P07686 (HEXB_HUMAN) Reviewed, UniProtKB/Swiss-Prot
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| Protein names | Recommended name: Beta-hexosaminidase subunit beta EC=3.2.1.52 Alternative name(s): Beta-N-acetylhexosaminidase subunit beta Short name=Hexosaminidase subunit B Cervical cancer proto-oncogene 7 protein Short name=HCC-7 N-acetyl-beta-glucosaminidase subunit beta Cleaved into the following 2 chains: | ||||
| Gene names |
| ||||
| Organism | Homo sapiens (Human) | ||||
| Taxonomic identifier | 9606 [NCBI] | ||||
| Taxonomic lineage | Eukaryota › Metazoa › Chordata › Craniata › Vertebrata › Euteleostomi › Mammalia › Eutheria › Euarchontoglires › Primates › Haplorrhini › Catarrhini › Hominidae › Homo |
Protein attributes
| Sequence length | 556 AA. |
| Sequence status | Complete. |
| Sequence processing | The displayed sequence is further processed into a mature form. |
| Protein existence | Evidence at protein level |
General annotation (Comments)
| Function | Responsible for the degradation of GM2 gangliosides, and a variety of other molecules containing terminal N-acetyl hexosamines, in the brain and other tissues. |
| Catalytic activity | Hydrolysis of terminal non-reducing N-acetyl-D-hexosamine residues in N-acetyl-beta-D-hexosaminides. |
| Subunit structure | There are 3 forms of beta-hexosaminidase: hexosaminidase A is a trimer composed of one subunit alpha, one subunit beta chain A and one subunit beta chain B; hexosaminidase B is a tetramer of two subunit beta chains A and two subunit beta chains B; hexosaminidase S is an homodimer of two alpha subunits. The two beta chains are derived from the cleavage of the beta subunit. |
| Subcellular location | |
| Post-translational modification | N-linked glycans at Asn-142 and Asn-190 consist of Man(3)-GlcNAc2 and Man(5 to 7)-GlcNAc2, respectively. The beta-A and beta-B chains are produced by proteolytic processing of the precursor beta chain. |
| Involvement in disease | Defects in HEXB are the cause of GM2-gangliosidosis type 2 (GM2G2) [MIM:268800]; also known as Sandhoff disease. GM2-gangliosidosis is an autosomal recessive lysosomal storage disease marked by the accumulation of GM2 gangliosides in the neuronal cells. GM2G2 is clinically indistinguishable from GM2-gangliosidosis type 1, presenting startle reactions, early blindness, progressive motor and mental deterioration, macrocephaly and cherry-red spots on the macula. Ref.24 Ref.25 Ref.26 Ref.27 Ref.28 Ref.29 Ref.30 Ref.31 Ref.32 Ref.33 |
| Sequence similarities | Belongs to the glycosyl hydrolase 20 family. |
| Sequence caution | The sequence AAA51828.1 differs from that shown. Reason: Frameshift at position 21. The sequence AAA68620.1 differs from that shown. Reason: Erroneous initiation. |
Ontologies
| Keywords | |
|---|---|
| Cellular component | Lysosome |
| Coding sequence diversity | Polymorphism |
| Disease | Disease mutation Gangliosidosis Neurodegeneration |
| Domain | Signal |
| Molecular function | Glycosidase Hydrolase |
| PTM | Disulfide bond Glycoprotein Zymogen |
| Technical term | 3D-structure Complete proteome Direct protein sequencing Reference proteome |
| Gene Ontology (GO) | |
| Biological process | cell death Inferred from electronic annotation. Source: UniProtKB-KW |
| Cellular component | lysosome Inferred from electronic annotation. Source: UniProtKB-SubCell |
| Molecular function | cation binding Inferred from electronic annotation. Source: InterPro protein heterodimerization activityInferred from direct assay. Source: MGI protein homodimerization activityInferred from direct assay. Source: MGI |
| Complete GO annotation... | |
Sequence annotation (Features)
| Feature key | Position(s) | Length | Description | Graphical view | Feature identifier | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule processing | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Signal peptide | 1 – 42 | 42 | Potential | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Propeptide | 43 – 121 | 79 | PRO_0000012002 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Chain | 122 – 556 | 435 | Beta-hexosaminidase subunit beta | PRO_0000012003 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Chain | 122 – 311 | 190 | Beta-hexosaminidase subunit beta chain B | PRO_0000012004 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Chain | 315 – 556 | 242 | Beta-hexosaminidase subunit beta chain A | PRO_0000012005 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sites | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Active site | 355 | 1 | Proton donor By similarity | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Amino acid modifications | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Glycosylation | 84 | 1 | N-linked (GlcNAc...) Ref.18 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Glycosylation | 142 | 1 | N-linked (GlcNAc...) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Glycosylation | 190 | 1 | N-linked (GlcNAc...) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Glycosylation | 323 | 1 | N-linked (GlcNAc...) Ref.18 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Glycosylation | 327 | 1 | N-linked (GlcNAc...) Ref.16 Ref.18 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Disulfide bond | 91 ↔ 137 | Ref.17 Ref.21 Ref.22 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Disulfide bond | 309 ↔ 360 | Ref.17 Ref.21 Ref.22 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Disulfide bond | 534 ↔ 551 | Ref.17 Ref.21 Ref.22 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Natural variations | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 62 | 1 | S → L in GM2G2. Ref.29 Corresponds to variant rs820878 [ dbSNP | Ensembl ]. | VAR_003247 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 121 | 1 | K → R. Corresponds to variant rs11556045 [ dbSNP | Ensembl ]. | VAR_003248 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 207 | 1 | I → V Probable polymorphism. Ref.24 Ref.30 Corresponds to variant rs10805890 [ dbSNP | Ensembl ]. | VAR_003249 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 255 | 1 | S → R in GM2G2. Ref.32 | VAR_011704 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 309 | 1 | C → Y in GM2G2; adult type; severe; almost complete absence of activity. Ref.28 | VAR_003250 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 417 | 1 | P → L in GM2G2. Ref.25 Ref.28 Corresponds to variant rs28942073 [ dbSNP | Ensembl ]. | VAR_003251 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 456 | 1 | Y → S in GM2G2. Ref.24 | VAR_003252 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 504 | 1 | P → S in GM2G2. Ref.33 | VAR_011705 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 505 | 1 | R → Q in GM2G2. Ref.26 Ref.30 | VAR_003253 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 534 | 1 | C → Y in GM2G2; infantile type. Ref.27 | VAR_003254 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 543 | 1 | A → T in GM2G2. Ref.31 | VAR_011706 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Secondary structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Helix Strand Turn | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 61 – 71 | 11 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 74 – 76 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 78 – 81 | 4 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 92 – 106 | 15 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 126 – 131 | 6 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 149 – 153 | 5 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 155 – 164 | 10 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 165 – 178 | 14 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 187 – 196 | 10 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 201 – 212 | 12 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 216 – 228 | 13 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 233 – 237 | 5 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 253 – 258 | 6 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 259 – 261 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 268 – 280 | 13 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 284 – 294 | 11 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 298 – 301 | 4 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 306 – 308 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 318 – 322 | 5 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 327 – 343 | 17 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 346 – 352 | 7 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 359 – 363 | 5 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 365 – 373 | 9 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 381 – 397 | 17 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 401 – 405 | 5 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 406 – 410 | 5 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 420 – 423 | 4 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 429 – 438 | 10 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 443 – 445 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 455 – 457 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 460 – 465 | 6 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 475 – 479 | 5 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 481 – 488 | 8 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 495 – 497 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 498 – 502 | 5 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 505 – 514 | 10 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 522 – 538 | 17 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 546 – 548 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequences
| ||||||||||||||||||
References
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Web resources
| HEXBdb HEXB mutation database |
| GeneReviews |
Cross-references
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| IPI | IPI00012585. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| RefSeq | NP_000512.1. NM_000521.3. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| UniGene | Hs.69293. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3D structure databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| PDBe RCSB PDB PDBj |
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| ProteinModelPortal | P07686. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| SMR | P07686. Positions 54-553. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| ModBase | Search... | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Protein family/group databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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PTM databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| PhosphoSite | P07686. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Polymorphism databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| DMDM | 123081. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
2D gel databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| UCD-2DPAGE | P07686. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Proteomic databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| PeptideAtlas | P07686. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| PRIDE | P07686. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Protocols and materials databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| StructuralBiologyKnowledgebase | Search... | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome annotation databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Ensembl | ENST00000261416; ENSP00000261416; ENSG00000049860. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| KEGG | hsa:3074. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| UCSC | uc003kdf.2. human. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Organism-specific databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| CTD | 3074. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GeneCards | GC05P074016. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| H-InvDB | HIX0004949. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| HGNC | HGNC:4879. HEXB. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MIM | 268800. phenotype. 606873. gene. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| neXtProt | NX_P07686. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orphanet | 796. Sandhoff disease. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| PharmGKB | PA29257. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GenAtlas | Search... | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Phylogenomic databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| InParanoid | P07686. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Enzyme and pathway databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| BioCyc | MetaCyc:HS00629-MONOMER. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene expression databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| CleanEx | HS_HEXB. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genevestigator | P07686. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Gene3D | G3DSA:3.20.20.80. Glyco_hydro_cat. 1 hit. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Entry information
| Entry name | HEXB_HUMAN | ||||||||
| Accession | Primary (citable) accession number: P07686 | ||||||||
| Entry history |
| ||||||||
| Entry status | Reviewed (UniProtKB/Swiss-Prot) | ||||||||
| Annotation program | Chordata Protein Annotation Program | ||||||||
| Disclaimer | Any medical or genetic information present in this entry is provided for research, educational and informational purposes only. It is not in any way intended to be used as a substitute for professional medical advice, diagnosis, treatment or care. | ||||||||
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