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UniProtKB/Swiss-Prot P06132 (DCUP_HUMAN)
Last modified
November 3, 2009.
Version 123.
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Third-party data |
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Names and origin
| Protein names | Recommended name: Uroporphyrinogen decarboxylase Short name=URO-D Short name=UPD EC=4.1.1.37 | ||
| Gene names |
| ||
| Organism | Homo sapiens (Human) [Complete proteome] | ||
| Taxonomic identifier | 9606 [NCBI] | ||
| Taxonomic lineage | Eukaryota › Metazoa › Chordata › Craniata › Vertebrata › Euteleostomi › Mammalia › Eutheria › Euarchontoglires › Primates › Haplorrhini › Catarrhini › Hominidae › Homo |
Protein attributes
| Sequence length | 367 AA. |
| Sequence status | Complete. |
| Sequence processing | The displayed sequence is not processed. |
| Protein existence | Evidence at protein level. |
General annotation (Comments)
| Function | Catalyzes the decarboxylation of four acetate groups of uroporphyrinogen-III to yield coproporphyrinogen-III. |
| Catalytic activity | Uroporphyrinogen III = coproporphyrinogen + 4 CO2. |
| Pathway | |
| Subunit structure | |
| Subcellular location | |
| Involvement in disease | Defects in UROD are the cause of familial porphyria cutanea tarda (FPCT) [MIM:176100]; also known as porphyria cutanea tarda type II. FPCT is an autosomal dominant disorder characterized by light-sensitive dermatitis, with onset in later life. It is associated with the excretion of large amounts of uroporphyrin in the urine. Iron overload is often present in association with varying degrees of liver damage. Besides the familial form of PCT, a relatively common idiosyncratic form is known in which only the liver enzyme is reduced. This form is referred to as porphyria cutanea tarda "sporadic " type or type I [MIM:176090]. PCT type I occurs sporadically as an unusual accompaniment of common hepatic disorders such as alcohol-associated liver disease. Ref.12 Ref.16 Ref.19 Ref.23 Ref.24 Ref.25 Ref.26 Ref.27 Ref.28 Ref.29 Defects in UROD are the cause of hepatoerythropoietic porphyria (HEP) [MIM:176100]. HEP is a rare autosomal recessive disorder. It is the severe form of cutaneous porphyria, and presents in infancy. The level of UROD is very low in erythrocytes and cultured skin fibroblasts, suggesting that HEP is the homozygous state for porphyria cutanea tarda. Ref.24 Ref.2 Ref.18 Ref.20 Ref.21 Ref.22 Ref.30 Ref.31 |
| Sequence similarities | Belongs to the uroporphyrinogen decarboxylase family. |
Ontologies
| Keywords | |
|---|---|
| Biological process | Heme biosynthesis Porphyrin biosynthesis |
| Cellular component | Cytoplasm |
| Disease | Disease mutation |
| Molecular function | Decarboxylase Lyase |
| PTM | Acetylation Phosphoprotein |
| Technical term | 3D-structure Complete proteome Direct protein sequencing |
| Gene Ontology (GO) | |
| Biological process | heme biosynthetic process Inferred by curator. Source: UniProtKB |
| Cellular component | cytoplasm Inferred from electronic annotation. Source: UniProtKB-SubCell |
| Molecular function | uroporphyrinogen decarboxylase activity Ref.21 Inferred from direct assay. Source: UniProtKB |
| Complete GO annotation... | |
Sequence annotation (Features)
| Feature key | Position(s) | Length | Description | Graphical view | Feature identifier | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule processing | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Chain | 1 – 367 | 367 | Uroporphyrinogen decarboxylase | PRO_0000187569 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Regions | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Region | 37 – 41 | 5 | Substrate binding | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sites | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Binding site | 55 | 1 | Substrate | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Binding site | 85 | 1 | Substrate | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Binding