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UniProtKB/Swiss-Prot P04156 (PRIO_HUMAN)
Last modified
July 7, 2009.
Version 134.
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Names and origin
| Protein names | Recommended name: Major prion protein Short name=PrP Alternative name(s): PrP27-30 PrP33-35C ASCR CD_antigen=CD230 | ||||
| Gene names |
| ||||
| Organism | Homo sapiens (Human) [Complete proteome] | ||||
| Taxonomic identifier | 9606 [NCBI] | ||||
| Taxonomic lineage | Eukaryota › Metazoa › Chordata › Craniata › Vertebrata › Euteleostomi › Mammalia › Eutheria › Euarchontoglires › Primates › Haplorrhini › Catarrhini › Hominidae › Homo |
Protein attributes
| Sequence length | 253 AA. |
| Sequence status | Complete. |
| Sequence processing | The displayed sequence is further processed into a mature form. |
| Protein existence | Evidence at protein level. |
General annotation (Comments)
| Function | The physiological function of PrP is not known. |
| Subunit structure | PrP has a tendency to aggregate yielding polymers called "rods". Interacts with GRB2, PRNPIP and SYN1 By similarity. |
| Subcellular location | Cell membrane; Lipid-anchor › GPI-anchor. Golgi apparatus By similarity. |
| Post-translational modification | The glycosylation pattern (the amount of mono-, di- and non-glycosylated forms or glycoforms) seems to differ in normal and CJD prion. |
| Polymorphism | The five tandem octapeptide repeats region is highly unstable. Insertions or deletions of octapeptide repeat units are associated to prion disease. |
| Involvement in disease | PrP is found in high quantity in the brain of humans and animals infected with neurodegenerative diseases known as transmissible spongiform encephalopathies or prion diseases, like: Creutzfeldt-Jakob disease (CJD), fatal familial insomnia (FFI), Gerstmann-Straussler disease (GSD), Huntington disease-like 1 (HDL1) and kuru in humans; scrapie in sheep and goat; bovine spongiform encephalopathy (BSE) in cattle; transmissible mink encephalopathy (TME); chronic wasting disease (CWD) of mule deer and elk; feline spongiform encephalopathy (FSE) in cats and exotic ungulate encephalopathy (EUE) in nyala and greater kudu. The prion diseases illustrate three manifestations of CNS degeneration: (1) infectious (2) sporadic and (3) dominantly inherited forms. TME, CWD, BSE, FSE, EUE are all thought to occur after consumption of prion-infected foodstuffs. Ref.25 Ref.26 Ref.28 Ref.29 Ref.32 Ref.33 Ref.36 Ref.37 Ref.41 Defects in PRNP are the cause of Creutzfeldt-Jakob disease (CJD) [MIM:123400]. CJD occurs primarily as a sporadic disorder (1 per million), while 10-15% are familial. Accidental transmission of CJD to humans appears to be iatrogenic (contaminated human growth hormone (HGH), corneal transplantation, electroencephalographic electrode implantation, etc.). Epidemiologic studies have failed to implicate the ingestion of infected annimal meat in the pathogenesis of CJD in human. The triad of microscopic features that characterize the prion diseases consists of (1) spongiform degeneration of neurons, (2) severe astrocytic gliosis that often appears to be out of proportion to the degree of nerve cell loss, and (3) amyloid plaque formation. CJD is characterized by progressive dementia and myoclonic seizures, affecting adults in mid-life. Some patients present sleep disorders, abnormalities of high cortical function, cerebellar and corticospinal disturbances. The disease ends in death after a 3-12 months illness. Ref.25 Ref.26 Ref.28 Ref.29 Ref.32 Ref.33 Ref.36 Ref.37 Ref.41 Defects in PRNP are the cause of fatal familial insomnia (FFI) [MIM:600072]. FFI is an autosomal dominant disorder and is characterized by neuronal degeneration limited to selected thalamic nuclei and progressive insomnia. Ref.24 Defects in PRNP are the cause of Gerstmann-Straussler disease (GSD) [MIM:137440]. GSD is a heterogeneous disorder and was defined as a spinocerebellar ataxia with dementia and plaquelike deposits. GSD incidence is less than 2 per 100 million live births. Ref.4 Ref.22 Ref.27 Ref.30 Ref.31 Ref.34 Ref.35 Ref.38 Ref.42 Defects in PRNP are the cause of Huntington disease-like 1 (HDL1) [MIM:603218]. HDL1 is an autosomal dominant, early onset neurodegenerative disorder with prominent psychiatric features. Defects in PRNP are the cause of kuru [MIM:245300]. Kuru is transmitted during ritualistic cannibalism, among natives of the New Guinea highlands. Patients exhibit various movement disorders like cerebellar abnormalities, rigidity of the limbs, and clonus. Emotional lability is present, and dementia is conspicuously absent. Death usually occurs from 3 to 12 month after onset. Defects in PRNP are the cause of prion disease with protracted course [MIM:606688]; an autosomal dominant presenile dementia with a rapidly progressive and protracted clinical course. The dementia was characterized clinically by frontotemporal features, including early personality changes. Some patients had memory loss, several showed aggressiveness, hyperorality and verbal stereotypy, others had parkinsonian symptoms. |
| Sequence similarities | Belongs to the prion family. |
Ontologies
Binary interactions
With | Entry | #Exp. | IntAct | Notes |
|---|---|---|---|---|
| itself | 3 | EBI-977302,EBI-977302 | ||
| Aldoc | P05063 | 1 | EBI-977302,EBI-444845 | From a different organism. |
| APP | P05067 | 1 | EBI-977302,EBI-77613 | |
| Hnrnpa2b1 | O88569 | 1 | EBI-977302,EBI-299636 | From a different organism. |
Sequence annotation (Features)
| Feature key | Position(s) | Length | Description | Graphical view | Feature identifier | |||||||||||||||||||||||
Molecule processing | ||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Signal peptide | 1 – 22 | 22 | ||||||||||||||||||||||||||
