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UniProtKB/Swiss-Prot P06734 (FCER2_HUMAN)
Last modified
November 24, 2009.
Version 116.
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50% identity |
Documents (7) |
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Names and origin
| Protein names | Recommended name: Low affinity immunoglobulin epsilon Fc receptor Alternative name(s): Lymphocyte IgE receptor Fc-epsilon-RII BLAST-2 Immunoglobulin E-binding factor CD_antigen=CD23 Cleaved into the following 2 chains: 1- Recommended name: Low affinity immunoglobulin epsilon Fc receptor membrane-bound form 2- Recommended name: Low affinity immunoglobulin epsilon Fc receptor soluble form | ||||
| Gene names |
| ||||
| Organism | Homo sapiens (Human) [Complete proteome] | ||||
| Taxonomic identifier | 9606 [NCBI] | ||||
| Taxonomic lineage | Eukaryota › Metazoa › Chordata › Craniata › Vertebrata › Euteleostomi › Mammalia › Eutheria › Euarchontoglires › Primates › Haplorrhini › Catarrhini › Hominidae › Homo |
Protein attributes
| Sequence length | 321 AA. |
| Sequence status | Complete. |
| Sequence processing | The displayed sequence is further processed into a mature form. |
| Protein existence | Evidence at protein level. |
General annotation (Comments)
| Function | This receptor has essential roles in the regulation of IgE production and in the differentiation of B-cells (it is a B-cell-specific antigen). |
| Subcellular location | Cell membrane; Single-pass type II membrane protein. Secreted. Note: Also exists as a soluble excreted form. |
| Post-translational modification | N- and O-glycosylated. |
| Miscellaneous | There are two kinds of Fc receptors for IgE, which differ in both structure and function: high affinity receptors on basophils and mast cells and low affinity receptors on lymphocytes and monocytes. |
| Sequence similarities | Contains 1 C-type lectin domain. |
Ontologies
Alternative products
| This entry describes 2 isoforms produced by alternative splicing. [Align] [Select] | ||||||
| Isoform A (identifier: P06734-1) This isoform has been chosen as the 'canonical' sequence. All positional information in this entry refers to it. This is also the sequence that appears in the downloadable versions of the entry. | ||||||
| Isoform B (identifier: P06734-2) The sequence of this isoform differs from the canonical sequence as follows: 1-7: MEEGQYS → MNPPSQ |
Sequence annotation (Features)
| Feature key | Position(s) | Length | Description | Graphical view | Feature identifier | ||||||||||||||||||||||
Molecule processing | |||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Chain | 1 – 321 | 321 | Low affinity immunoglobulin epsilon Fc receptor membrane-bound form | PRO_0000017391 | |||||||||||||||||||||||
| Chain | 150 – 321 | 172 | Low affinity immunoglobulin epsilon Fc receptor soluble form | PRO_0000017392 | |||||||||||||||||||||||
Regions | |||||||||||||||||||||||||||
| Topological domain | 1 – 21 | 21 | Cytoplasmic Potential | ||||||||||||||||||||||||
| Transmembrane | 22 – 47 | 26 | Signal-anchor for type II membrane protein Potential | ||||||||||||||||||||||||
| Topological domain | 48 – 321 | 274 | Extracellular Potential | ||||||||||||||||||||||||
| Repeat | 69 – 89 | 21 | |||||||||||||||||||||||||
| Repeat | 90 – 110 | 21 | |||||||||||||||||||||||||
| Repeat | 111 – 131 | 21 | |||||||||||||||||||||||||
| Domain | 162 – 284 | 123 | C-type lectin | ||||||||||||||||||||||||
Sites | |||||||||||||||||||||||||||
| Site | 149 – 150 | 2 | Cleavage | ||||||||||||||||||||||||
Amino acid modifications | |||||||||||||||||||||||||||
| Glycosylation | 63 | 1 | N-linked (GlcNAc...) Potential | ||||||||||||||||||||||||
| Disulfide bond | 160 ↔ 288 | By similarity | |||||||||||||||||||||||||
| Disulfide bond | 163 ↔ 174 | By similarity | |||||||||||||||||||||||||
| Disulfide bond | 191 ↔ 282 | Ref.5 | |||||||||||||||||||||||||
| Disulfide bond | 259 ↔ 273 | Ref.5 | |||||||||||||||||||||||||
Natural variations | |||||||||||||||||||||||||||
| Alternative sequence | 1 – 7 | 7 | MEEGQYS → MNPPSQ in isoform B. | VSP_003057 | |||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 62 | 1 | R → W: dbSNP rs2228137. | VAR_035387 | |||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 284 | 1 | R → Q: dbSNP rs8102872. | VAR_035388 | |||||||||||||||||||||||
Experimental info | |||||||||||||||||||||||||||
| Sequence conflict | 269 | 1 | N → T in CAA28465. Ref.3 | ||||||||||||||||||||||||
Secondary structure | |||||||||||||||||||||||||||
Helix Strand Turn | |||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 168 – 170 | 3 | |||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 173 – 182 | 10 | |||||||||||||||||||||||||
| Helix | 184 – 193 | 10 | |||||||||||||||||||||||||
| Helix | 204 – 211 | 8 | |||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 219 – 226 | 8 | |||||||||||||||||||||||||
| Turn | 227 – 230 | 4 | |||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 231 – 234 | 4 | |||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 259 – 262 | 4 | |||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 268 – 271 | 4 | |||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 277 – 285 | 9 | |||||||||||||||||||||||||
Sequences
| ||||||||||||||||||||||||
References
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| [1] | "Human lymphocyte Fc receptor for IgE: sequence homology of its cloned cDNA with animal lectins." Ikuta K., Takami M., Kim C.W., Honjo T., Miyoshi T., Tagaya Y., Kawabe T., Yodoi J. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 84:819-823(1987) [PubMed: 2949326] [Abstract] Cited for: NUCLEOTIDE SEQUENCE [MRNA]. |
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| [5] | "Partial characterization of natural and recombinant human soluble CD23." Rose K., Turcatti G., Graber P., Pochon S., Regamey P.-O., Jansen K.U., Magnenat E., Aubonney N., Bonnefoy J.-Y. Biochem. J. 286:819-824(1992) [PubMed: 1417742] [Abstract] Cited for: PARTIAL PROTEIN SEQUENCE, DISULFIDE BONDS. |
