P07949 (RET_HUMAN) Reviewed, UniProtKB/Swiss-Prot
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May 29, 2013.
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| Protein names | Recommended name: Proto-oncogene tyrosine-protein kinase receptor Ret EC=2.7.10.1 Alternative name(s): Cadherin family member 12 Proto-oncogene c-Ret Cleaved into the following 2 chains: | ||||
| Gene names |
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| Organism | Homo sapiens (Human) [Reference proteome] | ||||
| Taxonomic identifier | 9606 [NCBI] | ||||
| Taxonomic lineage | Eukaryota › Metazoa › Chordata › Craniata › Vertebrata › Euteleostomi › Mammalia › Eutheria › Euarchontoglires › Primates › Haplorrhini › Catarrhini › Hominidae › Homo![]() |
Protein attributes
| Sequence length | 1114 AA. |
| Sequence status | Complete. |
| Sequence processing | The displayed sequence is further processed into a mature form. |
| Protein existence | Evidence at protein level |
General annotation (Comments)
| Function | Receptor tyrosine-protein kinase involved in numerous cellular mechanisms including cell proliferation, neuronal navigation, cell migration, and cell differentiation upon binding with glial cell derived neurotrophic factor family ligands. Phosphorylates PTK2/FAK1. Regulates both cell death/survival balance and positional information. Required for the molecular mechanisms orchestration during intestine organogenesis; involved in the development of enteric nervous system and renal organogenesis during embryonic life, and promotes the formation of Peyer's patch-like structures, a major component of the gut-associated lymphoid tissue. Modulates cell adhesion via its cleavage by caspase in sympathetic neurons and mediates cell migration in an integrin (e.g. ITGB1 and ITGB3)-dependent manner. Involved in the development of the neural crest. Active in the absence of ligand, triggering apoptosis through a mechanism that requires receptor intracellular caspase cleavage. Acts as a dependence receptor; in the presence of the ligand GDNF in somatotrophs (within pituitary), promotes survival and down regulates growth hormone (GH) production, but triggers apoptosis in absence of GDNF. Regulates nociceptor survival and size. Triggers the differentiation of rapidly adapting (RA) mechanoreceptors. Mediator of several diseases such as neuroendocrine cancers; these diseases are characterized by aberrant integrins-regulated cell migration. Ref.22 Ref.25 Ref.26 Ref.29 Ref.30 |
| Catalytic activity | ATP + a [protein]-L-tyrosine = ADP + a [protein]-L-tyrosine phosphate. |
| Enzyme regulation | Repressed by 4-(3-hydroxyanilino)-quinolines derivatives, indolin-2-one-derivatives, 2-(alkylsulfanyl)-4-(3-thienyl) nicotinonitrile analogs, 3- and 4-substituted beta-carbolin-1-ones, vandetanib, motesanib, sorafenib (BAY 43-9006), cabozantinib (XL184), sunitinib, and withaferin A (WA). Inactivation by sorafenib both reduces kinase activity and promotes lysosomal degradation. Ref.16 Ref.17 Ref.18 Ref.23 Ref.24 Ref.28 Ref.32 |
| Subunit structure | Phosphorylated form interacts with the PBT domain of DOK2, DOK4 and DOK5. The phosphorylated form interacts with PLCG1 and GRB7 By similarity. Interacts (not phosphorylated) with CC PTK2/FAK1 (via FERM domain). Extracellular cell-membrane anchored RET cadherin fragments form complex in neurons with reduced trophic status, preferentially at the contact sites between somas. Interacts with AIP in the pituitary gland; this interaction prevents the formation of the AIP-survivin complex. Binds to ARTN. Ref.19 Ref.29 Ref.30 |
| Subcellular location | Cell membrane; Single-pass type I membrane protein. Endosome membrane; Single-pass type I membrane protein Ref.27. |
| Induction | Positively regulated by NKX2-1, PHOX2B, SOX10 and PAX3. Ref.16 Ref.17 Ref.18 Ref.20 Ref.23 Ref.24 Ref.28 Ref.32 |
| Post-translational modification | Autophosphorylated on C-terminal tyrosine residues upon ligand stimulation. Dephosphorylated by PTPRJ on Tyr-905, Tyr-1015 and Tyr-1062. Ref.12 Ref.13 Ref.15 Ref.31 Ref.32 Proteolytically cleaved by caspase-3. The soluble RET kinase fragment is able to induce cell death. The extracellular cell-membrane anchored RET cadherin fragment accelerates cell adhesion in sympathetic neurons. Ref.29 |
| Polymorphism | The Cys-982 polymorphism may be associated with an increased risk for developing Hirschsprung disease. |
