##gff-version 3 P07339 UniProtKB Signal peptide 1 20 . . . Ontology_term=ECO:0000255;evidence=ECO:0000255 P07339 UniProtKB Propeptide 21 64 . . . ID=PRO_0000025949;Note=Activation peptide P07339 UniProtKB Chain 65 412 . . . ID=PRO_0000025950;Note=Cathepsin D P07339 UniProtKB Chain 65 162 . . . ID=PRO_0000025951;Note=Cathepsin D light chain;Ontology_term=ECO:0000305;evidence=ECO:0000305|PubMed:1426530;Dbxref=PMID:1426530 P07339 UniProtKB Chain 169 412 . . . ID=PRO_0000025952;Note=Cathepsin D heavy chain;Ontology_term=ECO:0000305;evidence=ECO:0000305|PubMed:1426530;Dbxref=PMID:1426530 P07339 UniProtKB Domain 79 407 . . . Note=Peptidase A1;Ontology_term=ECO:0000255;evidence=ECO:0000255|PROSITE-ProRule:PRU01103 P07339 UniProtKB Active site 97 97 . . . Ontology_term=ECO:0000255,ECO:0000269;evidence=ECO:0000255|PROSITE-ProRule:PRU10094,ECO:0000269|PubMed:8393577;Dbxref=PMID:8393577 P07339 UniProtKB Active site 295 295 . . . Ontology_term=ECO:0000255,ECO:0000269;evidence=ECO:0000255|PROSITE-ProRule:PRU10094,ECO:0000269|PubMed:8393577;Dbxref=PMID:8393577 P07339 UniProtKB Glycosylation 63 63 . . . Note=O-linked (GalNAc...) threonine;Ontology_term=ECO:0000269;evidence=ECO:0000269|PubMed:23234360;Dbxref=PMID:23234360 P07339 UniProtKB Glycosylation 134 134 . . . Note=N-linked (GlcNAc...) asparagine;Ontology_term=ECO:0000269;evidence=ECO:0000269|PubMed:19159218;Dbxref=PMID:19159218 P07339 UniProtKB Glycosylation 263 263 . . . Note=N-linked (GlcNAc...) asparagine;Ontology_term=ECO:0000269,ECO:0000269,ECO:0000269,ECO:0000269,ECO:0000269;evidence=ECO:0000269|PubMed:12754519,ECO:0000269|PubMed:16263699,ECO:0000269|PubMed:16335952,ECO:0000269|PubMed:19159218,ECO:0000269|PubMed:8393577;Dbxref=PMID:12754519,PMID:16263699,PMID:16335952,PMID:19159218,PMID:8393577 P07339 UniProtKB Disulfide bond 91 160 . . . Ontology_term=ECO:0000269;evidence=ECO:0000269|PubMed:8393577;Dbxref=PMID:8393577 P07339 UniProtKB Disulfide bond 110 117 . . . Ontology_term=ECO:0000269;evidence=ECO:0000269|PubMed:8393577;Dbxref=PMID:8393577 P07339 UniProtKB Disulfide bond 286 290 . . . Ontology_term=ECO:0000269;evidence=ECO:0000269|PubMed:8393577;Dbxref=PMID:8393577 P07339 UniProtKB Disulfide bond 329 366 . . . . P07339 UniProtKB Natural variant 58 58 . . . ID=VAR_011621;Note=Associated with increased risk for AD%3B possibly influences secretion and intracellular maturation. A->V;Ontology_term=ECO:0000269;evidence=ECO:0000269|PubMed:10716266;Dbxref=dbSNP:rs17571,PMID:10716266 P07339 UniProtKB Natural variant 229 229 . . . ID=VAR_029362;Note=In CLN10. F->I;Ontology_term=ECO:0000269,ECO:0000269;evidence=ECO:0000269|PubMed:16685649,ECO:0000269|PubMed:21990111;Dbxref=dbSNP:rs121912789,PMID:16685649,PMID:21990111 P07339 UniProtKB Natural variant 282 282 . . . ID=VAR_058490;Note=G->R;Ontology_term=ECO:0000269;evidence=ECO:0000269|PubMed:16670177;Dbxref=dbSNP:rs147278302,PMID:16670177 P07339 UniProtKB Natural variant 383 383 . . . ID=VAR_029363;Note=In CLN10. W->C;Ontology_term=ECO:0000269;evidence=ECO:0000269|PubMed:16685649;Dbxref=dbSNP:rs121912790,PMID:16685649 P07339 UniProtKB Beta strand 67 74 . . . Ontology_term=ECO:0007829;evidence=ECO:0007829|PDB:4OD9 P07339 UniProtKB Turn 75 77 . . . Ontology_term=ECO:0007829;evidence=ECO:0007829|PDB:4OD9 P07339 UniProtKB Beta strand 78 85 . . . Ontology_term=ECO:0007829;evidence=ECO:0007829|PDB:4OD9 P07339 UniProtKB Turn 86 89 . . . Ontology_term=ECO:0007829;evidence=ECO:0007829|PDB:4OD9 P07339 UniProtKB Beta strand 90 97 . . . Ontology_term=ECO:0007829;evidence=ECO:0007829|PDB:4OD9 P07339 UniProtKB Beta strand 103 107 . . . Ontology_term=ECO:0007829;evidence=ECO:0007829|PDB:4OD9 P07339 UniProtKB