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UniProtKB/Swiss-Prot P06280 (AGAL_HUMAN)
Last modified
June 16, 2009.
Version 117.
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Clusters with 100%,
90%,
50% identity |
Documents (7) |
Third-party data |
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Names and origin
| Protein names | Recommended name: Alpha-galactosidase A EC=3.2.1.22 Alternative name(s): Alpha-D-galactoside galactohydrolase Alpha-D-galactosidase A Melibiase INN=Agalsidase | ||
| Gene names |
| ||
| Organism | Homo sapiens (Human) | ||
| Taxonomic identifier | 9606 [NCBI] | ||
| Taxonomic lineage | Eukaryota › Metazoa › Chordata › Craniata › Vertebrata › Euteleostomi › Mammalia › Eutheria › Euarchontoglires › Primates › Haplorrhini › Catarrhini › Hominidae › Homo |
Protein attributes
| Sequence length | 429 AA. |
| Sequence status | Complete. |
| Sequence processing | The displayed sequence is further processed into a mature form. |
| Protein existence | Evidence at protein level. |
General annotation (Comments)
| Catalytic activity | Hydrolysis of terminal, non-reducing alpha-D-galactose residues in alpha-D-galactosides, including galactose oligosaccharides, galactomannans and galactohydrolase. |
| Subunit structure | Homodimer. Ref.12 |
| Subcellular location | |
| Involvement in disease | Defects in GLA are the cause of Fabry disease (FD) [MIM:301500]. FD is a rare X-linked sphingolipidosis disease where glycolipid accumulates in many tissues. The disease consists of an inborn error of glycosphingolipid catabolism. FD patients show systemic accumulation of globotriaoslyceramide (Gb3) and related glycosphingolipids in the plasma and cellular lysosomes throughout the body. Clinical recognition in males results from characteristic skin lesions (angiokeratomas) over the lower trunk. Patients may show ocular deposits, febrile episodes, and burning pain in the extremities. Death results from renal failure, cardiac or cerebral complications of hypertension or other vascular disease. Heterozygous females may exhibit the disorder in an attenuated form, they are more likely to show corneal opacities. Ref.14 Ref.15 Ref.16 Ref.17 Ref.18 Ref.19 Ref.20 Ref.21 Ref.22 Ref.23 Ref.24 Ref.25 Ref.26 Ref.27 Ref.28 Ref.29 Ref.30 Ref.31 Ref.32 Ref.33 Ref.34 Ref.35 Ref.36 Ref.37 Ref.38 Ref.39 Ref.40 Ref.41 Ref.42 Ref.43 Ref.44 Ref.45 Ref.46 Ref.47 Ref.48 Ref.49 Ref.50 Ref.51 |
| Biotechnological use | Used to convert blood group antigens of type B into type O, the universal donor type. |
| Pharmaceutical use | Available under the names Replagal (Transkaryotic Therapies) and Fabrazyme (Genzyme). Used as a long-term enzyme replacement therapy in patients with a confirmed diagnosis of Fabry disease. |
| Sequence similarities | Belongs to the glycosyl hydrolase 27 family. |
| RNA editing |
Ontologies
Sequence annotation (Features)
| Feature key | Position(s) | Length | Description | Graphical view | Feature identifier | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule processing | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Signal peptide | 1 – 31 | 31 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Chain | 32 – 429 | 398 | Alpha-galactosidase A | PRO_0000001004 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Regions | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Region | 203 – 207 | 5 | Substrate binding | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sites | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Active site | 170 | 1 | Nucleophile By similarity | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Active site | 231 | 1 | Proton donor By similarity | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Amino acid modifications | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Glycosylation | 139 | 1 | N-linked (GlcNAc...) Ref.12 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Glycosylation | 192 | 1 | N-linked (GlcNAc...) Ref.12 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Glycosylation | 215 | 1 | N-linked (GlcNAc...) Ref.12 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Glycosylation | 408 | 1 | N-linked (GlcNAc...) Potential | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Disulfide bond | 52 ↔ 94 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Disulfide bond | 56 ↔ 63 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Disulfide bond | 142 ↔ 172 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Disulfide bond | 202 ↔ 223 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Disulfide bond | 378 ↔ 382 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Natural variations | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 20 | 1 | A → P in