site | 86 | 1 | Substrate | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Binding site | 164 | 1 | Substrate | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Binding site | 219 | 1 | Substrate | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Binding site | 339 | 1 | Substrate | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Site | 86 | 1 | Transition state stabilizer | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Amino acid modifications | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Modified residue | 1 | 1 | N-acetylmethionine | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Modified residue | 61 | 1 | Phosphoserine By similarity | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Natural variations | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 25 | 1 | G → E in FPCT; insoluble protein. Ref.16 | VAR_022567 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 46 | 1 | F → L in HEP; mild phenotype; strong decrease of activity. Ref.30 Ref.31 | VAR_022568 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 62 | 1 | P → L in HEP. Ref.2 | VAR_009103 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 80 | 1 | A → G in HEP. Ref.24 | VAR_007910 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 80 | 1 | A → S in FPCT; decrease of activity. Ref.16 Ref.28 | VAR_022569 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 134 | 1 | V → Q in FPCT and HEP; requires 2 nucleotide substitutions; nearly normal activity. Ref.16 Ref.26 Ref.28 Ref.22 | VAR_009104 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 142 | 1 | R → Q in FPCT. Ref.29 | VAR_010985 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 144 | 1 | R → P in FPCT; decrease of activity. Ref.28 | VAR_022570 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 156 | 1 | G → D in FPCT; decrease of activity. Ref.16 | VAR_022571 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 161 | 1 | L → Q in FPCT. Ref.29 | VAR_010986 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 165 | 1 | M → R in FPCT; activity < 2%. Ref.16 Ref.25 | VAR_007911 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 167 | 1 | E → K in HEP and FPCT; nearly normal activity. Ref.16 Ref.20 | VAR_007714 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 193 | 1 | R → P in FPCT; insoluble protein. Ref.16 | VAR_022572 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 195 | 1 | L → F in FPCT. Ref.25 | VAR_007912 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 216 | 1 | L → Q in FPCT. Ref.28 | VAR_022573 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 218 | 1 | E → K in FPCT; significant decrease of activity. Ref.28 | VAR_022574 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 219 | 1 | S → F in FPCT. Ref.29 | VAR_010987 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 220 | 1 | H → P in HEP; mild form. Ref.22 | VAR_009105 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 229 | 1 | F → L in FPCT. Ref.27 | VAR_009106 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 232 | 1 | F → L in FPCT; decrease of activity. Ref.16 | VAR_022575 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 235 | 1 | P → S in FPCT. Ref.29 | VAR_010988 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 253 | 1 | L → Q in FPCT; decrease of activity. Ref.16 Ref.24 | VAR_007913 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 260 | 1 | I → T in FPCT; decrease of activity. Ref.16 | VAR_022576 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 281 | 1 | G → E in FPTC and HEP. Ref.23 Ref.2 Ref.18 | VAR_007715 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 281 | 1 | G → V in FPCT. Ref.19 Ref.28 | VAR_007716 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 282 | 1 | L → R in FPCT. Ref.28 | VAR_022577 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 292 | 1 | R → G in HEP. Ref.21 | VAR_007717 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 303 | 1 | G → S in FPCT. Ref.28 | VAR_022578 