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UniProtKB/Swiss-Prot P04181 (OAT_HUMAN)
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July 7, 2009.
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90%,
50% identity |
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Third-party data |
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Names and origin
| Protein names | Recommended name: Ornithine aminotransferase, mitochondrial EC=2.6.1.13 Alternative name(s): Ornithine--oxo-acid aminotransferase Cleaved into the following 2 chains: 1- Recommended name: Ornithine aminotransferase, hepatic form 2- Recommended name: Ornithine aminotransferase, renal form | ||
| Gene names |
| ||
| Organism | Homo sapiens (Human) [Complete proteome] | ||
| Taxonomic identifier | 9606 [NCBI] | ||
| Taxonomic lineage | Eukaryota › Metazoa › Chordata › Craniata › Vertebrata › Euteleostomi › Mammalia › Eutheria › Euarchontoglires › Primates › Haplorrhini › Catarrhini › Hominidae › Homo |
Protein attributes
| Sequence length | 439 AA. |
| Sequence status | Complete. |
| Sequence processing | The displayed sequence is further processed into a mature form. |
| Protein existence | Evidence at protein level. |
General annotation (Comments)
| Catalytic activity | L-ornithine + a 2-oxo acid = L-glutamate 5-semialdehyde + an L-amino acid. |
| Cofactor | Pyridoxal phosphate. |
| Pathway | |
| Subunit structure | Homotetramer. |
| Subcellular location | |
| Involvement in disease | Defects in OAT are the cause of hyperornithinemia with gyrate atrophy of choroid and retina (HOGA) [MIM:258870]. HOGA is a slowly progressive blinding autosomal recessive disorder. Ref.17 Ref.18 Ref.19 Ref.20 Ref.21 Ref.22 |
| Sequence similarities | Belongs to the class-III pyridoxal-phosphate-dependent aminotransferase family. |
Ontologies
| Keywords | |
|---|---|
| Cellular component | Mitochondrion |
| Coding sequence diversity | Polymorphism |
| Disease | Disease mutation |
| Domain | Transit peptide |
| Ligand | Pyridoxal phosphate |
| Molecular function | Aminotransferase Transferase |
| Technical term | 3D-structure Complete proteome Direct protein sequencing |
| Gene Ontology (GO) | |
| Biological process | visual perception Ref.18 Traceable author statement. Source: ProtInc |
| Cellular component | mitochondrial matrix Ref.1 Non-traceable author statement. Source: ProtInc |
| Molecular function | ornithine-oxo-acid transaminase activity Ref.1 Traceable author statement. Source: ProtInc protein bindingInferred from physical interaction. Source: IntAct pyridoxal phosphate bindingInferred from electronic annotation. Source: InterPro |
| Complete GO annotation... | |
Sequence annotation (Features)
| Feature key | Position(s) | Length | Description | Graphical view | Feature identifier | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule processing | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Transit peptide | 1 – 35 | 35 | Mitochondrion; in renal form Ref.3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Transit peptide | 1 – 25 | 25 | Mitochondrion; in hepatic form | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Chain | 26 – 439 | 414 | Ornithine aminotransferase, hepatic form | PRO_0000001262 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Chain | 36 – 439 | 404 | Ornithine aminotransferase, renal form | PRO_0000001263 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Amino acid modifications | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Modified residue | 292 | 1 | N6-(pyridoxal phosphate)lysine | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Natural variations | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 54 | 1 | N → K in HOGA. Ref.17 | VAR_000565 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 55 | 1 | Y → H in HOGA. Ref.20 | VAR_000566 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 89 | 1 | N → K in HOGA. Ref.20 | VAR_000567 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 90 | 1 | Q → E in HOGA; mistargeted, accumulates in cytoplasm. Ref.22 | VAR_015648 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 93 | 1 | C → F in HOGA. Ref.20 | VAR_000568 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 154 | 1 | R → L in HOGA; complete loss of activity. Ref.20 | VAR_000569 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 180 | 1 | R → T in HOGA; complete loss of activity. Ref.19 Ref.20 | VAR_000570 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 184 | 1 | Missing in HOGA. Ref.20 | VAR_000571 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 226 | 1 | A → V in HOGA. Ref.21 | VAR_000572 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 241 | 1 | P → L in HOGA. Ref.19 Ref.20 | VAR_000573 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 245 | 1 | Y → C in HOGA. Ref.20 | VAR_000574 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 250 | 1 | R → P in HOGA. Ref.19 Ref.20 | VAR_000575 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 267 | 1 | T → I in HOGA. Ref.20 | VAR_000576 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 270 | 1 | A → P in HOGA. | VAR_000577 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 271 | 1 | R → K in HOGA. Ref.20 | VAR_000578 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 319 | 1 | H → Y in HOGA. Ref.18 | VAR_000579 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 332 | 1 | V → M in HOGA. Ref.17 | VAR_000580 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 353 | 1 | G → D in HOGA. Ref.19 Ref.20 | VAR_000581 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 375 | 1 | G → A in HOGA. Ref.20 | VAR_000582 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 394 | 1 | C → R in HOGA. Ref.19 Ref.20 | VAR_000583 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 402 | 1 | L → P in HOGA. Ref.20 | VAR_000584 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 417 | 1 | P → L in HOGA. Ref.20 | VAR_000585 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 437 | 1 | L → F: dbSNP rs1800456. Ref.20 | VAR_000586 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Helix Strand Turn | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 40 – 50 | 11 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 58 – 67 | 10 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 69 – 72 | 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 77 – 82 | 6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 83 – 86 | 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 95 – 105 | 11 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 115 – 119 | 5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 120 – 131 | 12 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 134 – 141 | 8 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 142 – 159 | 18 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 169 – 173 | 5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 182 – 186 | 5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 191 – 194 | 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 204 – 207 | 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 212 – 218 | 7 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 224 – 229 | 6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 231 – 233 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 234 – 237 | 