Reviewed,
UniProtKB/Swiss-Prot P05107 (ITB2_HUMAN)
Last modified
June 16, 2009.
Version 134.
History...
Clusters with 100%,
90%,
50% identity |
Documents (7) |
Third-party data |
Customize display | text xml rdf/xml gff fasta |
Names and origin
| Protein names | Recommended name: Integrin beta-2 Alternative name(s): Cell surface adhesion glycoproteins LFA-1/CR3/p150,95 subunit beta Complement receptor C3 subunit beta CD_antigen=CD18 | ||||
| Gene names |
| ||||
| Organism | Homo sapiens (Human) | ||||
| Taxonomic identifier | 9606 [NCBI] | ||||
| Taxonomic lineage | Eukaryota › Metazoa › Chordata › Craniata › Vertebrata › Euteleostomi › Mammalia › Eutheria › Euarchontoglires › Primates › Haplorrhini › Catarrhini › Hominidae › Homo |
Protein attributes
| Sequence length | 769 AA. |
| Sequence status | Complete. |
| Sequence processing | The displayed sequence is further processed into a mature form. |
| Protein existence | Evidence at protein level. |
General annotation (Comments)
| Function | Integrin alpha-L/beta-2 is a receptor for ICAM1, ICAM2, ICAM3 and ICAM4. Integrins alpha-M/beta-2 and alpha-X/beta-2 are receptors for the iC3b fragment of the third complement component and for fibrinogen. Integrin alpha-X/beta-2 recognizes the sequence G-P-R in fibrinogen alpha-chain. Integrin alpha-M/beta-2 recognizes P1 and P2 peptides of fibrinogen gamma chain. Integrin alpha-M/beta-2 is also a receptor for factor X. Integrin alpha-D/beta-2 is a receptor for ICAM3 and VCAM1. |
| Subunit structure | Heterodimer of an alpha and a beta subunit. Beta-2 associates with either alpha-L, alpha-M, alpha-X or alpha-D. Interacts with COPS5 and RANBP9. Ref.7 Ref.9 |
| Subcellular location | |
| Post-translational modification | Both Ser-745 and Ser-756 become phosphorylated when T-cells are exposed to phorbol esters. Phosphorylation on Thr-758 (but not on Ser-756) allows interaction with 14-3-3 proteins. Ref.8 |
| Involvement in disease | Defects in ITGB2 are the cause of leukocyte adhesion deficiency type I (LAD1) [MIM:116920]. LAD1 patients have recurrent bacterial infections and their leukocytes are deficient in a wide range of adhesion-dependent functions. Ref.6 Ref.12 Ref.13 Ref.14 Ref.15 Ref.16 Ref.17 Ref.18 |
| Sequence similarities | Belongs to the integrin beta chain family. Contains 1 VWFA domain. |
Ontologies
Sequence annotation (Features)
| Feature key | Position(s) | Length | Description | Graphical view | Feature identifier | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule processing | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Signal peptide | 1 – 22 | 22 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Chain | 23 – 769 | 747 | Integrin beta-2 | PRO_0000016341 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Regions | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Topological domain | 23 – 700 | 678 | Extracellular Potential | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Transmembrane | 701 – 723 | 23 | Potential | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Topological domain | 724 – 769 | 46 | Cytoplasmic Potential | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Domain | 124 – 363 | 240 | VWFA | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Repeat | 449 – 496 | 48 | I | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Repeat | 497 – 540 | 44 | II | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Repeat | 541 – 581 | 41 | III | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Repeat | 582 – 617 | 36 | IV | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Region | 449 – 617 | 169 | Cysteine-rich tandem repeats | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motif | 397 – 399 | 3 | Cell attachment site Potential | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Amino acid modifications | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Modified residue | 23 | 1 | Pyrrolidone carboxylic acid | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Modified residue | 745 | 1 | Phosphoserine; by PKC Ref.8 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Modified residue | 756 | 1 | Phosphoserine Ref.8 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Modified residue | 758 | 1 | Phosphothreonine; by PKC; in vitro Ref.8 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Modified residue | 759 | 1 | Phosphothreonine Potential | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Modified residue | 760 | 1 | Phosphothreonine; by PKC/PRKCA; in vitro Ref.8 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Glycosylation | 50 | 1 | N-linked (GlcNAc...) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Glycosylation | 116 | 1 | N-linked (GlcNAc...) Potential | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Glycosylation | 212 | 1 | N-linked (GlcNAc...) Ref.10 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Glycosylation | 254 | 1 | N-linked (GlcNAc...) Potential | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Glycosylation | 501 | 1 | N-linked (GlcNAc...) Potential | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Glycosylation | 642 | 1 | N-linked (GlcNAc...) Potential | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Disulfide bond | 25 ↔ 447 | By similarity | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Disulfide bond | 33 ↔ 43 | By similarity | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Disulfide bond | 36 ↔ 73 | By similarity | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Disulfide bond | 46 ↔ 62 | By similarity | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Disulfide bond | 191 ↔ 198 | By similarity | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Disulfide bond | 246 ↔ 286 | By similarity | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Disulfide bond | 386 ↔ 400 | By similarity | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Disulfide bond | 420 ↔ 662 | By similarity | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Disulfide bond | 445 ↔ 449 | By similarity | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Disulfide bond | 459 ↔ 470 | By similarity | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Disulfide bond | 467 ↔ 506 | By similarity | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Disulfide bond | 472 ↔ 481 | By similarity | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Disulfide bond | 483 ↔ 497 | By similarity | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Disulfide bond | 512 ↔ 517 | By similarity | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Disulfide bond | 514 ↔ 549 | By similarity | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Disulfide bond | 519 ↔ 534 | By similarity | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Disulfide bond | 536 ↔ 541 | By similarity | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Disulfide bond | 557 ↔ 562 | By similarity | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Disulfide bond | 559 ↔ 590 | By similarity | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Disulfide bond | 564 ↔ 573 | By similarity | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Disulfide bond | 575 ↔ 582 | By similarity | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Disulfide bond | 596 ↔ 601 | By similarity | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Disulfide bond | 598 ↔ 643 | By similarity | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Disulfide bond | 603 ↔ 612 | By similarity | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Disulfide bond | 615 ↔ 618 | By similarity | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Disulfide bond | 622 ↔ 631 | By similarity | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Disulfide bond | 628 ↔ 695 | By similarity | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Disulfide bond | 647 ↔ 670 | By similarity | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Natural variations | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 128 | 1 | D → N in LAD1. Ref.16 | VAR_003984 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 138 | 1 | S → P in LAD1. Ref.18 | VAR_013402 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 149 | 1 | L → P in LAD1. Ref.12 | VAR_003985 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 169 | 1 | G → R in LAD1. Ref.12 Ref.13 | VAR_003986 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 178 | 1 | P → L in LAD1. Ref.15 | VAR_003987 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 196 | 1 | K → T in LAD1. Ref.14 | VAR_003988 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 273 | 1 | G → R in LAD1. Ref.18 | VAR_013403 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 284 | 1 | G → S in LAD1. Ref.17 | VAR_003989 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 351 | 1 | N → S in LAD1. Ref.6 | VAR_003990 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 354 | 1 | Q → H: dbSNP rs235330. Ref.6 Ref.1 Ref.2 Ref.4 Ref.5 | VAR_030035 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 586 | 1 | R → W in LAD1. dbSNP rs5030672. Ref.6 | VAR_003991 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 593 | 1 | R → C in LAD1. Ref.14 | VAR_003992 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Experimental info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence conflict | 199 | 1 | Q → P in CAA68266. Ref.5 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Helix Strand Turn | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 33 – 37 | 5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 44 – 46 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 58 – 61 | 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 65 – 70 | 6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 75 – 