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 304 | 1 | N → K in FPCT. Ref.25 | VAR_007914 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 311 | 1 | Y → C in HEP. Ref.2 | VAR_009107 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 318 | 1 | G → R in FPCT. Ref.24 Ref.28 | VAR_007915 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 324 | 1 | M → T in FPCT. Ref.27 | VAR_009108 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 332 | 1 | R → H in FPCT. Ref.25 | VAR_007916 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 334 | 1 | I → T in FPCT. Ref.24 | VAR_007917 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Experimental info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Mutagenesis | 86 | 1 | D → E: 5-10% of wild-type activity. Ref.17 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Mutagenesis | 86 | 1 | D → G: Very low activity. Binds substrate with similar geometry as wild-type. Ref.17 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Mutagenesis | 86 | 1 | D → N: No activity. Unable to bind substrate. Ref.17 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Mutagenesis | 164 | 1 | Y → F: 25-30% of wild-type activity. Ref.17 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence conflict | 77 | 1 | P → L Ref.2 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence conflict | 77 | 1 | P → L Ref.4 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence conflict | 103 | 1 | G → S in AAA61258. Ref.1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence conflict | 103 | 1 | G → S in AAB59456. Ref.12 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence conflict | 120 | 1 | R → A in AAA61258. Ref.1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence conflict | 120 | 1 | R → A in AAB59456. Ref.12 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence conflict | 212 – 214 | 3 | Missing in AAB59456. Ref.12 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence conflict | 303 | 1 | G → V in AAH01778. Ref.10 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Helix Strand Turn | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 18 – 23 | 6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 38 – 40 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 44 – 50 | 7 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 55 – 57 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 58 – 60 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 62 – 75 | 14 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 89 – 93 | 5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 102 – 104 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 115 – 120 | 6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 124 – 126 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 127 – 130 | 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 132 – 145 | 14 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 151 – 156 | 6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 158 – 167 | 10 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 175 – 183 | 9 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 185 – 208 | 24 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 212 – 218 | 7 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 221 – 223 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 226 – 232 | 7 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 234 – 250 | 17 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 258 – 262 | 5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 266 – 268 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 269 – 272 | 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 278 – 282 | 5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 288 – 295 | 8 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 297 – 303 | 7 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 307 – 311 | 5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 314 – 328 | 15 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 330 – 335 | 6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 337 – 339 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 347 – 363 | 17 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequences
| ||||||||||||||||||
References
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| [1] | "Molecular cloning and nucleotide sequence of a complete human uroporphyrinogen decarboxylase cDNA." Romeo P.-H., Raich N., Dubart A., Beaupain D., Pryor M., Kushner J.P., Cohen-Solal M., Goossens M. J. Biol. Chem. 261:9825-9831(1986) [PubMed: 3015909] [Abstract] Cited for: NUCLEOTIDE SEQUENCE [MRNA], PROTEIN SEQUENCE OF 2-21; 37-65; 101-123; 175-251; 259-322; 325-344 AND 346-367. |
| [2] | "Uroporphyrinogen decarboxylase: complete human gene sequence and molecular study of three families with hepatoerythropoietic porphyria." Moran-Jimenez M.J., Ged C., Romana M., de Salamanca R.E., Taieb A., Topi G., D'Alessandro L., de Verneuil H. Am. J. Hum. Genet. 58:712-721(1996) [PubMed: 8644733] [Abstract] Cited for: NUCLEOTIDE SEQUENCE [GENOMIC DNA], VARIANTS HEP LEU-62; GLU-281 AND CYS-311. |
| [3] | Mendez M. Submitted (FEB-1998) to the EMBL/GenBank/DDBJ databases Cited for: NUCLEOTIDE SEQUENCE [GENOMIC DNA]. |
| [4] | "Uroporphyrinogen decarboxylase (UROD) cDNA sequence from Italian population." Martinez di Montemuros F., Fiorelli G., Cappellini M.D. Submitted (NOV-1998) to the EMBL/GenBank/DDBJ databases Cited for: NUCLEOTIDE SEQUENCE [MRNA]. |
| [5] | "Cloning of human full open reading frames in Gateway(TM) system entry vector (pDONR201)." Ebert L., Schick M., Neubert P., Schatten R., Henze S., Korn B. Submitted (JUN-2004) to the EMBL/GenBank/DDBJ databases Cited for: NUCLEOTIDE SEQUENCE [LARGE SCALE MRNA]. |
| [6] | "Cloning of human full open reading frames in Gateway(TM) system entry vector (pDONR201)." Halleck A., Ebert L., Mkoundinya M., Schick M., Eisenstein S., Neubert P., Kstrang K., Schatten R., Shen B., Henze S., Mar W., Korn B., Zuo D., Hu Y., LaBaer J. Submitted (JUN-2004) to the EMBL/GenBank/DDBJ databases Cited for: NUCLEOTIDE SEQUENCE [LARGE SCALE MRNA]. |
| [7] | "Complete sequencing and characterization of 21,243 full-length human cDNAs." Ota T., Suzuki Y., Nishikawa T., Otsuki T., Sugiyama T., Irie R., Wakamatsu A., Hayashi K., Sato H., Nagai K., Kimura K., Makita H., Sekine M., Obayashi M., Nishi T., Shibahara T., Tanaka T., Ishii S. Sugano S.Nat. Genet. 36:40-45(2004) [PubMed: 14702039] [Abstract] Cited for: NUCLEOTIDE SEQUENCE [LARGE SCALE MRNA]. Tissue: Skeletal muscle. |
| [8] | "The DNA sequence and biological annotation of human chromosome 1." Gregory S.G., Barlow K.F., McLay K.E., Kaul R., Swarbreck D., Dunham A., Scott C.E., Howe K.L., Woodfine K., Spencer C.C.A., Jones M.C., Gillson C., Searle S., Zhou Y., Kokocinski F., McDonald L., Evans R., Phillips K. Bentley D.R.Nature 441:315-321(2006) [PubMed: 16710414] [Abstract] Cited for: NUCLEOTIDE SEQUENCE [LARGE SCALE GENOMIC DNA]. |
| [9] | Mural R.J., Istrail S., Sutton G.G., Florea L., Halpern A.L., Mobarry C.M., Lippert R., Walenz B., Shatkay H., Dew I., Miller J.R., Flanigan M.J., Edwards N.J., Bolanos R., Fasulo D., Halldorsson B.V., Hannenhalli S., Turner R. Venter J.C.Submitted (SEP-2005) to the EMBL/GenBank/DDBJ databases Cited for: NUCLEOTIDE SEQUENCE [LARGE SCALE GENOMIC DNA]. |
| [10] | "The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC)." The MGC Project Team Genome Res. 14:2121-2127(2004) [PubMed: 15489334] [Abstract] Cited for: NUCLEOTIDE SEQUENCE [LARGE SCALE MRNA]. Tissue: Lymph. |
| [11] | "Structure of the gene for human uroporphyrinogen decarboxylase." Romana M., Dubart A., Beaupain D., Chabret C., Goossens M., Romeo P.-H. Nucleic Acids Res. 15:7343-7356(1987) [PubMed: 3658695] [Abstract] Cited for: NUCLEOTIDE SEQUENCE [GENOMIC DNA] OF 1-7. |
| [12] | "Uroporphyrinogen decarboxylase: a splice site mutation causes the deletion of exon 6 in multiple families with porphyria cutanea tarda." Garey J.R., Harrison L.M., Franklin K.F., Metcalf K.M., Radisky E.S., Kushner J.P. J. Clin. Invest. 86:1416-1422(1990) [PubMed: 2243121] [Abstract] Cited for: NUCLEOTIDE SEQUENCE [GENOMIC DNA] OF 95-258, INVOLVEMENT IN FPCT. |
