P06280 (AGAL_HUMAN) Reviewed, UniProtKB/Swiss-Prot
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May 1, 2013.
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| Protein names | Recommended name: Alpha-galactosidase A EC=3.2.1.22 Alternative name(s): Alpha-D-galactosidase A Alpha-D-galactoside galactohydrolase Melibiase INN=Agalsidase | ||
| Gene names |
| ||
| Organism | Homo sapiens (Human) [Reference proteome] | ||
| Taxonomic identifier | 9606 [NCBI] | ||
| Taxonomic lineage | Eukaryota › Metazoa › Chordata › Craniata › Vertebrata › Euteleostomi › Mammalia › Eutheria › Euarchontoglires › Primates › Haplorrhini › Catarrhini › Hominidae › Homo![]() |
Protein attributes
| Sequence length | 429 AA. |
| Sequence status | Complete. |
| Sequence processing | The displayed sequence is further processed into a mature form. |
| Protein existence | Evidence at protein level |
General annotation (Comments)
| Catalytic activity | Hydrolysis of terminal, non-reducing alpha-D-galactose residues in alpha-D-galactosides, including galactose oligosaccharides, galactomannans and galactolipids. |
| Subunit structure | Homodimer. Ref.12 |
| Subcellular location | |
| Involvement in disease | Fabry disease (FD) [MIM:301500]: Rare X-linked sphingolipidosis disease where glycolipid accumulates in many tissues. The disease consists of an inborn error of glycosphingolipid catabolism. FD patients show systemic accumulation of globotriaoslyceramide (Gb3) and related glycosphingolipids in the plasma and cellular lysosomes throughout the body. Clinical recognition in males results from characteristic skin lesions (angiokeratomas) over the lower trunk. Patients may show ocular deposits, febrile episodes, and burning pain in the extremities. Death results from renal failure, cardiac or cerebral complications of hypertension or other vascular disease. Heterozygous females may exhibit the disorder in an attenuated form, they are more likely to show corneal opacities. |
| Pharmaceutical use | Available under the names Replagal (Transkaryotic Therapies) and Fabrazyme (Genzyme). Used as a long-term enzyme replacement therapy in patients with a confirmed diagnosis of Fabry disease. |
| Sequence similarities | Belongs to the glycosyl hydrolase 27 family. |
| RNA editing |
Ontologies
Sequence annotation (Features)
| Feature key | Position(s) | Length | Description | Graphical view | Feature identifier | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule processing | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Signal peptide | 1 – 31 | 31 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Chain | 32 – 429 | 398 | Alpha-galactosidase A | PRO_0000001004 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Regions | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Region | 203 – 207 | 5 | Substrate binding | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sites | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Active site | 170 | 1 | Nucleophile By similarity | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Active site | 231 | 1 | Proton donor By similarity | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Amino acid modifications | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Glycosylation | 139 | 1 | N-linked (GlcNAc...) Ref.12 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Glycosylation | 192 | 1 | N-linked (GlcNAc...) Ref.12 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Glycosylation | 215 | 1 | N-linked (GlcNAc...) Ref.10 Ref.12 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Glycosylation | 408 | 1 | N-linked (GlcNAc...) Potential | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Disulfide bond | 52 ↔ 94 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Disulfide bond | 56 ↔ 63 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Disulfide bond | 142 ↔ 172 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Disulfide bond | 202 ↔ 223 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Disulfide bond | 378 ↔ 382 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Natural variations | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 12 – 14 | 3 | Missing in FD; has 4% of wild-type activity. | VAR_062550 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 20 | 1 | A → P in FD; atypical. Ref.26 Ref.33 | VAR_012362 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 31 | 1 | A → V in FD. Ref.34 Ref.51 | VAR_012363 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 32 | 1 | L → P in FD. Ref.25 | VAR_000431 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 34 | 1 | N → S in FD. Ref.19 Ref.20 Ref.25 Corresponds to variant rs28935192 [ dbSNP | Ensembl ]. | VAR_000432 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 35 | 1 | G → R in FD. Ref.21 | VAR_000433 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 40 | 1 | P → L in FD. Ref.44 | VAR_012364 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 40 | 1 | P → S in FD. Ref.14 Ref.33 Ref.38 | VAR_000434 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 42 | 1 | M → L in FD. Ref.51 | VAR_062551 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 42 | 1 | M → V in FD. Ref.28 Ref.42 | VAR_012365 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 43 | 1 | G → R in FD. Ref.51 | VAR_062552 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 45 – 46 | 2 | LH → RS in FD. | VAR_012366 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 46 | 1 | H → P in FD; has 36% of wild-type activity. Ref.53 | VAR_062553 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 46 | 1 | H → R in FD. Ref.34 | VAR_012367 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 46 | 1 | H → Y in FD. Ref.46 | VAR_012368 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 47 | 1 | W → G in FD. Ref.46 | VAR_012369 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 49 | 1 | R → L in FD. Ref.21 | VAR_000435 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 49 | 1 | R → P in FD. Ref.46 | VAR_012370 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 49 | 1 | R → S in FD. Ref.28 | VAR_012371 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 52 | 1 | C → R in FD. Ref.30 Ref.31 | VAR_000436 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 52 | 1 | C → S in FD. | VAR_000437 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 56 | 1 | C → F in FD. | VAR_000438 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 56 | 1 | C → G in FD. Ref.19 Corresponds to variant rs28935193 [ dbSNP | Ensembl ]. | VAR_000439 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 56 | 1 | C → Y in FD. Ref.28 | VAR_012372 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 59 | 1 | E → K in FD. | VAR_000440 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 65 | 1 | S → T in FD; does not affect enzyme function. Ref.35 Ref.49 | VAR_032290 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 66 | 1 | E → Q in FD; has 52% of wild-type activity. Ref.18 Ref.23 Ref.33 Ref.53 Corresponds to variant rs28935191 [ dbSNP | Ensembl ]. | VAR_000441 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 72 | 1 | M → V in FD; atypical. Ref.33 Ref.37 | VAR_000442 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 85 | 1 | G → D in FD. Ref.25 | VAR_000443 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 86 | 1 | Y → C in FD. Ref.34 | VAR_012373 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 89 | 1 | L → P in FD. Ref.34 | VAR_012374 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 89 | 1 | L → R in FD. | VAR_000444 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 91 | 1 | I → T in FD; mild. Ref.34 | VAR_012375 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 92 | 1 | D → H in FD. Ref.28 | VAR_012376 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 92 | 1 | D → Y in FD. Ref.34 | VAR_012377 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 93 | 1 | D → G in FD. Ref.28 | VAR_012378 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 93 | 1 | D → N in FD; has no enzyme activity. Ref.51 Ref.53 | VAR_062554 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 94 | 1 | C → S in FD. Ref.46 | VAR_012379 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 94 | 1 | C → Y in FD. Ref.34 | VAR_012380 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 95 | 1 | W → S in FD. Ref.44 Ref.46 | VAR_012381 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 97 | 1 | A → V in FD. Ref.34 | VAR_012382 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 100 | 1 | R → K in FD. | VAR_000445 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 100 | 1 | R → T in FD. Ref.34 | VAR_012383 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 112 – 117 | 6 | Missing in FD. | VAR_000446 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 112 | 1 | R → C in FD. Ref.18 Ref.23 Ref.33 Ref.42 Ref.44 Ref.46 Ref.51 | VAR_000447 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 112 | 1 | R → H in FD; mild. Ref.44 Ref.51 | VAR_000448 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 112 | 1 | R → S in FD. Ref.51 | VAR_062555 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 113 | 1 | F → L in FD; mild. Ref.34 | VAR_012384 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 113 | 1 | F → S in FD. Ref.46 | VAR_012385 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 120 – 121 | 2 | LA → PT in FD. | VAR_000449 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 120 | 1 | L → V in FD; has 42% of wild-type activity. Ref.53 | VAR_062556 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 128 | 1 | G → E in FD. Ref.31 | VAR_000450 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 131 | 1 | L → P in FD. | VAR_000451 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 134 | 1 | Y → S in FD. Ref.34 Ref.51 | VAR_012386 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 135 | 1 | A → V in FD. Ref.51 | VAR_062557 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 138 | 1 | G → R in FD. Ref.34 | VAR_012387 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 142 | 1 | C → R in FD. Ref.42 | VAR_012388 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 142 | 1 | C → Y in FD. Ref.24 Ref.33 | VAR_000452 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 143 | 1 | A → P in FD. Ref.47 | VAR_000453 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 143 | 1 | A → T in FD. Ref.34 Ref.46 Ref.52 | VAR_012389 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 144 | 1 | G → V in FD. | VAR_000454 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 146 | 1 | P → S in FD; mild. Corresponds to variant rs28935194 [ dbSNP | Ensembl ]. | VAR_000455 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 148 | 1 | S → N in FD. Ref.44 | VAR_012390 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 148 | 1 | S → R in FD. Ref.34 Ref.42 | VAR_012391 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 156 | 1 | A → T in FD. Ref.25 Corresponds to variant rs28935195 [ dbSNP | Ensembl ]. | VAR_000456 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 156 | 1 | A → V in FD. Ref.23 Ref.24 Ref.33 | VAR_000457 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 162 | 1 | W → C in FD. Ref.30 | VAR_012392 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 162 | 1 | W → R in FD. Ref.19 Corresponds to variant rs28935196 [ dbSNP | Ensembl ]. | VAR_000458 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 163 | 1 | G → V in FD. Ref.34 | VAR_012393 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 165 | 1 | D → V in FD. Ref.21 Ref.42 | VAR_000459 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 166 | 1 | L → V in FD. Ref.23 Ref.24 Ref.33 | VAR_000460 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 170 | 1 | D → V in FD. Ref.34 | VAR_012394 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 171 | 1 | G → D in FD. Ref.51 | VAR_062558 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 172 | 1 | C → R in FD. Ref.44 | VAR_012395 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 172 | 1 | C → Y in FD. | VAR_000461 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 183 | 1 | G → D in FD. Ref.42 | VAR_012396 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 187 | 1 | M → V in FD. Ref.44 | VAR_012397 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 201 | 1 | S → F in FD. Ref.51 | VAR_062559 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 202 | 1 | C → W in FD. Ref.39 Corresponds to variant rs28936082 [ dbSNP | Ensembl ]. | VAR_000462 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 202 | 1 | C → Y in FD. Ref.34 | VAR_012398 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 205 – 207 | 3 | Missing in FD. | VAR_012399 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 205 | 1 | P → T in FD. Ref.28 Ref.31 | VAR_000463 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 215 | 1 | N → S in FD; mild. Ref.20 Ref.38 Ref.42 Ref.46 Ref.51 Corresponds to variant rs28935197 [ dbSNP | Ensembl ]. | VAR_000464 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 216 | 1 | Y → D in FD. Ref.34 | VAR_012400 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 219 | 1 | I → N in FD. | VAR_000465 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 219 | 1 | I → T in FD; has 46% of wild-type activity. Ref.53 | VAR_062560 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 223 | 1 | C → G in FD. Ref.39 | VAR_012401 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 224 | 1 | N → D in FD. Ref.38 Ref.39 | VAR_000466 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 224 | 1 | N → S in FD. Ref.44 | VAR_012402 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 226 | 1 | W → R in FD. Ref.44 | VAR_012403 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 227 | 1 | R → Q in FD. Ref.19 Ref.44 Corresponds to variant rs28935198 [ dbSNP | Ensembl ]. | VAR_000467 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 230 | 1 | A → T in FD. Ref.44 | VAR_012404 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 231 | 1 | D → N in FD. Ref.32 | VAR_000468 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 234 | 1 | D → E in FD. Ref.51 | VAR_062561 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 235 | 1 | S → C in FD. Ref.42 | VAR_012405 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 236 | 1 | W → C in FD. Ref.28 | VAR_012406 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 236 | 1 | W → L in FD. Ref.42 | VAR_012407 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 242 | 1 | I → N in FD. Ref.33 | VAR_012408 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 244 | 1 | D → H in FD. Ref.42 | VAR_012409 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 244 | 1 | D → N in FD. | VAR_000469 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 247 | 1 | S → SWTS in FD. | VAR_000470 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 258 | 1 | G → R in FD. Ref.46 | VAR_012410 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 259 | 1 | P → L in FD. Ref.42 | VAR_012411 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 259 | 1 | P → R in FD. Ref.46 | VAR_012412 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 260 | 1 | G → A in FD. Ref.23 Ref.33 | VAR_012413 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 261 | 1 | G → D in FD. Ref.33 Ref.51 | VAR_012414 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 263 | 1 | N → S in FD. Ref.34 | VAR_012415 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 264 | 1 | D → V in FD. Ref.19 Ref.51 Corresponds to variant rs28935486 [ dbSNP | Ensembl ]. | VAR_000471 