P06700 (SIR2_YEAST) Reviewed, UniProtKB/Swiss-Prot
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May 1, 2013.
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| Protein names | Recommended name: NAD-dependent histone deacetylase SIR2 EC=3.5.1.- Alternative name(s): Regulatory protein SIR2 Silent information regulator 2 | ||||||||
| Gene names |
| ||||||||
| Organism | Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c) (Baker's yeast) [Reference proteome] | ||||||||
| Taxonomic identifier | 559292 [NCBI] | ||||||||
| Taxonomic lineage | Eukaryota › Fungi › Dikarya › Ascomycota › Saccharomycotina › Saccharomycetes › Saccharomycetales › Saccharomycetaceae › Saccharomyces › ![]() |
Protein attributes
| Sequence length | 562 AA. |
| Sequence status | Complete. |
| Protein existence | Evidence at protein level |
General annotation (Comments)
| Function | NAD-dependent deacetylase, which participates in a wide range of cellular events including chromosome silencing, chromosome segregation, DNA recombination and the determination of life span. Involved in transcriptional repression of the silent mating-type loci HML and HMR and telomeric silencing via its association with SIR3 and SIR4. Plays a central role in ribosomal DNA (rDNA) silencing via its association with the RENT complex, preventing hyperrecombination, and repressing transcription from foreign promoters, which contributes to extending life span. Probably represses transcription via the formation of heterochromatin structure, which involves the compaction of chromatin fiber into a more condensed form, although this complex in at least one case can still bind euchromatic levels of positive transcription regulators. Although it displays some NAD-dependent histone deacetylase activity on histone H3K9Ac and H3K14Ac and histone H4K16Ac in vitro, such activity is unclear in vivo and may not be essential. Ref.6 Ref.7 Ref.8 Ref.17 Ref.20 Ref.23 Ref.25 |
| Catalytic activity | NAD+ + an acetylprotein = nicotinamide + O-acetyl-ADP-ribose + a protein. |
| Cofactor | Binds 1 zinc ion per subunit By similarity. |
| Enzyme regulation | Its activity is increased by calorie restriction, which slows the pace of aging and increases maximum lifespan. Activated by resveratrol (3,5,4'-trihydroxy-trans-stilbene), which is found in red wine. Ref.19 |
| Subunit structure | Homomultimer. Interacts with ESC8 and ZDS2. Component of the RENT complex, at least composed of SIR2, CDC14 and NET1. The RENT complex interacts with FOB1. Forms a complex with SIR3 and SIR4. Interacts with MCM10 and SLX5. Ref.9 Ref.10 Ref.11 Ref.12 Ref.15 Ref.17 Ref.21 Ref.23 |
| Subcellular location | Nucleus › nucleolus. Note: Associated with nucleolar chromatin. Preferentially bound to the spacer regions of the rDNA repeats through its interaction with NET1. Ref.5 |
| Miscellaneous | Its stability is directly linked to life span, which is extended when it is present in high dosage. Conversely, its absence shortens life span. The reported ADP-ribosyltransferase activity of sirtuins is likely some inefficient side reaction of the deacetylase activity and may not be physiologically relevant (Ref.25). Present with 3350 molecules/cell in log phase SD medium. |
| Sequence similarities | Belongs to the sirtuin family. Class I subfamily. Contains 1 deacetylase sirtuin-type domain. |
| Caution | Was originally (Ref.6) thought to be an ADP-ribosyltransferase. |
| Biophysicochemical properties | Kinetic parameters: KM=29.3 µM for NAD+ Ref.20 KM=239 µM for a synthetic histone H3K9 acetyllysine peptide KM=420 µM for a synthetic histone H3K14 acetyllysine peptide KM=140 µM for a synthetic histone H4K5 acetyllysine peptide KM=54 µM for a synthetic histone H4K8 acetyllysine peptide KM=105 µM for a synthetic histone H4K12 acetyllysine peptide KM=17 µM for a synthetic histone H4K16 acetyllysine peptide |
Ontologies
Binary interactions
With | Entry | #Exp. | IntAct | Notes |
|---|---|---|---|---|
| CDC14 | Q00684 | 5 | EBI-17219,EBI-4192 | |
| SIR4 | P11978 | 7 | EBI-17219,EBI-17237 |
Sequence annotation (Features)