| Involvement in disease | Colorectal cancer (CRC) [MIM:114500]: A complex disease characterized by malignant lesions arising from the inner wall of the large intestine (the colon) and the rectum. Genetic alterations are often associated with progression from premalignant lesion (adenoma) to invasive adenocarcinoma. Risk factors for cancer of the colon and rectum include colon polyps, long-standing ulcerative colitis, and genetic family history. Hirschsprung disease 1 (HSCR1) [MIM:142623]: A disorder of neural crest development characterized by absence of enteric ganglia along a variable length of the intestine. It is the most common cause of congenital intestinal obstruction. Early symptoms range from complete acute neonatal obstruction, characterized by vomiting, abdominal distention and failure to pass stool, to chronic constipation in the older child. Medullary thyroid carcinoma (MTC) [MIM:155240]: Rare tumor derived from the C cells of the thyroid. Three hereditary forms are known, that are transmitted in an autosomal dominant fashion: (a) multiple neoplasia type 2A (MEN2A), (b) multiple neoplasia type IIB (MEN2B) and (c) familial MTC (FMTC), which occurs in 25-30% of MTC cases and where MTC is the only clinical manifestation. Multiple neoplasia 2B (MEN2B) [MIM:162300]: Uncommon inherited cancer syndrome characterized by predisposition to MTC and phaeochromocytoma which is associated with marfanoid habitus, mucosal neuromas, skeletal and ophtalmic abnormalities, and ganglioneuromas of the intestine tract. Then the disease progresses rapidly with the development of metastatic MTC and a pheochromocytome in 50% of cases. Pheochromocytoma (PCC) [MIM:171300]: A catecholamine-producing tumor of chromaffin tissue of the adrenal medulla or sympathetic paraganglia. The cardinal symptom, reflecting the increased secretion of epinephrine and norepinephrine, is hypertension, which may be persistent or intermittent. Multiple neoplasia 2A (MEN2A) [MIM:171400]: The most frequent form of medullary thyroid cancer (MTC). It is an inherited cancer syndrome characterized by MTC, phaeochromocytoma and/or hyperparathyroidism. Thyroid papillary carcinoma (TPC) [MIM:188550]: A common tumor of the thyroid that typically arises as an irregular, solid or cystic mass from otherwise normal thyroid tissue. Papillary carcinomas are malignant neoplasm characterized by the formation of numerous, irregular, finger-like projections of fibrous stroma that is covered with a surface layer of neoplastic epithelial cells. Renal adysplasia (RADYS) [MIM:191830]: Renal agenesis refers to the absence of one (unilateral) or both (bilateral) kidneys at birth. Bilateral renal agenesis belongs to a group of perinatally lethal renal diseases, including severe bilateral renal dysplasia, unilateral renal agenesis with contralateral dysplasia and severe obstructive uropathy. Congenital central hypoventilation syndrome (CCHS) [MIM:209880]: Rare disorder characterized by abnormal control of respiration in the absence of neuromuscular or lung disease, or an identifiable brain stem lesion. A deficiency in autonomic control of respiration results in inadequate or negligible ventilatory and arousal responses to hypercapnia and hypoxemia. |
| Miscellaneous | Treatment with withaferin A (WA) leads tumor regression in medullary thyroid carcinomas (MTC). |
| Sequence similarities | Belongs to the protein kinase superfamily. Tyr protein kinase family. Contains 1 cadherin domain. Contains 1 protein kinase domain. |
| Sequence caution | The sequence AAA36524.1 differs from that shown. Reason: Erroneous initiation. The sequence AAA36786.1 differs from that shown. Reason: Erroneous initiation. The sequence CAA33787.1 differs from that shown. Reason: Erroneous initiation. The sequence CAC14882.1 differs from that shown. Reason: Erroneous initiation. |
Ontologies
Alternative products
| This entry describes 2 isoforms produced by alternative splicing. [Align] [Select] | ||||||
| Isoform 1 (identifier: P07949-1) This isoform has been chosen as the 'canonical' sequence. All positional information in this entry refers to it. This is also the sequence that appears in the downloadable versions of the entry. | ||||||
| Note: No experimental confirmation available. | ||||||
| Isoform 2 (identifier: P07949-2) The sequence of this isoform differs from the canonical sequence as follows: 1064-1114: MSDPNWPGESPVPLTRADGTNTGFPRYPNDSVYANWMLSPSAAKLMDTFDS → RISHAFTRF |
Sequence annotation (Features)
