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UniProtKB/Swiss-Prot P05362 (ICAM1_HUMAN)
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July 7, 2009.
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Third-party data |
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Names and origin
| Protein names | Recommended name: Intercellular adhesion molecule 1 Short name=ICAM-1 Alternative name(s): Major group rhinovirus receptor CD_antigen=CD54 | ||
| Gene names |
| ||
| Organism | Homo sapiens (Human) [Complete proteome] | ||
| Taxonomic identifier | 9606 [NCBI] | ||
| Taxonomic lineage | Eukaryota › Metazoa › Chordata › Craniata › Vertebrata › Euteleostomi › Mammalia › Eutheria › Euarchontoglires › Primates › Haplorrhini › Catarrhini › Hominidae › Homo |
Protein attributes
| Sequence length | 532 AA. |
| Sequence status | Complete. |
| Sequence processing | The displayed sequence is further processed into a mature form. |
| Protein existence | Evidence at protein level. |
General annotation (Comments)
| Function | ICAM proteins are ligands for the leukocyte adhesion protein LFA-1 (integrin alpha-L/beta-2). During leukocyte trans-endothelial migration, ICAM1 engagement promotes the assembly of endothelial apical cups through SGEF and RHOG activation. In case of rhinovirus infection acts as a cellular receptor for the virus. Ref.10 Ref.11 Ref.12 Ref.16 |
| Subunit structure | Homodimer Probable. Interacts with human herpesvirus 8 MIR2 protein Probable. Interacts with MUC1 and promotes cell aggregation in epithelial cells. Interacts with SGEF. Binds to coxsackievirus A21 capsid proteins and acts as a receptor for this virus. |
| Subcellular location | |
| Post-translational modification | Monoubiquitinated, which is promoted by MARCH9 and leads to endocytosis. |
| Polymorphism | Homozygotes with ICAM1-Kalifi Met-56 seem to have an increased risk for cerebral malaria. |
| Sequence similarities | Belongs to the immunoglobulin superfamily. ICAM family. Contains 5 Ig-like C2-type (immunoglobulin-like) domains. |
Ontologies
Sequence annotation (Features)
| Feature key | Position(s) | Length | Description | Graphical view | Feature identifier | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule processing | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Signal peptide | 1 – 27 | 27 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Chain | 28 – 532 | 505 | Intercellular adhesion molecule 1 | PRO_0000014783 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Regions | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Topological domain | 28 – 480 | 453 | Extracellular Potential | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Transmembrane | 481 – 503 | 23 | Potential | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Topological domain | 504 – 532 | 29 | Cytoplasmic Potential | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Domain | 41 – 103 | 63 | Ig-like C2-type 1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Domain | 128 – 193 | 66 | Ig-like C2-type 2 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Domain | 230 – 297 | 68 | Ig-like C2-type 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Domain | 325 – 378 | 54 | Ig-like C2-type 4 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Domain | 412 – 464 | 53 | Ig-like C2-type 5 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motif | 152 – 154 | 3 | Cell attachment site; atypical Potential | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Amino acid modifications | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Modified residue | 521 | 1 | Phosphothreonine Ref.17 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Modified residue | 530 | 1 | Phosphothreonine Ref.17 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Glycosylation | 130 | 1 | N-linked (GlcNAc...) Ref.24 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Glycosylation | 145 | 1 | N-linked (GlcNAc...) Ref.24 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Glycosylation | 183 | 1 | N-linked (GlcNAc...) Ref.24 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Glycosylation | 202 | 1 | N-linked (GlcNAc...) Ref.24 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Glycosylation | 260 | 1 | N-linked (GlcNAc...) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Glycosylation | 267 | 1 | N-linked (GlcNAc...) Ref.14 Ref.25 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Glycosylation | 296 | 1 | N-linked (GlcNAc...) Ref.25 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Glycosylation | 385 | 1 | N-linked (GlcNAc...) Ref.25 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Glycosylation | 406 | 1 | N-linked (GlcNAc...) Potential | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Disulfide bond | 48 ↔ 92 | Ref.24 Ref.25 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Disulfide bond | 52 ↔ 96 | Ref.24 Ref.25 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Disulfide bond | 135 ↔ 186 | Ref.24 Ref.25 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Disulfide bond | 237 ↔ 290 | Ref.24 Ref.25 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Disulfide bond | 332 ↔ 371 | Ref.24 Ref.25 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Disulfide bond | 403 ↔ 419 | Ref.24 Ref.25 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Disulfide bond | 431 ↔ 457 | Ref.24 Ref.25 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Natural variations | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 34 | 1 | S → C: dbSNP rs5491. | VAR_049879 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 56 | 1 | K → M in Kilifi. dbSNP rs5491. | VAR_010204 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 155 | 1 | K → N: dbSNP rs5492. | VAR_014651 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 241 | 1 | G → R: dbSNP rs1799969. Ref.6 Ref.27 Ref.28 | VAR_014186 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 315 | 1 | V → M: dbSNP rs5495. | VAR_014652 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 352 | 1 | P → L: dbSNP rs1801714. Ref.6 | VAR_014653 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 397 | 1 | R → Q: dbSNP rs5497. Ref.6 | VAR_014654 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 469 | 1 | K → E: dbSNP rs5498. Ref.27 Ref.1 Ref.2 Ref.4 Ref.9 Ref.30 | VAR_014187 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 478 | 1 | R → W: dbSNP rs5030400. Ref.6 | VAR_016267 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Experimental info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence conflict | 9 – 10 | 2 | AL → PV in CAA40441. Ref.8 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence conflict | 17 | 1 | L → F in AAQ14902. Ref.9 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence conflict | 27 | 1 | A → V in AAQ14902. Ref.9 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Helix Strand Turn | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 29 – 39 | 11 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 42 – 50 | 9 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 52 – 54 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 56 – 61 | 6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 66 – 69 | 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 71 – 84 | 14 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 91 – 95 | 5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 100 – 104 | 5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 106 – 111 | 6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 114 – 118 | 5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 123 – 125 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 129 – 138 | 10 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 143 – 145 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 146 – 152 | 7 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 155 – 161 | 7 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 164 – 166 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 167 – 174 | 8 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 183 – 191 | 9 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 193 – 195 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 199 – 203 | 5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 220 – 222 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 225 – 228 | 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 231 – 241 | 11 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 245 – 247 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 