77 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 84 – 88 | 5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 97 – 99 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 101 – 107 | 7 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 113 – 119 | 7 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 297 – 300 | 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 304 – 309 | 6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 314 – 316 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 323 – 327 | 5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 330 – 333 | 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 335 – 338 | 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 340 – 346 | 7 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 352 – 358 | 7 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 360 – 362 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 366 – 371 | 6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 378 – 385 | 8 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 387 – 389 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 391 – 401 | 11 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 409 – 419 | 11 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 424 – 430 | 7 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 437 – 443 | 7 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 458 – 461 | 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 462 – 466 | 5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 469 – 472 | 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 490 – 495 | 6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 505 – 508 | 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 509 – 513 | 5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 516 – 519 | 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 528 – 531 | 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 536 – 539 | 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 552 – 554 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 555 – 558 | 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 561 – 564 | 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 568 – 570 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 754 – 762 | 9 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequences
| ||||||||||||||||||
References
| « Hide 'large scale' references | |
| [1] | "Cloning of the beta subunit of the leukocyte adhesion proteins: homology to an extracellular matrix receptor defines a novel supergene family." Kishimoto T.K., O'Connor K., Lee A., Roberts T.M., Springer T.A. Cell 48:681-690(1987) [PubMed: 3028646] [Abstract] Cited for: NUCLEOTIDE SEQUENCE [MRNA], VARIANT HIS-354. |
| [2] | "The gene organisation of the human beta 2 integrin subunit (CD18)." Weitzman J.B., Wells C.E., Wright A.H., Clark P.A., Law S.K.A. FEBS Lett. 294:97-103(1991) [PubMed: 1683838] [Abstract] Cited for: NUCLEOTIDE SEQUENCE [GENOMIC DNA], VARIANT HIS-354. |
| [3] | "The DNA sequence of human chromosome 21." Hattori M., Fujiyama A., Taylor T.D., Watanabe H., Yada T., Park H.-S., Toyoda A., Ishii K., Totoki Y., Choi D.-K., Groner Y., Soeda E., Ohki M., Takagi T., Sakaki Y., Taudien S., Blechschmidt K., Polley A. Yaspo M.-L.Nature 405:311-319(2000) [PubMed: 10830953] [Abstract] Cited for: NUCLEOTIDE SEQUENCE [LARGE SCALE GENOMIC DNA]. |
| [4] | "The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC)." The MGC Project Team Genome Res. 14:2121-2127(2004) [PubMed: 15489334] [Abstract] Cited for: NUCLEOTIDE SEQUENCE [LARGE SCALE MRNA], VARIANT HIS-354. Tissue: Muscle. |
| [5] | "The primary structure of the beta-subunit of the cell surface adhesion glycoproteins LFA-1, CR3 and p150,95 and its relationship to the fibronectin receptor." Law S.K.A., Gagnon J., Hildreth J.E., Wells C.E., Willis A.C., Wong A.J. EMBO J. 6:915-919(1987) [PubMed: 2954816] [Abstract] Cited for: NUCLEOTIDE SEQUENCE [MRNA] OF 9-769, PARTIAL PROTEIN SEQUENCE, VARIANT HIS-354. Tissue: Spleen. |
| [6] | "Genetic cause of leukocyte adhesion molecule deficiency. Abnormal splicing and a missense mutation in a conserved region of CD18 impair cell surface expression of beta 2 integrins." Nelson C., Rabb H., Arnaout M.A. J. Biol. Chem. 267:3351-3357(1992) [PubMed: 1346613] [Abstract] Cited for: NUCLEOTIDE SEQUENCE [MRNA] OF 347-355, VARIANTS LAD1 SER-351 AND TRP-586, VARIANT HIS-354. |
| [7] | "Integrin LFA-1 interacts with the transcriptional co-activator JAB1 to modulate AP-1 activity." Bianchi E., Denti S., Granata A., Bossi G., Geginat J., Villa A., Rogge L., Pardi R. Nature 404:617-621(2000) [PubMed: 10766246] [Abstract] Cited for: INTERACTION WITH COPS5. |
| [8] | "Phosphorylation of the cytoplasmic domain of the integrin CD18 chain by protein kinase C isoforms in leukocytes." Fagerholm S., Morrice N., Gahmberg C.G., Cohen P. J. Biol. Chem. 277:1728-1738(2002) [PubMed: 11700305] [Abstract] Cited for: PHOSPHORYLATION AT SER-745; SER-756; THR-758 AND THR-760. |