| Feature key | Position(s) | Length | Description | Graphical view | Feature identifier | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule processing | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Signal peptide | 1 – 28 | 28 | Potential | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Chain | 29 – 1114 | 1086 | Proto-oncogene tyrosine-protein kinase receptor Ret | PRO_0000024450 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Chain | 29 – 707 | 679 | Extracellular cell-membrane anchored RET cadherin 120 kDa fragment | PRO_0000415292 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Chain | 708 – 1017 | 310 | Soluble RET kinase fragment | PRO_0000415293 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Regions | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Topological domain | 29 – 635 | 607 | Extracellular Potential | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Transmembrane | 636 – 657 | 22 | Helical; Potential | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Topological domain | 658 – 1114 | 457 | Cytoplasmic Potential | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Domain | 168 – 272 | 105 | Cadherin | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Domain | 724 – 1016 | 293 | Protein kinase | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Nucleotide binding | 730 – 738 | 9 | ATP By similarity | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Region | 805 – 807 | 3 | Inhibitors binding | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sites | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Active site | 874 | 1 | Proton acceptor By similarity | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Binding site | 758 | 1 | ATP By similarity | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Binding site | 892 | 1 | Inhibitors | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Site | 587 – 588 | 2 | Breakpoint for translocation to form the TRIM27/RET oncogene | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Site | 707 – 708 | 2 | Cleavage; by caspase-3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Site | 712 – 713 | 2 | Breakpoint for translocation to form PCM1-RET; RET-CCDC6; RET-GOLGA5; RET-TRIM24 and RET-TRIM33 oncogenes | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Site | 1017 – 1018 | 2 | Cleavage; by caspase-3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Amino acid modifications | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Modified residue | 696 | 1 | Phosphoserine Ref.21 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Modified residue | 806 | 1 | Phosphotyrosine; by autocatalysis Ref.13 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Modified residue | 809 | 1 | Phosphotyrosine; by autocatalysis Ref.13 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Modified residue | 900 | 1 | Phosphotyrosine; by autocatalysis Ref.13 Ref.31 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Modified residue | 905 | 1 | Phosphotyrosine; by autocatalysis Ref.13 Ref.15 Ref.31 Ref.32 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Modified residue | 981 | 1 | Phosphotyrosine; by autocatalysis Ref.13 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Modified residue | 1015 | 1 | Phosphotyrosine; by autocatalysis Ref.12 Ref.13 Ref.15 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Modified residue | 1062 | 1 | Phosphotyrosine; by autocatalysis Ref.12 Ref.13 Ref.15 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Modified residue | 1090 | 1 | Phosphotyrosine; by autocatalysis Ref.13 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Modified residue | 1096 | 1 | Phosphotyrosine; by autocatalysis Ref.13 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Glycosylation | 98 | 1 | N-linked (GlcNAc...) Potential | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Glycosylation | 151 | 1 | N-linked (GlcNAc...) Ref.33 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Glycosylation | 199 | 1 | N-linked (GlcNAc...) Potential | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Glycosylation | 336 | 1 | N-linked (GlcNAc...) Potential | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Glycosylation | 343 | 1 | N-linked (GlcNAc...) Potential | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Glycosylation | 361 | 1 | N-linked (GlcNAc...) Potential | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Glycosylation | 367 | 1 | N-linked (GlcNAc...) Potential | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Glycosylation | 377 | 1 | N-linked (GlcNAc...) Potential | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Glycosylation | 394 | 1 | N-linked (GlcNAc...) Potential | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Glycosylation | 448 | 1 | N-linked (GlcNAc...) Potential | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Glycosylation | 468 | 1 | N-linked (GlcNAc...) Potential | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Glycosylation | 554 | 1 | N-linked (GlcNAc...) Potential | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Disulfide bond | 137 ↔ 142 | Ref.33 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Natural variations | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Alternative sequence | 1064 – 1114 | 51 | MSDPN…DTFDS → RISHAFTRF in isoform 2. | VSP_040735 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 20 | 1 | P → L in HSCR1; sporadic form. Ref.50 | VAR_009459 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 32 | 1 | S → L in HSCR1; familial form. Ref.46 Ref.82 Corresponds to variant rs76764689 [ dbSNP | Ensembl ]. | VAR_006295 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 40 | 1 | L → P in HSCR1. Ref.38 Ref.56 | VAR_009492 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 64 | 1 | P → L in HSCR1; familial form. Ref.46 Corresponds to variant rs77596424 [ dbSNP | Ensembl ]. | VAR_006296 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 67 | 1 | R → H in CCHS. Ref.86 Corresponds to variant rs192489011 [ dbSNP | Ensembl ]. | VAR_018153 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 77 | 1 | R → C in HSCR1. Ref.82 | VAR_009460 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 93 | 1 | G → S in HSCR1; unknown pathological significance. Ref.50 | VAR_006297 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 114 | 1 | R → C in HSCR1. Ref.90 | VAR_067101 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 114 | 1 | R → H in CCHS and HSCR1. Ref.85 Ref.86 Ref.90 | VAR_018154 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 142 | 1 | C → S in HSCR1; sporadic form. | VAR_006298 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 145 | 1 | V → G in HSCR1; also in a colorectal cancer sample; somatic mutation. Ref.87 Ref.90 | VAR_035711 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 155 | 1 | P → L in HSCR1. Ref.90 | VAR_067102 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 157 | 1 | C → Y in HSCR1; unknown pathological significance. Ref.55 | VAR_009461 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 163 | 1 | R → Q in a colorectal adenocarcinoma sample; somatic mutation. Ref.88 Corresponds to variant rs149403911 [ dbSNP | Ensembl ]. | VAR_041762 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 174 | 1 | F → S in HSCR1; sporadic form. Ref.65 | VAR_009462 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 175 | 1 | R → P in HSCR1. Ref.90 | VAR_067103 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 180 | 1 | R → P in HSCR1; sporadic form. Ref.61 | VAR_009463 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 197 | 1 | C → Y in HSCR1; sporadic form. Ref.65 | VAR_009464 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 198 | 1 | P → T in RADYS; prevents phosphorylation in response to GDNF. Ref.89 Corresponds to variant rs76736111 [ dbSNP | Ensembl ]. | VAR_044392 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 231 | 1 | R → H in HSCR1; familial form. Corresponds to variant rs79661516 [ dbSNP | Ensembl ]. | VAR_006299 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 251 | 1 | E → K in HSCR1; familial form. | VAR_006300 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 278 | 1 | T → A in HSCR1. Ref.90 | VAR_067104 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 278 | 1 | T → N Found in two patients with Hirschsprung disease. Ref.88 Ref.90 Corresponds to variant rs35118262 [ dbSNP | Ensembl ]. | VAR_041763 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 278 | 1 | T → P in HSCR1. Ref.90 | VAR_067105 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 287 | 1 | R → Q in HSCR1; sporadic form. | VAR_006301 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 292 | 1 | V → M Found in patients with Hirschsprung disease; unknown pathological significance. Ref.88 Ref.90 Corresponds to variant rs34682185 [ dbSNP | Ensembl ]. | VAR_041764 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 300 | 1 | D → N in HSCR1. Ref.90 | VAR_067106 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 313 | 1 | R → Q in HSCR1. Ref.61 Ref.90 Corresponds to variant rs77702891 [ dbSNP | Ensembl ]. | VAR_009465 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 316 | 1 | S → I in HSCR1. Ref.90 | VAR_067107 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 330 | 1 | R → Q in HSCR1. Ref.46 Ref.50 Corresponds to variant rs80236571 [ dbSNP | Ensembl ]. | VAR_006302 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 339 | 1 | S → L in HSCR1. Ref.90 | VAR_067108 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 353 | 1 | D → Y in HSCR1. Ref.90 | VAR_067109 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 359 | 1 | N → K in HSCR1; unknown pathological