FD; atypical. Ref.26 Ref.33 Ref.38 | VAR_012362 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 31 | 1 | A → V in FD. Ref.34 | VAR_012363 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 32 | 1 | L → P in FD. Ref.25 | VAR_000431 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 34 | 1 | N → S in FD. Ref.19 Ref.20 Ref.25 | VAR_000432 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 35 | 1 | G → R in FD. Ref.21 | VAR_000433 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 40 | 1 | P → L in FD. Ref.14 Ref.33 Ref.38 Ref.44 | VAR_012364 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 40 | 1 | P → S in FD. Ref.14 Ref.33 Ref.38 Ref.44 | VAR_000434 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 42 | 1 | M → V in FD. Ref.28 Ref.42 | VAR_012365 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 45 – 46 | 2 | LH → RS in FD. Ref.34 Ref.46 | VAR_012366 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 46 | 1 | H → R in FD. Ref.34 Ref.46 | VAR_012367 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 46 | 1 | H → Y in FD. Ref.34 Ref.46 | VAR_012368 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 47 | 1 | W → G in FD. Ref.46 | VAR_012369 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 49 | 1 | R → L in FD. Ref.21 Ref.28 Ref.46 | VAR_000435 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 49 | 1 | R → P in FD. Ref.21 Ref.28 Ref.46 | VAR_012370 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 49 | 1 | R → S in FD. Ref.21 Ref.28 Ref.46 | VAR_012371 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 52 | 1 | C → R in FD. Ref.30 Ref.31 | VAR_000436 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 52 | 1 | C → S in FD. Ref.30 Ref.31 | VAR_000437 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 56 | 1 | C → F in FD. Ref.19 Ref.28 | VAR_000438 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 56 | 1 | C → G in FD. Ref.19 Ref.28 | VAR_000439 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 56 | 1 | C → Y in FD. Ref.19 Ref.28 | VAR_012372 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 59 | 1 | E → K in FD. | VAR_000440 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 65 | 1 | S → T in FD; does not affect enzyme function. Ref.35 Ref.49 | VAR_032290 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 66 | 1 | E → Q in FD. Ref.18 Ref.23 Ref.33 | VAR_000441 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 72 | 1 | M → V in FD; atypical. Ref.33 Ref.37 | VAR_000442 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 85 | 1 | G → D in FD. Ref.25 | VAR_000443 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 86 | 1 | Y → C in FD. Ref.34 | VAR_012373 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 89 | 1 | L → P in FD. Ref.34 | VAR_012374 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 89 | 1 | L → R in FD. Ref.34 | VAR_000444 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 91 | 1 | I → T in FD; mild. Ref.34 | VAR_012375 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 92 | 1 | D → H in FD. Ref.28 Ref.34 | VAR_012376 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 92 | 1 | D → Y in FD. Ref.28 Ref.34 | VAR_012377 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 93 | 1 | D → G in FD. Ref.28 | VAR_012378 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 94 | 1 | C → S in FD. Ref.34 Ref.46 | VAR_012379 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 94 | 1 | C → Y in FD. Ref.34 Ref.46 | VAR_012380 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 95 | 1 | W → S in FD. Ref.44 Ref.46 | VAR_012381 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 97 | 1 | A → V in FD. Ref.34 | VAR_012382 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 100 | 1 | R → K in FD. Ref.34 Ref.38 | VAR_000445 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 100 | 1 | R → T in FD. Ref.34 Ref.38 | VAR_012383 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 112 – 117 | 6 | Missing in FD. Ref.18 Ref.23 Ref.33 Ref.42 Ref.44 Ref.46 | VAR_000446 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 112 | 1 | R → C in FD. Ref.18 Ref.23 Ref.33 Ref.42 Ref.44 Ref.46 | VAR_000447 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 112 | 1 | R → H in FD; mild. Ref.18 Ref.23 Ref.33 Ref.42 Ref.44 Ref.46 | VAR_000448 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 113 | 1 | F → L in FD; mild. Ref.34 Ref.46 | VAR_012384 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 113 | 1 | F → S in FD. Ref.34 Ref.46 | VAR_012385 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 120 – 121 | 2 | LA → PT in FD. Ref.38 | VAR_000449 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 128 | 1 | G → E in FD. Ref.31 | VAR_000450 