| Feature key | Position(s) | Length | Description | Graphical view | Feature identifier | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule processing | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Chain | 1 – 562 | 562 | NAD-dependent histone deacetylase SIR2 | PRO_0000110280 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Regions | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Domain | 245 – 529 | 285 | Deacetylase sirtuin-type | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Nucleotide binding | 262 – 281 | 20 | NAD | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Nucleotide binding | 344 – 347 | 4 | NAD By similarity | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Nucleotide binding | 471 – 473 | 3 | NAD By similarity | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Nucleotide binding | 496 – 498 | 3 | NAD By similarity | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sites | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Active site | 364 | 1 | Proton acceptor By similarity | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Metal binding | 372 | 1 | Zinc | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Metal binding | 375 | 1 | Zinc | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Metal binding | 396 | 1 | Zinc | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Metal binding | 399 | 1 | Zinc | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Binding site | 513 | 1 | NAD; via amide nitrogen By similarity | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Amino acid modifications | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Modified residue | 23 | 1 | Phosphoserine Ref.22 Ref.24 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Modified residue | 400 | 1 | Phosphotyrosine Ref.24 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Experimental info | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Mutagenesis | 139 | 1 | R → K: Defects in telomeric silencing. Ref.16 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Mutagenesis | 270 | 1 | G → E: Defects in telomeric silencing. Ref.16 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Mutagenesis | 296 | 1 | F → L: Defects in telomeric silencing. Ref.16 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Secondary structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Helix Strand Turn | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 102 – 105 | 4 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 111 – 113 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 124 – 126 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 132 – 154 | 23 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 163 – 170 | 8 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 173 – 175 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 178 – 187 | 10 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 213 – 217 | 5 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 244 – 253 | 10 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 255 – 261 | 7 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 263 – 269 | 7 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 274 – 276 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 280 – 283 | 4 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 284 – 287 | 4 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 292 – 296 | 5 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 298 – 303 | 6 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 306 – 311 | 6 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 312 – 315 | 4 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 324 – 334 | 11 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 338 – 343 | 6 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 349 – 352 | 4 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 357 – 359 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 360 – 362 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 365 – 372 | 8 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 373 – 375 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 378 – 380 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 