| [9] | "RanBPM is a phosphoprotein that associates with the plasma membrane and interacts with the integrin LFA-1." Denti S., Sirri A., Cheli A., Rogge L., Innamorati G., Putignano S., Fabbri M., Pardi R., Bianchi E. J. Biol. Chem. 279:13027-13034(2004) [PubMed: 14722085] [Abstract] Cited for: INTERACTION WITH RANBP9. |
| [10] | "Human plasma N-glycoproteome analysis by immunoaffinity subtraction, hydrazide chemistry, and mass spectrometry." Liu T., Qian W.-J., Gritsenko M.A., Camp D.G. II, Monroe M.E., Moore R.J., Smith R.D. J. Proteome Res. 4:2070-2080(2005) [PubMed: 16335952] [Abstract] Cited for: GLYCOSYLATION [LARGE SCALE ANALYSIS] AT ASN-212, MASS SPECTROMETRY. Tissue: Plasma. |
| [11] | "Glycoproteomics analysis of human liver tissue by combination of multiple enzyme digestion and hydrazide chemistry." Chen R., Jiang X., Sun D., Han G., Wang F., Ye M., Wang L., Zou H. J. Proteome Res. 8:651-661(2009) [PubMed: 19159218] [Abstract] Cited for: GLYCOSYLATION [LARGE SCALE ANALYSIS] AT ASN-50 AND ASN-212, MASS SPECTROMETRY. Tissue: Liver. |
| [12] | "Distinct mutations in two patients with leukocyte adhesion deficiency and their functional correlates." Wardlaw A.J., Hibbs M.L., Stacker S.A., Springer T.A. J. Exp. Med. 172:335-345(1990) [PubMed: 1694220] [Abstract] Cited for: VARIANTS LAD1 PRO-149 AND ARG-169. |
| [13] | "Molecular basis for a severe case of leukocyte adhesion deficiency." Corbi A., Vara A., Ursa A., Rodriguez M.C.G., Fontan G., Sanchez-Madrid F. Eur. J. Immunol. 22:1877-1881(1992) [PubMed: 1352501] [Abstract] Cited for: VARIANT LAD1 ARG-169. |
| [14] | "Point mutations impairing cell surface expression of the common beta subunit (CD18) in a patient with leukocyte adhesion molecule (Leu-CAM) deficiency." Arnaout M.A., Dana N., Gupta S.K., Tenen D.G., Fathallah D.M. J. Clin. Invest. 85:977-981(1990) [PubMed: 1968911] [Abstract] Cited for: VARIANTS LAD1 THR-196 AND CYS-593. |
| [15] | "Identification of two molecular defects in a child with leukocyte adherence deficiency." Back L.L., Kwok W.W., Hickstein D.D. J. Biol. Chem. 267:5482-5487(1992) [PubMed: 1347532] [Abstract] Cited for: VARIANT LAD1 LEU-178. |
| [16] | "Leukocyte adhesion deficiency: identification of novel mutations in two Japanese patients with a severe form." Matsuura S., Kishi F., Tsukahara M., Nunoi H., Matsuda I., Kobayashi K., Kajii T. Biochem. Biophys. Res. Commun. 184:1460-1467(1992) [PubMed: 1590804] [Abstract] Cited for: VARIANT LAD1 ASN-128. |
| [17] | "A point mutation associated with leukocyte adhesion deficiency type 1 of moderate severity." Back L.A., Kerkering M., Baker D., Bauer T.R., Embree L.J., Hickstein D.D. Biochem. Biophys. Res. Commun. 193:912-918(1993) [PubMed: 7686755] [Abstract] Cited for: VARIANT LAD1 SER-284. |
| [18] | "A novel leukocyte adhesion deficiency caused by expressed but nonfunctional beta2 integrins Mac-1 and LFA-1." Hogg N., Stewart M.P., Scarth S.L., Newton R., Shaw J.M., Law S.K.A., Klein N. J. Clin. Invest. 103:97-106(1999) [PubMed: 9884339] [Abstract] Cited for: VARIANTS LAD1 PRO-138 AND ARG-273. |
| + | Additional computationally mapped references. |
Cross-references
Sequence databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| M15395 mRNA. Translation: AAA59490.1. X64072 X63926 Genomic DNA. Translation: CAA45427.1. AL163300 Genomic DNA. Translation: CAB90553.1. BC005861 mRNA. Translation: AAH05861.1. Y00057 mRNA. Translation: CAA68266.1. S81234 mRNA. Translation: AAB21404.1. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IPI | IPI00291792. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| PIR | IJHULM. A25967. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| RefSeq | NP_000202.2. NP_001120963.1. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| UniGene | Hs.375957 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3D structure databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| ModBase | Search... | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Protein-protein interaction databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| DIP | DIP:478N. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IntAct | P05107. 1 interaction. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PTM databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| PhosphoSite | P05107. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Proteomic databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| PRIDE | P05107. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome annotation databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Ensembl | ENSG00000160255. Homo sapiens. [Contig view] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GeneID | 3689. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| KEGG | hsa:3689. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Organism-specific databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GeneCards | GC21M045130. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| H-InvDB | HIX0016175. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| HGNC | HGNC:6155. ITGB2. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| HPA | HPA008877. HPA016894. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MIM | 116920. phenotype. 600065. gene. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orphanet | 2968. Leukocyte adhesion deficiency. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| PharmGKB | PA29955. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GenAtlas | Search... | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Phylogenomic databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| HOGENOM | P05107. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| HOVERGEN | P05107. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| OMA | P05107. CHTSDVP. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Enzyme and pathway databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Pathway_Interaction_DB | amb2_neutrophils_pathway. amb2 Integrin signaling. hif1_tfpathway. HIF-1-alpha transcription factor network. a4b1_paxdep_pathway. Paxillin-dependent events mediated by a4b1. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Reactome | REACT_13552. Integrin cell surface interactions. REACT_604. Hemostasis. REACT_6900. Signaling in Immune system. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene expression databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| ArrayExpress | P05107. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Bgee | P05107. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| CleanEx | HS_ITGB2. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GermOnline | ENSG00000160255. Homo sapiens. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Family and domain databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| InterPro | IPR013032. EGF-like_reg_CS. IPR013111. EGF_extracell. IPR015812. Integrin_bsu. IPR015439. Integrin_bsu-2_C. IPR001169. Integrin_bsu_C. IPR014836. Integrin_bsu_cyt. IPR002369. Integrin_bsu_N. IPR012012. Integrin_bsu_subgr. IPR012896. Integrin_bsu_tail. IPR003659. Plexin-like. IPR002035. VWF_A. [Graphical view] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Gene3D | G3DSA:1.20.5.630. Integrin_bsu_cyt. 1 hit. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| PANTHER | PTHR10082. Integrin_beta_C. 1 hit. PTHR10082:SF15. Integrin_bsu-2_C. 1 hit. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Pfam | PF07974. EGF_2. 1 hit. PF08725. Integrin_b_cyt. 1 hit. PF07965. Integrin_B_tail. 1 hit. PF00362. Integrin_beta. 1 hit. [Graphical view] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| PIRSF | PIRSF002512. Integrin_B. 1 hit. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| PRINTS | PR01186. INTEGRINB. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| SMART | SM00187. INB. 1 hit. SM00423. PSI. 1 hit. SM00327. VWA. 1 hit. [Graphical view] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| PROSITE | PS00022. EGF_1. 2 hits. Uncertain. PS01186. EGF_2. 3 hits. Uncertain. PS00243. INTEGRIN_BETA. 3 hits. PS50234. VWFA. False negative. [Graphical view] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| ProtoNet | Search... | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Other Resources | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| DrugBank | DB00641. Simvastatin. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| NextBio | 14449. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| PMAP-CutDB | P05107. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| SOURCE | Search... | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry information
| Entry name | ITB2_HUMAN | ||||||||
| Accession | Primary (citable) accession number: P05107 Secondary accession number(s): Q16418 | ||||||||
| Entry history |
| ||||||||
| Entry status | Reviewed (UniProtKB/Swiss-Prot) | ||||||||
| Annotation project | HPI (Human Proteome Initiative) | ||||||||
Relevant documents
| Human cell differentiation molecules CD nomenclature of surface proteins of human leucocytes and list of entries |
| Human chromosome 21 Human chromosome 21: entries, gene names and cross-references to MIM |
| Human entries with polymorphisms or disease mutations List of human entries with polymorphisms or disease mutations |
| Human polymorphisms and disease mutations Index of human polymorphisms and disease mutations |
| MIM cross-references Online Mendelian Inheritance in Man (MIM) cross-references in UniProtKB/Swiss-Prot |
| PDB cross-references Index of Protein Data Bank (PDB) cross-references |
| SIMILARITY comments Index of protein domains and families |

Clusters with