Helix 115 118 . . . Ontology_term=ECO:0007829;evidence=ECO:0007829|PDB:4OD9 P07339 UniProtKB Helix 125 127 . . . Ontology_term=ECO:0007829;evidence=ECO:0007829|PDB:4OD9 P07339 UniProtKB Beta strand 132 141 . . . Ontology_term=ECO:0007829;evidence=ECO:0007829|PDB:4OD9 P07339 UniProtKB Beta strand 146 159 . . . Ontology_term=ECO:0007829;evidence=ECO:0007829|PDB:4OD9 P07339 UniProtKB Beta strand 172 184 . . . Ontology_term=ECO:0007829;evidence=ECO:0007829|PDB:4OD9 P07339 UniProtKB Helix 189 192 . . . Ontology_term=ECO:0007829;evidence=ECO:0007829|PDB:4OD9 P07339 UniProtKB Beta strand 194 200 . . . Ontology_term=ECO:0007829;evidence=ECO:0007829|PDB:4OD9 P07339 UniProtKB Helix 204 206 . . . Ontology_term=ECO:0007829;evidence=ECO:0007829|PDB:4OD9 P07339 UniProtKB Helix 208 210 . . . Ontology_term=ECO:0007829;evidence=ECO:0007829|PDB:4OD9 P07339 UniProtKB Helix 214 220 . . . Ontology_term=ECO:0007829;evidence=ECO:0007829|PDB:4OD9 P07339 UniProtKB Beta strand 224 226 . . . Ontology_term=ECO:0007829;evidence=ECO:0007829|PDB:4OD9 P07339 UniProtKB Beta strand 228 233 . . . Ontology_term=ECO:0007829;evidence=ECO:0007829|PDB:4OD9 P07339 UniProtKB Beta strand 236 238 . . . Ontology_term=ECO:0007829;evidence=ECO:0007829|PDB:1LYW P07339 UniProtKB Beta strand 239 249 . . . Ontology_term=ECO:0007829;evidence=ECO:0007829|PDB:4OD9 P07339 UniProtKB Helix 252 254 . . . Ontology_term=ECO:0007829;evidence=ECO:0007829|PDB:4OD9 P07339 UniProtKB Beta strand 255 263 . . . Ontology_term=ECO:0007829;evidence=ECO:0007829|PDB:4OD9 P07339 UniProtKB Turn 267 270 . . . Ontology_term=ECO:0007829;evidence=ECO:0007829|PDB:4OD9 P07339 UniProtKB Beta strand 271 274 . . . Ontology_term=ECO:0007829;evidence=ECO:0007829|PDB:4OD9 P07339 UniProtKB Beta strand 276 279 . . . Ontology_term=ECO:0007829;evidence=ECO:0007829|PDB:4OD9 P07339 UniProtKB Turn 280 282 . . . Ontology_term=ECO:0007829;evidence=ECO:0007829|PDB:1LYW P07339 UniProtKB Beta strand 284 286 . . . Ontology_term=ECO:0007829;evidence=ECO:0007829|PDB:4OD9 P07339 UniProtKB Beta strand 290 294 . . . Ontology_term=ECO:0007829;evidence=ECO:0007829|PDB:4OD9 P07339 UniProtKB Beta strand 299 303 . . . Ontology_term=ECO:0007829;evidence=ECO:0007829|PDB:4OD9 P07339 UniProtKB Helix 305 314 . . . Ontology_term=ECO:0007829;evidence=ECO:0007829|PDB:4OD9 P07339 UniProtKB Beta strand 318 321 . . . Ontology_term=ECO:0007829;evidence=ECO:0007829|PDB:1LYA P07339 UniProtKB Beta strand 325 327 . . . Ontology_term=ECO:0007829;evidence=ECO:0007829|PDB:4OD9 P07339 UniProtKB Helix 329 334 . . . Ontology_term=ECO:0007829;evidence=ECO:0007829|PDB:4OD9 P07339 UniProtKB Beta strand 338 342 . . . Ontology_term=ECO:0007829;evidence=ECO:0007829|PDB:4OD9 P07339 UniProtKB Beta strand 345 349 . . . Ontology_term=ECO:0007829;evidence=ECO:0007829|PDB:4OD9 P07339 UniProtKB Helix 351 354 . . . Ontology_term=ECO:0007829;evidence=ECO:0007829|PDB:4OD9 P07339 UniProtKB Beta strand 355 360 . . . Ontology_term=ECO:0007829;evidence=ECO:0007829|PDB:4OD9 P07339 UniProtKB Beta strand 363 372 . . . Ontology_term=ECO:0007829;evidence=ECO:0007829|PDB:4OD9 P07339 UniProtKB Turn 377 379 . . . Ontology_term=ECO:0007829;evidence=ECO:0007829|PDB:4OD9 P07339 UniProtKB Beta strand 383 385 . . . Ontology_term=ECO:0007829;evidence=ECO:0007829|PDB:4OD9 P07339 UniProtKB Helix 387 392 . . . Ontology_term=ECO:0007829;evidence=ECO:0007829|PDB:4OD9 P07339 UniProtKB Beta strand 393 398 . . . Ontology_term=ECO:0007829;evidence=ECO:0007829|PDB:4OD9 P07339 UniProtKB Turn 399 402 . . . Ontology_term=ECO:0007829;evidence=ECO:0007829|PDB:4OD9 P07339 UniProtKB Beta strand 403 409 . . . Ontology_term=ECO:0007829;evidence=ECO:0007829|PDB:4OD9