249 – 254 | 6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 262 – 266 | 5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 269 – 277 | 9 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 280 – 282 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 284 – 294 | 11 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 297 – 308 | 12 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 314 – 318 | 5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 320 – 323 | 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 327 – 333 | 7 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 353 – 359 | 7 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 362 – 364 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 368 – 377 | 10 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 380 – 389 | 10 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 391 – 397 | 7 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 405 – 410 | 6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 422 – 425 | 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 428 – 433 | 6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 434 – 436 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 449 – 451 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 453 – 461 | 9 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 464 – 475 | 12 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequences
| ||||||||||||||||||
References
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| [1] | "ICAM, an adhesion ligand of LFA-1, is homologous to the neural cell adhesion molecule NCAM." Simmons D., Makgoba M.W., Seed B. Nature 331:624-627(1988) [PubMed: 3340213] [Abstract] Cited for: NUCLEOTIDE SEQUENCE [MRNA], VARIANT GLU-469. |
| [2] | "Primary structure of ICAM-1 demonstrates interaction between members of the immunoglobulin and integrin supergene families." Staunton D.E., Marlin S.D., Stratowa C., Dustin M.L., Springer T.A. Cell 52:925-933(1988) [PubMed: 3349522] [Abstract] Cited for: NUCLEOTIDE SEQUENCE [MRNA], VARIANT GLU-469. |
| [3] | "cDNA cloning reveals that the major group rhinovirus receptor on HeLa cells is intercellular adhesion molecule 1." Tomassini J.E., Graham D., Dewitt C.M., Lineberger D.W., Rodkey J.A., Colonno R.J. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 86:4907-4911(1989) [PubMed: 2544880] [Abstract] Cited for: NUCLEOTIDE SEQUENCE [MRNA]. |
| [4] | "Cloning of the human gene for intercellular adhesion molecule 1 and analysis of its 5'-regulatory region. Induction by cytokines and phorbol ester." Voraberger G.F., Schaefer R., Stratowa C. J. Immunol. 147:2777-2786(1991) [PubMed: 1680919] [Abstract] Cited for: NUCLEOTIDE SEQUENCE [GENOMIC DNA], VARIANT GLU-469. |
| [5] | "Cloning of human full-length CDSs in BD Creator(TM) system donor vector." Kalnine N., Chen X., Rolfs A., Halleck A., Hines L., Eisenstein S., Koundinya M., Raphael J., Moreira D., Kelley T., LaBaer J., Lin Y., Phelan M., Farmer A. Submitted (MAY-2003) to the EMBL/GenBank/DDBJ databases Cited for: NUCLEOTIDE SEQUENCE [LARGE SCALE MRNA]. |
| [6] | SeattleSNPs variation discovery resource Submitted (JAN-2003) to the EMBL/GenBank/DDBJ databases Cited for: NUCLEOTIDE SEQUENCE [GENOMIC DNA], VARIANT KILIFI MET-56, VARIANTS ARG-241; LEU-352; GLN-397 AND TRP-478. |
| [7] | "The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC)." The MGC Project Team Genome Res. 14:2121-2127(2004) [PubMed: 15489334] [Abstract] Cited for: NUCLEOTIDE SEQUENCE [LARGE SCALE MRNA]. Tissue: Kidney. |
| [8] | "Structural characteristics of the 5' region of the human ICAM-1 gene." Stade B.G., Messer G., Riethmueller G., Johnson J.P. Immunobiology 182:79-87(1990) [PubMed: 1983003] [Abstract] Cited for: NUCLEOTIDE SEQUENCE [GENOMIC DNA] OF 1-22. |
| [9] | "The potential significance of adaptive evolution and dimerization in chimpanzee intercellular cell adhesion molecules (ICAMs)." Walter N.A.R., Stebbing J., Messier W. J. Theor. Biol. 232:339-346(2005) [PubMed: 15572059] [Abstract] Cited for: NUCLEOTIDE SEQUENCE [MRNA] OF 5-532, VARIANT GLU-469. Tissue: Blood. |
| [10] | "The major human rhinovirus receptor is ICAM-1." Greve J.M., Davis G., Meyer A.M., Forte C.P., Yost S.C., Marlor C.W., Kamarck M.E., McClelland A. Cell 56:839-847(1989) [PubMed: 2538243] [Abstract] Cited for: PARTIAL PROTEIN SEQUENCE, FUNCTION AS A RHINOVIRUS RECEPTOR. |