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 264 | 1 | D → Y in FD. Ref.51 | VAR_062562 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 265 | 1 | P → R in FD. Ref.30 | VAR_012416 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 266 | 1 | D → H in FD. Ref.44 | VAR_032291 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 266 | 1 | D → N in FD. Ref.43 | VAR_012418 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 266 | 1 | D → V in FD. Ref.19 Corresponds to variant rs28935487 [ dbSNP | Ensembl ]. | VAR_000472 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 267 | 1 | M → I in FD. Ref.42 Ref.46 | VAR_012419 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 269 | 1 | V → A in FD. Ref.20 Corresponds to variant rs28935488 [ dbSNP | Ensembl ]. | VAR_000473 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 272 | 1 | N → K in FD. | VAR_000474 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 272 | 1 | N → S in FD. Ref.50 Corresponds to variant rs28935495 [ dbSNP | Ensembl ]. | VAR_032292 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 276 | 1 | S → G in FD. Ref.51 | VAR_062563 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 279 | 1 | Q → E in FD; mild; does not significantly affect the enzyme activity but the mutant protein levels are decreased presumably in the ER of the cells. Ref.18 Ref.23 Ref.33 Ref.41 Corresponds to variant rs28935485 [ dbSNP | Ensembl ]. | VAR_000475 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 279 | 1 | Q → H in FD. Ref.46 | VAR_012420 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 280 | 1 | Q → H in FD. Ref.46 | VAR_012421 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 284 | 1 | M → T in FD. Ref.31 | VAR_000476 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 285 | 1 | A → P in FD. Ref.51 | VAR_062564 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 287 | 1 | W → C in FD. Ref.34 | VAR_012422 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 287 | 1 | W → G in FD. Ref.28 | VAR_012423 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 288 | 1 | A → D in FD. | VAR_000477 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 289 | 1 | I → F in FD. Ref.42 | VAR_012424 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 296 | 1 | M → I in FD; atypical. Ref.23 Ref.26 Ref.33 | VAR_012425 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 296 | 1 | M → V in FD; mild. Ref.15 | VAR_000478 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 297 | 1 | S → F in FD. Ref.19 Corresponds to variant rs28935489 [ dbSNP | Ensembl ]. | VAR_000479 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 298 | 1 | N → H in FD. Ref.28 Ref.46 | VAR_012426 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 298 | 1 | N → K in FD. Ref.31 | VAR_000480 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 298 | 1 | N → S in FD. Ref.34 | VAR_012427 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 300 | 1 | L → F in FD. Ref.51 | VAR_062565 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 301 | 1 | R → Q in FD; mild; does not significantly affect the enzyme activity but the mutant protein levels are decreased presumably in the ER of the cells. Ref.16 Ref.18 Ref.23 Ref.25 Ref.27 Ref.33 Ref.39 Ref.41 Ref.44 | VAR_000481 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 313 | 1 | D → Y in FD. Ref.19 Ref.38 Ref.46 Corresponds to variant rs28935490 [ dbSNP | Ensembl ]. | VAR_000482 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 316 – 322 | 7 | Missing in FD. | VAR_012429 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 316 | 1 | V → E in FD. Ref.21 | VAR_000483 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 320 | 1 | N → K in FD. Ref.23 Ref.33 | VAR_012430 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 320 | 1 | N → Y in FD. Ref.44 | VAR_012431 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 321 | 1 | Q → E in FD. Ref.42 | VAR_012432 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 327 | 1 | Q → K in FD. Ref.20 Ref.39 Corresponds to variant rs28935491 [ dbSNP | Ensembl ]. | VAR_000484 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 328 | 1 | G → A in FD. Ref.19 Ref.51 Corresponds to variant rs28935492 [ dbSNP | Ensembl ]. | VAR_000486 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 328 | 1 | G → R in FD. Ref.18 Ref.23 Ref.33 | VAR_000485 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 328 | 1 | G → V in FD. Ref.51 | VAR_062566 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 338 | 1 | E → K in FD. Ref.51 | VAR_062567 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 340 | 1 | W → R in FD. Ref.28 | VAR_012433 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 341 | 1 | E → K in FD. Ref.40 | VAR_012434 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 342 | 1 | R → Q in FD; severe. Corresponds to variant rs28935493 [ dbSNP | Ensembl ]. | VAR_000487 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 356 | 1 | R → Q in FD; has 15% of wild-type activity. Ref.53 | VAR_062568 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 356 | 1 | R → W in FD; severe. Ref.17 | VAR_000488 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 358 | 1 | E → A in FD. Ref.51 | VAR_062569 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 358 | 1 | E → K in FD. Ref.36 | VAR_000489 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 358 | 1 | Missing in FD. Ref.31 Ref.33 Ref.42 Ref.51 | VAR_000490 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 360 | 1 | G → C in FD; has 6% of wild-type activity. Ref.53 | VAR_062570 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 361 | 1 | G → R in FD; severe. Ref.20 Corresponds to variant rs28935494 [ dbSNP | Ensembl ]. | VAR_000491 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 363 | 1 | R → H in FD. Ref.46 | VAR_012435 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 373 | 1 | G → D in FD. Ref.45 | VAR_012436 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 373 | 1 | G → S in FD. Ref.23 Ref.33 | VAR_012437 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 377 | 1 | A → D in FD. Ref.46 | VAR_012438 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 378 | 1 | C → Y in FD. Ref.42 | VAR_012439 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 383 | 1 | Missing in FD; severe; with facial telangiectasias. Ref.29 | VAR_000492 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 396 | 1 | F → Y in RNA edited version. | VAR_000493 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 404 | 1 | Missing in FD; mild. Ref.19 Ref.34 Ref.51 | VAR_000494 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 409 | 1 | P → A in FD. Ref.46 | VAR_012440 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 409 | 1 | P → T in FD. Ref.46 | VAR_012441 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 410 | 1 | T → A in FD; mild. Ref.48 | VAR_032293 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 414 | 1 | L → S in FD. Ref.51 | VAR_062571 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Secondary structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Helix Strand Turn | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 42 – 46 | 5 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 47 – 50 | 4 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 56 – 58 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 60 – 62 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 63 – 65 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 66 – 78 | 13 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 81 – 84 | 4 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 88 – 90 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 102 – 104 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 110 – 112 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 113 – 115 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 116 – 126 | 11 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 130 – 140 | 11 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 144 – 146 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 149 – 151 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 152 – 162 | 11 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 166 – 170 | 5 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 177 – 193 | 17 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 199 – 202 | 4 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 205 – 208 | 4 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 209 – 211 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 216 – 222 | 7 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 224 – 227 | 4 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 236 – 248 | 13 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 250 – 253 | 4 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 254 – 256 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 261 – 264 | 4 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 272 – 274 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 277 – 289 | 13 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 294 – 296 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 305 – 311 | 7 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 314 – 320 | 7 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 329 – 334 | 6 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 337 – 343 | 7 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 345 – 347 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 349 – 355 | 7 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 359 – 361 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 363 – 368 | 6 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 369 – 371 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 373 – 375 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 376 – 378 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 379 – 390 | 12 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 392 – 398 | 7 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 402 – 407 | 6 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 412 – 419 | 8 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 420 – 424 | 5 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequences
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References
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Entry information
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