significance. Ref.55 | VAR_009466 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 360 | 1 | R → Q in HSCR1. Ref.90 | VAR_067110 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 360 | 1 | R → W in HSCR1. Ref.82 Ref.87 | VAR_009467 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 376 | 1 | V → A in RADYS; constitutively phosphorylated; expressed only the immature intracellular form. Ref.89 | VAR_044393 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 393 | 1 | F → L in HSCR1; familial form. Ref.46 Corresponds to variant rs78098482 [ dbSNP | Ensembl ]. | VAR_006303 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 394 | 1 | N → H in RADYS; prevents phosphorylation in response to GDNF. Ref.89 | VAR_044394 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 394 | 1 | N → K in HSCR1. Ref.82 | VAR_009468 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 397 | 1 | V → M in HSCR1. Ref.90 Corresponds to variant rs183729115 [ dbSNP | Ensembl ]. | VAR_067111 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 399 | 1 | P → L in HSCR1; sporadic form. Ref.38 | VAR_006304 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 412 | 1 | V → M in HSCR1. Ref.90 | VAR_067112 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 423 | 1 | G → R in HSCR1. Ref.90 | VAR_067113 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 432 | 1 | A → E in CCHS. Ref.86 | VAR_018155 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 475 | 1 | R → Q in HSCR1; sporadic form. Corresponds to variant rs138624658 [ dbSNP | Ensembl ]. | VAR_006305 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 480 | 1 | E → K in HSCR1. Ref.90 | VAR_067114 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 489 | 1 | D → N. Ref.86 Ref.88 Corresponds to variant rs9282834 [ dbSNP | Ensembl ]. | VAR_018156 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 531 | 1 | C → CEEC in MTC; familial form. | VAR_009469 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 549 – 550 | 2 | Missing in HSCR1. | VAR_067115 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 593 | 1 | G → E in a colorectal cancer sample; somatic mutation. Ref.87 | VAR_035712 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 595 | 1 | E → Q in HSCR1. Ref.90 | VAR_067116 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 600 | 1 | R → Q. Ref.81 | VAR_008966 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 609 | 1 | C → G in MEN2A. | VAR_009470 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 609 | 1 | C → R in MEN2A. Corresponds to variant rs77558292 [ dbSNP | Ensembl ]. | VAR_009471 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 609 | 1 | C → W in HSCR1; familial form. Ref.43 | VAR_006307 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 609 | 1 | C → Y in MTC, MEN2A and HSCR1; familial and sporadic forms. Ref.41 Ref.50 Ref.55 Ref.71 Corresponds to variant rs77939446 [ dbSNP | Ensembl ]. | VAR_006306 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 611 | 1 | C → G in MTC; familial form. Ref.69 | VAR_009472 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 611 | 1 | C → R in MEN2A. | VAR_009473 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 611 | 1 | C → S in MEN2A. | VAR_009474 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 611 | 1 | C → W in MEN2A and MTC; familial form. Ref.36 Corresponds to variant rs80069458 [ dbSNP | Ensembl ]. | VAR_006308 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 611 | 1 | C → Y in MEN2A. | VAR_006309 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 618 | 1 | C → F in MEN2A and MTC; familial form. | VAR_006312 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 618 | 1 | C → G in MEN2A. Ref.37 | VAR_006310 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 618 | 1 | C → R in MEN2A, MTC and HSCR1. Ref.40 Ref.41 Ref.43 Ref.62 Corresponds to variant rs76262710 [ dbSNP | Ensembl ]. | VAR_006311 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 618 | 1 | C → S in MEN2A, HSCR1 and MTC; familial and sporadic forms. Ref.36 Ref.40 Ref.41 Ref.49 Ref.71 Corresponds to variant rs79781594 [ dbSNP | Ensembl ]. | VAR_006313 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 618 | 1 | C → Y in MEN2A and MTC; familial form. | VAR_006314 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 620 | 1 | C → F in MEN2A and MTC; familial form. Ref.40 Corresponds to variant rs77503355 [ dbSNP | Ensembl ]. | VAR_006318 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 620 | 1 | C → G in MEN2A and MTC; familial and sporadic forms. | VAR_006315 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 620 | 1 | C → R in MEN2A, MTC