P05455 (LA_HUMAN) Reviewed, UniProtKB/Swiss-Prot
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May 1, 2013.
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| Protein names | Recommended name: Lupus La protein Alternative name(s): La autoantigen La ribonucleoprotein Sjoegren syndrome type B antigen Short name=SS-B | ||
| Gene names |
| ||
| Organism | Homo sapiens (Human) [Reference proteome] | ||
| Taxonomic identifier | 9606 [NCBI] | ||
| Taxonomic lineage | Eukaryota › Metazoa › Chordata › Craniata › Vertebrata › Euteleostomi › Mammalia › Eutheria › Euarchontoglires › Primates › Haplorrhini › Catarrhini › Hominidae › Homo![]() |
Protein attributes
| Sequence length | 408 AA. |
| Sequence status | Complete. |
| Protein existence | Evidence at protein level |
General annotation (Comments)
| Function | Binds to the 3' poly(U) terminii of nascent RNA polymerase III transcripts, protecting them from exonuclease digestion and facilitating their folding and maturation. Ref.2 Ref.10 |
| Subunit structure | Interacts with DDX15. May interact with RUFY1. Ref.12 Ref.13 |
| Subcellular location | Nucleus Probable. |
| Post-translational modification | Phosphorylated. The phosphorylation sites are at the C-terminal part of the protein. Ref.11 The N-terminus is blocked. |
| Miscellaneous | Sera from patients with systemic lupus erythematosus (SLE) often contain antibodies that react with the normal cellular La protein as if this antigen was foreign. |
| Sequence similarities | Contains 1 HTH La-type RNA-binding domain. Contains 1 RRM (RNA recognition motif) domain. |
Ontologies
| Keywords | |
|---|---|
| Cellular component | Nucleus |
| Coding sequence diversity | Polymorphism |
| Disease | Systemic lupus erythematosus |
| Ligand | RNA-binding |
| PTM | Acetylation Phosphoprotein |
| Technical term | 3D-structure Complete proteome Reference proteome |
| Gene Ontology (GO) | |
| Biological_process | histone mRNA metabolic process Traceable author statement PubMed 9154801. Source: ProtInc tRNA modificationTraceable author statement PubMed 10983981. Source: ProtInc |
| Cellular_component | nucleus Inferred from electronic annotation. Source: UniProtKB-SubCell ribonucleoprotein complexTraceable author statement Ref.2. Source: ProtInc |
| Molecular_function | mRNA binding Traceable author statement PubMed 9154801. Source: ProtInc nucleotide bindingInferred from electronic annotation. Source: InterPro tRNA bindingTraceable author statement PubMed 10983981. Source: ProtInc |
| Complete GO annotation... | |
Sequence annotation (Features)
| Feature key | Position(s) | Length | Description | Graphical view | Feature identifier | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule processing | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Chain | 1 – 408 | 408 | Lupus La protein | PRO_0000207599 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Regions | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Domain | 7 – 99 | 93 | HTH La-type RNA-binding | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Domain | 111 – 187 | 77 | RRM | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Amino acid modifications | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Modified residue | 116 | 1 | N6-acetyllysine Ref.19 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Modified residue | 128 | 1 | N6-acetyllysine Ref.19 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Modified residue | 328 | 1 | N6-acetyllysine Ref.19 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Modified residue | 360 | 1 | N6-acetyllysine Ref.19 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Modified residue | 366 | 1 | Phosphoserine; by CK2 Ref.11 Ref.14 Ref.15 Ref.16 Ref.17 Ref.18 Ref.20 Ref.22 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Natural variations | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 48 | 1 | P → S. Corresponds to variant rs17160793 [ dbSNP | Ensembl ]. | VAR_034066 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Experimental info | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence conflict | 54 | 1 | K → E in AAA36577. Ref.8 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Secondary structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Helix Strand Turn | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 11 – 24 | 14 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 27 – 29 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 30 – 32 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 34 – 42 | 9 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 43 – 45 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 46 – 48 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 49 – 52 | 4 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 56 – 61 | 6 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 65 – 73 | 9 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 80 – 82 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 86 – 91 | 6 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 102 – 110 | 9 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 112 – 116 | 5 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 124 – 131 | 8 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 132 – 134 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 137 – 144 | 8 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 146 – 148 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 150 – 160 | 11 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 161 – 169 | 9 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 174 – 177 | 4 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 181 – 184 | 4 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 185 – 187 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 233 – 239 | 7 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 246 – 252 | 7 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 259 – 263 | 5 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 269 – 277 | 9 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 279 – 288 | 10 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 289 – 291 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 298 – 304 | 7 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 308 – 326 | 19 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequences