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 131 | 1 | L → P in FD. | VAR_000451 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 134 | 1 | Y → S in FD. Ref.34 | VAR_012386 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 138 | 1 | G → R in FD. Ref.34 | VAR_012387 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 142 | 1 | C → R in FD. Ref.24 Ref.33 Ref.42 | VAR_012388 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 142 | 1 | C → Y in FD. Ref.24 Ref.33 Ref.42 | VAR_000452 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 143 | 1 | A → P in FD. Ref.34 Ref.46 Ref.47 Ref.51 | VAR_000453 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 143 | 1 | A → T in FD. Ref.34 Ref.46 Ref.47 Ref.51 | VAR_012389 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 144 | 1 | G → V in FD. | VAR_000454 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 146 | 1 | P → S in FD; mild. | VAR_000455 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 148 | 1 | S → N in FD. Ref.34 Ref.42 Ref.44 | VAR_012390 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 148 | 1 | S → R in FD. Ref.34 Ref.42 Ref.44 | VAR_012391 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 156 | 1 | A → T in FD. Ref.23 Ref.24 Ref.25 Ref.33 | VAR_000456 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 156 | 1 | A → V in FD. Ref.23 Ref.24 Ref.25 Ref.33 | VAR_000457 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 162 | 1 | W → C in FD. Ref.19 Ref.30 | VAR_012392 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 162 | 1 | W → R in FD. Ref.19 Ref.30 | VAR_000458 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 163 | 1 | G → V in FD. Ref.34 | VAR_012393 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 165 | 1 | D → V in FD. Ref.21 Ref.42 | VAR_000459 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 166 | 1 | L → V in FD. Ref.23 Ref.24 Ref.33 | VAR_000460 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 170 | 1 | D → V in FD. Ref.34 Ref.38 | VAR_012394 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 172 | 1 | C → R in FD. Ref.44 | VAR_012395 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 172 | 1 | C → Y in FD. Ref.44 | VAR_000461 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 183 | 1 | G → D in FD. Ref.42 | VAR_012396 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 187 | 1 | M → V in FD. Ref.44 | VAR_012397 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 202 | 1 | C → W in FD. Ref.34 Ref.39 | VAR_000462 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 202 | 1 | C → Y in FD. Ref.34 Ref.39 | VAR_012398 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 205 – 207 | 3 | Missing in FD. Ref.28 Ref.31 Ref.34 | VAR_012399 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 205 | 1 | P → T in FD. Ref.28 Ref.31 | VAR_000463 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 215 | 1 | N → S in FD; mild. Ref.20 Ref.38 Ref.42 Ref.46 | VAR_000464 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 216 | 1 | Y → D in FD. Ref.34 | VAR_012400 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 219 | 1 | I → N in FD. | VAR_000465 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 223 | 1 | C → G in FD. Ref.39 | VAR_012401 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 224 | 1 | N → D in FD. Ref.38 Ref.39 Ref.44 | VAR_000466 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 224 | 1 | N → S in FD. Ref.38 Ref.39 Ref.44 | VAR_012402 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 226 | 1 | W → R in FD. Ref.44 | VAR_012403 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 227 | 1 | R → Q in FD. Ref.19 Ref.44 | VAR_000467 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 230 | 1 | A → T in FD. Ref.38 Ref.44 | VAR_012404 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 231 | 1 | D → N in FD. Ref.32 | VAR_000468 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 235 | 1 | S → C in FD. Ref.42 | VAR_012405 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 236 | 1 | W → C in FD. Ref.28 Ref.42 | VAR_012406 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 236 | 1 | W → L in FD. Ref.28 Ref.42 | VAR_012407 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 242 | 1 | I → N in FD. Ref.33 | VAR_012408 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 244 | 1 | D → H in FD. Ref.42 | VAR_012409 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 244 | 1 | D → N in FD. Ref.42 | VAR_000469 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 247 | 1 | S → SWTS in FD. | VAR_000470 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 258 | 1 | G → R in FD. Ref.46 | VAR_012410 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 259 | 1 | P → L in FD. Ref.42 Ref.46 | VAR_012411 