and HSCR1; familial and sporadic forms. Ref.36 Ref.40 Ref.43 Ref.50 Ref.55 Ref.61 Ref.71 | VAR_006316 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 620 | 1 | C → S in MEN2A and MTC; familial form. Ref.41 Ref.49 | VAR_006317 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 620 | 1 | C → W in MEN2A and HSCR1. Ref.71 | VAR_009475 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 620 | 1 | C → Y in MEN2A. Ref.36 | VAR_006319 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 626 | 1 | Q → K in HSCR1; sporadic form. Ref.76 | VAR_009476 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 630 | 1 | C → F in MEN2A and MTC; familial form. | VAR_006320 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 630 | 1 | C → S in MTC; sporadic form. | VAR_009477 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 630 | 1 | C → Y in MTC; familial and sporadic forms. | VAR_009478 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 631 | 1 | D → G in thyroid carcinoma; somatic mutation. Corresponds to variant rs121913308 [ dbSNP | Ensembl ]. | VAR_006321 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 632 – 634 | 3 | ELC → DVR in MEN2A. | VAR_006322 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 634 – 635 | 2 | CR → WG in MEN2A. | VAR_006329 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 634 | 1 | C → CHELC in MEN2A. | VAR_009479 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 634 | 1 | C → F in MEN2A and pheochromocytoma. Ref.37 Ref.40 Ref.84 | VAR_006324 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 634 | 1 | C → G in MEN2A and pheochromocytoma. Ref.37 Ref.40 Ref.84 | VAR_006323 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 634 | 1 | C → R in MEN2A, pheochromocytoma and MTC; familial form; also found as somatic mutation in a sporadic thyroid carcinoma. Ref.36 Ref.37 Ref.49 Ref.84 | VAR_006326 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 634 | 1 | C → S in MEN2A, pheochromocytoma and MTC; familial form. Ref.37 Ref.84 | VAR_006327 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 634 | 1 | C → W in MEN2A, pheochromocytoma and MTC; familial form. Ref.84 | VAR_006328 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 634 | 1 | C → Y in MEN2A, pheochromocytoma and MTC; familial form. Ref.37 Ref.40 Ref.49 Ref.84 | VAR_006325 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 636 | 1 | T → TCRT in MEN2A. | VAR_006330 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 639 | 1 | A → G in MTC; sporadic form. Ref.83 | VAR_012743 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 640 | 1 | A → G in MEN2A. Ref.79 Corresponds to variant rs78935588 [ dbSNP | Ensembl ]. | VAR_009480 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 641 | 1 | A → G in MTC; sporadic form. Ref.83 | VAR_012744 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 679 | 1 | P → L in HSCR1. Ref.90 | VAR_067117 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 690 | 1 | S → P in HSCR1; sporadic form. | VAR_006331 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 691 | 1 | G → S. Ref.66 Ref.68 Ref.86 Ref.88 Corresponds to variant rs1799939 [ dbSNP | Ensembl ]. | VAR_006332 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 694 | 1 | R → Q in HSCR1. Ref.90 Corresponds to variant rs141185224 [ dbSNP | Ensembl ]. | VAR_067118 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 749 | 1 | R → T. Ref.88 Corresponds to variant rs34288963 [ dbSNP | Ensembl ]. | VAR_041765 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 762 | 1 | E → Q in HSCR1; sporadic form. Ref.38 | VAR_009481 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 765 | 1 | S → P in HSCR1. Ref.38 Ref.45 Ref.56 Corresponds to variant rs75075748 [ dbSNP | Ensembl ]. | VAR_009493 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 767 | 1 | S → R in HSCR1; sporadic form. | VAR_006334 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 768 | 1 | E → D in MTC; familial and sporadic forms. Ref.53 Ref.54 Ref.58 Corresponds to variant rs78014899 [ dbSNP | Ensembl ]. | VAR_006335 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 778 | 1 | V → I in RADYS; constitutively phosphorylated. Ref.89 Corresponds to variant rs75686697 [ dbSNP | Ensembl ]. | VAR_044395 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 783 | 1 | N → S in HSCR1. Ref.90 | VAR_067119 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 790 | 1 | L → F in MEN2A and MTC; familial form. Ref.74 Corresponds to variant rs75030001 [ dbSNP | Ensembl ]. | VAR_009482 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 791 | 1 | Y → F in HSCR1, pheochromocytoma, MTC and MEN2A; familial