| [13] | "Characterization and crystallization of human uroporphyrinogen decarboxylase." Phillips J.D., Whitby F.G., Kushner J.P., Hill C.P. Protein Sci. 6:1343-1346(1997) [PubMed: 9194196] [Abstract] Cited for: CRYSTALLIZATION, MASS SPECTROMETRY, SUBUNIT. |
| [14] | Colinge J., Superti-Furga G., Bennett K.L. Submitted (OCT-2008) to UniProtKB Cited for: IDENTIFICATION [LARGE SCALE ANALYSIS], MASS SPECTROMETRY. |
| [15] | "Crystal structure of human uroporphyrinogen decarboxylase." Whitby F.G., Phillips J.D., Kushner J.P., Hill C.P. EMBO J. 17:2463-2471(1998) [PubMed: 9564029] [Abstract] Cited for: X-RAY CRYSTALLOGRAPHY (1.6 ANGSTROMS), SUBUNIT. |
| [16] | "Functional consequences of naturally occurring mutations in human uroporphyrinogen decarboxylase." Phillips J.D., Parker T.L., Schubert H.L., Whitby F.G., Hill C.P., Kushner J.P. Blood 98:3179-3185(2001) [PubMed: 11719352] [Abstract] Cited for: X-RAY CRYSTALLOGRAPHY (2.1 ANGSTROMS) OF VARIANTS FPCT ASP-156; LEU-232 AND THR-260, VARIANTS FPCT GLU-25; SER-80; GLN-134; ASP-156; ARG-165; LYS-167; PRO-193; LEU-232; GLN-253 AND THR-260, CHARACTERIZATION OF VARIANTS FPCT GLU-25; SER-80; GLN-134; ASP-156; ARG-165; LYS-167; PRO-193; LEU-232; GLN-253 AND THR-260. |
| [17] | "Structural basis for tetrapyrrole coordination by uroporphyrinogen decarboxylase." Phillips J.D., Whitby F.G., Kushner J.P., Hill C.P. EMBO J. 22:6225-6233(2003) [PubMed: 14633982] [Abstract] Cited for: X-RAY CRYSTALLOGRAPHY (1.65 ANGSTROMS) OF WILD-TYPE AND MUTANTS ASN-86; GLU-86; GLY-86 AND PHE-164 IN COMPLEX WITH SUBSTRATE ANALOGS, MUTAGENESIS OF ASP-86 AND TYR-164, REACTION MECHANISM. |
| [18] | "Uroporphyrinogen decarboxylase structural mutant (Gly-281-->Glu) in a case of porphyria." de Verneuil H., Grandchamp B., Beaumont C., Picat C., Nordmann Y. Science 234:732-734(1986) [PubMed: 3775362] [Abstract] Cited for: VARIANT HEP GLU-281. |
| [19] | "A point mutation in the coding region of uroporphyrinogen decarboxylase associated with familial porphyria cutanea tarda." Garey J.R., Hansen J.L., Harrison L.M., Kennedy J.B., Kushner J.P. Blood 73:892-895(1989) [PubMed: 2920211] [Abstract] Cited for: VARIANT FPCT VAL-281. |
| [20] | "Identification of a new mutation responsible for hepatoerythropoietic porphyria." Romana M., Grandchamp B., Dubart A., Amselem S., Chabret C., Nordmann Y., Goossens M., Romeo P.-H. Eur. J. Clin. Invest. 21:225-229(1991) [PubMed: 1905636] [Abstract] Cited for: VARIANT HEP LYS-167. |
| [21] | "Characterization of a new mutation (R292G) and a deletion at the human uroporphyrinogen decarboxylase locus in two patients with hepatoerythropoietic porphyria." de Verneuil H., Bourgeois F., de Rooij F.W.M., Siersema P.D., Wilson J.H.P., Grandchamp B., Nordmann Y. Hum. Genet. 89:548-552(1992) [PubMed: 1634232] [Abstract] Cited for: VARIANT HEP GLY-292. |
| [22] | "Molecular defects of uroporphyrinogen decarboxylase in a patient with mild hepatoerythropoietic porphyria." Meguro K., Fujita H., Ishida N., Akagi R., Kurihara T., Galbraith R.A., Kappas A., Zabriskie J.B., Toback A.C., Harber L.C., Sassa S. J. Invest. Dermatol. 102:681-685(1994) [PubMed: 8176248] [Abstract] Cited for: VARIANTS HEP GLN-134 AND PRO-220. |
| [23] | "A mutation 'G281E' of the human uroporphyrinogen decarboxylase gene causes both hepatoerythropoietic porphyria and overt familial porphyria cutanea tarda: biochemical and genetic studies on Spanish patients." Roberts A.G., Elder G.H., de Salamanca R.E., Herrero C., Lecha M., Mascaro J.M. J. Invest. Dermatol. 104:500-502(1995) [PubMed: 7706766] [Abstract] Cited for: VARIANT FPCT/HEP GLU-281. |
| [24] | "Five new mutations in the uroporphyrinogen decarboxylase gene identified in families with cutaneous porphyria." McManus J.F., Begley C.G., Sassa S., Ratnaike S. Blood 88:3589-3600(1996) [PubMed: 8896428] [Abstract] Cited for: VARIANT HEP GLY-80, VARIANTS FPCT GLN-253; ARG-318 AND THR-334. |