381 – 384 | 4 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 385 – 389 | 5 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 397 – 399 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 400 – 406 | 7 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 433 – 436 | 4 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 437 – 442 | 6 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 451 – 460 | 10 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 461 – 463 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 466 – 471 | 6 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 479 – 481 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 482 – 485 | 4 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 492 – 498 | 7 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 506 – 511 | 6 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 513 – 524 | 12 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 533 – 537 | 5 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 541 – 547 | 7 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 550 – 555 | 6 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequences
| ||||||||||||||||||
References
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| [1] | "Characterization of two genes required for the position-effect control of yeast mating-type genes." Shore D., Squire M., Nasmyth K.A. EMBO J. 3:2817-2823(1984) [PubMed] [Europe PMC] [Abstract] Cited for: NUCLEOTIDE SEQUENCE [GENOMIC DNA]. |
| [2] | "The sequence of a 36.7 kb segment on the left arm of chromosome IV from Saccharomyces cerevisiae reveals 20 non-overlapping open reading frames (ORFs) including SIT4, FAD1, NAM1, RNA11, SIR2, NAT1, PRP9, ACT2 and MPS1 and 11 new ORFs." Saren A.-M., Laamanen P., Lejarcegui J.B., Paulin L. Yeast 13:65-71(1997) [PubMed] [Europe PMC] [Abstract] Cited for: NUCLEOTIDE SEQUENCE [GENOMIC DNA]. Strain: ATCC 204508 / S288c. |
| [3] | "The nucleotide sequence of Saccharomyces cerevisiae chromosome IV." Jacq C., Alt-Moerbe J., Andre B., Arnold W., Bahr A., Ballesta J.P.G., Bargues M., Baron L., Becker A., Biteau N., Bloecker H., Blugeon C., Boskovic J., Brandt P., Brueckner M., Buitrago M.J., Coster F., Delaveau T. Zaccaria P.Nature 387:75-78(1997) [PubMed] [Europe PMC] [Abstract] Cited for: NUCLEOTIDE SEQUENCE [LARGE SCALE GENOMIC DNA]. Strain: ATCC 204508 / S288c. |
| [4] | Saccharomyces Genome Database Submitted (DEC-2009) to the EMBL/GenBank/DDBJ databases Cited for: GENOME REANNOTATION. Strain: ATCC 204508 / S288c. |
| [5] | "Localization of Sir2p: the nucleolus as a compartment for silent information regulators." Gotta M., Strahl-Bolsinger S., Renauld H., Laroche T., Kennedy B.K., Grunstein M., Gasser S.M. EMBO J. 16:3243-3255(1997) [PubMed] [Europe PMC] [Abstract] Cited for: SUBCELLULAR LOCATION. |
| [6] | "An enzymatic activity in the yeast Sir2 protein that is essential for gene silencing." Tanny J.C., Dowd G.J., Huang J., Hilz H., Moazed D. Cell 99:735-745(1999) [PubMed] [Europe PMC] [Abstract] Cited for: PRELIMINARY FUNCTION. |
| [7] | "Transcriptional silencing and longevity protein Sir2 is an NAD-dependent histone deacetylase." Imai S., Armstrong C.M., Kaeberlein M., Guarente L. Nature 403:795-800(2000) [PubMed] [Europe PMC] [Abstract] Cited for: FUNCTION. |
| [8] | "Silencing factors participate in DNA repair and recombination in Saccharomyces cerevisiae." Tsukamoto Y., Kato J., Ikeda H. Nature 388:900-903(1997) [PubMed] [Europe PMC] [Abstract] Cited for: FUNCTION. |
| [9] | "Silent information regulator protein complexes in Saccharomyces cerevisiae: a SIR2/SIR4 complex and evidence for a regulatory domain in SIR4 that inhibits its interaction with SIR3." Moazed D., Kistler A., Axelrod A., Rine J., Johnson A.D. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 94:2186-2191(1997) [PubMed] [Europe PMC] [Abstract] Cited for: INTERACTION WITH SIR3 AND SIR4. |
| [10] | "Exit from mitosis is triggered by Tem1-dependent release of the protein phosphatase Cdc14 from nucleolar RENT complex." Shou W., Seol J.H., Shevchenko A., Baskerville C., Moazed D., Chen Z.W.S., Jang J., Shevchenko A., Charbonneau H., Deshaies R.J. Cell 97:233-244(1999) [PubMed] [Europe PMC] [Abstract] Cited for: IDENTIFICATION IN A RENT COMPLEX WITH CDC14. |
