › Sciurognathi › Muroidea › Muridae › Murinae › Rattus |
Protein attributes
| Sequence length | 471 AA. |
| Sequence status | Complete. |
| Sequence processing | The displayed sequence is further processed into a mature form. |
| Protein existence | Evidence at protein level. |
General annotation (Comments)
| Function | Synthesis and degradation of fructose 2,6-bisphosphate. |
| Catalytic activity | Beta-D-fructose 2,6-bisphosphate + H2O = D-fructose 6-phosphate + phosphate. ATP + D-fructose 6-phosphate = ADP + beta-D-fructose 2,6-bisphosphate. |
| Enzyme regulation | Phosphorylation results in inhibition of the kinase activity. |
| Subunit structure | Homodimer. |
| Tissue specificity | Liver. |
| Sequence similarities | In the C-terminal section; belongs to the phosphoglycerate mutase family. |
Ontologies
Alternative products
| This entry describes 2 isoforms produced by alternative splicing. [Align] [Select] | ||||||
| Isoform 1 (identifier: P07953-1) This isoform has been chosen as the 'canonical' sequence. All positional information in this entry refers to it. This is also the sequence that appears in the downloadable versions of the entry. | ||||||
| Isoform 2 (identifier: P07953-2) The sequence of this isoform differs from the canonical sequence as follows: 1-33: MSREMGELTQTRLQKIWIPHSSSSSVLQRRRGS → MEEKASKRTA |
Sequence annotation (Features)
| Feature key | Position(s) | Length | Description | Graphical view | Feature identifier | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule processing | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Initiator methionine | 1 | 1 | Removed Ref.8 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Chain | 2 – 471 | 470 | 6-phosphofructo-2-kinase/fructose-2,6-biphosphatase 1 | PRO_0000179962 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Regions | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Nucleotide binding | 49 – 56 | 8 | ATP By similarity | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Region | 2 – 250 | 249 | 6-phosphofructo-2-kinase | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Region | 251 – 471 | 221 | Fructose-2,6-bisphosphatase | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sites | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Active site | 131 | 1 | Potential | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Active site | 161 | 1 | Potential | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Active site | 259 | 1 | Tele-phosphohistidine intermediate | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Active site | 328 | 1 | Potential | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Active site | 393 | 1 | Proton donor | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Binding site | 105 | 1 | Fructose-6-phosphate By similarity | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Binding site | 196 | 1 | Fructose-6-phosphate By similarity | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Amino acid modifications | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Modified residue | 2 | 1 | N-acetylserine Ref.5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Modified residue | 33 | 1 | Phosphoserine; by PKA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Natural variations | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Alternative sequence | 1 – 33 | 33 | MSREM…RRRGS → MEEKASKRTA in isoform 2. | VSP_004674 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Experimental info | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence conflict | 135 | 1 | T → Y Ref.3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence conflict | 135 | 1 | T → Y Ref.4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence conflict | 135 | 1 | T → Y Ref.5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence conflict | 138 | 1 | E → F Ref.3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence conflict | 257 | 1 | Missing AA sequence Ref.7 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Secondary structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Helix Strand Turn | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 254 – 258 | 5 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 263 – 267 | 5 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 278 – 293 | 16 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 300 – 303 | 4 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 307 – 314 | 8 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 315 – 317 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 320 – 322 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 324 – 326 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 332 – 334 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 339 – 345 | 7 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 347 – 355 | 9 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 357 – 359 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 368 – 383 | 16 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 386 – 392 | 7 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 394 – 404 | 11 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 409 – 411 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 412 – 414 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 421 – 428 | 8 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 431 – 438 | 8 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequences
| ||||||||||||||||||||||||
References