form. Ref.61 Ref.74 Ref.84 Corresponds to variant rs77724903 [ dbSNP | Ensembl ]. | VAR_009483 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 804 | 1 | V → L in MTC; familial form. Ref.54 Corresponds to variant rs79658334 [ dbSNP | Ensembl ]. | VAR_006336 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 804 | 1 | V → M in MTC; familial form. Ref.73 Ref.80 Corresponds to variant rs79658334 [ dbSNP | Ensembl ]. | VAR_006337 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 813 | 1 | R → Q in HSCR1; sporadic form. Ref.76 | VAR_009484 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 826 | 1 | Y → S. Ref.88 Corresponds to variant rs34617196 [ dbSNP | Ensembl ]. | VAR_041766 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 830 | 1 | G → R in HSCR1. Ref.90 | VAR_067120 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 844 | 1 | R → L in MTC; familial form. Ref.80 Ref.88 Corresponds to variant rs55947360 [ dbSNP | Ensembl ]. | VAR_011582 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 873 | 1 | R → Q in HSCR1; sporadic form. | VAR_006338 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 883 | 1 | A → F in MEN2B; somatic mutation in sporadic medullary thyroid carcinoma; requires 2 nucleotide substitutions. Ref.63 Ref.67 | VAR_009485 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 891 | 1 | S → A in MTC; familial form. Ref.64 Corresponds to variant rs75234356 [ dbSNP | Ensembl ]. | VAR_009486 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 893 | 1 | F → L in HSCR1; sporadic form. | VAR_006339 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 894 | 1 | G → S in RADYS; constitutively phosphorylated; expressed only the immature intracellular form. Ref.89 | VAR_044396 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 897 | 1 | R → Q in HSCR1; sporadic form. Ref.38 Ref.45 Corresponds to variant rs76087194 [ dbSNP | Ensembl ]. | VAR_006340 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 907 | 1 | K → E in HSCR1; sporadic form. | VAR_006341 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 907 | 1 | K → T in HSCR1. Ref.90 | VAR_067121 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 918 | 1 | M → T in RADYS, MEN2B and MTC; sporadic form; somatic mutation. Ref.39 Ref.44 Ref.47 Ref.52 Ref.58 Ref.89 Corresponds to variant rs74799832 [ dbSNP | Ensembl ]. | VAR_006342 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 921 | 1 | E → K in HSCR1; sporadic form. | VAR_006343 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 922 | 1 | S → F in MTC; sporadic form. Ref.83 | VAR_012745 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 922 | 1 | S → Y Rare polymorphism. Ref.52 | VAR_009487 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 946 | 1 | T → M in MEN2B and MTC; familial form. | VAR_006345 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 961 | 1 | F → L in HSCR1. Ref.90 | VAR_067122 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 972 | 1 | R → G in HSCR1; familial form. Ref.38 Ref.45 Corresponds to variant rs76534745 [ dbSNP | Ensembl ]. | VAR_006346 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 973 | 1 | P → L in HSCR1; familial form. Ref.38 | VAR_006347 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 980 | 1 | M → T in HSCR1; sporadic form. | VAR_006348 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 982 | 1 | R → C. Ref.3 Ref.50 Ref.70 Ref.86 Ref.88 Corresponds to variant rs17158558 [ dbSNP | Ensembl ]. | VAR_006349 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 1039 | 1 | P → L in CCHS; with colonic aganglionosis. Ref.68 Corresponds to variant rs79853121 [ dbSNP | Ensembl ]. | VAR_018157 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 1039 | 1 | P → Q. | VAR_009488 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 1049 | 1 | P → L in RADYS; prevents phosphorylation in response to GDNF. Ref.89 | VAR_044397 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 1052 | 1 | L → V in HSCR1. Ref.90 | VAR_067123 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 1059 | 1 | Missing in HSCR1. Ref.55 Ref.77 | VAR_009489 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 1061 | 1 | L → P in HSCR1. Ref.55 Ref.77 | VAR_009490 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 1062 | 1 | Y → C in HSCR1. Ref.90 | VAR_067124 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 1064 | 1 | M → T in HSCR1; familial form. Ref.90 | VAR_009491 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 1067 | 1 | P → S in RADYS; prevents phosphorylation in response to GDNF. Ref.89 | VAR_044398 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 1112 | 1 | F → Y in a