| [11] | "Net1, a Sir2-associated nucleolar protein required for rDNA silencing and nucleolar integrity." Straight A.F., Shou W., Dowd G.J., Turck C.W., Deshaies R.J., Johnson A.D., Moazed D. Cell 97:245-256(1999) [PubMed] [Europe PMC] [Abstract] Cited for: IDENTIFICATION IN A RENT COMPLEX WITH NET1. |
| [12] | "Two paralogs involved in transcriptional silencing that antagonistically control yeast life span." Roy N., Runge K.W. Curr. Biol. 10:111-114(2000) [PubMed] [Europe PMC] [Abstract] Cited for: INTERACTION WITH ZDS2. |
| [13] | "Silenced chromatin is permissive to activator binding and PIC recruitment." Sekinger E.A., Gross D.S. Cell 105:403-414(2001) [PubMed] [Europe PMC] [Abstract] Cited for: MECHANISM OF TRANSCRIPTION REPRESSION. |
| [14] | "The molecular biology of the SIR proteins." Gasser S.M., Cockell M.M. Gene 279:1-16(2001) [PubMed] [Europe PMC] [Abstract] Cited for: REVIEW. |
| [15] | "Restoration of silencing in Saccharomyces cerevisiae by tethering of a novel Sir2-interacting protein, Esc8." Cuperus G., Shore D. Genetics 162:633-645(2002) [PubMed] [Europe PMC] [Abstract] Cited for: INTERACTION WITH ESC8. |
| [16] | "A unique class of conditional sir2 mutants displays distinct silencing defects in Saccharomyces cerevisiae." Garcia S.N., Pillus L. Genetics 162:721-736(2002) [PubMed] [Europe PMC] [Abstract] Cited for: MUTAGENESIS OF ARG-139; GLY-270 AND PHE-296. |
| [17] | "Association of the RENT complex with nontranscribed and coding regions of rDNA and a regional requirement for the replication fork block protein Fob1 in rDNA silencing." Huang J., Moazed D. Genes Dev. 17:2162-2176(2003) [PubMed] [Europe PMC] [Abstract] Cited for: FUNCTION, INTERACTION WITH FOB1. |
| [18] | "Global analysis of protein expression in yeast." Ghaemmaghami S., Huh W.-K., Bower K., Howson R.W., Belle A., Dephoure N., O'Shea E.K., Weissman J.S. Nature 425:737-741(2003) [PubMed] [Europe PMC] [Abstract] Cited for: LEVEL OF PROTEIN EXPRESSION [LARGE SCALE ANALYSIS]. |
| [19] | "Small molecule activators of sirtuins extend Saccharomyces cerevisiae lifespan." Howitz K.T., Bitterman K.J., Cohen H.Y., Lamming D.W., Lavu S., Wood J.G., Zipkin R.E., Chung P., Kisielewski A., Zhang L.-L., Scherer B., Sinclair D.A. Nature 425:191-196(2003) [PubMed] [Europe PMC] [Abstract] Cited for: ENZYME REGULATION. |
| [20] | "Substrate specificity and kinetic mechanism of the Sir2 family of NAD+-dependent histone/protein deacetylases." Borra M.T., Langer M.R., Slama J.T., Denu J.M. Biochemistry 43:9877-9887(2004) [PubMed] [Europe PMC] [Abstract] Cited for: FUNCTION, BIOPHYSICOCHEMICAL PROPERTIES. |
| [21] | "Dual roles for Mcm10 in DNA replication initiation and silencing at the mating-type loci." Douglas N.L., Dozier S.K., Donato J.J. Mol. Biol. Rep. 32:197-204(2005) [PubMed] [Europe PMC] [Abstract] Cited for: INTERACTION WITH MCM10. |
| [22] | "Proteome-wide identification of in vivo targets of DNA damage checkpoint kinases." Smolka M.B., Albuquerque C.P., Chen S.H., Zhou H. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 104:10364-10369(2007) [PubMed] [Europe PMC] [Abstract] Cited for: PHOSPHORYLATION [LARGE SCALE ANALYSIS] AT SER-23, MASS SPECTROMETRY. |
| [23] | "Slx5 promotes transcriptional silencing and is required for robust growth in the absence of Sir2." Darst R.P., Garcia S.N., Koch M.R., Pillus L. Mol. Cell. Biol. 28:1361-1372(2008) [PubMed] [Europe PMC] [Abstract] Cited for: FUNCTION, INTERACTION WITH SLX5/HEX3. |
| [24] | "A multidimensional chromatography technology for in-depth phosphoproteome analysis." Albuquerque C.P., Smolka M.B., Payne S.H., Bafna V., Eng J., Zhou H. Mol. Cell. Proteomics 7:1389-1396(2008) [PubMed] [Europe PMC] [Abstract] Cited for: PHOSPHORYLATION [LARGE SCALE ANALYSIS] AT SER-23 AND TYR-400, MASS SPECTROMETRY. |
| [25] | "Investigating the ADP-ribosyltransferase activity of sirtuins with NAD analogues and 32P-NAD." Du J., Jiang H., Lin H. Biochemistry 48:2878-2890(2009) [PubMed] [Europe PMC] [Abstract] Cited for: FUNCTION. |