| [1] | "Complete nucleotide sequence coding for rat liver 6-phosphofructo-2-kinase/fructose-2,6-bisphosphatase derived from a cDNA clone." Darville M.I., Crepin K.M., Vandekerckhove J., van Damme J., Octave J.-N., Rider M.H., Marchand M.J., Hue L., Rousseau G.G. FEBS Lett. 224:317-321(1987) [PubMed: 2856848] [Abstract] Cited for: NUCLEOTIDE SEQUENCE (ISOFORM 1), PROTEIN SEQUENCE OF 16-29; 65-74; 90-105; 123-137; 189-195; 240-252; 259-266 AND 309-324 (ISOFORM 1). Strain: Wistar. Tissue: Liver. |
| [2] | "Isolation of a cDNA clone for rat liver 6-phosphofructo 2-kinase/fructose 2,6-bisphosphatase." Colosa A.D., Lively M.O., El-Maghrabi M.R., Pilkis S.J. Biochem. Biophys. Res. Commun. 143:1092-1098(1987) [PubMed: 3032183] [Abstract] Cited for: NUCLEOTIDE SEQUENCE (ISOFORM 1). Strain: Sprague-Dawley. |
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| [4] | "Induction of rat liver 6-phosphofructo-2-kinase/fructose-2,6-bisphosphatase mRNA by refeeding and insulin." Colosia A.D., Marker A.J., Lange A.J., El-Maghrabi M.R., Granner D.K., Tauler A., Pilkis J., Pilkis S.J. J. Biol. Chem. 263:18669-18677(1988) [PubMed: 2848802] [Abstract] Cited for: NUCLEOTIDE SEQUENCE [MRNA] (ISOFORM 1). Tissue: Liver. |
| [5] | "Complete amino acid sequence of rat liver 6-phosphofructo-2-kinase/fructose-2,6-bisphosphatase." Lively M.O., El-Maghrabi M.R., Pilkis J., D'Angelo G., Colosia A.D., Ciavola J.A., Fraser B.A., Pilkis S.J. J. Biol. Chem. 263:839-849(1988) [PubMed: 2826464] [Abstract] Cited for: PROTEIN SEQUENCE (ISOFORM 1), ACETYLATION AT SER-2. Tissue: Liver. |
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Cross-references
Sequence databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Y00702 mRNA. Translation: CAA68694.1. X15579 mRNA. Translation: CAA33606.1. X15580 mRNA. Translation: CAA33607.1. M26215 Genomic DNA. Translation: AAA02888.2. M26216 Genomic DNA. Translation: AAA02889.1. J04197 mRNA. Translation: AAA79008.1. M27886 Genomic DNA. Translation: AAA58780.1. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IPI | IPI00327110. IPI00393624. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| PIR | KIRTFB. S11761. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| RefSeq | NP_036753.4. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| UniGene | Rn.10115 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3D structure databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| SMR | P07953. Positions 42-470. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| ModBase | Search... | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Protein-protein interaction databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IntAct | P07953. 2 interactions. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PTM databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| PhosphoSite | P07953. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome annotation databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Ensembl | ENSRNOG00000000165. Rattus norvegicus. [Contig view] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GeneID | 24638. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| KEGG | rno:24638. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Organism-specific databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| RGD | 3307. Pfkfb1. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Phylogenomic databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| HOVERGEN | P07953. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| OMA | P07953. TTHARRQ. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Enzyme and pathway databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| BRENDA | 2.7.1.105. 248. 3.1.3.46. 248. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene expression databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| ArrayExpress | P07953. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GermOnline | ENSRNOG00000000165. Rattus norvegicus. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Family and domain databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| InterPro | IPR003094. 6Pfruct_kin. IPR013079. 6Phosfructo_kin. IPR016260. Bifunct_6PFK/fruc_bisP_Ptase. IPR001345. PG/BPGM_mutase. IPR013078. PG_mutase. [Graphical view] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| PANTHER | PTHR10606. 6Pfruct_kin. 1 hit. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Pfam | PF01591. 6PF2K. 1 hit. PF00300. PGAM. 1 hit. [Graphical view] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| PIRSF | PIRSF000709. 6PFK_2-Ptase. 1 hit. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| PRINTS | PR00991. 6PFRUCTKNASE. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| PROSITE | PS00175. PG_MUTASE. 1 hit. [Graphical view] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| ProtoNet | Search... | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Other Resources | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| NextBio | 603924. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry information
| Entry name | F261_RAT | ||||||||
| Accession | Primary (citable) accession number: P07953 Secondary accession number(s): P16119 | ||||||||
| Entry history |
| ||||||||
| Entry status | Reviewed (UniProtKB/Swiss-Prot) | ||||||||
| Annotation project | HPI (Human Proteome Initiative) | ||||||||
Relevant documents
| PDB cross-references Index of Protein Data Bank (PDB) cross-references |
| SIMILARITY comments Index of protein domains and families |

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