| [11] | "A soluble form of intercellular adhesion molecule-1 inhibits rhinovirus infection." Marlin S.D., Staunton D.E., Springer T.A., Stratowa C., Sommergruber W., Merluzzi V.J. Nature 344:70-72(1990) [PubMed: 1968231] [Abstract] Cited for: FUNCTION AS A RHINOVIRUS RECEPTOR. |
| [12] | "MUC1 mucin core protein binds to the domain 1 of ICAM-1." Hayashi T., Takahashi T., Motoya S., Ishida T., Itoh F., Adachi M., Hinoda Y., Imai K. Digestion 63 Suppl. 1:87-92(2001) [PubMed: 11173916] [Abstract] Cited for: INTERACTION WITH MUC1, FUNCTION. |
| [13] | "Interaction of coxsackievirus A21 with its cellular receptor, ICAM-1." Xiao C., Bator C.M., Bowman V.D., Rieder E., He Y., Hebert B., Bella J., Baker T.S., Wimmer E., Kuhn R.J., Rossmann M.G. J. Virol. 75:2444-2451(2001) [PubMed: 11160747] [Abstract] Cited for: INTERACTION WITH COXSACKIEVIRUS A21 CAPSID PROTEINS. |
| [14] | "Human plasma N-glycoproteome analysis by immunoaffinity subtraction, hydrazide chemistry, and mass spectrometry." Liu T., Qian W.-J., Gritsenko M.A., Camp D.G. II, Monroe M.E., Moore R.J., Smith R.D. J. Proteome Res. 4:2070-2080(2005) [PubMed: 16335952] [Abstract] Cited for: GLYCOSYLATION [LARGE SCALE ANALYSIS] AT ASN-267, MASS SPECTROMETRY. Tissue: Plasma. |
| [15] | "MARCH-IX mediates ubiquitination and downregulation of ICAM-1." Hoer S., Smith L., Lehner P.J. FEBS Lett. 581:45-51(2007) [PubMed: 17174307] [Abstract] Cited for: UBIQUITINATION. |
| [16] | "RhoG regulates endothelial apical cup assembly downstream from ICAM1 engagement and is involved in leukocyte trans-endothelial migration." van Buul J.D., Allingham M.J., Samson T., Meller J., Boulter E., Garcia-Mata R., Burridge K. J. Cell Biol. 178:1279-1293(2007) [PubMed: 17875742] [Abstract] Cited for: INTERACTION WITH SGEF, FUNCTION. |
| [17] | "A quantitative atlas of mitotic phosphorylation." Dephoure N., Zhou C., Villen J., Beausoleil S.A., Bakalarski C.E., Elledge S.J., Gygi S.P. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 105:10762-10767(2008) [PubMed: 18669648] [Abstract] Cited for: PHOSPHORYLATION [LARGE SCALE ANALYSIS] AT THR-521 AND THR-530, MASS SPECTROMETRY. |
| [18] | Colinge J., Superti-Furga G., Bennett K.L. Submitted (OCT-2008) to UniProtKB Cited for: IDENTIFICATION [LARGE SCALE ANALYSIS], MASS SPECTROMETRY. |
| [19] | "Glycoproteomics analysis of human liver tissue by combination of multiple enzyme digestion and hydrazide chemistry." Chen R., Jiang X., Sun D., Han G., Wang F., Ye M., Wang L., Zou H. J. Proteome Res. 8:651-661(2009) [PubMed: 19159218] [Abstract] Cited for: GLYCOSYLATION [LARGE SCALE ANALYSIS] AT ASN-202; ASN-260 AND ASN-267, MASS SPECTROMETRY. Tissue: Liver. |
| [20] | "Mass-spectrometric identification and relative quantification of N-linked cell surface glycoproteins." Wollscheid B., Bausch-Fluck D., Henderson C., O'Brien R., Bibel M., Schiess R., Aebersold R., Watts J.D. Nat. Biotechnol. 27:378-386(2009) [PubMed: 19349973] [Abstract] Cited for: GLYCOSYLATION [LARGE SCALE ANALYSIS] AT ASN-145 AND ASN-267, MASS SPECTROMETRY. |
| [21] | "A dimeric crystal structure for the N-terminal two domains of intercellular adhesion molecule-1." Casasnovas J.M., Stehle T., Liu J.H., Wang J.H., Springer T.A. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 95:4134-4139(1998) [PubMed: 9539702] [Abstract] Cited for: X-RAY CRYSTALLOGRAPHY (3.0 ANGSTROMS) OF 28-217. |
| [22] | "The structure of the two amino-terminal domains of human ICAM-1 suggests how it functions as a rhinovirus receptor and as an LFA-1 integrin ligand." Bella J., Kolatkar P.R., Marlor C.W., Greve J.M., Rossmann M.G. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 95:4140-4145(1998) [PubMed: 9539703] [Abstract] Cited for: X-RAY CRYSTALLOGRAPHY (3.25 ANGSTROMS) OF 28-212 IN COMPLEX WITH HUMAN RHINOVIRUS 14. |
| [23] | "Structural studies of two rhinovirus serotypes complexed with fragments of their cellular receptor." Kolatkar P.R., Bella J., Olson N.H., Bator C.M., Baker T.S., Rossmann M.G. EMBO J. 18:6249-6259(1999) [PubMed: 10562537] [Abstract] Cited for: X-RAY CRYSTALLOGRAPHY (3.25 ANGSTROMS) OF 28-212. |