| [26] | "Autoregulation of the yeast Sir2 deacetylase by reaction and trapping of a pseudosubstrate motif in the active site." Hall B.E., Buchberger J.R., Gerber S.A., Ambrosio A.L.B., Gygi S.P., Filman D., Moazed D., Ellenberger T. Submitted (JUN-2006) to the PDB data bank Cited for: X-RAY CRYSTALLOGRAPHY (1.85 ANGSTROMS) OF 209-562 IN COMPLEX WITH ZINC AND NICOTINAMIDE. |
| + | Additional computationally mapped references. |
Web resources
| Protein Spotlight In vino vita? - Issue 40 of November 2003 |
Cross-references
Sequence databases | |||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| EMBL GenBank DDBJ | X01419 Genomic DNA. Translation: CAA25667.1. Z71781 Genomic DNA. Translation: CAA96447.1. Z74090 Genomic DNA. Translation: CAA98600.1. BK006938 Genomic DNA. Translation: DAA11814.1. | ||||||||||||||||||
| PIR | RGBYS2. S05891. | ||||||||||||||||||
| RefSeq | NP_010242.1. NM_001180101.1. | ||||||||||||||||||
3D structure databases | |||||||||||||||||||
| PDBe RCSB PDB PDBj |
| ||||||||||||||||||
| ProteinModelPortal | P06700. | ||||||||||||||||||
| SMR | P06700. Positions 99-555. | ||||||||||||||||||
| ModBase | Search... | ||||||||||||||||||
Protein-protein interaction databases | |||||||||||||||||||
| DIP | DIP-596N. | ||||||||||||||||||
| IntAct | P06700. 48 interactions. | ||||||||||||||||||
| MINT | MINT-509141. | ||||||||||||||||||
| STRING | 4932.YDL042C. | ||||||||||||||||||
Proteomic databases | |||||||||||||||||||
| PaxDb | P06700. | ||||||||||||||||||
| PeptideAtlas | P06700. | ||||||||||||||||||
| PRIDE | P06700. | ||||||||||||||||||
Protocols and materials databases | |||||||||||||||||||
| StructuralBiologyKnowledgebase | Search... | ||||||||||||||||||
Genome annotation databases | |||||||||||||||||||
| EnsemblFungi | YDL042C; YDL042C; YDL042C. | ||||||||||||||||||
| GeneID | 851520. | ||||||||||||||||||
| KEGG | sce:YDL042C. | ||||||||||||||||||
Organism-specific databases | |||||||||||||||||||
| CYGD | YDL042c. | ||||||||||||||||||
| SGD | S000002200. SIR2. | ||||||||||||||||||
Phylogenomic databases | |||||||||||||||||||
| eggNOG | COG0846. | ||||||||||||||||||
| GeneTree | ENSGT00680000100043. | ||||||||||||||||||
| HOGENOM | HOG000191845. | ||||||||||||||||||
| KO | K11121. | ||||||||||||||||||
| OMA | PVKHAEF. | ||||||||||||||||||
| OrthoDB | EOG4DZ53T. | ||||||||||||||||||
Gene expression databases | |||||||||||||||||||
| Genevestigator | P06700. | ||||||||||||||||||
| GermOnline | YDL042C. Saccharomyces cerevisiae. | ||||||||||||||||||
Family and domain databases | |||||||||||||||||||
| Gene3D | 3.30.1600.10. 3 hits. | ||||||||||||||||||
| InterPro | IPR007654. NAD-dep_histone_deAcase_SIR2_N. IPR003000. Sirtuin. IPR026591. Sirtuin_cat_small_dom. IPR026590. Ssirtuin_cat_dom. [Graphical view] | ||||||||||||||||||
| PANTHER | PTHR11085. PTHR11085. 1 hit. | ||||||||||||||||||
| Pfam | PF04574. DUF592. 1 hit. PF02146. SIR2. 1 hit. [Graphical view] | ||||||||||||||||||
| PROSITE | PS50305. SIRTUIN. 1 hit. [Graphical view] | ||||||||||||||||||
| ProtoNet | Search... | ||||||||||||||||||
Other | |||||||||||||||||||
| BindingDB | P06700. | ||||||||||||||||||
| ChEMBL | CHEMBL3275. | ||||||||||||||||||
| EvolutionaryTrace | P06700. | ||||||||||||||||||
| NextBio | 968896. | ||||||||||||||||||
Entry information
| Entry name | SIR2_YEAST | ||||||||
| Accession | Primary (citable) accession number: P06700 Secondary accession number(s): D6VRV4 | ||||||||
| Entry history |
| ||||||||
| Entry status | Reviewed (UniProtKB/Swiss-Prot) | ||||||||
| Annotation program | Fungal Protein Annotation Program | ||||||||
Relevant documents
| Yeast Yeast (Saccharomyces cerevisiae): entries, gene names and cross-references to SGD |
| Yeast chromosome IV Yeast (Saccharomyces cerevisiae) chromosome IV: entries and gene names |
| PDB cross-references Index of Protein Data Bank (PDB) cross-references |
| SIMILARITY comments Index of protein domains and families |
| Protein Spotlight Protein Spotlight articles and cited UniProtKB/Swiss-Prot entries |

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