| Chain | 23 – 230 | 208 | Major prion protein | PRO_0000025675 | ||||||||||||||||||||||||
| Propeptide | 231 – 253 | 23 | Removed in mature form By similarity | PRO_0000025676 | ||||||||||||||||||||||||
Regions | ||||||||||||||||||||||||||||
| Repeat | 51 – 59 | 9 | 1 | |||||||||||||||||||||||||
| Repeat | 60 – 67 | 8 | 2 | |||||||||||||||||||||||||
| Repeat | 68 – 75 | 8 | 3 | |||||||||||||||||||||||||
| Repeat | 76 – 83 | 8 | 4 | |||||||||||||||||||||||||
| Repeat | 84 – 91 | 8 | 5 | |||||||||||||||||||||||||
| Region | 23 – 230 | 208 | Interaction with GRB2, PRNPIP and SYN1 By similarity | |||||||||||||||||||||||||
| Region | 51 – 91 | 41 | 5 X 8 AA tandem repeats of P-H-G-G-G-W-G-Q | |||||||||||||||||||||||||
Amino acid modifications | ||||||||||||||||||||||||||||
| Lipidation | 230 | 1 | GPI-anchor amidated serine By similarity | |||||||||||||||||||||||||
| Glycosylation | 181 | 1 | N-linked (GlcNAc...) | |||||||||||||||||||||||||
| Glycosylation | 197 | 1 | N-linked (GlcNAc...) | |||||||||||||||||||||||||
| Disulfide bond | 179 ↔ 214 | |||||||||||||||||||||||||||
Natural variations | ||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 56 – 63 | 8 | Missing Ref.2 Ref.10 Ref.12 | VAR_013763 | ||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 102 | 1 | P → L in GSD and early-onset dementia. | VAR_006464 | ||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 105 | 1 | P → L in GSD. Ref.30 Ref.31 | VAR_006465 | ||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 117 | 1 | A → V Linked to development of dementing Gerstmann-Straussler disease. Ref.23 | VAR_006466 | ||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 129 | 1 | M → V Polymorphism; determines the disease phenotype in patients who have a PrP mutation at position 178. Patients with M-129 develop FFI, those with V-129 develop CJD. dbSNP rs1799990. Ref.23 | VAR_006467 | ||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 131 | 1 | G → V in GSD. Ref.42 | VAR_014264 | ||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 171 | 1 | N → S in schizoaffective disorder. dbSNP rs16990018. Ref.11 | VAR_006468 | ||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 178 | 1 | D → N in FFI and CJD. | VAR_006469 | ||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 180 | 1 | V → I in CJD. Ref.28 | VAR_006470 | ||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 183 | 1 | T → A in familial spongiform encephalopathy. Ref.40 | VAR_006471 | ||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 187 | 1 | H → R in GSD. Ref.4 | VAR_008746 | ||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 188 | 1 | T → K in early-onset dementia; dementia associated to prion diseases. Ref.40 Ref.39 | VAR_008748 | ||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 188 | 1 | T → R Ref.40 Ref.39 | VAR_008747 | ||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 196 | 1 | E → K in CJD. Ref.41 | VAR_008749 | ||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 198 | 1 | F → S in GSD; atypical form with neurofibrillary tangles. | VAR_006472 | ||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 200 | 1 | E → K in CJD. Ref.26 Ref.32 Ref.33 | VAR_006473 | ||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 202 | 1 | D → N in GSD. Ref.38 | VAR_008750 | ||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 203 | 1 | V → I in CJD; it could be an extremely rare polymorphism. Ref.41 | VAR_008751 | ||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 208 | 1 | R → H in CJD. Ref.36 Ref.37 | VAR_006474 | ||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 210 | 1 | V → I in CJD. Ref.29 | VAR_006475 | ||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 211 | 1 | E → Q in CJD. Ref.41 | VAR_008752 | ||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 212 | 1 | Q → P in GSD. Ref.38 | VAR_008753 | ||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 217 | 1 | Q → R in GSD; with neurofibrillary tangles. Ref.27 | VAR_006476 | ||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 219 | 1 | E → K: dbSNP rs1800014. Ref.35 | VAR_006477 | ||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 232 | 1 | M → R in CJD. Ref.28 | VAR_006478 | ||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 238 | 1 | P → S Ref.39 | VAR_008754 | ||||||||||||||||||||||||
Experimental info | ||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence conflict | 118 | 1 | Missing in AAA19664. Ref.9 | |||||||||||||||||||||||||
| Sequence conflict | 118 | 1 | Missing in BAA00011. Ref.9 | |||||||||||||||||||||||||
| Sequence conflict | 169 | 1 | Y → H in ABD63004. Ref.6 | |||||||||||||||||||||||||
| Sequence conflict | 227 | 1 | Q → K in AAH22532. Ref.8 | |||||||||||||||||||||||||
Secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||
Helix Strand Turn | ||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 63 – 66 | 4 | ||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 70 – 73 | 4 | ||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 74 – 76 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 78 – 82 | 5 | ||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 144 – 153 | 10 | ||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 154 – 156 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 166 – 168 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 172 – 189 | 18 | ||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 191 – 193 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 194 – 197 | 4 | ||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 200 – 223 | 24 | ||||||||||||||||||||||||||
Sequences
| ||||||||||||||||||
References
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Cross-references
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Other Resources | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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