bladder transitional cell carcinoma sample; somatic mutation. Ref.88 | VAR_041767 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Experimental info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Mutagenesis | 707 | 1 | D → N: Impaired cleavage by caspase-3 and loss of induced cell death. Ref.29 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Mutagenesis | 708 – 1114 | 407 | Missing: Loss of induced cell death, but increased cell aggregation. Ref.29 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Mutagenesis | 758 | 1 | K → R: Loss of kinase activity. Ref.29 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence conflict | 647 | 1 | I → V in AAA36786. Ref.6 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence conflict | 664 | 1 | A → S in BAF84496. Ref.1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence conflict | 750 | 1 | A → G in AAA36524. Ref.9 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence conflict | 904 | 1 | S → P in AAA36786. Ref.6 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Helix Strand Turn | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 30 – 32 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 34 – 41 | 8 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 49 – 52 | 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 70 – 73 | 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 75 – 77 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 79 – 82 | 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 85 – 88 | 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 90 – 92 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 94 – 99 | 6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 103 – 111 | 9 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 120 – 126 | 7 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 139 – 141 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 142 – 152 | 11 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 157 – 159 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 162 – 166 | 5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 174 – 178 | 5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 184 – 187 | 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 191 – 196 | 6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 202 – 208 | 7 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 212 – 215 | 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 222 – 227 | 6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 231 – 233 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 235 – 245 | 11 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 252 – 263 | 12 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 705 – 711 | 7 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 715 – 717 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 721 – 723 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 724 – 732 | 9 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 734 – 744 | 11 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 746 – 748 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 750 – 759 | 10 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 766 – 779 | 14 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 790 – 794 | 5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 796 – 799 | 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 801 – 805 | 5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 812 – 818 | 7 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 819 – 821 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 848 – 867 | 20 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 877 – 879 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 880 – 883 | 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 884 – 886 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 887 – 890 | 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 893 – 895 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 900 – 902 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 915 – 917 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 920 – 925 | 6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 930 – 945 | 16 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 957 – 959 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 960 – 965 | 6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 978 – 987 | 10 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 992 – 994 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 998 – 1010 | 13 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequences
| ||||||||||||||||||||||||
References
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