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| [7] | "Modeling of the lectin-homology domains of the human and murine low-affinity Fc epsilon receptor (Fc epsilon RII/CD23)." Padlan E.A., Helm B.A. Receptor 3:325-341(1993) [PubMed: 8142907] [Abstract] Cited for: 3D-STRUCTURE MODELING OF LECTIN DOMAIN. |
| [8] | "Structure-based modeling of the ligand binding domain of the human cell surface receptor CD23 and comparison of two independently derived molecular models." Bajorath J., Aruffo A. Protein Sci. 5:240-247(1996) [PubMed: 8745401] [Abstract] Cited for: 3D-STRUCTURE MODELING OF 173-285. |
| + | Additional computationally mapped references. |
Cross-references
Sequence databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| M15059 mRNA. Translation: AAA52434.1. M14766 mRNA. Translation: AAA52435.1. X04772 mRNA. Translation: CAA28465.1. M23562 Genomic DNA. Translation: AAA52433.1. BC014108 mRNA. Translation: AAH14108.1. BC062591 mRNA. Translation: AAH62591.1. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IPI | IPI00027491. IPI00217263. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| PIR | LNHUER. A26067. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| RefSeq | NP_001993.2. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| UniGene | Hs.465778 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3D structure databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| ModBase | Search... | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Protein-protein interaction databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| STRING | P06734. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Proteomic databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| PRIDE | P06734. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome annotation databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Ensembl | ENST00000346664; ENSP00000264072; ENSG00000104921; Homo sapiens. [Genome view] ENST00000394208; ENSP00000377758; ENSG00000104921; Homo sapiens. [Genome view] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GeneID | 2208. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| KEGG | hsa:2208. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| UCSC | uc002mhm.1. human. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Organism-specific databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| CTD | 2208. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GeneCards | GC19M007659. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| H-InvDB | HIX0018076. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| HGNC | HGNC:3612. FCER2. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| HPA | CAB002624. HPA008928. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MIM | 151445. gene. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| PharmGKB | PA28058. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GenAtlas | Search... | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Phylogenomic databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| HOGENOM | P06734. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| HOVERGEN | P06734. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| OMA | KCYYFGE | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| OrthoDB | EOG9HX7KF | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Enzyme and pathway databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Pathway_Interaction_DB | il4_2pathway. IL4-mediated signaling events. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene expression databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| ArrayExpress | P06734. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Bgee | P06734. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| CleanEx | HS_FCER2. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genevestigator | P06734. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GermOnline | ENSG00000104921. Homo sapiens. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Family and domain databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| InterPro | IPR002353. AntifreezeII. IPR001304. C-type_lectin. IPR016186. C-type_lectin-like. IPR018378. C-type_lectin_CS. IPR016187. C-type_lectin_fold. [Graphical view] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Gene3D | G3DSA:3.10.100.10. C-type_lectin-like. 1 hit. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Pfam | PF00059. Lectin_C. 1 hit. [Graphical view] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| PRINTS | PR00356. ANTIFREEZEII. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| SMART | SM00034. CLECT. 1 hit. [Graphical view] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| PROSITE | PS00615. C_TYPE_LECTIN_1. 1 hit. PS50041. C_TYPE_LECTIN_2. 1 hit. [Graphical view] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| ProtoNet | Search... | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Other Resources | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| NextBio | 8943. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| PMAP-CutDB | P06734. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| SOURCE | Search... | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry information
| Entry name | FCER2_HUMAN | ||||||||
| Accession | Primary (citable) accession number: P06734 | ||||||||
| Entry history |
| ||||||||
| Entry status | Reviewed (UniProtKB/Swiss-Prot) | ||||||||
| Annotation project | HPI (Human Proteome Initiative) | ||||||||
| Disclaimer | Any medical or genetic information present in this entry is provided for research, educational and informational purposes only. It is not in any way intended to be used as a substitute for professional medical advice, diagnosis, treatment or care. | ||||||||
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