| ||||||||||||||||||
References
| « Hide 'large scale' references | |
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| + | Additional computationally mapped references. |
Cross-references
Sequence databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| EMBL GenBank DDBJ | X13697 mRNA. Translation: CAA31985.1. J04205 mRNA. Translation: AAA51885.1. BT009862 mRNA. Translation: AAP88864.1. AB451228 mRNA. Translation: BAG70042.1. AC009967 Genomic DNA. Translation: AAY14868.1. CH471058 Genomic DNA. Translation: EAX11258.1. CH471058 Genomic DNA. Translation: EAX11259.1. BC001289 mRNA. Translation: AAH01289.1. BC020818 mRNA. Translation: AAH20818.1. M20328 mRNA. Translation: AAA36577.1. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IPI | IPI00009032. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| PIR | A31888. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| RefSeq | NP_003133.1. NM_003142.4. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| UniGene | Hs.632535. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3D structure databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| PDBe RCSB PDB PDBj |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| DisProt | DP00229. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| ProteinModelPortal | P05455. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| SMR | P05455. Positions 10-188, 225-334. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| ModBase | Search... | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Protein-protein interaction databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| DIP | DIP-29750N. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IntAct | P05455. 19 interactions. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MINT | MINT-5002383. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| STRING | 9606.ENSP00000260956. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PTM databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| PhosphoSite | P05455. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Polymorphism databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| DMDM | 125985. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Proteomic databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| PaxDb | P05455. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| PeptideAtlas | P05455. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| PRIDE | P05455. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Protocols and materials databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| DNASU | 6741. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| StructuralBiologyKnowledgebase | Search... | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome annotation databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Ensembl | ENST00000260956; ENSP00000260956; ENSG00000138385. ENST00000409333; ENSP00000386636; ENSG00000138385. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GeneID | 6741. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| KEGG | hsa:6741. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| UCSC | uc002ufk.3. human. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Organism-specific databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| CTD | 6741. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GeneCards | GC02P170619. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| HGNC | HGNC:11316. SSB. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| HPA | CAB004643. HPA012385. HPA017287. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MIM | 109090. gene. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| neXtProt | NX_P05455. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| PharmGKB | PA36140. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GenAtlas | Search... | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Phylogenomic databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| eggNOG | COG5193. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| HOGENOM | HOG000006947. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| HOVERGEN | HBG001407. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| InParanoid | P05455. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| KO | K11090. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| OMA | ENAEMKS. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| OrthoDB | EOG4C2HB3. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| PhylomeDB | P05455. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene expression databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| ArrayExpress | P05455. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Bgee | P05455. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| CleanEx | HS_SSB. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genevestigator | P05455. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GermOnline | ENSG00000138385. Homo sapiens. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Family and domain databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Gene3D | 1.10.10.10. 1 hit. 3.30.70.330. 2 hits. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| PROSITE | PS50961. HTH_LA. 1 hit. PS50102. RRM. 1 hit. [Graphical view] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| ProtoNet | Search... | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Other | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| EvolutionaryTrace | P05455. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GenomeRNAi | 6741. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| NextBio | 26296. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| PMAP-CutDB | P05455. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| SOURCE | Search... | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry information
| Entry name | LA_HUMAN | ||||||||
| Accession | Primary (citable) accession number: P05455 Secondary accession number(s): Q15367, Q53XJ4 | ||||||||
| Entry history |
| ||||||||
| Entry status | Reviewed (UniProtKB/Swiss-Prot) | ||||||||
| Annotation program | Chordata Protein Annotation Program | ||||||||
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