| [24] | "Structures of the alpha L I domain and its complex with ICAM-1 reveal a shape-shifting pathway for integrin regulation." Shimaoka M., Xiao T., Liu J.H., Yang Y., Dong Y., Jun C.D., McCormack A., Zhang R., Joachimiak A., Takagi J., Wang J.H., Springer T.A. Cell 112:99-111(2003) [PubMed: 12526797] [Abstract] Cited for: X-RAY CRYSTALLOGRAPHY (3.3 ANGSTROMS) OF 28-318 IN COMPLEX WITH ITGAL VWFA DOMAIN, DISULFIDE BONDS, GLYCOSYLATION AT ASN-130; ASN-145; ASN-183 AND ASN-202. |
| [25] | "Structural basis for dimerization of ICAM-1 on the cell surface." Yang Y., Jun C.D., Liu J.H., Zhang R., Joachimiak A., Springer T.A., Wang J.H. Mol. Cell 14:269-276(2004) [PubMed: 15099525] [Abstract] Cited for: X-RAY CRYSTALLOGRAPHY (3.06 ANGSTROMS) OF 212-477, SUBUNIT, DISULFIDE BONDS, GLYCOSYLATION AT ASN-267; ASN-296 AND ASN-385. |
| [26] | "The crystal structure of coxsackievirus A21 and its interaction with ICAM-1." Xiao C., Bator-Kelly C.M., Rieder E., Chipman P.R., Craig A., Kuhn R.J., Wimmer E., Rossmann M.G. Structure 13:1019-1033(2005) [PubMed: 16004874] [Abstract] Cited for: STRUCTURE BY ELECTRON MICROSCOPY (8.0 ANGSTROMS) OF 24-473 IN COMPLEX WITH COXSACKIEVIRUS A21, SUBUNIT. |
| [27] | "Polymorphisms and linkage analysis for ICAM-1 and the selectin gene cluster." Vora D.K., Rosenbloom C.L., Beaudet A.L., Cottingham R.W. Genomics 21:473-477(1994) [PubMed: 7525451] [Abstract] Cited for: VARIANTS ARG-241 AND GLU-469. |
| [28] | "DNA polymorphisms in adhesion molecule genes -- a new risk factor for early atherosclerosis." Wenzel K., Ernst M., Rohde K., Baumann G., Speer A. Hum. Genet. 97:15-20(1996) [PubMed: 8557254] [Abstract] Cited for: VARIANT ARG-241. |
| [29] | "A high frequency African coding polymorphism in the N-terminal domain of ICAM-1 predisposing to cerebral malaria in Kenya." Fernandez-Reyes D., Craig A.G., Kyes S.A., Peshu N., Snow R.W., Berendt A.R., Marsh K., Newbold C.I. Hum. Mol. Genet. 6:1357-1360(1997) [PubMed: 9259284] [Abstract] Cited for: VARIANT KILIFI MET-56. |
| [30] | "Patterns of single-nucleotide polymorphisms in candidate genes for blood-pressure homeostasis." Halushka M.K., Fan J.-B., Bentley K., Hsie L., Shen N., Weder A., Cooper R., Lipshutz R., Chakravarti A. Nat. Genet. 22:239-247(1999) [PubMed: 10391210] [Abstract] Cited for: VARIANT KILIFI MET-56, VARIANT GLU-469. |
| + | Additional computationally mapped references. |
Web resources
| Atlas of Genetics and Cytogenetics in Oncology and Haematology |
| Wikipedia Intercellular adhesion molecule entry |
| SeattleSNPs |
| Virus Particle ExploreR db Icosahedral capsid structure |
| Functional Glycomics Gateway - Glycan Binding ICAM-1 |
Cross-references
Sequence databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| X06990 mRNA. Translation: CAA30051.1. J03132 mRNA. Translation: AAA52709.1. M24283 mRNA. Translation: AAA52708.1. X59286, X59287, X59288 Genomic DNA. Translation: CAA41977.1. BT006854 mRNA. Translation: AAP35500.1. AY225514 Genomic DNA. Translation: AAO30128.1. BC015969 mRNA. Translation: AAH15969.1. X57151 Genomic DNA. Translation: CAA40441.1. AF340039 mRNA. Translation: AAQ14902.1. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IPI | IPI00008494. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| PIR | A29849. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| RefSeq | NP_000192.2. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| UniGene | Hs.706750 Hs.707983 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3D structure databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| SMR | P05362. Positions 28-477. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| ModBase | Search... | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PTM databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| PhosphoSite | P05362. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Proteomic databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| PRIDE | P05362. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome annotation databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Ensembl | ENSG00000090339. Homo sapiens. [Contig view] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GeneID | 3383. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| KEGG | hsa:3383. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| UCSC | uc002mnq.2. human. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Organism-specific databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GeneCards | GC19P010247. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| H-InvDB | HIX0014738. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| HGNC | HGNC:5344. ICAM1. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| HPA | CAB002142. HPA002126. HPA004877. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MIM | 147840. gene. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orphanet | 1334. Chronic mucocutaneous candidiasis. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| PharmGKB | PA29592. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GenAtlas | Search... | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Phylogenomic databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| HOGENOM | P05362. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| HOVERGEN | P05362. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| OMA | P05362. YSFPAPN. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Enzyme and pathway databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Pathway_Interaction_DB | amb2_neutrophils_pathway. amb2 Integrin signaling. txa2pathway. Thromboxane A2 receptor signaling. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Reactome | REACT_13552. Integrin cell surface interactions. REACT_6900. Signaling in Immune system. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene expression databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| ArrayExpress | P05362. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Bgee | P05362. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| CleanEx | HS_ICAM1. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GermOnline | ENSG00000090339. Homo sapiens. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Family and domain databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| InterPro | IPR003988. ICAM. IPR013768. ICAM_N. IPR003987. ICAM_VCAM_N. IPR013783. Ig-like_fold. IPR003599. Ig_sub. [Graphical view] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Gene3D | G3DSA:2.60.40.10. Ig-like_fold. 3 hits. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Pfam | PF03921. ICAM_N. 1 hit. [Graphical view] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| PRINTS | PR01473. ICAM. PR01472. ICAMVCAM1. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| SMART | SM00409. IG. 1 hit. [Graphical view] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| PROSITE | PS50835. IG_LIKE. False negative. [Graphical view] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| ProtoNet | Search... | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Other Resources | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| DrugBank | DB00108. Natalizumab. DB00641. Simvastatin. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| NextBio | 13376. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| PMAP-CutDB | P05362. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| SOURCE | Search... | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry information
| Entry name | ICAM1_HUMAN | ||||||||
| Accession | Primary (citable) accession number: P05362 Secondary accession number(s): Q5NKV7, Q96B50 | ||||||||
| Entry history |
| ||||||||
| Entry status | Reviewed (UniProtKB/Swiss-Prot) | ||||||||
| Annotation project | HPI (Human Proteome Initiative) | ||||||||
Relevant documents
| Human cell differentiation molecules CD nomenclature of surface proteins of human leucocytes and list of entries |
| Human chromosome 19 Human chromosome 19: entries, gene names and cross-references to MIM |
| Human entries with polymorphisms or disease mutations List of human entries with polymorphisms or disease mutations |
| Human polymorphisms and disease mutations Index of human polymorphisms and disease mutations |
| MIM cross-references Online Mendelian Inheritance in Man (MIM) cross-references in UniProtKB/Swiss-Prot |
| PDB cross-references Index of Protein Data Bank (PDB) cross-references |
| SIMILARITY comments Index of protein domains and families |

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