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 259 | 1 | P → R in FD. Ref.42 Ref.46 | VAR_012412 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 260 | 1 | G → A in FD. Ref.23 Ref.33 Ref.38 | VAR_012413 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 261 | 1 | G → D in FD. Ref.33 | VAR_012414 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 263 | 1 | N → S in FD. Ref.34 | VAR_012415 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 264 | 1 | D → V in FD. dbSNP rs28935486. Ref.19 | VAR_000471 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 265 | 1 | P → R in FD. Ref.30 | VAR_012416 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 266 | 1 | D → H in FD. Ref.19 Ref.43 Ref.44 | VAR_032291 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 266 | 1 | D → N in FD. Ref.19 Ref.43 Ref.44 | VAR_012418 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 266 | 1 | D → V in FD. dbSNP rs28935487. Ref.19 Ref.43 Ref.44 | VAR_000472 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 267 | 1 | M → I in FD. Ref.42 Ref.46 | VAR_012419 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 269 | 1 | V → A in FD. dbSNP rs28935488. Ref.20 | VAR_000473 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 272 | 1 | N → K in FD. Ref.50 | VAR_000474 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 272 | 1 | N → S in FD. dbSNP rs28935495. Ref.50 | VAR_032292 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 279 | 1 | Q → E in FD; mild; does not significantly affect the enzyme activity but the mutant protein levels are decreased presumably in the ER of the cells. Ref.18 Ref.23 Ref.33 Ref.41 Ref.46 | VAR_000475 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 279 | 1 | Q → H in FD. Ref.18 Ref.23 Ref.33 Ref.41 Ref.46 | VAR_012420 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 280 | 1 | Q → H in FD. Ref.38 Ref.46 | VAR_012421 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 284 | 1 | M → T in FD. Ref.31 | VAR_000476 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 287 | 1 | W → C in FD. Ref.28 Ref.34 | VAR_012422 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 287 | 1 | W → G in FD. Ref.28 Ref.34 | VAR_012423 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 288 | 1 | A → D in FD. | VAR_000477 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 289 | 1 | I → F in FD. Ref.42 | VAR_012424 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 296 | 1 | M → I in FD; atypical. Ref.15 Ref.23 Ref.26 Ref.33 | VAR_012425 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 296 | 1 | M → V in FD; mild. Ref.15 Ref.23 Ref.26 Ref.33 | VAR_000478 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 297 | 1 | S → F in FD. dbSNP rs28935489. Ref.19 | VAR_000479 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 298 | 1 | N → H in FD. Ref.28 Ref.31 Ref.34 Ref.46 | VAR_012426 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 298 | 1 | N → K in FD. Ref.28 Ref.31 Ref.34 Ref.46 | VAR_000480 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 298 | 1 | N → S in FD. Ref.28 Ref.31 Ref.34 Ref.46 | VAR_012427 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 301 | 1 | R → Q in FD; mild; does not significantly affect the enzyme activity but the mutant protein levels are decreased presumably in the ER of the cells. Ref.16 Ref.18 Ref.23 Ref.25 Ref.27 Ref.33 Ref.39 Ref.41 Ref.44 | VAR_000481 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 313 | 1 | D → Y in FD. dbSNP rs28935490. Ref.19 Ref.38 Ref.46 | VAR_000482 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 316 – 322 | 7 | Missing in FD. Ref.21 Ref.30 | VAR_012429 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 316 | 1 | V → E in FD. Ref.21 | VAR_000483 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 320 | 1 | N → K in FD. Ref.23 Ref.33 Ref.38 Ref.44 | VAR_012430 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 320 | 1 | N → Y in FD. Ref.23 Ref.33 Ref.38 Ref.44 | VAR_012431 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 321 | 1 | Q → E in FD. Ref.42 | VAR_012432 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 327 | 1 | Q → K in FD. dbSNP rs28935491. Ref.20 Ref.39 | VAR_000484 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 328 | 1 | G → A in FD. Ref.18 Ref.19 Ref.23 Ref.33 | VAR_000486 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 328 | 1 | G → R in FD. Ref.18 Ref.19 Ref.23 Ref.33 | VAR_000485 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 340 | 1 | W → R in FD. Ref.28 Ref.38 | VAR_012433 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 341 | 1 | E → K in FD. Ref.40 | VAR_012434 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 342 | 1 | R → Q in FD; severe. dbSNP rs28935493. | VAR_000487 