| [25] | "Familial porphyria cutanea tarda: characterization of seven novel uroporphyrinogen decarboxylase mutations and frequency of common hemochromatosis alleles." Mendez M., Sorkin L., Rossetti M.V., Astrin K.H., Batlle A.M.C., Parera V.E., Aizencang G.I., Desnick R.J. Am. J. Hum. Genet. 63:1363-1375(1998) [PubMed: 9792863] [Abstract] Cited for: VARIANTS FPCT ARG-165; PHE-195; LYS-304 AND HIS-332. |
| [26] | "Three new mutations in the uroporphyrinogen decarboxylase gene in familial porphyria cutanea tarda." McManus J.F., Begley C.G., Sassa S., Ratnaike S. Hum. Mutat. 13:412-412(1999) [PubMed: 10338097] [Abstract] Cited for: VARIANT FPCT GLN-134. |
| [27] | "Screening for mutations in the uroporphyrinogen decarboxylase gene using denaturing gradient gel electrophoresis. Identification and characterization of six novel mutations associated with familial PCT." Christiansen L., Ged C., Hombrados I., Broens-Poulsen J., Fontanellas A., de Verneuil H., Hoerder M., Petersen N.E. Hum. Mutat. 14:222-232(1999) [PubMed: 10477430] [Abstract] Cited for: VARIANTS FPCT LEU-229 AND THR-324. |
| [28] | "Co-inheritance of mutations in the uroporphyrinogen decarboxylase and hemochromatosis genes accelerates the onset of porphyria cutanea tarda." Brady J.J., Jackson H.A., Roberts A.G., Morgan R.R., Whatley S.D., Rowlands G.L., Darby C., Shudell E., Watson R., Paiker J., Worwood M.W., Elder G.H. J. Invest. Dermatol. 115:868-874(2000) [PubMed: 11069625] [Abstract] Cited for: VARIANTS FPCT SER-80; GLN-134; PRO-144; GLN-216; LYS-218; VAL-281; ARG-282; SER-303 AND ARG-318, CHARACTERIZATION OF VARIANTS FPCT PRO-144 AND LYS-218. |
| [29] | "Seven novel point mutations in the uroporphyrinogen decarboxylase (UROD) gene in patients with familial porphyria cutanea tarda (f-PCT)." Cappellini M.D., Martinez Di Montemuros F., Tavazzi D., Fargion S., Pizzuti A., Comino A., Cainelli T., Fiorelli G. Hum. Mutat. 17:350-350(2001) [PubMed: 11295834] [Abstract] Cited for: VARIANTS FPCT GLN-142; GLN-161; PHE-219 AND SER-235. |
| [30] | "Description of a new mutation in hepatoerythropoietic porphyria and prenatal exclusion of a homozygous fetus." Ged C., Ozalla D., Herrero C., Lecha M., Mendez M., de Verneuil H., Mascaro J.M. Arch. Dermatol. 138:957-960(2002) [PubMed: 12071824] [Abstract] Cited for: VARIANT HEP LEU-46, CHARACTERIZATION OF VARIANT HEP LEU-46. |
| [31] | "Hepatoerythropoietic porphyria: a missense mutation in the UROD gene is associated with mild disease and an unusual porphyrin excretion pattern." Armstrong D.K.B., Sharpe P.C., Chambers C.R., Whatley S.D., Roberts A.G., Elder G.H. Br. J. Dermatol. 151:920-923(2004) [PubMed: 15491440] [Abstract] Cited for: VARIANT HEP LEU-46. |
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Cross-references
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Other Resources | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Entry information
| Entry name | DCUP_HUMAN | ||||||||
| Accession | Primary (citable) accession number: P06132 Secondary accession number(s): A8K762 Q9BUZ0 | ||||||||
| Entry history |
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| Entry status | Reviewed (UniProtKB/Swiss-Prot) | ||||||||
| Annotation project | HPI (Human Proteome Initiative) | ||||||||
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Relevant documents
| Human chromosome 1 Human chromosome 1: entries, gene names and cross-references to MIM |
| Human entries with polymorphisms or disease mutations List of human entries with polymorphisms or disease mutations |
| Human polymorphisms and disease mutations Index of human polymorphisms and disease mutations |
| MIM cross-references Online Mendelian Inheritance in Man (MIM) cross-references in UniProtKB/Swiss-Prot |
| PATHWAY comments Index of metabolic and biosynthesis pathways |
| PDB cross-references Index of Protein Data Bank (PDB) cross-references |
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