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 245 – 255 | 11 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 259 – 263 | 5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 265 – 272 | 8 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 273 – 276 | 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 277 – 281 | 5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 286 – 290 | 5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 292 – 295 | 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 302 – 306 | 5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 308 – 311 | 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 327 – 342 | 16 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 345 – 360 | 16 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 365 – 367 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 368 – 374 | 7 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 377 – 382 | 6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 390 – 399 | 10 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 406 – 414 | 9 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 422 – 436 | 15 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequences
| ||||||||||||||||||
References
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| + | Additional computationally mapped references. |
Cross-references
Sequence databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| M12267 mRNA. Translation: AAA59956.1. M14963 mRNA. Translation: AAA59959.1. Y07511 mRNA. Translation: CAA68809.1. M23204 mRNA. Translation: AAA36386.1. M23205 Genomic DNA. No translation available. M88760 Genomic DNA. Translation: AAA59958.1. Sequence problems. M29927 M29926 Genomic DNA. Translation: AAA59957.1. AK312561 mRNA. Translation: BAG35458.1. CR457045 mRNA. Translation: CAG33326.1. AL445237 Genomic DNA. Translation: CAI17293.1. CH471066 Genomic DNA. Translation: EAW49271.1. BC000964 mRNA. Translation: AAH00964.1. BC016928 mRNA. Translation: AAH16928.1. S66418 mRNA. Translation: AAB20298.1. S66421 mRNA. Translation: AAB20297.1. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IPI | IPI00022334. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| PIR | XNHUO. A30806. I55360. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| RefSeq | NP_000265.1. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| UniGene | Hs.523332 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3D structure databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| ModBase | Search... | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Protein-protein interaction databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IntAct | P04181. 14 interactions. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
2-D gel databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| REPRODUCTION-2DPAGE | IPI00022334. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Proteomic databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| PeptideAtlas | P04181. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| PRIDE | P04181. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome annotation databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Ensembl | ENSG00000065154. Homo sapiens. [Contig view] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GeneID | 4942. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| KEGG | hsa:4942. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| UCSC | uc001lhp.2. human. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Organism-specific databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GeneCards | GC10M126075. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| H-InvDB | HIX0009284. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| HGNC | HGNC:8091. OAT. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MIM | 258870. gene+phenotype. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orphanet | 414. Hyperornithinemia. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| PharmGKB | PA31880. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GenAtlas | Search... | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Phylogenomic databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| HOGENOM | P04181. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| HOVERGEN | P04181. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| OMA | P04181. ICDEIQT. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Enzyme and pathway databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| BioCyc | MetaCyc:MON-11404. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| BRENDA | 2.6.1.13. 247. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Reactome | REACT_13. Metabolism of amino acids. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene expression databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| ArrayExpress | P04181. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Bgee | P04181. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| CleanEx | HS_OAT. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GermOnline | ENSG00000065154. Homo sapiens. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Family and domain databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| InterPro | IPR005814. Aminotrans_3. IPR010164. Orn_aminotrans. IPR015421. PyrdxlP-dep_Trfase_major_sub1. [Graphical view] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Gene3D | G3DSA:3.40.640.10. PyrdxlP-dep_Trfase_major_sub1. 1 hit. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| PANTHER | PTHR11986. Aminotrans_3. 1 hit. PTHR11986:SF18. Orn_aminotrans. 1 hit. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Pfam | PF00202. Aminotran_3. 1 hit. [Graphical view] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| TIGRFAMs | TIGR01885. Orn_aminotrans. 1 hit. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| PROSITE | PS00600. AA_TRANSFER_CLASS_3. 1 hit. [Graphical view] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| ProtoNet | Search... | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Other Resources | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| DrugBank | DB00129. L-Ornithine. DB00114. Pyridoxal Phosphate. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| NextBio | 19041. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| SOURCE | Search... | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry information
| Entry name | OAT_HUMAN | ||||||||
| Accession | Primary (citable) accession number: P04181 Secondary accession number(s): Q16068 Q9UD03 | ||||||||
| Entry history |
| ||||||||
| Entry status | Reviewed (UniProtKB/Swiss-Prot) | ||||||||
| Annotation project | HPI (Human Proteome Initiative) | ||||||||
Relevant documents
| Human chromosome 10 Human chromosome 10: entries, gene names and cross-references to MIM |
| Human entries with polymorphisms or disease mutations List of human entries with polymorphisms or disease mutations |
| Human polymorphisms and disease mutations Index of human polymorphisms and disease mutations |
| MIM cross-references Online Mendelian Inheritance in Man (MIM) cross-references in UniProtKB/Swiss-Prot |
| PATHWAY comments Index of metabolic and biosynthesis pathways |
| PDB cross-references Index of Protein Data Bank (PDB) cross-references |
| SIMILARITY comments Index of protein domains and families |

Clusters with