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 356 | 1 | R → W in FD; severe. Ref.17 | VAR_000488 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 358 | 1 | E → K in FD. Ref.31 Ref.33 Ref.36 Ref.42 | VAR_000489 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 358 | 1 | Missing in FD. Ref.31 Ref.33 Ref.36 Ref.42 | VAR_000490 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 361 | 1 | G → R in FD; severe. dbSNP rs28935494. Ref.20 | VAR_000491 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 363 | 1 | R → H in FD. Ref.46 | VAR_012435 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 373 | 1 | G → D in FD. Ref.23 Ref.33 Ref.45 | VAR_012436 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 373 | 1 | G → S in FD. Ref.23 Ref.33 Ref.45 | VAR_012437 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 377 | 1 | A → D in FD. Ref.46 | VAR_012438 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 378 | 1 | C → Y in FD. Ref.42 | VAR_012439 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 383 | 1 | Missing in FD; severe; with facial telangiectasias. Ref.29 | VAR_000492 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 396 | 1 | F → Y in RNA edited version. | VAR_000493 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 404 | 1 | Missing in FD; mild. Ref.19 Ref.34 | VAR_000494 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 409 | 1 | P → A in FD. Ref.46 | VAR_012440 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 409 | 1 | P → T in FD. Ref.46 | VAR_012441 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 410 | 1 | T → A in FD; mild. Ref.38 Ref.48 | VAR_032293 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Helix Strand Turn | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 42 – 46 | 5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 47 – 50 | 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 56 – 58 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 60 – 62 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 66 – 78 | 13 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 81 – 84 | 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 88 – 90 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 110 – 112 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 116 – 126 | 11 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 130 – 140 | 11 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 144 – 146 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 149 – 151 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 152 – 162 | 11 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 166 – 170 | 5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 177 – 194 | 18 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 199 – 202 | 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 204 – 208 | 5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 209 – 211 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 216 – 219 | 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 220 – 222 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 224 – 227 | 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 236 – 247 | 12 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 248 – 252 | 5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 253 – 256 | 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 261 – 264 | 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 272 – 274 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 277 – 289 | 13 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 294 – 296 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 305 – 312 | 8 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 314 – 320 | 7 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 329 – 332 | 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 334 – 343 | 10 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 345 – 355 | 11 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 359 – 361 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 363 – 369 | 7 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 370 – 372 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 374 – 376 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 379 – 383 | 5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 385 – 390 | 6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 396 – 400 | 5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 402 – 407 | 6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 412 – 419 | 8 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequences
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References
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Cross-references
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